Группа микроскопических исследований

Рябчикова Елена Ивановна
профессор, доктор биологических наук, г.н.с.
телефон: (383) 363-51-63
Email

• Визуализация и изучение ультраструктуры наноконструкций разного типа.
• Исследование механизмов взаимодействия наночастиц с клетками в 2D- и 3D-клеточных системах (монослой и сфероиды).
• Изучение морфологии и репродукции вирусов, бактерий и других микроорганизмов.
• Исследование механизмов антибактериального эффекта новых химических соединений, синтезированных в ИХБФМ СО РАН.
• Изучение изменений ультраструктуры растительного сырья при механохимической обработке.
• Визуализация макромолекулярных конструкций и их взаимодействия с клетками.

• Описана ультраструктура многоуровневых наноконструкций (МУНК) на основе наночастиц золота (НЧЗ), несущих siРНК, и её изменения в процессе приготовления, очистки и концентрирования.
• Определены механизмы проникновения МУНК, несущих siРНК, в клетки линий HepG2, HEK293, SC-1 и HEK-FT в 2D- и 3D-клеточных системах (монослой и сфероиды).
• Выявлена зависимость структуры сфероидов от тканевого происхождения клеток.
• Определены механизмы проникновения НЧЗ, НЧЗ-БСА, НЧЗ-ПЭИ и НЧЗ-ПЭГ в клетки линий HepG2, HEK293, SC-1 и HEK-FT в 2D- и 3D-клеточных системах (монослой и сфероиды).
• Описаны изменения морфологии соломы злаковых и шелухи гречихи при механохимической обработке, изучены и описана ультраструктура чаги.
• Показана результативность и информативность электронно-микроскопического исследования механизмов действия противомикробных и противогрибковых препаратов.

Базовый проект ПФНИ ГАН

• VI.62.1.4 Интеллектуальные материалы для биомедицины. (2017-2020 гг.)
  

Гранты Российского фонда фундаментальных исследований

• № 18-34-00111 мол_а «льтраструктурные характеристики взаимодействия антимикробных пептидов с клетками патогенных для человека микроорганизмов» (2018-2019 гг.)
  
• № 18-29-08062 мк «Разработка новых подходов к созданию молекулярных биороботов на основе гибридных ДНК-РНК-наноконструкций»(2018-2021 гг.).
  

Российский научный фонд

• № 19-15-00217 «Многоуровневые транспортеры для эффективной доставки в клетки терапевтических нуклеиновых кислот с различным механизмом действия» (2019-2021гг.)
• № 22-15-00228 «Разработка метода определения состава белковой короны на липидных наночастицах при инкубации с сывороткой крови»

1. first_pagesettingsOrder Article Reprints Open AccessArticle Synthesis of Magnetic Nanoparticles Coated with Human Serum Albumin and Loaded by Doxorubicin. Petrov K.D., Ryabova E.S., Dmitrienko E.V., Chubarov A.S. Magnetochemistry. 2025. V. 11. N 2. P. 13. DOI: 10.3390/magnetochemistry11020013
2. Методы фиксации биоплёнок Staphylococcus aureus и Salmonella enterica для микроскопического исследования. Григорьева А.Е., Тупицына А.В., Бардашева А.В., Рябова Е.С., Рябчикова Е.И. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2024. Т. 177. № 2. С. 258-264. DOI: 10.47056/0365-9615-2024-177-2-258-264
3. Неагломерированные олигонуклеотид-содержащие нанокомпозиты на основе наночастиц диоксида титана. Репкова М.Н., Мазурков О.Ю., Филиппова Е.И., Мазуркова Н.А., Полетаева Ю.Е., Рябчикова Е.И., Зарытова В.Ф., Левина А.С. Биоорганическая химия. 2024. Т. 50. № 6. С. 862-870. DOI: 10.31857/S0132342324060128
4. Bacteriophage vB_SepP_134 and Endolysin LysSte_134_1 as Potential Staphylococcus-Biofilm-Removing Biological Agents. Golosova N.N., Matveev A.L., Tikunova N.V., Khlusevich Y.A., Kozlova Y.N., Morozova V.V., Babkin I.V., Ushakova T., Zhirakovskaia E.V., Panina E.A., Ryabchikova E.I., Tikunov A. Viruses. 2024. V. 16. P. 385. DOI: 10.3390/v16030385
5. Связь белков экзосом с эффективностью терморадиохимиотерапии у больных c избыточной массой тела и раком прямой кишки: пилотное проспективное когортное исследование. Юнусова Н.В., Сваровский Д.А., Коновалов А.И., Костромицкий Д.Н., Кондакова И.В., Усова А.В., Фролова И.Г., Сиденко Е.А., Какурина Г.В., Гердт Л.В., Григорьева А.Е., Старцева Ж.А. Альманах клинической медицины. 2024. Т. 52. № 2. С. 66-76. DOI: 10.18786/2072-0505-2024-52-013
6. Concentration and Composition of Circulating Adipocyte Derived Extracellular Vesicles in Patients with Colonic Polyps and Colorectal Cancer. Journal of Evolutio. Yunusova N.V., Svarovsky D.A., Kolegova E.S., Cheremisina O.V., Kostromitsky D.N., Kondakova I.V., Sidenko E.A., Dobrodeev A.Yu., Grigoryeva A.E. Ж. эвол. биохим. и физиол. 2024. V. 60. N 4. P. 1328-1335. DOI: 10.1134/S0022093024040069 перевод
7. Methods for Fixing Biofilms of Staphylococcus aureus and Salmonella enterica for Microscopic Examination. Grigoryeva A.E., Tupitsyna A.V., Bardasheva A., Ryabova E.S., Ryabchikova E.I. Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 2024. V. 177. N. 2. P. 281-286. DOI: 10.1007/s10517-024-06174-перевод
8. Study of Hard Protein Corona on Lipid Surface of Composite Nanoconstruction. Epanchintseva A.V., Baranova S.V., Poletaeva Y., Bakhno I.A., Ryabchikova E.I., Dovydenko I.S. Nanomaterials. 2024. V. 14. N 21. P. 1767. DOI: 10.3390/nano14211767
9. Концентрация и состав циркулирующих адипоцитарных везикул у больных с полипами толстой кишки и колоректальным раком. Юнусова Н.В., Сваровский Д.А., Колегова Е.С., Черемисина О.В., Костромицкий Д.Н., Кондакова И.В., Сиденко Е.А., Добродеев А.Ю., Григорьева А.Е. Ж. эвол. биохим. и физиол.. 2024. Т. 60. № 4. С. 403–410. DOI: 10.31857/S0044452924040078
10. The Photomodification Method Allows for Determining the Composition of the Full and Soft Protein Corona on the Lipid Surface of Composite Nanoparticles. Epanchintseva A.V., Baranova S.V., Poletaeva Y., Tupitsyna A.V., Ryabchikova E.I., Dovydenko I.S. Nanomaterials. 2024. V. 14. P. 1976. DOI: 10.3390/nano14231976
11. An Approach to Identifying Single-Nucleotide Mutations Using Noncovalent Associates of Gold Nanoparticles with Fluorescently Labeled Oligonucleotides. Epanchintseva A.V., Gorbunova E.A., Nekrasov M.D., Poletaeva Y., Pyshnaya I.A. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. P. 13230. DOI: 10.3390/ijms252413230
12. Attempts to preserve and visualize protein corona on the surface of biological nanoparticles in blood serum using photomodification. Poletaeva Y., Tupitsyna A.V., Grigoryeva A.E., Dovydenko I.S., Ryabchikova E.I. Beilstein Journal of Nanotechnology. 2024. V. 15. P. 1654–1666. DOI: 10.3762/bjnano.15.130
13. Non-agglomerated oligonucleotide-containing nanocomposites based on titanium dioxide nanoparticles. Repkova M.N., Mazurkov O.Yu., Filippova E.I., Mazurkova N.A., Poletaeva Y., Ryabchikova E.I., Zarytova V.F., Levina A.S.. Russ. J. Bioorganic Chem. 2024. V. 50. N 6. P. 1–10. DOI: 10.1134/S1068162024060384 перевод
14. Comparative Analysis of Tumor-Associated microRNAs and Tetraspanines from Exosomes of Plasma and Ascitic Fluids of Ovarian Cancer Patients. Yunusova N., Dzhugashvili E., Yalovaya A.I., Kolomiets L., Shefer A.A., Grigoryeva A.E., Tupikin A.E., Kondakova I., Tamkovich S.N. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 23. N 1. P. 464. DOI: 10.3390/ijms24010464
15. Chloroquine Enhances Death in Lung Adenocarcinoma A549 Cells Exposed to Cold Atmospheric Plasma Jet. Patrakova E.A., Biryukov M.M., Troitskaya O.S., Gugin P., Milakhina E., Semenov D.V., Poletaeva Y., Ryabchikova E.I., Novak D.D., Kryackova N.V., Polyakova A.A., Zhilnikova M., Zakrevsky D., Schweigert I., Koval O.A. Cells. 2023. V. 12. N 2. P. 290. DOI: 10.3390/cells12020290
16. pH-Responsible Doxorubicin-Loaded Fe3O4@CaCO3 Nanocomposites for Cancer Treatment. Popova V.K., Poletaeva Y., Chubarov A.S., Pyshnyi D.V., Dmitrienko E.V. Coatings. 2023. V. 13. N 2. C. 324. DOI: 10.3390/coatings13020324
17. pH-Responsible Doxorubicin-Loaded Fe3O4@CaCO3 Nanocomposites for Cancer Treatment. Popova V.K., Poletaeva Y., Chubarov A.S., Dmitrienko E.V. Pharmaceutics. 2023. V. 15. N 3. P. 771. DOI: 10.3390/pharmaceutics15030771
18. Nylon-6-Coated Doxorubicin-Loaded Magnetic Nanoparticles and Nanocapsules for Cancer Treatment. Bobrikova E.N., Poletaeva Y., Zheng Y, Chubarov A.S., Dmitrienko E.V.. Magnetochemistry. 2023. V. 9. N 4. P. 106. DOI: 10.3390/magnetochemistry9040106
19. Сравнительная оценка уровней опухоле-ассоциированных микроРНК экзосом плазмы крови и асцитической жидкости пациентов с раком яичников. Джугашвили Е.И., Юнусова Н.В., Яловая А.И., Григорьева А.Е., Середа Е.Е., Коломеец Л.А., Тамкович С.Н. Успехи молекулярной онкологии. 2023. Т. 2. С. 32-40. DOI: 10.17650/2313-805X-2023-10-2-108-116
20. The Composition of Small Extracellular Vesicles (sEVs) in the Blood Plasma of Colorectal Cancer Patients Reflects the Presence of Metabolic Syndrome and Correlates with Angiogenesis and the Effectiveness of Thermoradiation Therapy. Yunusova N.V., Svarovsky D.A., Konovalov A.I., Kostromitsky D.N., Startseva Z.A., Cheremisina O.V., Afanas’ev S.G., Kondakova I.V., Grigoryeva A.E., Vtorushin S.V., Sereda E., Usova A.V., Tamkovich S.N. J Pers Med. 2023. V. 13. N 4. P. 684. DOI: 10.3390/jpm13040684
21. Preparation of Magnetic Molecularly Imprinted Polymer for Methylene Blue Capture. Sedelnikova A.Y., Poletaeva Y., Golyshev V.M., Chubarov A.S., Dmitrienko E.V.. Magnetochemistry. 2023. V. 9. P. 196. DOI: 10.3390/magnetochemistry9080196
22. Isolation of Extracellular Vesicles of Holothuria (Sea Cucumber Eupentacta fraudatrix). Tupitsyna A.V., Grigoryeva A.E., Soboleva S.E., Maltseva N.A., Sedykh S.E., Poletaeva Y., Dmitrenok P.S., Ryabchikova E.I., Nevinsky G.A. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 12907. DOI: 10.3390/ijms241612907
23. Changes in the Ultrastructure of Staphylococcus aureus Cells Make It Possible to Identify and Analyze the Injuring Effects of Ciprofloxacin, Polycationic Amphiphile and Their Hybrid. Grigoryeva A.E., Bardasheva A., Ryabova E.S., Tupitsyna A.V., Zadvornykh D.A., Koroleva L.S., Silnikov V.N., Tikunova N.V., Ryabchikova E.I. Microorganisms. 2023. V. 11. P. 2192. DOI: 10.3390/microorganisms11092192
24. The Molecular Basis for Selectivity of the Cytotoxic Response of Lung Adenocarcinoma Cells to Cold Atmospheric Plasma. Biryukov M.M., Semenov D.V., Kryachkova N., Polyakova A.A., Patrakova E.A., Troitskaya O.S., Milakhina E., Poletaeva Y., Gugin P., Ryabchikova E.I., Zakrevsky D., Schweigert I., Koval O.A. Biomolecules. 2023. V. 13. P. 1672. DOI: 10.3390/biom13111672
25. Template-Assisted Assembly of Hybrid DNA/RNA Nanostructures Using Branched Oligodeoxy- and Oligoribonucleotides. Fokina A.A., Poletaeva Y., Dukova S., Klabenkova K.V., Rad’kova Z.V., Bakulina A., Zatsepin T.S., Ryabchikova E.I., Стеценко Д.А. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 21. P. 15978. DOI: 10.3390/ijms242115978
26. Fixation and Visualization of Full Protein Corona on Lipid Surface of Composite Nanoconstruction. Epanchintseva A.V., Poletaeva Y., Bakhno I.A., Белов V.V., Grigoryeva A.E., Baranova S.V., Ryabchikova E.I., Dovydenko I.S. Nanomaterials. 2023. V. 13. P. 3094. DOI: 10.3390/nano13243094
27. Оценка корреляции уровней экзосомальных опухоль-ассоциированных MIR-24 и MIR-101 в плазме крови и асцитической жидкости у пациенток с диссеминированным раком яичников. Джугашвили Е.И., Юнусова Н.В., Яловая А.И., Григорьева А.Е., Тупикин А.Е., Середа Е.Е., Коломиец Л.А. Вопросы онкологии. 2023. Т. 69. № 3S. С. 310-311. тезисы конференции

Разработаны учебные пособия для школьников:

1. Практикум по микроскопии. Строение органов и тканей млекопитающих. Новосибирск, 2019
2. Практикум по микроскопии. Строение растений. Новосибирск, 2019.
3. Практикум по микроскопии. Строение животных. Новосибирск, 2019.
4. Курс занятий «Изучаем микромир» (4 шт.). Программа практикума. Новосибирск, 2018

1. ШТАММ БАКТЕРИОФАГА Staphylococcus aureus SA20, ОБЕСПЕЧИВАЮЩИЙ РАЗРУШЕНИЕ БИОПЛЕНОК, ОБРАЗУЕМЫХ БАКТЕРИЯМИ РОДА Staphylococcus. Козлова Ю.Н., Морозова В.В., Тикунова Н.В., Рябчикова Е.И., Курильщиков А.М., Власов В.В. 2015г № 2565824
2. СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЭКЗОСОМ ИЗ КРОВИ. Тамкович С.Н., Лактионов П.П., Тутанов О.С., Рябчикова Е.И., Григорьева А.Е., Власов В.В. 2015 г. № 2556825

1. Автомат для гистологической проводки тканей “Tissue-Tek” (Sakura Finetek Inc., США); микротом для изготовления парафиновых срезов RM 2255 (Leica, ФРГ);
2. Световой микроскоп Leica DM 2500 с цифровой камерой Leica DFC420 C (Leica, Германия);
3. Микроскоп инвертированный МИБ-Р (Ломо, Россия)
4. Бокс микробиологической безопасности БМБ-II (Ламинар-С, Россия)
5. Вакуумная напылительная установка JEE-420 (Jeol, Япония);
6. Ультрамикротом для изготовления полутонких и ультратонких срезов Leica EM UC7 (Leica, ФРГ);
7. Просвечивающий электронный микроскоп высокого разрешения JEM 1400 (Джеол, Япония), снабженный встроенной цифровой камерой производителя и цифровой камерой бокового ввода Veleta (SIS, Германия).