====== Лаборатория биотехнологии ====== ===== Заведующий лабораторией ===== \\ {{:ru:structure:рихтер_в.а..jpg?nolink&200 |}} \\ **Рихтер Владимир Александрович**\\ **доктор биологических наук,**\\ г.н.с. \\ телефон: (383) 363-51-90, (383) 363-51-52\\ [[richter@niboch.nsc.ru|richter@niboch.nsc.ru]]\\ \\ ---- ===== Сотрудники ===== ^ ФИО ^ Должность ^ Звание ^ Телефон ^ Researcher ID ^ |Агеенко Алиса Борисовна |м.н.с. | 363-51-89 | [[http://www.researcherid.com/rid/AAP-4020-2020|AAP-4020-2020]] | |Амирханов Ринат Нариманович |м.н.с.|к.х.н. |363-51-89 |[[http://www.researcherid.com/rid/AAZ-9940-2020|AAZ-9940-2020]] | |Акентьев Сергей Сергеевич |лаборант | | 363-51-04 | | |Бывакина Арина Александровна |лаборант | | 363-51-04 | [[http://www.researcherid.com/rid/JOK-4515-2023|JOK-4515-2023]] | |Войтова Анна Александровна |ст. лаборант | | 363-51-89 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-9745-2018|G-9745-2018]] | |Дымова Майя Александровна | с.н.с. |к.б.н. | 363-51-89 |[[http://www.researcherid.com/rid/E-8240-2011|E-8240-2011]] | |Довженко Галина Владимировна |ст. лаборант | | 363-51-09 | | |Жильникова Мария Васильевна |ст. лаборант | | 363-51-09 | | |Зверева Софья Павловна |инженер | | | [[http://www.researcherid.com/rid/GYJ-0019-2022|GYJ-0019-2022]] | |Закабунин Александр Иванович |вед. инженер | | 363-51-06 | | |Ильичев Алексей Александрович |лаборант| |363-51-04 | | |Коваль Ольга Александровна |в.н.с. |д.б.н. | 363-51-90 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-8836-2013|G-8836-2013]] | |Крячкова Надежда Вадимовна |ст. лаборант | | 363-51-09 | | |Кулигина Елена Владимировна |с.н.с. |к.б.н. | 363-51-90 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-5565-2013|G-5565-2013]] | |Нуштаева Анна Андреевна |н.с. |к.б.н. | 363-51-09 | | |Малышева Дарья Олеговна |лаборант| | 363-51-04| | |Матвеев Леонид Эдуардович |вед. инженер | | 363-51-37 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-6226-2013|G-6226-2013]] | |Муханов Владимир Сергеевич |лаборант| | 363-51-04| | |Рахманова Марина Евгеньевна |м.н.с.| | 363-51-89 | | |Новак Диана Дмитриевна |м.н.с.| | 363-51-04 | | |Петров Глеб Олегович|ст. лаборант | |363-51-89 | | |Полякова Алина Александровна |лаборант | | | | |Рихтер Владимир Александрович |зав. лабораторией |д.б.н. | 363-51-52 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-9750-2013|G-9750-2013]] | |Романова Ирина Владимировна |вед. инженер | | 363-51-90 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-5571-2013|G-5571-2013]] | |Рябченко Александр Владимирович|вед. инженер | |363-51-04 | | |Самойленко Светлана Викторовна|инженер | | 363-51-09 | | |Семенов Дмитрий Владимирович |с.н.с., доцент |к.х.н. | 363-51-89 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-6224-2013|G-6224-2013]] | ---- ===== Основные направления исследований ===== \\ * Исследование белков и пептидов физиологических жидкостей человека, вызывающих апоптотическую гибель раковых клеток. Создание новых терапевтических средств на основе рекомбинантных аналогов проапоптотических пептидов.\\ * Исследование структуры и биологических функций внеклеточных РНК человека.\\ * Разработка эффективных методов терапии и ранней диагностики глиобластом с помощью различных подходов (виротерапия, фаготерапия, БНЗТ и пр.) ===== Технологическая деятельность ===== * Мечение органических соединений тритием.\\ * Синтез нуклеозид моно-, ди- и трифосфатов и олигонуклеотидов, меченных изотопом фосфора 32.\\ * Препаративный синтез канонических и модифицированных нуклеозидтрифосфатов.\\ ---- ===== Важнейшие научные результаты ===== \\ * Выделен и охарактеризован белок молока человека (лактаптин), вызывающий апоптотическую гибель раковых клеток аденокарциномы молочной железы человека MCF-7. [Некипелая В.В. и др., Докл. АН. 2008. 419(2), 268; Патент РФ № 2317304, 2008 г]. \\ * Получены, наработаны и охарактеризованы генно-инженерные аналоги лактаптина в прокариотических системах. Показано специфическое проапоптотическое действие аналога лактаптина RL2 на раковые клетки человека в культуре и на первичные клетки опухоли молочной железы человека. [Semenov D.V. et al., The Protein Journal. 2010. 29(3), 174; Патент РФ № 2401307, 2010 г; Фомин А.С. и др., Биоорганическая химия. 2012. 38(1), 1]. * Разработан способ лечения метастазирующих злокачественных заболеваний животных рекомбинантным аналогом лактаптина RL2. [Koval O.A., Biochimie. 2012. 94(12), 2467; Патент РФ № 2461566, 2012 г]. * Закончены доклинические испытания противоопухолевого лекарственного средства на основе рекомбинантного аналога лактаптина RL2. * Проведен анализ многообразия малых некодирующих РНК плазмы крови здоровых доноров и пациентов с немелкоклеточным раком легкого методом высокопроизводительного параллельного секвенирования на платформе SOLiD. Охарактеризованы изменения внеклеточного транскриптома человека при образовании злокачественных опухолей. [Semenov et al., Expert Opin. Biol. Ther. 2012. 12 (1), 43]. * Сконструированы и синтезированы искусственные аналоги U24 C/D бокс мяоРНК, направленные на нуклеотиды 28S и 18S рРНК человека, пре-мРНК и зрелой мРНК белка теплового шока hsc70 (ген HSPA8). Трансфекция клеток человека аналогами C/D бокс РНК, направленными на нуклеотиды пре-мРНК hsc70, вызывает частичное нарушение сплайсинга пре-мРНК гена HSPA8 и снижает уровень мРНК-мишени. Трансфекция аналогами C/D бокс РНК, направленными на нуклеотиды 18S и 28S рРНК, ключевые для функционирования рибосом, вызывает снижение жизнеспособности клеток человека в культуре. [Степанов Г.А. и др., Acta Naturaе. 2012. 4(1), 26; Stepanov G.A. et al., BioMed Research International. 2013:656158]. * Синтезированы аналоги Alu-РНК и малой цитоплазматической 7SL РНК человека. Установлено, что трансфекция клеток аденокарциномы молочной железы человека MCF-7 аналогами Alu-РНК и 7SL РНК сопровождается снижением жизнеспособности и индукцией проапоптотических изменений в этих клетках. Индукция проапоптотических изменений клеток человека под действием аналогов Alu-РНК и 7SL РНК связана с активацией транскрипции генов факторов клеточного стресса, в том числе, факторов ответа на стресс эндоплазматического ретикулума. [Барякин Д.Н. и др. Acta Naturae. 2012. 5(4). С. 92-103.] ---- ===== Текущие гранты ===== \\ **Базовые проекты** **Программа фундаментальных научных исследований государственных академий наук (2017 - 2020 гг.)** * № ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.62.1.5, 0309-2016-0003. «Синтетическая биология: разработка средств манипуляции генетическим материалом и создание перспективных препаратов для терапии и диагностики». * № ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.62.1.3, 0309-2016-0005. «Терапевтические нуклеиновые кислоты». * ГЗ № 0309-2018-0015 КП ФНИ СО РАН II.1 Блок: Изменения траснкриптома крови при раке щитовидной железы. Проект: «Молекулярная характеристика опухолевых новообразований щитовидной железы человека. Прогноз и выбор адекватного лечения». (2018-2020 гг.)\\ **Гранты Российского научного фонда**\\ * № _DST 19-44-02006 "Таргетная доставка новых ингибиторов P21 активированной киназы 1 (Pak1) в агрессивные клетки глиобластомы путем конъюгации с опухолеспецифическими пептидами, отобранными из фаговой пептидной библиотеки" (2019-2021 гг.) * № 21-14-00195 «Молекулярные механизмы терапевтического действия онколитического вируса осповакцины на злокачественные опухоли головного мозга» * № 20-74-10039 «Органоидоподобные 3D-модели рака молочной железы, состоящие из опухолевых, стромальных и иммунных клеток» * № 22-64-00041 «Аптамеры как инструменты повышения противоопухолевой эффективности онколитического вируса VV-GMCSF-Lact для терапии злокачественных опухолей головного мозга» **Гранты Российского фонда фундаментальных исследований**\\ * № 19-34-90134 Аспиранты "Усиление противоопухолевого иммунного ответа под воздействием препаратов на основе лактаптина в комбинации с ингибиторами ферментов деградации аминокислот" (2019-2021 гг.) ---- [[http://www.niboch.nsc.ru/doku.php/ru/science/grants/gk|Отчеты по проектам МинОбрНауки России]] \\ ===== Публикации 2021-2023 года ===== \\ - Transcriptome Changes in Glioma Cells upon Infection with the Oncolytic Virus VV-GMCSF-Lact. Semenov D.V., Vasileva N.S., Dymova M.A., Mishinov S.V., Savinovskaya Y.I., Ageenko A.B., Dome A.S., Zinchenko N.D., Stepanov G.A., Kochneva G.V., Richter V.A., Kuligina E.V. Cells. 2023. V. 12. P. 2616. DOI: 10.3390/cells12222616 - The Molecular Basis for Selectivity of the Cytotoxic Response of Lung Adenocarcinoma Cells to Cold Atmospheric Plasma. Biryukov M.M., Semenov D.V., Kryachkova N., Polyakova A., Patrakova E.A., Troitskaya O.S., Milakhina E., Poletaeva Y., Gugin P., Ryabchikova E.I., Zakrevsky D., Schweigert I., Koval O.A. Biomolecules. 2023. V. 13. P. 1672. DOI: 10.3390/biom13111672 - Аптамеры для диагностики и лечения глиальных опухолей человека. Замай Т.Н., Дымова М.А., Народов А.А., Кошманова А.А., Грек Д.С., Воронковский И.И., Горбушин А.К., Кичкайло А.С., Кулигина Е.В., Рихтер В.А., Зуков Р.А. Сибирский онкологический журнал. 2023. T. 22. № 5. С. 105–117. DOI: 10.21294/1814-4861-2023-22-5-105-117 - Противоопухолевый препарат на основе генно-модифицированного вируса осповакцины VV-GMCSF-LACT. Кулигина Е.В., Рихтер В.А., Власов В.В. Вестник РАН. 2023. T. 93. № 9. С. 855-864. DOI: 10.31857/S0869587323090098 - Получение высокоселективных аптамеров к онколитическому вирусу VV-GMCSF-Lact. Теоретические и экспериментальные подходы. Дымова М.А., Кулигина Е.В., Рихтер В.А., Артюшенко П.В., Рогова А.В., Щугорева И.А., Томилин Ф.Н., Кичкайло А.С., Замай Т.Н. Сибирское медицинское обозрение. 2023. № 5. С. 95-101. DOI: 10.20333/25000136-2023-5-95-101 - Подавление EGFR ингибирует сферообразование клеток культуры MCF7 со сверхэкспрессией EGFR. Новак Д.Д., Троицкая О.С., Нуштаева А.А., Жильникова М.В., Рихтер В.А., Мещанинова М.И., Коваль О.А. Acta Naturae. 2023. Т. 15. № 2 (57). С. 60-69. DOI: 10.32607/actanaturae.17857 - Cytotoxic Activity of a Cold Atmospheric Plasma Jet in Relation to a 3D Cell Model of Human Breast Cancer. Patrakova E.A., Biryukov M.M., Troitskaya O.S., Novak D.D., Milakhina E.V., Gugin P.P., Zakrevsky D.E., Schweigert I.V., Koval O.A. Cell and Tissue Biology. 2023. V. 17. P. 233–246. DOI: 10.1134/S1990519X23030094. //перевод // - Характеристики холодной плазменной струи при возбуждении синусоидальным и положительным импульсным напряжениями для медицинских приложений. Швейгерт И.В., Закревский Д.Э., Милахина Е.В., Гугин П.П. , Бирюков М.М. , Патракова Е.А. , Троицкая О.С. , Коваль О.А. Физика плазмы. 2023. Т.49. №5. С.447-453. DOI: 10.31857/S0367292122601400 - Characteristics of Cold Atmospheric Plasma Jet when Excited by Sinusoidal and Positive Pulse Voltages for Medical Applications. Schweigert I.V., Zakrevsky D.E., Milakhina E.V., Gugin P.P., Biryukov M.M., Patrakova E.A., Troitskaya O.S., Koval O.A. Plasma Physics Reports. 2023. V. 49. N 5. P. 595–601. DOI: 10.1134/S1063780X2360010X //(перевод)// - Development of DNA Aptamers for Visualization of Glial Brain Tumors and Detection of Circulating Tumor Cells. Narodov A.A., Komarova M.A., Zamay T.N., Zamay G.S., Kolovskaya O.S., Erakhtin E.E., Glazyrin Y.E., Veprintsev D.V., Moryachkov R.V., Zabluda V.V., Shchugoreva I.A., Artyushenko P.V., Mironov V.A., Morozov D.I., Khorzhevskii V.A., Gorbushin A.V., Koshmanova A.A., Nikolaeva E.D., Grinev I.P., Voronkovskii I.I., Grek D.S., Belugin K.V., Volzhentsev A.A., Badmaev O.N., Luzan N., Lukyanenko K.A., Peters G., Lapin I.N., Kirichenko A.K., Konarev P.V., Morozov E.V., Mironov G.G., Gargaun A., Muharemagic D., Zamay S.S., Kochkina E.V., Dymova M.A., Smolyarova T.E., Sokolov A.E., Modestov A.A., Tokarev N.A., Shepelevich N., Ozerskaya A.V., Chanchikova N.G., Krat A.V., Zukov R.A., Bakhtina V.I., Shnyakin P.G., Shesternya P.A., Svetlichnyi V.A., Petrova M.M., Artyukhov I.P., Tomilin F.N., Berezovski M.V. Kichkailo A.S. Mol Ther Nucleic Acids. 2023. V. 32. P. 267-288. DOI: 10.1016/j.omtn.2023.03.015 - Design of the New Closo-Dodecarborate-Containing Gemcitabine Analogue for the Albumin-Based Theranostics Composition. Raskolupova V.I., Wang M., Dymova M.A., Petrov G.O., Shchudlo I., Taskaev S.Y., Abramova T.V., Godovikova T.S., Silnikov V.N., Popova T.V. Molecules. 2023. V. 28. P. 2672. DOI: 10.3390/molecules28062672 - Цитотоксическая активность атмосферной холодной плазменной струи в отношении 3D-клеточной модели рака молочной железы человека. Патракова Е.А., Бирюков М.М., Троицкая О.С., Новак Д.Д., Милахина Е.В., Гугин П.П., Закревский Д.Э., Швейгерт И.В., Коваль О.А. Цитология.2023. Т.65. № 1. С. 398-53. DOI: 10.31857/S004137712301008X - Transcriptomic Analysis of CRISPR/Cas9-Mediated PARP1-Knockout Cells under the Influence of Topotecan and TDP1 Inhibitor. Dyrkheeva N.S., Malakhova A.A., Zakharenko A.L., Okorokova L.S., Shtokalo D.N., Pavlova S.V., Medvedev S.P., Zakiyan S.M., Nushtaeva A.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Khodyreva S.N., Luzina O.A., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 6. P. 5148. DOI: 10.3390/ijms24065148 - Aptamers Enhance Oncolytic Viruses’ Antitumor Efficacy. Dymova M.A., Kichkailo A.S., Kuligina E.V., Richter V.A. Pharmaceutics. 2023. V. 15. N 1. P. 151. DOI: 10.3390/pharmaceutics15010151 - “Pulsed Hypoxia” Gradually Reprograms Breast Cancer Fibroblasts into Pro-Tumorigenic Cells via Mesenchymal–Epithelial Transition. Nushtaeva A.A., Ermakov M., Abdurakhmanova M.M., Troitskaya O.S., Belovezhets T.N., Varlamov M., Gayner T.A., Richter V.A., Koval O.A. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 3. P. 2494. DOI: 10.3390/ijms24032494 - Aptamers for Addressed Boron Delivery in BNCT: Effect of Boron Cluster Attachment Site on Functional Activity Novopashina D.S., Dymova M.A., Davydova A.S., Meschaninova M.I., Malysheva D.O., Kuligina E.V., Richter V.A., Kolesnikov V.A., Taskaev S.Y., Vorobyeva M.A. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 306. DOI: 10.3390/ijms24010306 - Chloroquine Enhances Death in Lung Adenocarcinoma A549 Cells Exposed to Cold Atmospheric Plasma Jet Patrakova E.A., Biryukov M.M., Troitskaya O.S., Gugin P., Milakhina E., Semenov D.V., Poletaeva Y., Ryabchikova E.I., Novak D.D., Kryachkova N., Polyakova A., Zhilnikova M., Zakrevsky D., Schweigert I., Koval O.A. Cells. 2023. V. 12 N 2 P. 290. DOI: 10.3390/cells12020290 - Опухоль-ассоциированные фибробласты и их роль в опухолевой прогреcсии Ермаков М.С., Нуштаева А.А., Рихтер В.А., Коваль О.А. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2022. Т. 26 № 1 С. 14-21. DOI: 10.18699/VJGB-22-03 - Иммуногенная гибель опухолевых клеток в терапии онкологических заболеваний Троицкая О.С., Новак Д.Д., Рихтер В.А., Коваль О.А. Acta Naturae. 2022. Т. 14 № 1 С. 40-53. DOI: 10.32607/actanaturae.11523 - CRISPR-Cas9 mediated knockout of AnxA6 gene enhances influenza A virus replication in low-permissive HEK293FT cell line Komissarov A.B., Sergeeva M.V., Zhuravlev E.S., Medvedev S.P., Malakhova A.A., Andreeva E., Shurygina A.-P., Gorshkov A., Timofeeva M., Balahonova E.A., Grudinin M., Zakiyan S.M., Richter V.A., Stepanov G.A. Gene. 2022. V. 809. P. 146024. DOI: 10.1016/j.gene.2021.146024 - A grounded electrode beneath dielectric targets, including cancer cells, enhances the impact of cold atmospheric plasma jet Schweigert I., Zakrevsky D., Milakhina E., Gugin P., Biryukov M.M., Patrakova E.A., Koval O.A. Plasma Phys. Control. Fusion. 2022. V. 64. N 4. P. 044015. DOI: 10.1088/1361-6587/ac53f1 - Biochemical and technological propertiesof moose (alces alces) recombinant chymosin Balabova D.V., Rudometov A.P., Belenkaya S.V., Belov A.N., Koval A.D., Bondar A.A., Bakulina A.Yu., Rukhlova E.A., Elchaninov V.V., Shcherbakov D.N. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2022.. Т. 26 № 3. С. 240-249. - Activated Carbon for Drug Delivery from Composite Biomaterials: The Effect of Grinding on Sirolimus Binding and Release Nazarkina Z.K., Savostyanova T.A., Chelobanov B.P., Romanova I.V., Simonov P.A., Kvon R.I., Karpenko A.A., Laktionov P.P. Pharmaceuticals. 2022. V. 14. N 7. P. 1386. DOI: 10.3390/pharmaceutics14071386 - Клетки рака молочной железы изменяют чувствительность к гормональным и ростовым стимулам при 3D-культивировании Нуштаева А.А., Савинкова М.М., Ермаков М.С., Варламов М.Е., Новак Д.Д., Рихтер В.А., Коваль О.А. Цитология. 2022. Т. 64. № 4. С. 353–365. DOI: 10.31857/S0041377122040046 - Post‐Transcriptional Modifications of RNA as Regulators of Apoptosis in Glioblastoma Dome A.S., Dymova M.A., Richter V.A., Stepanov G.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 9272. DOI: 10.3390/ijms23169272 - Сигнальные пути, определяющие эффективность терапии глиобластомы вирусом осповакцины Васильева Н.С., Агеенко А.Б., Рихтер В.А., Кулигина Е.В. Acta Naturae. 2022. Т. 14. № 2. С. 62-70. DOI: 10.32607/actanaturae.11623 - Immunogenic Cell Death in Cancer Therapy Troitskaya O.S., Novak D.D., Richter V.A., Koval O.A. Acta Naturae. 2022. V. 14. N 1. P. 40 – 53. DOI: 10.32607/actanaturae.11523 - Immunological Effects of Cold Atmospheric Plasma-Treated Cells in Comparison with Those of Cells Treated with Lactaptin-Based Anticancer Drugs Troitskaya O.S., Novak D.D., Varlamov M., Biryukov M.M., Nushtaeva A.A., Kochneva G.V., Zakrevsky D., Schweigert I., Richter V.A., Koval O.A. Biophysica. 2022. V. 2. N 3. P. 266-280. DOI: 10.3390/biophysica2030025 **(перевод)** - Transcriptome Changes in Glioma Cells Cultivated under Conditions of Neurosphere Formation Vasileva N.S., Kuligina E.V., Dymova M.A., Savinovskaya Y.I., Zinchenko N.D., Ageenko A.B., Mishinov S.V., Dome A.S., Stepanov G.A., Richter V.A., Semenov D.V. Cells. 2022. V. 11. P. 3106. DOI: 10.3390/cells11193106 - Stability of ZIF-8 nanoparticles in most common cell culture media Spitsyna A.S., Poryvaev A.S., Sannikova N.E., Yazikova A.A., Fedin M.V., Krumkacheva O.A., Kirilyuk I.A., Dobrynin S.A., Chinak O.A. Molecules. 2022. V. 27. N 10. P. 3240. DOI: 10.3390/molecules27103240 - MicroRNA and mRNA Expression Changes in Glioblastoma Cells Cultivated under Conditions of Neurosphere Formation Dymova M.A., Vasileva N.S., Kuligina E.V., Savinovskaya Y.I., Zinchenko N.D., Ageenko A.B., Mishinov S.V., Stepanov G.A., Richter V.A. Curr. Issues Mol. Biol. 2022. V. 44. N 11. P. 5294-5311. DOI: 10.3390/cimb44110360 - Роль ингибитора апоптоза XIAP в устойчивости клеток глиобластомы к действию рекомбинантного вируса осповакцины VV-GMCSF-LACT Васильева Н.С., Агеенко А.Б., Чинак О.А., Рихтер В.А., Кулигина Е.В. Биотехнология. 2022. Т. 38. № 5. С. 73-79. DOI: 10.56304/S0234275822050155 - Analysis of Expression Pattern of snoRNAs in Human Cells A549 Infected by Influenza A Virus Zhuravlev E.S., Sergeeva M.V., Malanin S., Amirkhanov R.N., Semenov D.V., Grigoryeva T., Komissarov A.B., Stepanov G.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 13666. DOI: 10.3390/ijms232213666 - Inactivation and Degradation of Influenza A Virus on the Surface of Photoactive Self-Cleaning Cotton Fabric Functionalized with Nanocrystalline TiO2 Selishchev D., Stepanov G.A., Sergeeva M.V., Solovyeva M., Zhuravlev E.S., Komissarov A.B., Richter V.A., Kozlov D. Catalysts. 2022. V. 12. P. 1298. DOI: 10.3390/catal12111298 - Исследование взаимодействия холодной плазмы со сфероидами, сформированными клетками человека Бирюков М.М., Патракова Е.А., Коваль О.А., Милахина Е.В., Закревский Д.Э., Швейгерт И.В. Цитология. 2022 Т. 64. N 7. С. 665-666. DOI: 10.31857/S004137712207001X **(тезисы конференции)** - Bacteriophage-Mediated Cancer Gene Therapy Petrov G.O., Dymova M.A., Richter V.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 14245. DOI: 10.3390/ijms232214245 - Oligonucleotide aptamers as novel cell-specific delivery agents for boron neutron capture therapy Vorobyeva M.A., Dymova M.A., Novopashina D.S., Kuligina E.V., Kolesnikov I.A., Taskaev S.Y., Richter V.A., Meschaninova M.I. Сибирское медицинское обозрение. 2022. V. 2022. N 5. P. 108. DOI: 10.20333/25000136-2022-5-108 **(тезисы конференции)** - Оптимизация параметров холодной плазменной струи при возбуждении синусоидальным напряжением для эффективного подавления жизнеспособности раковых клеток Гугин П.П., Закревский Д.Э., Милахина Е.В., Бирюков М.М., Коваль О.А., Патракова Е.А., Швейгерт И.В. Медицинская техника 2022. № 6. С. 26-29. - Breast cancer cells in 3D model alters their sensitivity to hormonal and growth factors Nushtaeva A.A., Savinkova M.M., Ermakov M., Varlamov M., Novak D.D., Richter V.A., Koval O.A. Cell and Tissue Biology. 2022. V. 16. N 6. P. 555–567. DOI: 10.1134/S1990519X22060050 **(перевод)** - Effect of voltage pulse duration on electrophysical and thermalcharacteristics of cold atmospheric plasma jet Schweigert I.V., Zakrevsky D.E., Gugin P.P., Milakhina E.V., Biryukov M.M., Keidar M., Koval O.A. Plasma Sources Science and Technology. 2022. V. 31. N 11. P. 114004. DOI: 10.1088/1361-6595/aca120 - Aptamer-based RNA-bio-drugs for the combined therapy of GBM Ibba M.L., Ciccone G., Condorelli G., Franciscis V., Catuogno S., Moryachkov R.V., Morozov E.V., Kuligina E.V., Esposito C.L. Сибирское медицинское обозрение. 2022. V. 2022. N 5 P. 114. DOI: 10.20333/25000136-2022-5-114 **(тезисы конференции)** - Клеточная линия увеальной меланомы для моделирования метастатических поражений центральной нервной системы Коваль О.А., Нуштаева А.А., Бирюков М.М., Троицкая О.С., Новак Д.Д., Гайнер Т.А., Милахина Е.В., Закревский Д.Э., Атаманов В.В., Кононова Н.В., Соболева М.Е., Мун В.Р., Черных В.В., Швейгерт И.В. Гены и клетки. 2022. Том XVII. № 3. С. 113. **(тезисы конференции)** - Human Blood Extracellular Vesicles Activate Transcription of NF-kB-Dependent Genes in A549 Lung Adenocarcinoma Cells Savinovskaya Y.I., Nushtaeva A.A., Savelyeva A.V., Morozov V.V., Ryabchikova E.I., Kuligina E.V., Richter V.A., Semenov D.V. Curr. Issues Mol. Biol. 2022. V. 44. P. 6028–6045. DOI: 10.3390/cimb44120411 - Uncovering molecular mechanisms of regulated cell death in the naked mole rat Evdokimov A.N., Popov A.A., Ryabchikova E.I., Koval O.A., Romanenko S., Trifanov V.A., Petruseva I.O., Lavrik I.N., Lavrik O.I. Aging-US. 2021. V. 13. N 3. P. 3239-3253. DOI: 10.18632/aging.202577 - Изучение свойств рекомбинантной эндонуклеазы IV Mycobacterium tuberculosis Дымова М.А., Ендуткин А.В., Полуновский В.В., Закабунин А.И., Храпов Е.А., Торгашева Н.А., Юдкина А.В., Мечетин Г.В., Филипенко М.Л., Жарков Д.О. Молекулярная биология. 2021. Т. 55. № 2. С. 258–268. DOI: 10.31857/S002689842102004X - Interplay between mitophagy and apoptosis defines a cell fate upon co-treatment of breast cancer cells with a recombinant fragment of human κ-Casein and TRAIL Wohlfromm F., Richter M., Otrin L., Seyrek K., Vidakovic-Koch T., Kuligina E.V., Richter V.A., Koval O.A., Lavrik I.N. Front. Cell Dev Biol. 2021. V. 8. P. 617762. DOI: 10.3389/fcell.2020.617762 - Method of measuring high-LET particles dose Dymova M.A., Dmitrieva M.D., Kuligina E.V., Richter V.A., Savinov S., Shchudlo I., Sycheva T., Taskaeva L., Taskaev S. Radiation Research. 2021. V. 196. P. 192–196. DOI: 10.1667/RADE-21-00015.1 - Clinical Evaluation of P21 Activated Kinase 1 (PAK1) Activation in Gliomas and its Effect on Cell Proliferation Akkanapally V., Archana B., Veena Kumari V., Rahul K., Sowmiya M., Lawrence D., Ganesh K., Prathiba D., Dymova M.A., Suresh K.R., Ganesh V. Cancer Investigation. 2021. V. 39. N 1. P. 98-113. DOI: 10.1080/07357907.2020.1858097 - Influence of PTX-eluting electrospun produced stent coating elongation on PTX release and PTX transport through arterial wall after stenting Nazarkina Z.K., Chelobanov B.P., Kuznetsov K.A., Shutov A.V., Romanova I.V., Karpenko A.A., Laktionov P.P. Polymers (Basel). 2021. V. 13. N 7. P. 1165. DOI: 10.3390/polym13071165 - Characterization of recombinant endonuclease IV from Mycobacterium tuberculosis Dymova M.A., Endutkin A.V., Polunovsky V.V., Zakabunin A.I., Khrapov E.A., Torgasheva N.A., Yudkina A.V., Mechetin G.V., Filipenko M.L., Zharkov D.O. Молекулярная биология. 2021. V. 55. N 2. P. 225-233. DOI: 10.1134/S0026893321020059 **(перевод)** - Molecular Mechanisms of Drug Resistance in Glioblastoma Dymova M.A., Kuligina E.V., Richter V.A. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. P. 6385. DOI: 10.3390/ijms22126385 - Tumor Cell-Specific 2′-Fluoro RNA Aptamer Conjugated with Closo-Dodecaborate as A Potential Agent for Boron Neutron Capture Therapy Vorobyeva M.A., Dymova M.A., Novopashina D.S., Kuligina E.V., Timoshenko V.V., Kolesnikov I.A., Taskaev S.Y., Richter V.A., Venyaminova A.G. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. N 14. P. 7326. DOI: 10.3390/ijms22147326 - In silico analysis of amino acid sequences of glioblastoma homing peptides Dymova M.A., Dmitrieva M.D., Kuligina E.V., Richter V.A. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 263. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 - Guest Leakage from ZIF-8 Particles under Drug Delivery Conditions: Quantitative Characterization and Guest-Induced Framework Stabilization Poryvaev A.S., Yazikova A.A., Polyukhov D.M., Chinak O.A., Richter V.A., Krumkacheva O.A., Fedin M.V. J. Phys. Chem. C. 2021. V. 125. N 28. P. 15606 – 15613. DOI: 10.1021/acs.jpcc.1c03876 - Effects of cold atmospheric plasma on cancer and normal cells in vitro Patrakova E.A., Troitskaya O.S., Biryukov M.M., Zakrevsky D., Schweigert I., Richter V.A., Koval O.A. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 299. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 **(тезисы конференции)** - Anticancer peptide RL2 – a promising tool for intracellular delivery of therapeutics and diagnostic molecules Chinak O.A., Patrakova E.A., Ovcherenko S., Shernyukov A., Koval O.A., Kuligina E.V., Bagryanskaya E.G., Richter V.A. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 299-300. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 **(тезисы конференции)** - IDO inhibitors increase the antitumor immunity of ICD-dying cells Troitskaya O.S., Varlamov M., Kuligina E.V., Richter V.A., Koval O.A. Febs Open Bio 2021 V. 11 S. 1 P. 401-402 DOI: 10.1002/2211-5463.13205 **(тезисы конференции)** - Tumor stem cells could promote glioblastoma sensitivity to oncolytic virus Vasileva N.S., Ageenko A.B., Dmitrieva M.D., Richter V.A., Kuligina E.V. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 410. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 **(тезисы конференции)** - Comparative Analysis of the Efficiency of the Binding of Phage Particles Displaying Tumor-Targeting Peptides to Cancer and Healthy Brain Cells Dymova M.A., Voitova A., Dmitrieva M.D., Richter V.A., Kuligina E.V. Applied biochem. and microbiol. 2021. V. 57. N 9. P. 25–30. DOI: 10.1134/S0003683821090027 - Modification of a Tumor-Targeting Bacteriophage for Potential Diagnostic Applications Dymova M.A., Utkin Y.A., Dmitrieva M.D., Kuligina E.V., Richter V.A. Molecules. 2021.. V. 26. P. 6564. DOI: 10.3390/molecules26216564 - Homocystamide Conjugates of Human Serum Albumin as a Platform to Prepare Bimodal Multidrug Delivery Systems for Boron Neutron Capture Therapy Popova T.V., Dymova M.A., Koroleva L.S., Zakharova O., Lisitskiy V.A., Raskolupova V.I., Sycheva T., Taskaev S., Silnikov V.N., Godovikova T.S. Molecules. 2021. V. 26. P. 6537. DOI: 10.3390/molecules26216537 - Double Recombinant Vaccinia Virus: A Candidate Drug against Human Glioblastoma Vasileva N.S., Ageenko A.B., Dmitrieva M.D., Nushtaeva A.A., Mishinov S., Kochneva G.V., Richter V.A., Kuligina E.V. Life-Basel. 2021. V. 11. P. 1084. DOI: 10.3390/life11101084 - Uptake of Cell-Penetrating Peptide RL2 by Human Lung Cancer Cells: Monitoring by Electron Paramagnetic Resonance and Confocal Laser Scanning Microscopy Ovcherenko S.S., Chinak O.A., Chechushkov A.V., Dobrynin S., Kirilyuk I.A., Babaylova E.S., Richter V.A., Bagryanskaya E.G. Molecules. 2021. V. 26. N 18. P. 5442. DOI: 10.3390/molecules26185442 - EGFR Transgene Stimulates Spontaneous Formation of MCF7 Breast Cancer Cells Spheroids with Partly Loss of HER3 Receptor Troitskaya O.S., Novak D.D., Nushtaeva A.A., Savinkova M.M., Varlamov M., Ermakov M., Richter V.A., Koval O.A. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. N 23. P. 12937. DOI: 10.3390/ijms222312937 - Modulation of long non-coding RNA Gas5 splicing using CRISPR/Cas9 editing of small nucleolar RNA genes Matveeva A.M., Vinogradov D.I., Zhuravlev E.S., Semenov D.V., Vlassov V.V., Stepanov G.A. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 32. DOI: 10.1002/2211-5463.13206 **(тезисы конференции)** - Mismatch of frequencies of ac voltage and streamers propagation in cold atmospheric plasma jet for typical regimes of cancer cell treatment Schweigert I., Alexandrova A., Zakrevsky D., Milakhina E., Gugin P., Biryukov M.M., Patrakova E.A., Koval O.A. J. Phys.: Conf. Ser. 2021. V. 2100. N 012020. P. 1-7. DOI: 10.1088/1742-6596/2100/1/012020 - The autophagy contribution into the cells killing by cold atmospheric plasma irradiation Patrakova E.A., Biryukov M.M., Schweigert I., Zakrevsky D., Troitskaya O.S., Gugin P., Milakhina E., Koval O.A. Cell Death Discovery. 2021 V. 7 S. 1 С. 10-11. **(тезисы конференции)** ---- \\ ===== Патенты ===== \\ - **РЕКОМБИНАНТНЫЙ ПЕПТИД EL1, ОБЛАДАЮЩИЙ ЦИТОТОКСИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ ЧЕЛОВЕКА**. Коваль О.А., Волкова О.Ю., Горчаков А.А., Кулемзин С.В., Ткаченко А.В., Нуштаева А.А., Кулигина Е.В., Рихтер В.А., Таранин А.В. 2017 г. № 2683221 - **"РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pFK3, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ РЕКОМБИНАНТНОГО ПЕПТИДА RL3, ЯВЛЯЮЩЕГОСЯ АНАЛОГОМ ФРАГМЕНТА КАППА-КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ БАКТЕРИЙ Escherichia coli ХL1- Blue/pFK3 И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ПЕПТИД RL3 - АНАЛОГ ФРАГМЕНТА КАППА- КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, ОБЛАДАЮЩИЙ АПОПТОТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ"**. Международный патент (Евразийское патентное ведомство) Потапенко М.О., Савельева А.В., Фомин А.С., Трошкова Г.П., Коваль О.А., Кулигина Е.В., Семенов Д.В., Рихтер В.А. 2016 г. №23387.\\ - **"РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pFK4, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ РЕКОМБИНАНТНОГО ПЕПТИДА RL4, ЯВЛЯЮЩЕГОСЯ АНАЛОГОМ ФРАГМЕНТА КАППА-КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI XL1-BLUE/pFK4 И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ПЕПТИД RL4 - АНАЛОГ ФРАГМЕНТА КАППА-КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, ОБЛАДАЮЩИЙ АПОПТОТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ".** Международный патент (Евразийское патентное ведомство) Потапенко М.О., Савельева А.В., Фомин А.С., Трошкова Г.П., Коваль О.А., Кулигина Е.В., Семенов Д.В., Рихтер В.А. 2016 № 23475.\\ - **РЕКОМБИНАНТНЫЙ ШТАММ VV-GMCSF/LACT-DGF ВИРУСА ОСПОВАКЦИНЫ, ОБЛАДАЮЩИЙ ОНКОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ И ПРОДУЦИРУЮЩИЙ СЕКРЕТИРУЕМЫЙ ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК, СОСТОЯЩИЙ ИЗ ГРАНУЛОЦИТАРНО-МАКРОФАГАЛЬНОГО КОЛОНИЕСТИМУЛИРУЮЩЕГО ФАКТОРА ЧЕЛОВЕКА И ОНКОТОКСИЧЕСКОГО БЕЛКА ЛАКТАПТИНА** (Согл. 14.604.21.0057, рук. Рихтер В.А.) Кочнева Г.В., Сиволобова Г.Ф., Лупан Т.А., Гражданцева А.А., Ткачёва А.В., Кулигина Е.В., Коваль О.А., Рихтер В.А. 2016 г. № 2630672 - **РЕКОМБИНАНТНЫЙШТАММVV-GMCSF-LactВИРУСАОСПОВАКЦИНЫ,ОБЛАДАЮЩИЙ ОНКОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ И ПРОДУЦИРУЮЩИЙ ГРАНУЛОЦИТАРНО- МАКРОФАГАЛЬНЫЙ КОЛОНИЕСТИМУЛИРУЮЩИЙ ФАКТОР ЧЕЛОВЕКА И ОНКОТОКСИЧЕСКИЙ БЕЛОК ЛАКТАПТИН**. Кочнева Г.В., Сиволобова Г.Ф., Лупан Т.А., Гражданцева А.А., Ткачёва А.В., Кулигина Е.В., Коваль О.А., Рихтер В.А. 2016 № 2604187.\\ - **"ОПУХОЛЬ-СПЕЦИФИЧЕСКИЙ ПЕПТИД ДЛЯ АДРЕСНОЙ ХИМИОТЕРАПИИ ОПУХОЛЕЙ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ЧЕЛОВЕКА"** Немудрая А.А., Кулигина Е.В., Макарцова А.А., Коваль О.А., Рихтер В.А. 2016 № 2595404.\\ - **"РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCLm4/hygro-14D5, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД СО СВОЙСТВАМИ ЛЕГКОЙ ЦЕПИ ХИМЕРНОГО АНТИТЕЛА ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, И РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCHm2-14D5, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД СО СВОЙСТВАМИ ТЯЖЕЛОЙ ЦЕПИ ХИМЕРНОГО АНТИТЕЛА ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ХИМЕРНОЕ АНТИТЕЛО, ОБЕСПЕЧИВАЮЩЕЕ ЭКСТРЕННУЮ ПРОФИЛАКТИКУ КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА У МЫШЕЙ.**" Тикунова Н.В., Байков И.К., Матвеев А.Л., Бабкина И.Н., Матвеев Л.Э., Рихтер В.А. 2015 № 2550252.\\ - **"ХИМЕРНОЕ АНТИТЕЛО ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА"**. "Ноу-хау" (Секрет-производства). Тикунова Н.В., Трошкова Г.П., Матвеев А.Л., Байков И.К., Хлусевич Я.А. 2014.\\ - **"СПОСОБ ЛЕЧЕНИЯ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕЙ У МЛЕКОПИТАЮЩИХ"**. Коваль О.А., Каледин В.И., Кулигина Е.В., Семенов Д.В., Фомин А.С., Потапенко М.О., Рихтер В.А. 2012 № 2461566.\\ - **"РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pFK2, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ РЕКОМБИНАНТНОГО ПЕПТИДА, ЯВЛЯЮЩЕГОСЯ АНАЛОГОМ ФРАГМЕНТА КАППА-КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ПЕПТИДА И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ПЕПТИД, АНАЛОГ ФРАГМЕНТА КАППА-КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, ОБЛАДАЮЩИЙ АПОПТОТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ.**" Тикунова Н.В., Семенов Д.В., Бабкина И.Н., Кулигина Е.В., Коваль О.А., Фомин А.С., Матвеева В.А., Матвеев А.Л., Матвеев Л.Э., Рихтер В.А. 2010 № 2401307.\\ - **"ШТАММ ГИБРИДНЫХ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ КЛЕТОК ЖИВОТНЫХ Mus. Musculus, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА, СПЕЦИФИЧНЫЕ К ПЕПТИДУ, ОБЛАДАЮЩЕМУ АПОПТОТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ ЧЕЛОВЕКА"**. Матвеев Л.Э., Матвеев А.Л., Семенов Д.В., Фомин А.С., Кулигина Е.В., Матвеева В.А., Тикунова Н.В., Рихтер В.А. 2010 № 2402605.\\ - **"РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pSC13D6, СОДЕРЖАЩАЯ ГЕН ОДНОЦЕПОЧЕЧНОГО АНТИТЕЛА ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, И ШТАММ БАКТЕРИЙ Escherichia coli BL21(DE3)/pSC13D6 - ПРОДУЦЕНТ ОДНОЦЕПОЧЕЧНЫХ АНТИТЕЛ ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ОБЛАДАЮЩИХ ВИРУСНЕЙТРАЛИЗУЮЩИМИ СВОЙСТВАМИ"**. Леванов Л.Н., Тикунова Н.В., Матвеев Л.Э., Гончарова Е.П., Юн Т.Э., Рыжиков А.Б., Матвеева В.А., Рихтер В.А. 2010 № 2378378.\\ - **"ПЕПТИД, ОБЛАДАЮЩИЙ АПОПТОТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ ЧЕЛОВЕКА"**. Власов В.В., Рихтер В.А., Семенов Д.В., Некипелая В.В., Кулигина Е.В., Потапенко М.О. 2008 № 2317304.\\ ---- ===== Оборудование ===== \\ * оборудование для работы с культурами эукариотических и прокариотических клеток - СО2-инкубаторами; * боксы с ламинированным потоком воздуха; * световые и люминесцентные микроскопы; * аналитические и препаративные хроматографы; * приборы для проведения ПЦР и ПЦР в реальном времени; * электрофоретическое оборудование; * проточный цитофлуориметр; * парк холодильников и центрифуг.