====== Лаборатория химии РНК ====== ===== Заведующий лабораторией ===== \\ {{:ru:structure:мария_воробьева2.jpg?nolink&200 |}} \\ **Воробьева Мария Александровна**\\ **с.н.с., к.х.н.** \\ телефон: (383) 363-51-29, [[kuzn@niboch.nsc.ru]] ---- ===== Сотрудники ===== ^ ФИО ^ Должность ^ Звание ^ Телефон ^ Researcher ID ^ |Воробьев Павел Евгеньевич |н.с. |к.х.н.| 363-51-29 | [[http://www.researcherid.com/rid/A-9989-2019|A-9989-2019]] | |Воробьева Мария Александровна |зав.лаб., с.н.с. |к.х.н. | 363-51-29 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-4632-2013|G-4632-2013]] | |Горленко Елена Сергеевна| лаборант | | 363-51-29 | | |Давыдова Анна Сергеевна |н.с. |к.х.н.| 363-51-29 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-3084-2013|G-3084-2013]] | |Данилин Николай Александрович | инженер | | 363-51-29 | [[http://www.researcherid.com/rid/AGG-5841-2021|AGG-5841-2021]] | |Зыков Вячеслав Андреевич| ст.лаборант | | 363-51-29 | | |Кожев Арсений Александрович| лаборант | | 363-51-29 | | |Кропачева Надежда Олеговна|лаборант | | 363-51-29 | | |Мещанинова Мария Ивановна |с.н.с. |к.х.н. | 363-51-29 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-3496-2013|G-3496-2013]] | |Новопашина Дарья Сергеевна |c.н.с. |к.х.н., доцент | 363-51-29 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-1731-2013|G-1731-2013]] | |Шатунова Елизавета Андреевна|м.н.с. | | 363-51-29 |[[http://www.researcherid.com/rid/ABD-9728-2021|ABD-9728-2021]] | ---- \\ ===== Основные направления исследований ===== \\ * Разработка подходов к химическому синтезу аналогов и производных олигорибонуклеотидов – искусственных регуляторов экспрессии генов, биосенсоров и инструментов исследований НК-НК и НК-белковых взаимодействий: Малые интерферирующие РНК (siРНК) и их модифицированные аналоги с улучшенными физико-химическими, биологическими и фармакологическими характеристиками;\\ Устойчивые в биологических средах модифицированные РНК-аптамеры как перспективные терапевтические и диагностические средства; \\ Антисенс- и антиген- реагенты и зонды на основе 2'-О-модифицированных олигорибонуклеотидов; \\ Технологии автоматического mid-scale синтеза олигорибонуклеотидов, их аналогов и конъюгатов.\\ * Создание мультифункциональных конструкций на основе олигонуклеотидов и синтетических органических и неорганических наноносителей как перспективных инструментов тераностики и биосенсорных наноплатформ. ---- ===== Важнейшие научные результаты ===== \\ * Разработаны твердофазные методы синтеза олигорибонуклеотидов и их 2’-O-модифицированных аналогов в качестве базовых структур для создания ген-направленных биологически активных конструкций. Оптимизированы условия и разработаны протоколы синтеза олигорибонуклеотидов и их аналогов на автоматическом синтезаторе ASM 800 и планшетных синтезаторах ASM 1000 и ASM 2000 (БИОССЕТ, Россия), что позволяет обеспечивать научно-исследовательские работы ЛХРНК и других лабораторий Института. * Создан широкий спектр новых конъюгатов олигорибонуклеотидов и их 2’-О-метилированных аналогов, несущих в различных положениях олигомерной цепи алкилирующие, фотоактивируемые, триплексформирующие, интеркалирующие, гидрофобные, флуоресцентные и др. группировки, для направленного воздействия на биополимеры. Часть работ этого цикла была удостоена Государственной премии Российской Федерации (1999 г.). Разработан новый подход к функционализации гетероциклических оснований олигорибонуклеотидов, позволяющий конструировать различные типы конъюгатов для изучения РНК-НК и РНК-белковых взаимодействий [//Репкова М.Н. и др., Биоорган. химия. 1999. 25. 690; Изв. АН. Сер. хим. 2002. 51, 1104; Nucl., Nucl., Nucleic Acids. 2003. 22, 1509; 2004. 23, 969//]. Созданы серии новых фотоактивируемых аналогов мРНК, успешно используемых в качестве инструментов исследования мРНК-связывающего центра рибосом человека (см. страницу Лаборатории структуры и функций рибосом ИХБФМ СО РАН). Созданы устойчивые в биологических средах новые триплексформирующие олиго(2'-О-метилрибонуклеотиды), содержащие на 5’-конце лиганды малой бороздки и триплекс-специфический интеркалятор. Продемонстрирована их способность ингибировать транскрипцию в системе in vitro [Novopashina D.S. et al., Chem. Biodiv. 2005. 2, 936; Halby L. et al., J. Biomol. Struct. Dyn. 2007. 25, 61; Новопашина Д.С. и др., Биоорган. химия. 2013. 39, 159]. Впервые получены 5'-, 3'- и 2'- моно- и биспиренильные конъюгаты олиго(2’-О-метилрибонуклеотидов) и мультипиренильные тандемные конструкции на их основе – перспективные флуоресцентные зонды для изучения гибридизации олигонуклеотидов с НК, выявления мутаций различных типов в ДНК и детекции РНК в растворе. [//Novopashina D.S. et al., Nucl., Nucl., Nucleic Acids. 2005. 24, 729; 2007. 26, 821; Крашенинина О.А. и др., Биоорган. химия. 2011. 37, 273; Новопашина Д.С. и др., Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. 9, 15//]. * Предложен и реализован новый подход к конструированию устойчивых в биологических средах бинарных НК-энзимов на основе рибозима «головка молотка» и ДНКзи//ма 10-23. Показано, что бинарные конструкции способны эффективно расщеплять как короткие РНК-субстраты, так и протяженные природные РНК (на примере MDR1 мРНК и IGF1 мРНК). [Vorobjeva M. et al., Oligonucleotides. 2006. 16, 239; Воробьева М.А. и др., Успехи химии. 2011. 80, 139]. Нуклеазоустойчивые 2'-О-метилрибонуклеозидсодержащие ДНКзимы эффективно ингибируют функции гена IGF-1 в клетках [//Fokina A.A. et al., Biochemistry. 2012. 51, 2181//]. * Разработаны подходы к синтезу модифицированных siРНК и их конъюгатов, обладающих комплексом улучшенных физико-химических и биологических характеристик [Volkov A.A. et al., Oligonucleotides. 2009. 19, 191; Круглова Н.С. и др., Молекуляр. биология. 2010. 44, 284; Petrova (Kruglova) N.S. et al., Oligonucleotides. 2010. 20, 297; Nucleic Asids Res. 2012. 40, 2330; Durfort T. et al. PLoS ONE. 2012. 7, e29213//]. * Разрабатываются подходы к получению мультифункциональных углеродных нанотрубок как платформы для создания биосовместимых транспортеров НК, биосенсоров и инструментов тераностики [//Апарцин Е.К. и др., Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2012. 10, 181; Российские нанотехнологии. 2012, 7,38; Novopashina D.S. et al. Ukr. J. Phys. 2012, 57, 718//]. Создан макет электрохимического биосенсора для детекции специфических последовательностей НК (совместно с ИНХ СО РАН). [//Федоровская Е.О. и др., Заявка на патент РФ № 2011143078 от 26.10.2011//]. * Впервые получены 2’-фтор-модифицированные РНК-аптамеры, способные узнавать патогенные аутоантитела из крови больных рассеянным склерозом [Tivanova A.S. et al., Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components. 2011. 12, 419; Tivanova A.S. et al., FEBS Journal. 2011, 278, 164] и с рецептором инсулиноподобного фактора роста человека I типа (IGF-IR) на поверхности живых клеток [//Давыдова А.С. и др., Acta Naturae. 2011, 3, 31; Davydova A. et al., Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components. 2011, 12, 416//], исследованы их свойства. ---- ===== Текущие гранты ===== \\ **Базовый проект**\\ * ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.62.1.4, 0309-2016-0004 "Интеллектуальные материалы для биомедицины".(2017-2020 гг.)\\ **Гранты Российского научного фонда**\\ * № 19-74-20127 инфр "Новые таргетные агенты для БНЗТ глиобластом на основе борсодержащих конъюгатов опухолеспецифичных НК-аптамеров" (2019-2022 гг.) * № 19-14-00251 "Малые интерферирующие РНК против хронического воспаления и опухолевой прогрессии". (2019-2021 гг.) **Гранты Российского фонда фундаментальных исследований**\\ * № 18-33-20109 мол_а_вед "Стабильность" "Стимул-чувствительные мягкие биоматериалы на основе дендримеров для доставки лекарств."(2018-2020 гг.)\\ * № 20-54-15005 НЦНИ_а "Новые подходы к адресной доставке в клетки молекул РНК, влияющих на экспрессию митохондриального генома" (2020-2023 гг.) * № 19-34-51026 "Система доставки компонентов системы геномного редактирования CRISPR/Cas9 в клетки для решения задач современной биомедицины" (2019-2021 гг.) * № 19-04-00838 А "Фоторегулируемые аналоги РНК для контролируемого воздействия на геном и экспрессию генов".(2019-2021 гг.) * № 19-04-01073 А "Контролируемая эволюция направляющей РНК – новый подход к повышению эффективности системы геномного редактирования CRISPR/Cas9" (2019-2021 гг.) * № 22-24-00930 «Поиск новых вариантов sgРНК для улучшения кинетических характеристик системы геномного редактирования CRISPR/Cas9» * № 22-15-20050 «Новые тест-системы на основе аптамеров для диагностики и мониторинга анкилозирующего спондилита» * № 22-14-00294 «Системы геномного редактирования CRISPR/Cas9 c регуляцией активности на уровне направляющей РНК.» ===== Публикации 2021-2023 года ===== \\ - Inner Amino Acid Contacts Are Key Factors of Multistage Structural Rearrangements of DNA and Affect Substrate Specificity of Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease APE1. Bulygin A.A., Syryamina V.N., Kuznetsova A.A., Novopashina D.S., Dzuba S.A., Kuznetsov N.A. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24 N 14. P. 11474. DOI: 10.3390/ijms241411474 - The Interleukine-17 Cytokine Family: Role in Development and Progression of Spondyloarthritis, Current and Potential Therapeutic Inhibitors. Davydova A.S., Kurochkina Yu.D., Goncharova V., Vorobyeva M.A., Korolev M. Biomedicines. 2023. V. 11. N 5. P. 1328. DOI: 10.3390/biomedicines11051328 - The Activity of Natural Polymorphic Variants of Human DNA Polymerase β Having an Amino Acid Substitution in the Transferase Domain. Kladova O.A., Tyugashev T.E., Mikuchina E.S., Kuznetsov N.A., Novopashina D.S., Kuznetsova A.A.Cells. 2023. V. 12. N 9. P. 1300. DOI: 10.3390/cells12091300 - Human Polβ Natural Polymorphic Variants G118V and R149I Affects Substate Binding and Catalysis. Kladova O.A., Tyugashev T.E., Mikuchina E.S., Soloviev N.O., Kuznetsov N.A., Novopashina D.S., Kuznetsova A.A. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 6. P. 5892.DOI: 10.3390/ijms24065892 - Impact of Double-Stranded RNA Internalization on Hematopoietic Progenitors and Krebs-2 Cells and Mechanism. Ritter G.S., Proskurina A.S., Meschaninova M.I., Potter E.A., Petrova D.D., Ruzanova V.S., Kirikovich S.S., Levites E.V., Efremov Y.R., Nikolin V.P., Popova N.A., Venyaminova A.G., Taranov O.S., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Kolchanov N.A., Bogachev S.S. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 5. P. 4858. DOI: 10.3390/ijms24054858 - Convenient Solid-Phase Attachment of Small-Molecule Ligands to Oligonucleotides via a Biodegradable Acid-Labile P-N-Bond. Kropacheva N.O., Golyshkin A.A., Vorobyeva M.A., Meschaninova M.I. Molecules. 2023. V. 28. N 4. P. 1904. DOI: 10.3390/molecules28041904 - Aptamers for Addressed Boron Delivery in BNCT: Effect of Boron Cluster Attachment Site on Functional Activity. Novopashina D.S., Dymova M.A., Davydova A.S., Meschaninova M.I., Malysheva D.O., Kuligina E.V., Richter V.A., Kolesnikov V.A., Taskaev S.Y., Vorobyeva M.A. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. 306. DOI: 10.3390/ijms24010306 - Effects of Cationic Dendrimers and Their Complexes with microRNAs on Immunocompetent Cells. Knauer N.Yu., Pashkina E., Aktanova А., Boeva O., Arkhipova V., Barkovskaya M., Meschaninova M.I., Karpus A., Majoral J.-P., Kozlov V., Apartsin E.K. Pharmaceutics. 2023. V. 15. N 1. P. 148. DOI: 10.3390/pharmaceutics15010148 - Triazine-Carbosilane Dendrimersomes Enhance Cellular Uptake and Phototoxic Activity of Rose Bengal in Basal Cell Skin Carcinoma Cells. Sztandera K., Gorzkiewicz M., Bątal M., Arkhipova V., Knauer N., Sánchez-Nieves J., Javier de la Mata F., Gomez R., Apartsin E.K., Klajnert-Maculewicz B. International journal of nanomedicine. 2022. V. 17. 1139-1154. DOI: 10.2147/IJN.S352349 - Dendriplex-Impregnated Hydrogels With Programmed Release Rate. Apartsin E.K., Venyaminova A.G., Majoral J-P., Caminade A-M. Front. Chem. 2022. V. 9. 780608. DOI: 10.3389/fchem.2021.780608 - In vitro validation of the therapeutic potential of dendrimer-based nanoformulations against tumor stem cells. Knauer N.Yu, Pashkina E.A., Kozlov V.A., Hewera M., Arkhipova V., Meschaninova M.I., Apartsin E.K., Nguyen P.-H., Zhang W., Caminade A.-M., Majoral J.-P., Croner R.S., Kahlert U.D. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 10. P. 5691. DOI: 10.3390/ijms23105691 - Amphiphilic Triazine‐Phosphorus Metallodendrons Possessing Anti‐Cancer Stem Cell Activity. Apartsin E.K., Knauer N.Yu., Kahlert U.D., Caminade A.-M. Pharmaceutics. 2022. V. 14. N 2. P. 393. DOI: 10.3390/pharmaceutics14020393 - Structural and Functional Differences between Homologous Bacterial Ribonucleases. Ulyanova V., Nadyrova A., Dudkina E., Kuznetsova A.A., Ahmetgalieva A., Faizullin D., Surchenko Y., Novopashina D.S., Zuev Y., Kuznetsov N.A., Ilinskaya O. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 3. P. 1867. DOI: 10.3390/ijms23031867 - Comparative Analysis of Exo- and Endonuclease Activities of APE1-like Enzymes. Davletgildeeva A.T., Kuznetsova A.A., Novopashina D.S., Ishchenko A.A., Saparbaev M.K., Fedorova O.S., Kuznetsov N.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 5. 2869. DOI: 10.3390/ijms23052869 - CD133-Functionalized Gold Nanoparticles as a Carrier Platform for Telaglenastat (CB-839) against Tumor Stem Cells. Poonaki E., Nickel A.-C., Ardestani M.S., Rademacher L., Kaul M., Apartsin E.K., Meuth S.G., Gorji A., Janiak C., Kahlert U.D. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 10. P. 5479. DOI: 10.3390/ijms23105479 - Новый подход к синтезу фотоблокированных малых интерферирующих РНК для активируемой светом РНК-интерференции. Ахметова Е.А., Ким Д.В., Доме А.С., Мещанинова М.И., Новопашина Д.С. Биоорганическая химия. 2022. Т. 48. № 5. С.580-588. DOI: 10.31857/S0132342322050037 - Aptamer-Based Biosensors for the Colorimetric Detection of Blood Biomarkers: Paving the Way to Clinical Laboratory Testing. Davydova A.S., Vorobyeva M.A. Biomedicines. 2022. V. 10. N 7. P. 1606. DOI: 10.3390/biomedicines10071606 - Clinical Diagnostic Value of Dkk-1 Level in Ankylosing Spondylitis: Comparison of Test Systems Based on Aptamers and Antibodies. Vorobyeva M.A., Shatunova E.A., Kolpakov K., Kurochkina Yu.D., Korolev M.A. Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 2022. V. 173. I. 3. P. 317-321. DOI: 10.1007/s10517-022-05541-z ** (перевод)** - Клинико-диагностическое значение уровня DKK-1 при анкилозирующем спондилите: сравнение тест-систем на основе аптамеров и антител. Воробьева М.А., Шатунова Е.А., Колпаков К.И., Курочкина Ю.Д., Королев М.А. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2022. Т. 173. № 3. С. 307-312. DOI: 10.47056/0365-9615-2022-173-3-307-312 - The mechanism of damage recognition by apurinic/apyrimidinic endonuclease Nfo from Escherichia coli. Senchurova S.I., Syryamina V.N., Kuznetsova A.A., Novopashina D.S., Ishchenko A.A., Saparbaev M.K., Dzuba S.A., Fedorova O.S., Kuznetsov N.A. Biochim. Biophys. Acta - General Subjects. 2022. V. 1866. N 11. P. 130216. DOI: 10.1016/j.bbagen.2022.130216 - Improving Stability and Specificity of CRISPR/Cas9 System by Selective Modification of Guide RNAs with 2′-fluoro and Locked Nucleic Acid Nucleotides. Sakovina L., Vokhtantsev I.P., Vorobyeva M.A., Vorobyev P.E., Novopashina D.S. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 21. P. 13460. DOI: 10.3390/ijms232113460 - Oligonucleotide aptamers as novel cell-specific delivery agents for boron neutron capture therapy. Vorobyeva M.A., Dymova M.A., Novopashina D.S., Kuligina E.V., Kolesnikov I.A., Taskaev S.Y., Richter V.A., Meschaninova M.I. Сибирское медицинское обозрение. 2022. V. 2022. N 5. P. 108. DOI: 10.20333/25000136-2022-5-108 **(тезисы конференции)** - PB2207: In vitro validation of dendrimer-based approach for micro-RNA delivery into Leukemia cells HemaSphere. Knauer N.Yu., Pashkina E.A., Boeva O., Aktanova А., Arkhipova V., Meschaninova M.I., Gomez R., Sánchez-Nieves J., Nickel A.-C., Kahlert U., Majoral J.-P., Kozlov V., Apartsin E.K. HemaSphere. 2022. V. 6. S.3. P. 2077-2078. DOI: 10.1097/01.HS9.0000851656.23415.d9 - Photocaged Small Interfering RNA. Akhmetova E.A., Kim D.V., Dome A.S., Meschaninova M.I., Novopashina D.S. Биоорганическая химия. 2022. V. 48. N 5. P. 1036-1042. DOI: 10.1134/S106816202205003X **(перевод)** - Knockdown of the mRNA encoding the ribosomal protein eL38 in mammalian cells causes a substantial reorganization of genomic transcription. Gopanenko A.V., Kolobova A.V., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Biochimie. 2021. V. 184. 132-142. DOI: 10.1016/j.biochi.2021.02.017 - Lipophilic conjugates for carrier-free delivery of RNA importable into human mitochondria. Dovydenko I.S., Meschaninova M.I., Heckel A.-M., Venyaminova A.G., Entelis N. Methods in Molecular Biology. 2021. V. 2277. Chapter 4. P. 1-27. DOI: 10.1007/978-1-0716-1270-5_4 - Фотоактивируемая система CRISPR/CAS9. Ахметова Е.А., Голышев В.М., Вохтанцев И.П., Мещанинова М.И., Веньяминова А.Г., Новопашина Д.С. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 2. С. 276-286. DOI: 10.31857/S0132342321020020 - Направляющие РНКазу Р конъюгаты олигонуклеотидов с олиго(N-метилпирролом) как перспективные антибактериальные препараты. Данилин Н.А., Матвеев А.Л., Бардашева А.В., Тикунова Н.В., Новопашина Д.С., Веньяминова А.Г. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 2. С. 259-269. DOI: 10.31857/S0132342321020081 - Новые двухкомпонентные пиренильные зонды на основе олиго(2'-О-метилрибонуклеотидов) для детекции микроРНК. Семиколенова О.А., Голышев В.М., Ким Б-Х., Веньяминова А.Г., Новопашина Д.С. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 2. С.218-227. DOI: 10.31857/S0132342321020238 - A versatile solid-phase approach to the synthesis of oligonucleotide conjugates with biodegradable hydrazone linker. Meschaninova M.I., Entelis N.S., Chernolovskaya E.L., Venyaminova A.G. Molecules. 2021. V. 26. N 8. P. 2119. DOI: 10.3390/molecules26082119 - Terminal mono- and bis-conjugates of oligonucleotides with closo-dodecaborate: synthesis and physico-chemical properties. Novopashina D.S., Vorobyeva M.A., Lomzov A.A., Silnikov V.N., Venyaminova A.G. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. N 1. P. 182. DOI: 10.3390/ijms22010182 - Мутационный и кинетический анализ эндорибонуклеазной активности APE1. Кузнецова А.А., Гаврилова А.А., Новопашина Д.С., Федорова О.С., Кузнецов Н.А. Молекулярная биология. 2021. Т. 55. № 2. С. 243-257. DOI: 10.31857/S0026898421020099 - Interaction of Lipophilic Conjugates of Modified siRNAs with Hematopoietic Cells in vitro and in vivo. Chernikov I.V., Meschaninova M.I., Gladkikh D.V., Venyaminova A.G., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L. Russ. J. Bioorganic Chem. 2021. V. 47. N 2. P. 399-410. DOI: 10.1134/S1068162021020072 - Взаимодействие липофильных конъюгатов модифицированных siРНК с гемопоэтическими клетками in vitro и in vivo. Черников И.В., Мещанинова М.И., Гладких Д.В., Веньяминова А.Г., Зенкова М.А., Власов В.В., Черноловская Е.Л. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 2. С. 195-207. DOI: 10.31857/S013234232102007X - Two alternative conformations of mRNA in the human ribosome during elongation and termination of translation as revealed by EPR spectroscopy. Bulygin K.N., Timofeev I.O., Malygin A.A., Graifer D.M., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Babaylova E.S., Fedin M.V., Frolova L.Y., Karpova G.G., Bagryanskaya E.G. Comput Struct Biotechnol J. 2021. V. 19. 4702-4710. DOI: 10.1016/j.csbj.2021.08.024 - Photoactivatable System CRISPR/Cas9. Akhmetova E.A., Golyshev V.M., Vokhtantsev I.P., Venyaminova A.G., Novopashina D.S. Биоорганическая химия. 2021. V. 47. N 2. P. 276–286. DOI: 10.1134/S1068162021020023 **(перевод)** - Conjugates of RNase P-Guiding Oligonucleotides with Oligo(N-Methylpyrrole) as Prospective Antibacterial Agents. Danilin N.A., Matveev A.L., Tikunova N.V., Venyaminova A.G., Novopashina D.S. Биоорганическая химия. 2021. V. 47. N 2. P. 469–477. DOI: 10.1134/S1068162021020084 ** (перевод)** - New Two-Component Pyrene Probes Based on Oligo(2'-O-Methylribonucleotides) for microRNA Detection. Semikolenova O.A., Golyshev V.M., Kim B.H., Venyaminova A.G., Novopashina D.S. Биоорганическая химия. 2021. V. 47. N 2. P. 432-440. DOI: 10.1134/S1068162021020230 **(перевод)** - Recent Advances in the Synthesis of High Boron-loaded Nucleic Acids for BNCT. Novopashina D.S., Vorobyeva M.A., Venyaminova A.G. Front. Chem. 2021. V. 9. 619052. DOI: 10.3389/fchem.2021.619052 - Tumor Cell-Specific 2′-Fluoro RNA Aptamer Conjugated with Closo-Dodecaborate as A Potential Agent for Boron Neutron Capture Therapy. Vorobyeva M.A., Dymova M.A., Novopashina D.S., Kuligina E.V., Timoshenko V.V., Kolesnikov I.A., Taskaev S.Y., Richter V.A., Venyaminova A.G. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. N 14. P. 7326. DOI: 10.3390/ijms22147326 - Novel approach to the delivery into the cells and light-activation of the guide RNA for the genome editing CRISPR/Cas9 system. Yakovlev A.N., Akhmetova E.A., Danilin N.A., Semikolenova O.A., Vokhtantsev I.P., Kim D.V., Zharkov D.O., Venyaminova A.G., Novopashina D.S. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 122. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 **(тезисы конференции)** - Comparative study of PyA-cluster system and excimer forming oligonucleotide probes for the detection of miRNA. Semikolenova O.A., Lee H.J., Kim B.H., Venyaminova A.G., Novopashina D.S. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 241. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 **(тезисы конференции)** - AP sites in various mRNA positions cross-link to the protein uS3 in the translating mammalian ribosome. Ochkasova A., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Graifer D.M., Karpova G.G. Biochim. Biophys. Acta - Proteins and Proteomics. 2021. V. 1869. N 10. P. 140698. DOI: 10.1016/j.bbapap.2021.140698 - The prospective antibacterial conjugates of modified oligonucleotides. Danilin N.A., Novopashina D.S., Matveev A.L., Bardasheva A., Tikunova N.V., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V., Venyaminova A.G. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 307. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 ** (тезисы конференции)** - Interaction of Lipophilic Conjugates of Modified siRNAs with Hematopoietic Cells In Vitro and In Vivo. Chernikov I.V., Meschaninova M.I., Gladkikh D.V., Venyaminova A.G., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L. Биоорганическая химия. 2021. V. 47. N 2. P. 399-410. DOI: 10.1134/S1068162021020072 **(перевод)** - Photoactivatable CRISPR/CAS9 system. Akhmetova E.A., Golyshev V.M., Vokhtantsev I.P., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Novopashina D.S. Биоорганическая химия. 2021. V. 47. N 2. P. 496-504. DOI: 10.1134/S1068162021020023 **(перевод)** - Photoactivatable nanoCRISPR/Cas9 System Based on crRNA Reversibly Immobilized on Carbon Nanoparticles. Semikolenova O.A., Sakovina L., Akhmetova E., Kim D.V., Vokhtantsev I.P., Golyshev V.M., Vorobyeva M.A., Novopashin S., Novopashina D.S. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. 10919. DOI: 10.3390/ijms222010919 - Supramolecular Self-Associations of Amphiphilic Dendrons and Their Properties. Apartsin E.K., Caminade A.-M. Chem. Eur. J. 2021. V. 27. 1–24. DOI: 10.1002/chem.202102589 ===== Патенты ===== \\ - **РНК-АПТАМЕР, ОБЛАДАЮЩИЙ СПОСОБНОСТЬЮ УЗНАВАТЬ АУТОАНТИТЕЛА, ХАРАКТЕРНЫЕ ДЛЯ РАССЕЯННОГО СКЛЕРОЗА**. Тимошенко В.В., Воробьева М.А., Невинский Г.А., Веньяминова А.Г. 2017 № 2644229 - **РНК-АПТАМЕР, ОБЛАДАЮЩИЙ СПОСОБНОСТЬЮ УЗНАВАТЬ ХАРАКТЕРНЫЕ ДЛЯ РАССЕЯННОГО СКЛЕРОЗА АУТОАНТИТЕЛА**. Фокина А.А., Воробьева М.А., Тимошенко В.В., Поповецкая А.С., Невинский Г.А., Веньяминова А.Г. 2015 № 2549704.\\ - **СПОСОБ ДЕТЕКЦИИ СПЕЦИФИЧЕСКИХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ (ВАРИАНТЫ) И УСТРОЙСТВО ДЛЯ ЕГО ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ**. Федоровская Е.О., Апарцин Е.К., Новопашина Д.С., Булушева Л.Г., Веньяминова А.Г., Окотруб А.В. 2014 № 2509157. ===== Оборудование ===== \\ * Автоматические ДНК/РНК-синтезаторы фирмы БИОССЕТ; * аналитические и препаративные хроматографы; * концентратор Speed Vac и ротационные испарители; * электрофоретическое оборудование; * термостаты и термомиксеры.\\