ru:structure:labs:zar
Содержание

Лаборатория химии нуклеиновых кислот

Заведующий лабораторией


Купрюшкин Максим Сергеевич
Заведующий лабораторией
к.х.н., с.н.с.,

телефон: (383) 363-51-45,



Лаборатория химии нуклеиновых кислот ведет свое начало от лаборатории природных полимеров новосибирского института органической химии СО АН СССР, заведующим которой в 1960 г. стал профессор Д. Г. Кнорре, а одним из первых сотрудников – Н. И. Гринева. В 1970 г. был создан отдел биохимии НИОХ СО АН СССР, одну из двух лабораторий которого – лабораторию химии нуклеиновых кислот – возглавил член-корр. АН СССР Д. Г. Кнорре. В 1984 г. отдел биохимии был преобразован в Новосибирский институт биоорганической химии СО АН СССР (с 2003 г. – Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). С 1986 по 2014 г лабораторией руководила д.х.н., проф., лауреат Государственной премии премии в области науки и техники Зарытова (Куликова) В.Ф.

Сотрудники

ФИО Должность Звание Телефон Researcher ID
Вострикова Юлия Олеговна лаборант 363-51-45
Жарков Тимофей Дмитриевичм.н.с. 363-51-72 ABE-1687-2021
Жуков Сергей Артёмович м.н.с. 363-51-45AAJ-6611-2021
Купрюшкин Максим Сергеевич, зав.лабораториейс.н.с.к.х.н. 363-51-45 G-1698-2013
Куликова Валентина Филипповна г.н.с.д.х.н., профессор 363-51-23 G-3526-2013
Левина Ася Сауловна с.н.с. к.х.н., доцент 363-51-23 G-4230-2013
Некрасов Михаил Дмитриевич вед.инженер 363-51-23
Репкова Марина Николаевна н.с. к.х.н. 363-51-23 G-4305-2013
Валяев Александр Владимирович лаборант 363-51-45
Сероклинова Екатерина Геннадьевна лаборант 363-51-45

Основные направления исследований




Важнейшие научные результаты




Текущие гранты

Базовые проекты

Гранты Российского научного фонда


Публикации 2023 - 2025 года


  1. Противовирусная активность модифицированных олигонуклеотидов в лимфоидных клетках человека, инфицированных ВИЧ‐1. Готфрид Л.Г., Павлова А.С., Купрюшкин М.С., Пышная И.А., Гашникова Н.М. Юг России: экология, развитие. 2024. Т. 19. № 4. C. 57‐67. DOI: 10.18470/1992‐1098‐2024‐4‐5
  2. Extracellular vesicle mimetics as delivery vehicles for oligonucleotide-based therapeutics and plasmid DNA. Oshchepkova A.L., Chernikov I.V., Miroshnichenko S.K., Patutina O.A., Markov O.V., Savin I.A., Meschaninova M.I., Zhukov S., Kupryushkin M.S., Maslov M.A., Sen'kova A.V., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L., Zenkova M.A. Front. bioengin. and Biotech. 2024. V. 12. P. 1-18. DOI: 10.3389/fbioe.2024.1437817
  3. Неагломерированные олигонуклеотид-содержащие нанокомпозиты на основе наночастиц диоксида титана. Репкова М.Н., Мазурков О.Ю., Филиппова Е.И., Мазуркова Н.А., Полетаева Ю.Е., Рябчикова Е.И., Зарытова В.Ф., Левина А.С. Биоорганическая химия. 2024. Т. 50. № 6. С. 862-870. DOI: 10.31857/S0132342324060128
  4. Effect of modification of siRNA molecules delivered with aminopropylsilanol nanoparticles on suppression of A/H5N1 virus in cell culture. Repkova M.N., Mazurkov O.Yu., Filippova E.I., Procenko M.A., Mazurkova N.A., Meschaninova M.I., Levina A.S., Zarytova V.F. Biochim. Biophys. Acta - General Subjects. 2024. V. 1868. N 12. P. 130727. DOI: 10.1016/j.bbagen.2024.130727
  5. Нанокомпозиты, состоящие из наночастиц диоксида титана, антисмысловых олигонуклеотидов и фотоактивируемых групп, как агенты для эффективного воздействия на нуклеиновые кислоты. Левина А.С., Репкова М.Н., Мазурков О.Ю., Макаревич Е.В., Мазуркова Н.А., Зарытова В.Ф. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101. № 1. С.127-132. DOI: 10.36233/0372-9311-456
  6. Substantial antiviral potential of deoxyribozymes fixed on anatase nanoparticles against influenza A viruses in vitro and in vivo. Levina A.S., Repkova M.N., Netesova N.A., Ternovoi V.A., Mazurkov O.Yu., Filippova E., Mazurkova N.A., Zarytova V.F. Journal of Pharmaceutical Sciences. 2024. V. 113. N 5. P. 1202-1208. DOI: 10.1016/j.xphs.2023.10.028
  7. Influence of Combinations of Lipophilic and Phosphate Backbone Modifications on Cellular Uptake of Modified Oligonucleotides. Zharkov T.D., Markov O.V., Zhukov S., Khodyreva S.N., Kupryushkin M.S. Molecules. 2024. V. 29. N. 2. P. 452. DOI: 10.3390/molecules29020452
  8. Effect of the Phosphoryl Guanidine Modification in Chimeric DNA–RNA crRNAs on the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro. Prokhorova D.V., Kupryushkin M.S., Zhukov S., Zharkov T.D., Dovydenko I.S., Yakovleva K.I., Pereverzev I.M., Matveeva A.M., Pyshnyi D.V., Stepanov G.A. ACS Chem. Biol. 2024. V. 19. N 6. P. 1311-1319. DOI: 10.1021/acschembio.4c00147
  9. Application of Iodine-Amine Oxidation Approach in the Synthesis of Various N-Alkyl Phosphoramidate Oligonucleotide Derivatives. Nekrasov M.D., Pyshnyi D.V., Kupryushkin M.S. Medicinal Chemistry. 2024. V. 21. № 3. P. 229 - 238. DOI: 10.2174/0115734064325532241002105426
  10. An Approach to Identifying Single-Nucleotide Mutations Using Noncovalent Associates of Gold Nanoparticles with Fluorescently Labeled Oligonucleotides. Epanchintseva A.V., Gorbunova E.A., Nekrasov M.D., Poletaeva Y., Pyshnaya I.A. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. P. 13230. DOI: 10.3390/ijms252413230
  11. Селективное подавление репликации вируса гриппа A/H5N1 in vitro с помощью нанокомплексов, состоящих из siRNA и наночастиц аминопропилсиланола. Репкова М.Н., Левина А.С., Мазурков О.Ю., Макаревич Е.В., Филиппова Е.И., Мазуркова Н.А., Зарытова В.Ф. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101. № 6. С. 794–802. DOI: 10.36233/0372-9311-575
  12. Эффективное ингибирование репликации вируса простого герпеса 1-го типа in vitro с помощью олигонуклеотид-содержащих нанокомпозитов. Репкова М.Н., Зарытова В.Ф., Мазурков О.Ю., Мазуркова Н.А., Макаревич Е.В., Филиппова Е.И., Некрасов М.Д., Купрюшкин М.С., Левина А.С. Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2024. Т. 74. № 4. С. 338–345. DOI: 10.55959/MSU0137-0952-16-79-4-14
  13. Non-agglomerated oligonucleotide-containing nanocomposites based on titanium dioxide nanoparticles. Repkova M.N., Mazurkov O.Yu., Filippova E.I., Mazurkova N.A., Poletaeva Y., Ryabchikova E.I., Zarytova V.F., Levina A.S. Russ. J. Bioorganic Chem. 2024. V. 50. N 6. P. 1–10. DOI: 10.1134/S1068162024060384 перевод
  14. Selective suppression of influenza A/H5N1 virus replication in vitro using nanocomplexes consisting of siRNA and aminopropylsilanol nanoparticles. Repkova M.N., Levina A.S., Mazurkov O.Ju., Makarevich E.V., Filippova E.I., Mazurkova N.A., Zarytova V.F. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. V. 101. N 6. P. 794–801. DOI: 10.36233/0372-9311-575. перевод
  15. Олигонуклеотид-содержащие нанокомпозиты на основе наночастиц аминопропилсиланола. L-Journal «Тенденции развития науки и образования». Репкова М.Н., Зарытова В.Ф., Филиппова Е.И., Левина А.С. Тенденции развития науки и образования. 2024. С. 135–140. DOI: 10.18411/trnio-12-2024-749
  16. The Lipophilic Purine Nucleoside—Tdp1 Inhibitor—Enhances DNA Damage Induced by Topotecan In Vitro and Potentiates the Antitumor Effect of Topotecan In Vivo. Chernyshova I.A., Zakharenko A.L., Kurochkin N.N., Dyrkheeva N.S., Kornienko T.E., Popova N.A., Nikolin V.P., Ilina E.S., Zharkov T.D., Kupryushkin M.S., Oslovsky V.E., Drenichev M.S., Lavrik O.I. Molecules. 2023. V. 28. N 1. P. 323. DOI: 10.3390/molecules28010323
  17. Комплексы и высокомолекулярные ассоциаты додецил-содержащих олигонуклеотидов с сывороточным альбумином. Павлова А.С., Илющенко В.В., Купрюшкин М.С., Жарков Т.Д., Дюдеева Е.С., Бауэр И.А., Чубаров А.С., Пышный Д.В., Пышная И.А. Биохимия. 2023. V. 88. N 8. С. 1423 – 1440. DOI: 10.31857/S0320972523080109
  18. Fork- and Comb-like Lipophilic Structures: Different Chemical Approaches to the Synthesis of Oligonucleotides with Multiple Dodecyl Residues. Zharkov T.D., Mironova E.M., Markov O.V., Zhukov S., Khodyreva S.N., Kupryushkin M.S. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 19. P. 14637. DOI: 10.3390/ijms241914637
  19. Complexes and Supramolecular Associates of Dodecyl-Containing Oligonucleotides with Serum Albumin. Pavlova A.S., Iliusenko V.V., Kupryushkin M.S., Zharkov T.D., Dyudeeva E., Bauer I.A., Chubarov A.S., Pyshnyi D.V., Pyshnaya I.A. Biochemistry (Moscow). 2023. V. 88. P. 1165-1180. DOI: 10.1134/S0006297923080102. перевод
  20. Олигорибонуклеотид-содержащие нанокомплексы на основе наночастиц аминосиланола как эффективные ингибиторы вируса гриппа А. Репкова М.Н., Мазурков Е.И., Филиппова М.А., Проценко Н.А., Мазуркова Н.А., Челобанов Б.П., Левина А.С., Зарытова В.Ф. Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2023. Т. 78. № 4. С. 267–272. DOI: 10.55959/MSU0137-0952-16-78-4-8
  21. Терапевтические нуклеиновые кислоты против вирусов простого герпеса. Левина А.С., Репкова М.Н., Зарытова В.Ф. Биоорганическая химия. 2023. Т. 49. № 6. С. 591-610. DOI: 10.31857/S013234232306009X
  22. Therapeutic Nucleic Acids against Herpes Simplex Viruses. Levina A.S., Repkova M.N., Zarytova V.F. Биоорганическая химия. 2023. V. 49. N 6. P. 1–20. DOI: 10.1134/S107036322212 перевод
  23. Self-Penetrating Oligonucleotide Derivatives: Features of Self-Assembly and Interactions with Serum and Intracellular Proteins. Bauer I.A., Ilina E.S., Zharkov T.D., Grigoryeva E.V., Chinak O.A., Kupryushkin M.S., Golyshev V.M., Mitin D.E., Chubarov A.S., Khodyreva S.N., Dmitrienko E.V. Pharmaceutics. 2023. V. 15. N 12. P. 2779. DOI: 10.3390/pharmaceutics15122779
  24. Oligoribonucleotide-containing nanocomplexes based on aminopropylsilanol nanoparticles as effective inhibitors of influenza A virus replication. Repkova M.N., Mazurkov O.Yu., Filippova E.I., Procenko M.A., Mazurkova N.A., Chelobanov B.P., Levina A.S., Zarytova V.F. Вестник Московского университета. Серия 16. Биология. 2023. V. 78. N 4. P. 249-254. DOI: 10.3103/s0096392524600431.перевод



Патенты


  1. СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ НАНОРАЗМЕРНОЙ СИСТЕМЫ ДОСТАВКИ ТРИФОСФАТА АЗИДОТИМИДИНА В КЛЕТКИ МЛЕКОПИТАЮЩИХ. Васильева С.В., Левина А.С., Репкова М.Н., Шацкая Н.В., Сильников В.Н., Мазуркова Н., Зарытова В.Ф. 2015 № 2563171.
  2. РНК-АПТАМЕР, ОБЛАДАЮЩИЙ СПОСОБНОСТЬЮ УЗНАВАТЬ ХАРАКТЕРНЫЕ ДЛЯ РАССЕЯННОГО СКЛЕРОЗА АУТОАНТИТЕЛА. Фокина А.А., Воробьева М.А., Тимошенко В.В., Поповецкая А.С., Невинский Г.А., Веньяминова А.Г. 2015г. № 2549704.
  3. СРЕДСТВО, ОБЛАДАЮЩЕЕ АНТИБАКТЕРИАЛЬНОЙ АКТИВНОСТЬЮ. Сильников В.Н., Буракова Е.А., Королева Л.С., Яринич Л.А. 2014 г. № 2532328
  4. СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ НАНОРАЗМЕРНОЙ СИСТЕМЫ ДОСТАВКИ НУКЛЕОЗИДТРИФОСФАТОВ В КЛЕТКИ МЛЕКОПИТАЮЩИХ. Зарытова В.Ф., Левина А.С., Васильева С.В., Сильников В.Н., Шацкая Н.В., Репкова М.Н. 2014 г. № 2527681.
  5. СРЕДСТВО, ПРОЯВЛЯЮЩЕЕ ПРОТИВИРУСНУЮ АКТИВНОСТЬ В ОТНОШЕНИИ ДНК- ВИРУСОВ. Федорова А.А., Гончарова Е.П., Буракова Е.А., Сильников В.Н., Власов В.В., Зенкова М.А. 2013 г. № 2487876
  6. НАНОКОМПОЗИТ С АКТИВНЫМ ЛИГАНДОМ, СПОСОБ ЕГО ПРИГОТОВЛЕНИЯ И СПОСОБ АДРЕСНОЙ ИНАКТИВАЦИИ ВИРУСА ГРИППА ВНУТРИ КЛЕТКИ. Зарытова В.Ф., Исмагилов Зинфер Ришатович, Левина А.С., Репкова М.Н., Шикина Надежда Васильевна, Загребельный С.Н., Мазуркова Н.А.2013 г. № 2496878.
  7. НОВЫЕ ТИПЫ МОДИФИЦИРОВАННЫХ НУКЛЕОТИДОВ С ЗАМЕЩЕННОЙ ФОСФАТНОЙ ГРУППОЙ И МЕТОД ИХ ПОЛУЧЕНИЯ. «Ноу-хау» (Секрет производства). Стеценко Д.А., Пышный Д.В., Купрюшкин М.С. 2013 г.
  8. НАНОКОМПОЗИТЫ ДИОКСИДА ТИТАНА ДЛЯ ИНАКТИВАЦИИ ВИРУСНОГО ГЕНОМА ВНУТРИ КЛЕТОК, СПОСОБ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ. Исмагилов З.Р., Шикина Н.В., Пармон В.Н., Зарытова В.Ф., Левина А.С., Репкова М.Н., Беланов Е.Ф., Зиновьев В.В., Малыгин Э.Г., Загребельный С.Н., Байбородин С.И., Нетесов С.В., Евдокимов А.Н. 2012 г. № 2444571.
  9. СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ НАНОРАЗМЕРНОЙ СИСТЕМЫ ДОСТАВКИ АНТИБИОТИКОВ РЯДА БЛЕОМИЦИНА В КЛЕТКИ МЛЕКОПИТАЮЩИХ. Зарытова В.Ф., Левина А.С., Репкова М.Н., Шацкая Н.В., Исмагилов З.Р., Шикина Н. В.2012 г. № 2458705.
  10. СРЕДСТВО, ОБЛАДАЮЩЕЕ АНТИБАКТЕРИАЛЬНОЙ АКТИВНОСТЬЮ. Сильников В.Н., Буракова Е.А., Глотова Т.И., Глотов А.Г., Репин В.Е. 2012 г. № 2443705.
  11. СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ВИРУСНОГО ГЕПАТИТА С И ОПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТИПА ВИРУСА. Шопаева Г.А., Бейсембаева Ш.А., Пышная И.А., Дмитриенко Е.В., Зарытова В.Ф., Пышный Д.В. № 2010 № 22681.
  12. ПРОИЗВОДНЫЕ N-ЗАМЕЩЕННОГО 1,4-ДИАЗАБИЦИКЛО-[2.2.2]-ОКТАНА, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ ПРОТИВОВИРУСНУЮ АКТИВНОСТЬ В ОТНОШЕНИИ РНК-ВИРУСОВ. Буракова Е.А., Власов В.В., Гончарова Е.П., Зенкова М.А., Ковалев Н.А., Ковпак М.П., Сильников В.Н., Тамкович Н.В. 2010 г. № 2399669.
  13. СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ СОЛЕЙ 5'-ТРИФОСФАТОВ ДЕЗОКСИРИБО- И РИБООЛИГОНУКЛЕОТИДОВ. Абрамова Т.В., Васильева С.В., Серпокрылова И.Ю., Власов В.В., Сильников В.Н. 2008 г. № 2326888
  14. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ЗАМЕН В ИЗВЕСТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ. Пышный Д.В., Иванова Е.М., Пышная И.А., Дымшиц Г.М., Зарытова В.Ф. 2005 № 2247781.
  15. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ АНАЛИЗИРУЕМОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК. Пышный Д.В., Иванова Е.М., Пышная И.А., Зарытова В.Ф. 2005 г. № 2259402
  16. СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ДНК-ЧИПОВ. Зарытова В.Ф., Левина А.С., Михалева Е.А. 2004 г. № 2236467

Оборудование