====== Лаборатория биохимии нуклеиновых кислот ====== ===== Заведующая лабораторией ===== \\ {{:structure:labs:zen_s.jpg?nolink&100 |}} \\ **Зенкова Марина Аркадьевна** \\ **чл.-корр. РАН, профессор, доктор биологических наук**, \\ лауреат премии Ленинского комсомола, г.н.с.\\ телефон: (383) 363-51-60\\ [[marzen@niboch.nsc.ru|marzen@niboch.nsc.ru]]\\ \\ ---- ===== Сотрудники ===== ^ ФИО ^ Должность ^ Звание, ученая степень ^ Телефон ^ Researcher ID ^ |Алексеева Людмила Александровна |м.н.с |к.б.н. | 363-51-62 | [[http://www.researcherid.com/rid/AAF-2362-2021|AAF-2362-2021]] | |Бреннер Евгений Владиславович |м.н.с. |к.б.н. | 363-51-61 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-1694-2013|G-1694-2013]] | |Владимирова Альбина Васильевна |вед. инженер | | 363-51-61 | | |Власов Валентин Викторович| г.н.с. |акад. РАН| 363-51-15 | [[http://www.researcherid.com/rid/F-4720-2013 |F-4720-2013]] | |Мирошниченко Светлана Константиновна |н.с. | к.б.н. | 363-51-61 |[[http://www.researcherid.com/rid/T-7288-2017|T-7288-2017]] | |Гладких Даниил Викторович |м.н.с. | | 363-51-61 |[[http://www.researcherid.com/rid/H-2391-2016|H-2391-2016]] | |Дзюба Тамара Николаевна |ст. лаборант | | 363-51-62 | | |Зенкова Марина Аркадьевна |зав. лабораторией, г.н.с. |чл.-корр. РАН, д.б.н., профессор | 363-51-60 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-5088-2013|G-5088-2013]] | |Кожевникова Ольга Владимирона |ст. лаборант | | 363-51-61| |Логашенко Евгения Борисовна |с.н.с., ученый секретарь Института|к.б.н. | 363-51-61 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-1417-2013|G-1417-2013]] | |Марков Андрей Владимирович |с.н.с.|к.б.н. | 363-51-61 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-3552-2013|G-3552-2013]] | |Марков Олег Владимирович |н.с.| к.б.н. | 363-51-61 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-2676-2013|G-2676-2013]] | |Миронова Надежда Львовна |в.н.с. |д.б.н. | 363-51-61 |[[http://www.researcherid.com/rid/G-1408-2013|G-1408-2013]] | |Патутина Ольга Александровна |с.н.с. |к.б.н. | 363-51-61 | [[http://www.researcherid.com/rid/F-9159-2013|F-9159-2013]] | |Савин Иннокентий Андреевич |м.н.с.|к.м.н. | 363-51-61 |[[http://www.researcherid.com/rid/ABE-2458-2021|ABE-2458-2021]] | |Сенькова Александра Васильевна |с.н.с. |к.м.н. | 363-51-61 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-1632-2013|G-1632-2013]] | |Староселец Ярослав Юрьевич |м.н.с.|к.б.н. | 363-51-61 |[[http://www.researcherid.com/rid/V-5058-2018|V-5058-2018]] | |Талышев Вадим Алексеевич |инженер| | | | |Татарникова Ирина Сергеевна |м.н.с.|к.м.н. | 363-51-61 | |Филатова Алина Алексеевна |ст.лаборант | | 363-51-61 | | |Черников Иван Вячеславович |н.с.| к.б.н.| 363-51-61 |[[http://www.researcherid.com/rid/N-9872-2017 |N-9872-2017]] | |Черноловская Елена Леонидовна |г.н.с. |д.б.н. | 363-51-61 | [[http://www.researcherid.com/rid/G-4678-2013|G-4678-2013]] | |Чиглинцева Дарья Александровна | лаборант | | 363-51-61 | [[http://www.researcherid.com/rid/ABE-4310-2021|ABE-4310-2021]] | Виварий |Можная Александра Григорьевна |заведующая виварием| 363-51-65, 5002 | |Григорьева Лариса Андреевна |лаборант | 363-51-65 | ---- ===== Основные направления исследований ===== \\ * Разработка новых методов регуляции экспрессии генов и терапевтических средств на основе олигонуклеотидов и их аналогов * Изучение путей доставки генетического материала в клетку * Создание и изучение агентов, обладающих нуклеазной активностью для терапевтических целей. ---- ===== Важнейшие научные результаты ===== \\ * Установлен механизм гибридизации антисмысловых олигонуклеотидов с РНК, показано, что этот процесс является многостадийным и инициируется путем формирования промежуточного комплекса между олигонуклеотидом и частично комплементарной ему последовательностью, расположенной в петле или одноцепочечном участке РНК. [//Serikov R. et al., J. Biomol. Strt. Dyn., 2011. 29(1), 27//]. * Сконструирована первая в мире «химическая» рибонуклеаза, олигонуклеотид–пептид, расщепляющая РНК после остатков гуанозина. Разработанный катализатор представляет интерес как инструмент исследования структуры РНК и комплексов РНК-белок. [//Mironova N.L. et al., Nucleic Acids Res. 2007. 35, 2356; Mironova N.L. et al., J. Biomol. Strt. Dyn. 2006. 23, 591//]. * Впервые показана возможность образования новых молекул РНК в сопряженной реакции расщепления/лигирования, протекающей в комплексе частично-комплементарных олигорибонуклеотидов в присутствии ионов магния. Описанная реакция могла протекать в пребиотических условиях мира РНК, обеспечивая как удлинение молекул, так и появление новых последовательностей. [//Nechaev S.V. et al., Int. J. Molecular Sci. 2009. 10, 1788; Lutay A.V. et al., In book: Origin of life. Chemical Approach. 2008, 323; Lutay, A.V. et al., Chem. & Biodivers. 2007. 4, 762; Lutay A.V. et al., Biogeosciences. 2006. 3, 243//].\\ * Сконструированы и исследованы низкомолекулярные оригинальные соединения, расщепляющие РНК со специфичностью, соответствующей рибонуклеазе А. Показано, что созданные «искусственные рибонуклеазы» обладают противовирусной активностью в отношении РНК-содержащих вирусов и могут быть применены для получения кандидатных вакцин. [//Тамкович Н.В. и др., Биоорган. химия. 2010. 36, 223; Kovalev N. et al., Bioorganic Chem. 2008 36, 33; Kovalev N. et al., Bioorg. Chem. 2006. 34, 274//].\\ * На основе данных о деградации малых интерферируюших РНК (siРНК) и их модифицированных аналогов в среде с сывороткой разработан алгоритм адресной химической модификации siРНК, позволяющий получать siРНК, обладающие повышенной нуклеазоустойчивостью. Эти siРНК вызывают рекордное по длительности подавление экспрессии гена-мишени - в течение 12-14 дней после однократного введения в клетки. [//Chernolovskaya E.L. et al., Curr. Opin. Mol. Ther. 2010. 12, 158; Круглова Н.С. и др., Молекуляр. биология. 2010. 44, 284; Спирин П.В. и др., Молекуляр. биология. 2010. 44, 876//].\\ * Получены малые интерферирующие РНК (siРНК), направленные на мРНК генов c-myc и N-myc, которые эффективно снижают уровень этих мРНК в клетках нейробластомы человека, и в 10-15 раз замедляют скорость роста этих клеток. Подавление экспрессии гена c-myc наблюдается в течение достаточно продолжительного времени, что демонстрирует потенциал малых интерферирующих РНК (siРНК-I) как основы для создания препаратов противораковой терапии. [//Акимов И.А. и др., Молекуляр. биология. 2010. 44, 98; Akimov I.A. et al., Oligonucleotides. 2009. 19, 31; Kabilova T.O. et al., Oligonucleotides. 2006. 16, 15; Кабилова Т.О. и др., Молекуляр. биология. 2006. 40, 1037; Kabilova Т.О. et al., Ann. N.Y. Acad. Sci. 2006. 1091, 425//].\\ * На примере моделей метастазирующих опухолей (карциноме лёгких Льюис и гепатоме А-1) впервые показано, что внутримышечное введение РНКазы А в дозах 0.5–50 мкг/кг, в сочетании с ДНКазой I приводит к практически полному подавлению процесса метастазирования. Снижение количества и площади метастазов коррелирует со снижением уровня циркулирующих внеклеточных РНК и ДНК, а также с повышением уровня рибо-/декзоксирибонуклеазной активности плазмы крови. [//Патутина О.А. и др., Acta Naturae. 2010. 2, 95; Патутина О.А. и др., Acta Naturae. 2009. 2, 47; Шкляева (Патутина) О.А. и др., Докл. АН. 2008. 420, 134; Mironova N. et al., Ann. N.Y. Acad. Sci. 2006. 1091, 490//].\\ ---- ===== Текущие гранты ===== \\ **Базовые проекты**\\ **Проекты Базового бюджетного финансирования, выполняемых в рамках Госзадания ФГБУН ИХБФМ СО РАН, по плану работ Института на 2021-2023 гг. ** * 0245-2021-0004. Биохимия нуклеиновых кислот как платформа создания средств терапии и диагностики социально значимых заболеваний. Зенкова М.А. **Гранты Российского научного фонда** * № 19-14-00250 "миРНК-направленные противоопухолевые препараты: терапевтический потенциал и специфичность действия"(2019-2021 гг.) * № 19-14-00251 "Малые интерферирующие РНК против хронического воспаления и опухолевой прогрессии" (2019-2021 гг.) * № 19-74-30011 лаб_мир "Терапевтические нуклеиновые кислоты для регуляции процессов воспаления, метастазирования и управления иммунитетом"(2019-2022 гг.) * № 19-14-00250 П «миРНК-направленные противоопухолевые препараты: терапевтический потенциал и специфичность действия» * № 19-14-00251 П «Малые интерферирующие РНК против хронического воспаления и опухолевой прогрессии.» * № 22-14-00289 «Внеклеточные опухолеспецифические ДНК: механизмы, опосредующие их участие в опухолевой трансформации и метастазировании» **Гранты Российского фонда фундаментальных исследований** * № 18-29-08009 мк "Биоподобные системы доставки терапевтических нуклеиновых кислот в клетки".(2018-2021 гг.) * № 19-04-00836 "Влияние наночастиц неорганической пыли на функциональные свойства макрофагов при хронической обструктивной болезни легких" (2019-2021 гг.) **Стипендии Президента РФ** * СП-4718.2021.4. Адипокины и опухолевая прогрессия: взаимосвязь, мастер-регуляторы и терапевтические подходы. 2021 - февраль 2023. Марков А.В. ---- ===== Публикации 2021 - 2023 года ===== \\ - Bronchial asthma, airway remodeling and lung fibrosis as successive steps of one process. Savin I.A., Zenkova M.A., Sen’kova A.V. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 16042. DOI: 10.3390/ijms242216042 - Influence of the Composition of Cationic Liposomes on the Performance of Cargo Immunostimulatory RNA. Bishani А., Makarova D.M., Shmendel E.V., Maslov M.A., Sen'kova A.V., Savin I.A., Gladkikh D.V., Zenkova M.A., Chernolovskaya E.L. Pharmaceutics. 2023. V. 15. P. 2184. DOI: 10.3390/pharmaceutics15092184 - Soloxolone Methyl Reduces the Stimulatory Effect of Leptin on the Aggressive Phenotype of Murine Neuro2a Neuroblastoma Cells via the MAPK/ERK1/2 Pathway. Odarenko K.V., Salomatina O.V., Chernikov I.V., Salakhutdinov N.F., Zenkova M.A., Markov A.V. Pharmaceuticals. 2023. V. 16. P. 1369. DOI: 10.3390/ph16101369 - Effective prognostic model for therapy response prediction in acute myeloid leukemia patients. Kolesnikova M.A., Sen'kova A.V., Pospelova T.I., Zenkova M.A. J Pers Med. 2023. V. 13. P. 1234. DOI: 10.3390/jpm13081234 - Исследование противоопухолевого потенциала солоксолон триптамида в отношении мультиформной глиобластомы с помощью in silico, in vitro и in vivo подходов. Марков А.В., Одаренко К.В., Сенькова А.В., Ильина А.А., Зенкова М.А. Биохимия. 2023. T. 88, № 7, С. 1237-1253. DOI: 10.31857/S0320972523070114 - Markov A.V., Odarenko K.V., Sen’kova A.V., Ilyina A.A., Zenkova M.A. Evaluation of the antitumor potential of soloxolone tryptamide against glioblastoma multiforme using in silico, in vitro, and in vivo approaches. Biochemistry (Moscow). 2023. V.88. N 7. P. 1008-1021. DOI: 10.1134/S000629792307012X (перевод) - Исследование противоопухолевого потенциала солоксолон триптамида в отношении мультиформной глиобластомы с помощью in silico, in vitro и in vivo подходов. Марков А.В., Одаренко К.В., Сенькова А.В., Ильина А.А., Зенкова М.А. Биохимия. 2023. Т. 88. № 7. С. 1237-1253. DOI: 10.31857/S0320972523070126 - Evaluation of the Antitumor Potential of Soloxolone Tryptamide against Glioblastoma Multiforme Using in silico, in vitro, and in vivo Approaches. Markov A.V., Odarenko K.V., Sen'kova A.V., Ilyina A.A., Zenkova M.A. Biochemistry (Moscow). 2023. V. 88. N 7. P. 1237-1253. DOI: 10.1134/S000629792307012X// (перевод)// - Синтез и трансфицирующая активность дисульфидных поликатионных амфифилов. Петухов И.А., Пучков П.А., Морозова Н.Г., Зенкова М.А., Маслов М.А. Биоорганическая химия. 2023. Т. 49. № 2. С. 165-177. DOI: 10.31857/S0132342323010232 - Extracellular Vesicles for Therapeutic Nucleic Acid Delivery: Loading Strategies and Challenges. Oshchepkova A.L., Zenkova M.A., Vlassov V.V. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 7287. DOI: 10.3390/ijms24087287 - Identification of Novel Core Genes Involved in Malignant Transformation of Inflamed Colon Tissue Using a Computational Biology Approach and Verification in Murine Models. Markov A.V., Savin I.A., Zenkova M.A., Sen'kova A.V. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 4311. DOI: 10.3390/ijms24054311 - siRNA-Mediated Timp1 Silencing Inhibited the Inflammatory Phenotype during Acute Lung Injury. Chernikov I.V., Staroseletc Y.Y., Tatarnikova I.S., Sen'kova A.V., Savin I.A., Markov A.V., Logashenko E.B., Chernolovskaya E.L., Zenkova M.A., Vlassov V.V. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 1641. DOI: 10.3390/ijms24021641 - Protective effect of soloxolone derivatives in carrageenan- and LPS-driven acute inflammation: Pharmacological profiling and their effects on key inflammation-related processes. Sen'kova A.V., Savin I.A., Odarenko K.V., Salomatina O.V., Salakhutdinov N.F., Zenkova M.A., Markov A.V. Biomedicine & Pharmacotherapy. 2023. V. 159. P. 114231. DOI: 10.1016/j.biopha.2023.114231 - Structural modifications of siRNA Improve ITS Performance In Vivo. Chernikov I.V., Ponomareva U.A., Chernolovskaya E.L. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 2. P. 956. DOI: 10.3390/ijms24020956 - Pulmonary Fibrosis as a Result of Acute Lung Inflammation: Molecular Mechanisms, Relevant In Vivo Models, Prognostic and Therapeutic Approaches. Savin I.A., Zenkova M.A., Sen'kova A.V. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 14959. DOI: 10.3390/ijms232314959 - Antisense oligonucleotide gapmers containing phosphoryl guanidine groups reverse MDR1 mediated multiple drug resistance of tumor cells. Kupryushkin M.S., Filatov A.V., Mironova N.L., Patutina O.A., Chernikov I.V., Chernolovskaya E.L., Zenkova M.A., Pyshnyi D.V., Stetsenko D.A., Altman S., Vlassov V.V. Mol. Ther. Nucl. Acids. 2022. V. 27. P. 211-226. DOI: 10.1016/j.omtn.2021.11.025 - New deoxycholic acid derived tyrosyl-dna phosphodiesterase 1 inhibitors also inhibit tyrosyl-dna phosphodiesterase 2. Salomatina O.V., Dyrkheeva N.S., Popadyuk I.I., Zakharenko A.L., Ilina E.S., Komarova N.I., Reynisson J., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I., Volcho К.P. Molecules. 2022. V. 27. N 1. P. 72. DOI: 10.3390/molecules27010072 - "Bind, cleave and leave": multiple turnover catalysis of RNA cleavage by bulge-loop inducing supramolecular conjugates. Amirloo B., Staroseletc Y.Y., Yousaf S., Clarke D.J., Brown T., Aojula H., Zenkova M.A., Bichenkova E.V. Nucleic Acids Res. 2022. V. 50. N 2. P. 651-673. DOI: 10.1093/nar/gkab1273 - Риски и лечение рецидивов интраэпителиальных повреждений шейки матки. Шумейкина А.О., Красильников С.Э., Кедрова А.Г., Мансурова А.С., Чернышова А.Л., Качесов И.В., Логашенко Е.Б. Опухоли женской репродуктивной системы. 2022. Т. 18. № 3. С. 72-78. DOI: 10.17650 / 1994‑4098‑2022‑18‑3‑00‑00 - Heteroleptic Pd(II) and Pt(II) Complexes with Redox-Active Ligands: Synthesis, Structure, and Multimodal Anticancer Mechanism. Romashev N.F., Abramov P.A., Bakaev I.V., Fomenko I.S., Samsonenko D.G., Novikova A.S., Tong K.K.H., Ahn D., Dorovatovskii P.V., Zubavichus Y.V., Ryadun A.A., Patutina O.A., Sokolov M.N., Babak M.V., Gushchin A.L. Inorganic Chemistry. 2022. V. 61. N 4. P. 2105-2118. DOI: 10.1021/acs.inorgchem.1c03314 - Combined effects of oncolytic vaccinia virus and dendritic cells on the progression of melanoma B16-F10 in mice. Goncharova E.P., Gamburg T.A., Markov O.V., Zenkova M.A. J Cancer Metastasis Treat. 2022. V. 8. N 10. P. 1-14. DOI: 10.20517/2394-4722.2021.195 - Uncovering the anti-angiogenic effect of semisynthetic triterpenoid CDDO-Im on HUVEGs by an integrated network pharmacology approach. Markov A.V., Odarenko K.V., Ilyina A.A. Comput. in Biol. and Med. 2022. V. 141. N.105034. DOI: 10.1016/j.compbiomed.2021.10534 - Novel Soloxolone Amides as Potent Anti-Glioblastoma Candidates: Design, Synthesis, In Silico Analysis and Biological Activities In Vitro and In Vivo. Markov A.V., Ilyina A.A., Salomatina O.V., Sen'kova A.V., Okhina A.A., Rogachev A.D., Salakhutdinov N.F., Zenkova M.A. Pharmaceuticals. 2022. V. 15. P. 603. DOI: 10.3390/ph15050603 - Inflammation features and phenotype of occupational chronic obstructive pulmonary disease attributed to industrial aerosol containing nanoparticles. Shpagina L.A., Zenkova M.A., Saprykin A.I., Logashenko E.B., Shpagin I.S., Kotova O.S., Tsygankova A.R., Kuznetsova G., Anikina E., Kamneva N., Gerasimenko D. Saf Health Work. 2022. V. 13. Suppl. P. 249. DOI: 10.1016/j.shaw.2021.12.1528 **(тезисы конференции)** - Novel Epoxides of Soloxolone Methyl: An Effect of the Formation of Oxirane Ring and Stereoisomerism on Cytotoxic Profile, Anti-Metastatic and Anti-Inflammatory Activities In Vitro and In Vivo. Salomatina O.V., Sen'kova A.V., Moralev A.D., Savin I.A., Komarova N.I., Salakhutdinov N.F., Zenkova M.A., Markov A.V. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 6214. DOI: 10.3390/ijms23116214 - New p35 (H3L) Epitope Involved in Vaccinia Virus Neutralization and Its Deimmunization. Khlusevich Y.A., Matveev A.L., Emelyanova L., Goncharova E.P., Golosova N., Pereverzev I.M., Tikunova N.V. Viruses . 2022. V. 14. P. 1224. DOI: 10.3390/v14061224 - Asthma and Post-Asthmatic Fibrosis: A Search for New Promising Molecular Markers of Transition from Acute Inflammation to Pulmonary Fibrosis. Savin I.A., Markov A.V., Zenkova M.A., Sen'kova A.V. Biomedicines. 2022. V. 10. № 5. P. 1017. DOI: 10.3390/biomedicines10051017 - Bovine Pancreatic RNase A: An Insight into the Mechanism of Antitumor Activity in Vitro and in Vivo. Mohamed E.I., Sen'kova A.V., Markov O.V., Markov A.V., Savin I.A., Zenkova M.A., Mironova N.L. Pharmaceutics. 2022. V. 14. Iss. 1173. P. 1-26. DOI: 10.3390/pharmaceutics14061173 - Bulge-Forming miRNases Cleave Oncogenic miRNAs at the Central Loop Region in a Sequence-Specific Manner. Patutina O.A., Chiglintceva D.A., Amirloo B., Clarke D., Miroshnichenko S.K., Vlassov V.V., Bichenkova E.V., Zenkova M.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 12. P. 6562. DOI: 10.3390/ijms23126562 - Tribute to Sidney Altman. Gopalan V., Nilsen T., Altman A.M., Stark B.C., Feinstein S.I., Koski R., Mickiewicz C., Stark B., Gegenheimer P., Kirsebom L.A., Arnez J.G., Forster A.C., Kazakov S.A., Yuan Y., Liu F., Jarrous N., Yang L., Jiang G., Jiang T., Rosenbaum J.L., Miller G., DiMaio D., Carlson J.R., McClain W.H., Mathews M.B., Kaempfe, R., Deutscher M.P., Chen L.-L., Li Y., Wang E., Patutina O.A., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Lucks J.B., Gopalan V. RNA. 2022. V. 28. N 11. P. 1393-1429. DOI: 10.1261/rna.079397.122 - Symmetric lipophilic polyamines exhibiting antitumor activity. Perevoshchikova K.A., Eshtukova-Shcheglova E.A., Markov O.V., Markov A.V., Chernikov I.V., Maslov M.A., Zenkova M.A. Bioorg. Med. Chem. 2022. P. 117089. DOI: 10.1016/j.bmc.2022.117089 - Single Shot vs. Cocktail: A Comparison of Mono- and Combinative Application of miRNA-Targeted Mesyl Oligonucleotides for Efficient Antitumor Therapy. Miroshnichenko S.K., Patutina O.A., Sen'kova A.V., Burakova E.A., Savin I.A., Markov A.V., Shmendel E.V., Maslov M.A., Stetsenko D.A., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Cancers. 2022. V. 14. N 18. e.4396. DOI: 10.3390/cancers14184396 - Dendritic Cell-Derived Artificial Microvesicles Inhibit RLS40 Lymphosarcoma Growth in Mice via Stimulation of Th1/Th17 Immune Response. Markov O.V., Sen'kova A.V., Mohamed E.I., Shmendel E.V., Maslov M.A., Oshchepkova A.L., Brenner E.V., Mironova N.L., Zenkova M.A. Pharmaceutics. 2022. V. 14. N 11. P. 2542. DOI: 10.3390/pharmaceutics14112542 - Identification of neutralizing epitopes of the vaccinia virus H3L protein. Khlusevich Y.A., Emelyanova L., Matveev A.L., Goncharova E.P., Shevelev G.Yu., Tikunova N.V. Febs Open Bio. 2022. V. 12. S. 1. P. 160-161. DOI: 10.1002/2211-5463.13440 **(тезисы конференции)** - Diverse Neutrophil Functions in Cancer and Promising Neutrophil-Based Cancer Therapies. Sounbuli K., Mironova N.L., Alekseeva L.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 15827. DOI: 10.3390/ijms232415827 - RNA knockdown by synthetic peptidyl-oligonucleotide ribonucleases: behavior of recognition and cleavage elements under physiological conditions. Gebrezgiabher M., Zalloum W.A., Clarke D.J., Miles S.M., Fedorova A.A.., Zenkova M.A., Bichenkova E.V. J. Biomol. Struct. Dyn. 2021. V. 39. N 7. P. 2555-2574. DOI: 10.1080/07391102.2020.1751711 - A versatile solid-phase approach to the synthesis of oligonucleotide conjugates with biodegradable hydrazone linker. Meschaninova M.I., Entelis N.S., Chernolovskaya E.L., Venyaminova A.G. Molecules. 2021. V. 26. N 8. P. 2119. DOI: 10.3390/molecules26082119 - Interaction of Lipophilic Conjugates of Modified siRNAs with Hematopoietic Cells in vitro and in vivo. Chernikov I.V., Meschaninova M.I., Gladkikh D.V., Venyaminova A.G., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L. Russ. J. Bioorganic Chem. 2021. V. 47. N 2. P. 399-410. DOI: 10.1134/S1068162021020072 **(перевод)** - Взаимодействие липофильных конъюгатов модифицированных siРНК с гемопоэтическими клетками in vitro и in vivo. Черников И.В., Мещанинова М.И., Гладких Д.В., Веньяминова А.Г., Зенкова М.А., Власов В.В., Черноловская Е.Л. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 2. С. 195-207. DOI: 10.31857/S013234232102007X - Drug responsiveness of leukemic cells detected in vitro at diagnosis correlates with therapy response and survival in patients with acute myeloid leukemia. Kolesnikova M.A., Sen'kova A.V., Pospelova T.I., Zenkova M.A. Cancer Reports. 2021. e1362. DOI: 10.1002/cnr2.1362 - Novel Lipid-Oligonucleotide Conjugates Containing Long-Chain Sulfonyl Phosphoramidate Groups: Synthesis and Biological Properties. Derzhalova A.C., Markov O.V., Fokina A.A., Shiohama Y., Zatsepin T., Fujii M., Zenkova M.A., Stetsenko D.A. Applied Sciences (Basel). 2021. V. 11. N 3. P. 1-15. DOI: 10.3390/app11031174 - Site-Selective Artifical Ribonucleases: Renaissance of Oligonucleotide Conjugates for Irreversible Cleavage of RNA Sequences. Staroseletc Y.Y., Miroshnichenko S.K., Patutina O.A., Bichenkova E.V., Amirloo B., Heyman T., Chiglintceva D.A., Zenkova M.A. Molecules. 2021. V. 26. e 1732. DOI: 10.3390/molecules26061732 - Human recombinant DNase I (Pulmozyme®) inhibits lung metastases in murine metastatic B16 melanoma model that correlates with restoration of the DNase activity and the decrease SINE/LINE and c-Myc fragments in blood cell-free DNA. Alekseeva L.A., Sen'kova A.V., Savin I.A., Zenkova M.A., Mironova N.L. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. P. 12074. DOI: 10.3390/ijms222112074 - Deoxycholic acid as a molecular scaffold for tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibition: a synthesis, structure–activity relationship and molecular modeling study. Salomatina O.V., Popadyuk I.I., Komarova N.I., Salakhutdinov N.F., Volcho К.P., Zakharenko A.L., Zakharova O., Chepanova A.A., Dyrkheeva N.S., Anarbayev R.O., Lavrik O.I., Reynisson J. Steroids. 2021. V. 165. С. 108771. DOI: 10.1016/j.steroids.2020.108771 - Folate-Equipped Cationic Liposomes Deliver Anti-MDR1-siRNA to the Tumor and Increase the Efficiency of Chemotherapy. Gladkikh D.V., Sen'kova A.V., Chernikov I.V., Kabilova T.O., Popova N.A., Nikolin V.P., Shmendel E.V., Maslov M.A., Vlassov V.V., Zenkova M.A., Chernolovskaya E.L. Pharmaceutics2021. V. 13. P. 1252. DOI: 10.3390/pharmaceutics13081252 - Триазиниламидофосфатные олигонуклеотиды: получение и исследование их взаимодействия с клетками и ДНК-связывающими белками. Купрюшкин М.С., Жарков Т.Д., Ильина Е.С., Марков О.В., Кочеткова А.С., Ахметова М.М., Ломзов А.А., Пышный Д.В., Лаврик О.И., Ходырева С.Н. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 3. С. 348-364. DOI: 10.31857/S0132342321030118 - Folate-containing liposomal drug formulations as potential anticancer agents. Shmendel E.V., Zenkova M.A., Maslov M.A. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 312-313. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 - Anticancer activity of lipopolyamines. Perevoshchikova K., Shcheglova E., Markov A.V., Markov O.V., Maslov M.A., Zenkova M.A. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 313. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 - Role of cell-free DNA and deoxyribonucleases in tumor progression. Alekseeva L.A., Mironova N.L. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. P. 12246. DOI: 10.3390/ijms222212246 - Tropism of Extracellular Vesicles and Cell-Derived Nanovesicles to Normal and Cancer Cells: New Perspectives in Tumor-Targeted Nucleic Acid Delivery. Oshchepkova A.L., Markov O.V., Evtushenko E., Chernonosov A.A., Kiseleva E., Morozova K., Matveeva V., Artemyeva L.V., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Pharmaceutics. 2021. V. 13. P. 1911. DOI: 0.3390/pharmaceutics13111911 - Core genes involved in the regulation of acute lung injury and their association with COVID-19 and tumor progression: A bioinformatics and experimental study. Sen'kova A.V., Savin I.A., Brenner E.V., Zenkova M.A., Markov A.V. PloS ONE. 2021. V. 16. N 11. e0260450. DOI: 10.1371/journal.pone.0260450 - Uncovering the anti-angiogenic effect of semisynthetic triterpenoid CDDO-Im on HUVECs by an integrated network pharmacology approach. Markov A.V., Odarenko K.V., Ilyina A.A., Zenkova M.A. Comput. in Biol. and Med. 2021. P. 105034. DOI: 10.1016/j.compbiomed.2021.105034 - Хроническая обструктивная болезнь лёгких в условиях воздействия промышленных аэрозолей, содержащих наночастицы: особенности воспаления и фенотип. Зенкова М.А., Сапрыкин А.И., Логашенко Е.Б., Шпагин И.С., Котова О.С., Цыганкова А.Р., Кузнецова Г.В., Аникина Е.В., Камнева Н.В., Герасименко Д.А. Медицина труда и промышленная экология. 2021. Т. 61. № 8. С. 488-496. DOI: 10.31089/1026-9428-2021-61-8-488-496 - Antigen-Specific Stimulation and Expansion of CAR-T Cells Using Membrane Vesicles as Target Cell Surrogates. Ukrainskaya V., Rubtsov Y., Pershin D., Podoplelova N., Terekhov S., Yaroshevich I., Sokolova A., Bagrov D., Kulakovskaya E., Shipunova V., Deyev S., Ziganshin R., Chernov A., Telegin G., Maksimov E., Markov O.V., Oshchepkova A.L., Zenkova M.A., Xie J., Zhang H., Gabibov A., Maschan M., Stepanov A., Lerner R. Small. 2021. V. 45. e2102643. DOI: 10.1002/smll.202102643 - Activation of Innate Immunity by Therapeutic Nucleic Acids. Bishani А., Chernolovskaya E.L. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. N. 13360. P. 1-19. DOI: 10.3390/ijms222413360 - Exacerbations of occupational chronic obstructive pulmonary disease due to industrial aerosols containing nanoparticles after recovering from COVID-19. Shpagina L., Zenkova M.A., Shpagin I., Kotova O., Logashenko E.B., Saprykin A., Tsygankova A., Kamneva N., Anikina E., Gerasimenko D., Likhenko-Logvinenko K. European Respiratory Journal. 2021. V. 58. N 65. PA3177. DOI: 10.1183/13993003.congress-2021.PA3177 **(тезисы конференции)** \\ ===== Лекции ===== * {{:ru:structure:labs:лекция_химия-биополимеров4_иллюстрации.pdf|.}}Нуклеиновые кислоты. * {{:ru:structure:labs:лекция_химия_биополимеров4.pdf|.}}Механизмы интернализации нуклеиновых кислот эукариотическими клетками. * {{:ru:structure:labs:тнк_популярная_статья.pdf|.}}Что такое терапевтические нуклеиновые кислоты и как они взаимодействуют с клетками. ---- ===== Патенты ===== \\ * **СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЛЕЧЕНИЯ БОЛЬНЫХ ОСТРЫМИ МИЕЛОБЛАСТНЫМИ ЛЕЙКОЗАМИ ПРОТИВООПУХОЛЕВЫМИ ПРЕПАРАТАМИ ДВУНОРОБИЦИНОМ И ЦИТОЗИН-АРАБИНОЗИДОМ**. Колесникова М.А., Сенькова А.В., Черников И.В.. Поспелова Т.И.. Зенкова М.А., Ковынев И.Б. // Патент РФ № 2702657. Приоритет от 03.06.2019. Дата регистрации 9.10.2019 г. * **ВОДОРАСТВОРИМАЯ КОМПОЗИЦИЯ, ОБЛАДАЮЩАЯ ПРОТИВООПУХОЛЕВОЙ АКТИВНОСТЬЮ И СПОСОБ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ**. Саломатина О.В., Салахутдинов Н.Ф., Зенкова М.А., Логашенко Е.Б., Марков А.В., Болдырева Е.В., Огиенко А.Г., Огиенко А.А., Богданова Е.Г. // Патент РФ № 2611362. Приоритет от 26.11.2015. Дата регистрации 21.02.2017 г. - **ПОЛИЭТИЛЕНГЛИКОЛЬ-СОДЕРЖАЩИЙ ЛИПИД, КОМПОЗИЦИЯ НА ЕГО ОСНОВЕ С КАТИОННЫМ АМФИФИЛОМ И НЕЙТРАЛЬНЫМ ФОСФОЛИПИДОМ И СПОСОБ ЕЕ ПОЛУЧЕНИЯ ДЛЯ ДОСТАВКИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ IN VIVO.** Шмендель Е.В., Кабилова Т.О., Морозова Н.Г., Маслов М.А., Зенков Н.К. 2017 г. № 2683572 - **СРЕДСТВО, ОБЛАДАЮЩЕЕ ПРОТИВОВИРУСНОЙ АКТИВНОСТЬЮ В ОТНОШЕНИИ ВИРУСА ГРИППА**. Костыро Я.А., Гончарова Е.П., Солдатенко А.С., Зенкова М.А., Власов В.В., Иванов Андрей В.2016 г. № 2635765 - **СПОСОБ ОЧИСТКИ ВИРУСА ОСПОВАКЦИНЫ ИЛИ ЕГО РЕКОМБИНАНТНЫХ ВАРИАНТОВ**. Гончарова Е.П., Петров И.С., Зенкова М.А. 2014 № 2537000.\\ - **СРЕДСТВО, ОБЛАДАЮЩЕЕ АНТИОКСИДАНТНОЙ, ПРОТИВОВОСПАЛИТЕЛЬНОЙ, НЕЙРОПРОТЕКТОРНОЙ, ГИПОЛИПИДЕМИЧЕСКОЙ, ГИПОХОЛЕСТЕРИНЕМИЧЕСКОЙ, ГИПОГЛИКЕМИЧЕСКОЙ, ГЕПАТОПРОТЕКТОРНОЙ, ИММУНОСУПРЕССОРНОЙ АКТИВНОСТЯМИ**. Саломатина О.В., Салахутдинов Н.Ф., Толстиков Г.А.. Логашенко Е.Б., Марков А.В., Зенкова М.А.. Власов В.В., Бельская Н.В., Бельский Ю.П. Патент № 2487884. Приоритет от 13.07.2012 г. Дата регистрации 20.07.2013 г. - **СРЕДСТВО, ПРОЯВЛЯЮЩЕЕ ПРОТИВИРУСНУЮ АКТИВНОСТЬ В ОТНОШЕНИИ ДНК- ВИРУСОВ**. Федорова А.А., Гончарова Е.П., Буракова Е.А., Сильников В.Н., Власов В.В., Зенкова М.А. 2013 № 2487876.\\ - **КОМПОЗИЦИЯ ДЛЯ ДОСТАВКИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ В КЛЕТКИ МЛЕКОПИТАЮЩИХ**. Зенкова М.А., Кабилова Т.О., Маслов М.А., Морозова Н.Г., Петухов И.А., Серебренникова Г.А. 2011 № 2423147.\\ - **ПРОТИВООПУХОЛЕВОЕ СРЕДСТВО ТРИТЕРПЕНОВОЙ ПРИРОДЫ, ПОЛУЧЕННОЕ ПУТЕМ МОДИФИКАЦИИ ГЛИЦИРРЕТОВОЙ КИСЛОТЫ**. Саломатина О.В., Салахутдинов Н.Ф., Толстиков Г.А., Логашенко Е.Б., Зенкова М.А., Власов В.В. 2010 № 2401273.\\ - **ПРОТИВООПУХОЛЕВОЕ СРЕДСТВО ТРИТЕРПЕНОВОЙ ПРИРОДЫ**. Саломатина О.В., Салахутдинов Н.Ф., Толстиков Г.А., Логашенко Е.Б., Зенкова М.А., Власов В.В. 2010 № 2393165.\\ - **РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pSC13D6, СОДЕРЖАЩАЯ ГЕН ОДНОЦЕПОЧЕЧНОГО АНТИТЕЛА ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, И ШТАММ БАКТЕРИЙ Escherichia coli BL21(DE3)/pSC13D6 - ПРОДУЦЕНТ ОДНОЦЕПОЧЕЧНЫХ АНТИТЕЛ ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ОБЛАДАЮЩИХ ВИРУСНЕЙТРАЛИЗУЮЩИМИ СВОЙСТВАМИ**. Леванов Л.Н., Тикунова Н.В., Матвеев Л.Э., Гончарова Е.П., Юн Т.Э., Рыжиков А.Б., Матвеева В.А., Рихтер В.А. 2010 № 2378378.\\ - **СРЕДСТВО, ОБЛАДАЮЩЕЕ ПРОТИВОВИРУСНОЙ АКТИВНОСТЬЮ**. Королева Л.С., Власов В.В., Гончарова Е.П., Зенкова М.А., Ковалев Н.А., Ковпак М.П., Сильников В.Н., Тамкович Н.В. 2010 № 2402563.\\ - **rac-N-[2,3-ДИ(ТЕТРАДЕЦИЛОКСИ)ПРОП-1-ИЛ]ПИРИДИНИЙ БРОМИД В КАЧЕСТВЕ АГЕНТА ДЛЯ ДОСТАВКИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ В КЛЕТКИ МЛЕКОПИТАЮЩИХ**. Маслов М.А., Медведева Д.А., Власов В.В., Зенкова М.А., Морозова Н.Г., Серебренникова Г.А. 2010 № 2405772.\\ - **СРЕДСТВО ДЛЯ ИНАКТИВАЦИИ ДНК-ВИРУСОВ.** Федорова А.А., Гончарова Е.П., Королева Л.С., Сильников В.Н., Власов В.В., Зенкова М.А. 2013 № 2480478.\\ - **ПРОИЗВОДНЫЕ N-ЗАМЕЩЕННОГО 1,4-ДИАЗАБИЦИКЛО-[2.2.2]-ОКТАНА, ПРОЯВЛЯЮЩИЕ ПРОТИВОВИРУСНУЮ АКТИВНОСТЬ В ОТНОШЕНИИ РНК-ВИРУСОВ**. Буракова Е.А., Власов В.В., Гончарова Е.П., Зенкова М.А., Ковалев Н.А., Ковпак М.П., Сильников В.Н., Тамкович Н.В. 2010 № 2399669.\\ - **УГЛЕВОДСОДЕРЖАЩИЕ КАТИОННЫЕ АМФИФИЛЫ, ОБЛАДАЮЩИЕ СПОСОБНОСТЬЮ ДОСТАВЛЯТЬ НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ В КЛЕТКИ МЛЕКОПИТАЮЩИХ**. Маслов М.А., Медведева Д.А., Власов В.В., Зенкова М.А., Морозова Н.Г., Серебренникова Г.А. 2010 № 2394834.\\ - **СРЕДСТВО ДЛЯ ИНАКТИВАЦИИ ВИРУСОВ, ОБЛАДАЮЩЕЕ ОДНОВРЕМЕННОЙ РИБОНУКЛЕАЗНОЙ, МЕМБРАНОЛИТИЧЕСКОЙ И ПРОТИВОВИРУСНОЙ АКТИВНОСТЯМИ**. Королева Л.С., Власов В.В., Гончарова Е.П., Зенкова М.А., Ковалев Н.А., Ковпак М.П., Сильников В.Н., Тамкович Н.В. 2010 № 2399388.\\ - **ФРАГМЕНТЫ ДВУЦЕПОЧЕЧНОЙ РНК, ОБЛАДАЮЩИЕ АНТИПРОЛИФЕРАТИВНОЙ И ИНТЕРФЕРОН-ИНДУЦИРУЮЩЕЙ АКТИВНОСТЯМИ**. Кабилова Т.О., Черноловская Е.Л., Зенкова М.А., Власов В.В. 2010 № 2391405.\\ - **СПОСОБ ЛЕЧЕНИЯ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ ОПУХОЛЕЙ У ЖИВОТНЫХ**. Шкляева О.А., Миронова Н.Л., Зенкова М.А., Власов В.В. 2008 № 2317825.\\ - **ОЛИГОНУКЛЕОТИДПЕПТИДНЫЙ КОНЪЮГАТ, ОБЛАДАЮЩИЙ СПОСОБНОСТЬЮ РАСЩЕПЛЯТЬ ФОСФОДИЭФИРНЫЕ СВЯЗИ РНК В ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ 5'GpN3'**. Миронова Н.Л., Пышный Д.В., Штадлер Д.В., Зенкова М.А., Власов В.В. 2007 № 2305108.\\ ---- ===== Оборудование ===== \\ Лаборатория располагает уникальным набором современного оборудования:\\ * Прибор для HCS анализа (In Cell Analyzer 2000) * Микроскоп Axioplаn c камерой MRe5 (Zeiss) * Амплификатор iCyclerIQ5 (BioRad) * Амплификатор (Eppendorf) * Спектрофотометр * Гомогенизатор в комплекте с адаптером Quick Prep * Анализатор биохимический автоматический * Многоканальный фотометр Multiscan RS (Thermo Scientific) * хроматограф Waters Alliance, амплификаторы для проведения PCR в режиме реального времени (Bio-Rad); * роботизированная система пробоподготовки (Eppendorf); * полный комплект электрофоретического оборудования; * флуоресцентные микроскопы, оборудованные ССД-камерами (Zeiss); * цитофлюориметр Cytomics FX500 (Beckman Coulter); * фосфоримаджер (Bio-Rad); * система гель-документации Infinity-1500/36M (Vilber Lormat).