Анализ нуклеиновых кислот [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
» ЦКП "Геномика" СО РАН » Научно-исследовательская работа » Анализ нуклеиновых кислот
Анализ нуклеиновых кислот

Анализ нуклеиновых кислот


Agilent 2100 Bioanalyzer - это прибор для автоматического разделения нуклеиновых кислот (ДНК, РНК), использующий для этого электрофорез на микрофлюидном чипе. К преимуществам прибора следует отнести высокую чувствительность, высокое разрешение и автоматизированный процесс анализа и обсчета полученных данных.

Наиболее рациональным использованием Bioanalyzer 2100 является анализ образцов нуклеиновых кислот, для оценки качества которых не хватает чувствительности традиционного гель-электрофореза. В частности это касается анализа полученных библиотек для высокопроизводительного секвенирования, а также случаев когда исходного материала, из которого выделяются нуклеиновые кислоты, слишком мало. В таких случаях для анализа ДНК мы используем High Sensitivity DNA Kit (от 5 pg), а РНК - RNA 6000 Pico Kit (50 pg). Немаловажной особенностью последнего является возможность определение индекса целостности выделенной РНК (RNA Integrity Number (RIN)).



Характеристики DNA 1000 Kit High Sensitivity DNA Kit RNA 6000 Pico Kit Small RNA
Диапазон, bp 25–1000 50-7000 150-6000 6-150

Точность
25–100 bp ±5 bp
100–500 bp ±5%
500–1000 bp ±10%
50-600 bp ±10%
600-7000 bp± 20%
- -
Чувствительность0.5-50 ng/µL 5-500 pg/µL 50-5000 pg/µL (total RNA)
250-5000 pg/µL (mRNA)
10-100 ng/µL (total RNA)
>50 pg/µL (miRNA)
Кол-во образцов на чип 12 11 11 11
Время анализа, мин 35 45 30 30



Существуют и другие виды чипов для анализа ДНК и РНК.

Результаты анализа могут быть представлены как в виде хроматограмм, так и привычных электрофореграмм.
Для просмотра файлов необходимо воспользоваться 2100 Expert Software.



C 2005 г. проанализировано

379689

образцов


© Copyright 2018. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика