Типовые варианты работ [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
» ЦКП "Геномика" СО РАН » Научно-исследовательская работа » Секвенирование по Сэнгеру » Типовые варианты работ
Типовые варианты работ

Типовые варианты работ


1. Анализ готовых реакций Сэнгера

Заказчик:

  • проводит амплификацию и очистку ДНК для секвенирования;
  • ставит реакцию Сэнгера с использованием собственного BigDye;
  • очищает пробы от невключившегося BigDye и солей;
  • высылает для анализа высушенные продукты реакции Сэнгера.


ЦКП:

  • растворяет очищенные реакции Сэнгера и анализирует на капиллярном секвенаторе;
  • обрабатывает секвенограммы программным обеспечением;
  • предоставляет заказчику данные в виде файлов секвенограмм.


Оплачиваются все образцы, как получившиеся так и не получившиеся.

Требования к образцам



2. Проведение реакций Сэнгера и их анализ

Заказчик:

  • проводит амплификацию и очистку ДНК для секвенирования;
  • смешивает 0,3-0,5 pmol ДНК и 5 pmol праймера и в высушенном виде высылает для анализа.


ЦКП:

  • проводит реакцию Сэнгера;
  • очищает пробы от невключившегося BigDye и солей;
  • анализирует пробы на капиллярном секвенаторе;
  • обрабатывает секвенограммы программным обеспечением;
  • предоставляет заказчику данные в виде файлов секвенограмм.


Оплачиваются все образцы, как получившиеся так и не получившиеся.



3. Секвенирование ДНК с гарантией результата (только совместные работы с ЦКПГ)

Заказчик:

  • предоставляет амплифицированные образцы ДНК;
  • предоставляет концентрированные растворы специфических праймеров.


ЦКП:

  • проводит необходимые операции доочистки ДНК;
  • проводит реакцию Сэнгера;
  • очищает пробы от невключившегося BigDye и солей;
  • анализирует пробы на капиллярном секвенаторе;
  • обрабатывает секвенограммы программным обеспечением;
  • предоставляет заказчику данные в виде файлов секвенограмм.


Оплачиваются ТОЛЬКО получившиеся образцы.



4. Полный цикл секвенирования ДНК с гарантией результата (только совместные работы с ЦКПГ)

Заказчик:

  • предоставляет образцы ДНК;
  • предоставляет концентрированные растворы специфических праймеров (при наличии).


ЦКП:

  • проводит при необходимости амплификацию и очистку ДНК;
  • выбирает и синтезирует специфические праймеры для секвенирования;
  • проводит реакцию Сэнгера;
  • очищает пробы от невключившегося BigDye и солей;
  • анализирует пробы на капиллярном секвенаторе;
  • обрабатывает секвенограммы программным обеспечением;
  • предоставляет заказчику данные в виде файлов секвенограмм.


Оплачиваются ТОЛЬКО получившиеся образцы.




C 2005 г. проанализировано

399177

образцов


© Copyright 2019. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика