Требования к качеству ДНК [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
» ЦКП "Геномика" СО РАН » Научно-исследовательская работа » De novo секвенирование бактериальных и вирусных геномов » Требования к качеству ДНК
Требования к качеству ДНК

Требования к качеству ДНК





1. ДНК должна быть растворена в деионизованной воде с концентрацией не менее 20 нг/мкл.

2. В образце ДНК должна быть измерена концентрация РНК на Qubit. В том случае, если концентрация РНК >20% от концентрации ДНК, препарат должен быть обработан РНКазой, очищен от последней, а измерения повторены.

3. Необходимо привести спектр поглощения (200-300 нм) образца ДНК. Спектр должен быть классическим с максимумом на 260 нм и минимумом на 230 нм. Соотношение A260/ A280 1.6-1.8, а A260/ A230 в пределах 2-2.2.

4. Общее количество ДНК, измеренной на Qubit, должно составлять не менее 500 нг и не должно отличаться более чем на 20% от количества определенного при A260 на спектрофотометре.

5. Необходимо привести электрофорез образца ДНК с нанесенным маркером, из которого будет видно, что длина фрагментов ДНК составляет не менее 10 Кб. Последнее особенно критично, если планируется сборка кольцевого бактериального генома с использованием MinIon.



C 2005 г. проанализировано

405388

образцов


© Copyright 2019. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика