====== Анализ нуклеиновых кислот ====== \\ **[[http://www.genomics.agilent.com/en/Bioanalyzer-System/2100-Bioanalyzer-Instruments/?cid=AG-PT-106&tabId=AG-PR-1001&callback=datacallback&searchText=bioanal&_=1403774250215|Agilent 2100 Bioanalyzer]]** - это прибор для автоматического разделения нуклеиновых кислот (ДНК, РНК), использующий для этого электрофорез на микрофлюидном чипе. К преимуществам прибора следует отнести высокую чувствительность, высокое разрешение и автоматизированный процесс анализа и обсчета полученных данных. \\ \\ Наиболее рациональным использованием Bioanalyzer 2100 является анализ образцов нуклеиновых кислот, для оценки качества которых не хватает чувствительности традиционного гель-электрофореза. В частности это касается анализа полученных библиотек для высокопроизводительного секвенирования, а также случаев когда исходного материала, из которого выделяются нуклеиновые кислоты, слишком мало. В таких случаях для анализа ДНК мы используем **High Sensitivity DNA Kit** (от 5 pg), а РНК - **RNA 6000 Pico Kit** (50 pg). Немаловажной особенностью последнего является возможность определение индекса целостности выделенной РНК ([[http://www.genomics.agilent.com/GenericA.aspx?PageType=Custom&SubPageType=Custom&PageID=2181|RNA Integrity Number (RIN)]]). \\ \\ {{:sequest:equipment:bioanalyzer.jpg?nolink&375|}} ^Характеристики ^DNA 1000 Kit ^DNA 12000 Kit ^High Sensitivity DNA Kit ^RNA 6000 Pico Kit ^Small RNA ^ |Диапазон, bp | 25–1000 |100-12000 |50-7000 | 150-6000 | 6-150 | |\\ Точность | 25–100 bp ±5 bp \\ 100–500 bp ±5% \\ 500–1000 bp ±10% |100-1000 bp ±5% \\ 1000-12000 bp ±15% |50-600 bp ±10% \\ 600-7000 bp ±20%| - | - | |Чувствительность|0.5-50 ng/µL |0.5-50 ng/µL |5-500 pg/µL |50-5000 pg/µL (total RNA) \\ 250-5000 pg/µL (mRNA)| 10-100 ng/µL (total RNA)\\ >50 pg/µL (miRNA)| |Кол-во образцов на чип |12 |12 |11 |11| 11 | |Время анализа, мин |35 |30 |45 |30 | 30 | \\ \\ Существуют и другие виды [[http://www.genomics.agilent.com/en/Bioanalyzer-DNA-RNA-Kits/DNA-Analysis-Kits/?cid=AG-PT-105&tabId=AG-PR-1040&cid=AG-PT-105|чипов]] для анализа ДНК и РНК. \\ \\ Результаты анализа могут быть представлены как в виде хроматограмм, так и привычных электрофореграмм.\\ Для просмотра файлов необходимо воспользоваться [[http://www.agilent.com/cs/library/software/Public/2100_Expert_B0209_SI725_SR1.exe|2100 Expert Software]].\\ \\ {{:sequest:foruser:bioanalyzer1.jpg?direct&500|}} {{:sequest:foruser:gel.jpg?direct&500|}}