====== Фрагментный анализ ====== \\ Секвенаторы откалиброваны на 2 набора красок ({{:sequest:foruser:abi_dye_set_card.pdf|Dye Set 32 и 33}}). Один из красителей (LIZ или ROX) в этих наборах зарезервирован для стандарта длин. В центре имеются стандарты длин GeneScan LIZ-120, 500, 600 и GeneScan ROX-500. В случае необходимости анализа более длинных фрагментов необходимо закупать соответствующий стандарт длин у Life Technologies.\\ \\ Образцы на фрагментный анализ передаются в центр либо в высушенном виде без добавления стандарта длин или растворенными в формамиде с добавлением стандарта длин. Высушенные образцы могут храниться в холодильнике.\\ {{:sequest:foruser:frag_analysis.jpg?nolink&500|}} \\ Растворенные образцы должны быть нанесены на секвенатор в день растворения поэтому необходимо передавать такие образцы в первой половине рабочего дня. Растворять образцы необходимо в 20 мкл деионизованного формамида и только от Applied Biosystems (можно получить в центре). При использовании формамида стороннего производителя нанесение образцов на секвенатор не гарантируется.\\ Если планируется передача целой плашки образцов, то **одно место должно быть свободно для контроля**, т.е. максимум это 95 образцов. \\ \\ Образцы должны передаваться только в следующем типе пластика: * Стрипованные пробирки на 250 мкл для ПЦР (цельные, 8 пробирок/стрип, full profile) от Life Technologies, Axygen, Bio-Rad или Eppendorf. * Планшет на 250 мкл для ПЦР (96 лунок, semi-skirted, full profile) от Life Technologies, Axygen, Bio-Rad или Eppendorf. \\ Полученные результаты обсчитываются пользователем при помощи бесплатной программы [[http://downloads.lifetechnologies.com/Instrument_Software/CE/PeakScanner/v2.0/PeakScanner-V2_0.zip|Peak Scanner 2.0]]. Если ссылка перестала работать, то вы можете после регистрации скачать её на сайте [[http://resource.thermofisher.com/page/WE28396_2/|Thermo Fisher]]. \\ \\ {{:sequest:foruser:dna_fragment_analysis_by_capillary_electroforesis.pdf|Руководство пользователя по фрагментному анализу}} \\ {{:sequest:foruser:peakscanner_basic_size_analysis.pdf|Peakscanner_basic size analysis}} \\ {{:sequest:foruser:peakscanner_faq.pdf|Peakscanner_FAQ}} \\ {{:sequest:foruser:peakscanner_instructions.pdf|Peakscanner_instructions}} \\