sequest:research:devices:small_genomes:serotyping

Серотипирование


Серотип (Серовар) — группа микроорганизмов одного вида, объединяемых общей антигенной структурой, определяемой иммунологическими методами. Серотип не является таксономической категорией и позволяет систематизовать патогенные и условно-патогенные микроорганизмы, что необходимо в эпидемиологических исследованиях. Их систематизация ведётся на основе вирулентности, липополисахаридов (ЛПС), грамотрицательности, присутствия экзотоксинов, генетических особенностей или других факторов, позволяющих различить двух особей одного вида.

Род Сальмонелл (Salmonella) в некотором роде является уникальным, для него описано более 2600 серотипов. Лабораторная диагностика сальмонеллезов основана на ферментативной и антигенной характеристиках (схема Кауффмана—Уайта), которые позволяют отнести выделенный штамм к роду Salmonella, виду, подвиду и серологическому варианту. Однако, традиционное серотипирование имеет ряд недостатков, включая трудоемкость и высокую стоимость сывороток.

В качестве альтернативы ЦКП «Геномика» предлагает проведение полногеномного секвенирования с последующим определением серотипа по генетическим детерминантам.