====== Таксономическая идентификация бактерий и архей ====== \\ \\ {{ :sequest:research:taxonomy.jpg?nolink&300 |}} Как правило, таксономическая идентификация прокариот начинается с секвенирования и анализа гена 16S рРНК. Однако, нередко наблюдается ситуация когда близкие виды имеют полностью или почти одинаковые гены 16S рРНК. В этом случае необходимо анализировать дополнительные маркеры, набор которых может отличаться для разных видов. \\ \\ В качестве более точной альтернативы ЦКП "Геномика" проводит таксономическую идентификацию по результатам полногеномного секвенирования, данные которого используются для построения общего филогенетического дерева ([[https://gtdb.ecogenomic.org|GTDB]]) по порядку 120 прокариотическим генам. Именно такой подход является наиболее точным вариантом установления таксономии в настоящий момент и его результаты в некоторых случаях привели к существенному изменению положения ряда таксонов.