Геномный секвенатор SOLiD 5500xl [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
» ЦКП "Геномика" СО РАН » Приборная база » Геномный секвенатор SOLiD 5500xl
Геномный секвенатор SOLiD 5500xl

Геномный секвенатор SOLiD 5500xl



SOLiD 5500xl это экономичный геномный секвенатор последнего поколения, работающий по принципу оплаты реактивов только за используемую дорожку (Pay-Per-Lane Sequencing). Секвенировать можно сразу на 2-х проточных чипах, в каждой из которых имеется 6 независимых дорожек. Это позволяет конфигурировать длину чтения на каждой дорожке индивидуально, а также анализировать различные типы библиотек. Возможность использования баркодов увеличивает возможности анализа до 96 образцов в одной дорожке. Запуск прибора с двумя проточными чипами позволяет проанализировать до 16 экзомов/транскриптомов и 2-х геномов человека с 30-ти кратным покрытием чтения. Использование системы ECC (Exact Call Chemistry) позволяет достичь точности чтения 99,99 %. Объем анализируемых данных может достигать 10-15 Гигабаз в день, причем на 1 дорожке можно пронализировать 1 экзом за 2 дня, 1 транскриптом – 3.5 дня, 1 геном человека с 4-5-кратным покрытием – 7 дней. Длина прочтения для фрагментной библиотеки увеличена до 75 букв, а для библиотеки парных фрагментов до 60 букв.

Возможности прибора

  1. Полногеномное ресеквенирование.
  2. Секвенирование полного экзома и транскриптома.
  3. Секвенирование метагенома.
  4. Изучение регуляции экспрессии генов (микроРНК, CHIP-seq).
  5. Определение профиля метилирования.


Описание SOLiD 5500xl



C 2005 г. проанализировано

379689

образцов


© Copyright 2018. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика