2024

1. Агафонов А.В., Шабанова Е.В., Асбаганов С.В. Микроэволюционные отношения между сибирскими видами Elymus margaritae, E. komarovii и E. transbaicalensis (Poaceae) по данным секвенирования ядерного гена GBSS 1 (waxy) и гибридизации. Журнал Сибирского Федерального Университета. Серия: Биология 2024. 17. 3. 248–263
2. Андреева А.С., Тотменина О.Д., Кабанов А.С., Антонец М.Е., Боднев С.А., Трегубчак Т.В., Аликина Т.Ю., Батурина О.А., Бауэр Т.В., Ребус М.Е., Сафатов А.С., Кабилов М.Р. Оценка патогенного потенциала микроорганизмов атмосферных аэрозолей. Здоровье населения и среда обитания 2024. 32. 4. 27–36
3. Бадмаева Н.К. Молекулярно-генетические исследования видов рода Leymus Hochst. (Poaceae). Проблемы Ботаники Южной Сибири И Монголии 2024. 23–1. 23–27
4. Давыдова Н.В., Мишукова О.В., Афонюшкин В.Н., Миронова Т.Е., Козлова О.С. Изучение симбиотических взаимодействий микроскопических грибов и бактерий, выделенных от сельскохозяйственной птицы и свиней. Птицеводство 2024. 2. 35–43
5. Зайков В.Ф., Кечайкин А.А., Скапцов М.В., Смирнов С.В., Дорофеев В.И., Анисимов А.В., Баткин А.А., Панкратов С.Ю., Шмаков А.И. Ревизия серии Bungeanae рода Pulsatilla (Ranunculaceae) на основе морфологических и молекулярно-генетических данных. Turczaninowia 2024. 27. 2. 71–85
6. Каминская Я.П., Ильчибаева Т.В., Козлова Т.А., Колосова Н.Г., Науменко В.С., Цыбко А.С. Развитие Признаков Болезни Альцгеймера У Крыс Oxys Сопровождается Снижением Экспрессии Дофаминового Нейротрофического Фактора Мозга (cdnf) И Не Компенсируется Его Сверхэкспрессией. Нейрохимия 2024. 41. 4. 372–383
7. Лаврентьева Е.В., Раднагуруева А.А., Батурина О.А., Хахинов В.В. Таксономическое разнообразие микробного сообщества в термальном источнике Кучигер (Байкальская рифтовая зона). Сибирский Экологический Журнал 2024. 31. 1. 30–40
8. Леонов П.А., Юрлова Г.В., Полубоярова Т.В., Васильев Г.В., Шипова А.А., Голованова Е.В., Шеховцов С.В., Зубко К.С. Митохондриальный геном Eisenia altaica (Lumbricidae, Annelida). Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции 2024. 10. 2. 93–98
9. Масленникова В.С., Пыхтина М.Б., Табанюхов К.А., Шелихова Е.В., Мосалев К.И., Катохин А.В., Бондарь А.А., Беклемишев А.Б., Воевода М.И. Распространенность и видовой состав вирусов картофеля в Новосибирской области. Вавиловский Журнал Генетики и Селекции 2024. 28. 5. 554–562
10. Минаков И.Д., Путилин И.Р., Зотина Т.А., Ямских И.Е., Куцев М.Г., Киприянова Л.М. Морфологические и экологические особенности жестколистного водяного лютика Ranunculus subrigidus (Batrachium, Ranunculaceae) в реке Енисей (Сибирь, Россия). Turczaninowia 2024. 27. 1. 171–185
11. Панкова Т.В., Ломоносова М.Н., Ваулин О.В., Королюк А.Ю., Королюк Е.А., Шауло Д.Н., Осмонали Б. Цитогеография полиплоидного комплекса Bassia prostrata s. l. (Chenopodiaceae) по данным анализа размера генома и PCR-RFLP хпДНК. Генетика 2024. 60. 3. 13–26
12. Петрова С.Г., Неустроев М.П., Женишбеков А.И. Штамм Бактерий Salmonella Abortus Equi Для Разработки Мер Борьбы. Вестник Ошского Государственного Университета. Сельское Хозяйство: Агрономия, Ветеринария И Зоотехния 2024. 2 (7). 111–122
13. Рябова К.К., Ямских И.Е., Степанов Н.В., Куцев М.Г. Сравнительный Морфологический И Генетический Анализ Популяций Corydalis Bracteata Sensu Lato (papaveraceae) Из Южной Сибири. Ботанический Журнал 2024. 109. 1. 83–98
14. Рябова К.К., Ямских И.Е., Хорева М.Г., Щеглова И.П., Мочалова О.А., Куцев М.Г. О секционной принадлежности видов Corydalis gorinensis, Corydalis gorodkovii и Corydalis magadanica, произрастающих на Дальнем Востоке. Turczaninowia 2024. 27. 3. 15–24
15. Сафатов А.С., Лаптева Н.А., Олькин С.Е., Андреева И.С., Буряк Г.А., Ребус М.Е., Резникова И.К., Аликина Т.Ю., Батурина О.А., Кабилов М.Р. Зависимость концентрации культивируемых микроорганизмов и суммарного белка от метеоусловий в окрестностях г. Новосибирска. Оптика Атмосферы И Океана 2024. 37. 6 (425). 468–474
16. Смирнов А.В., Рыжкова А.С., Юнусова А.М. Влияние ауксин-зависимой деградации когезина и конденсинов на репарацию двуцепочечных разрывов ДНК в эмбриональных стволовых клетках мыши. Вавиловский Журнал Генетики и Селекции 2024. 28. 6. 583–591
17. Терещенко Д.С., Гризанова Е.В., Шелихова Е.В., Аликина Т.Ю., Кабилов М.Р., Дубовский И.М. Сравнительный анализ иммунного ответа, кишечной микробиоты и восприимчивости к бактериям Bacillus thuringiensis у колорадского жука Leptinotarsa decemlineata. Журнал эволюционной биохимии и физиологии 2024. 60. 6. 649–664
18. Черепушкина В.С., Сысоева О.Е., Афонюшкин В.Н., Давыдова Н.В. Изучение случаев микозов у цыплят-бройлеров в Западно-Сибирском регионе в 2022 году с использованием различных методов диагностики. Птицеводство 2024. 2. 44–50
19. Чиркова В.Ю., Щербаков Д.Н., Колосов П.В., Ширманов М.В., Колосова Е.А., Малкова А.В., Шарлаева Е.А., Иркитова А.Н., Евдокимов И.Ю. Получение α-амилазы Bacillus amyloliquefaciens в экспрессионной системе Bacillus mojavensis и свойства рекомбинантного фермента. Биотехнология 2024. 40. 1. 42–50
20. Шеховцов С.В., Держинский Е.А., Голованова Е.В. Дождевые черви (Oligochaeta, Lumbricidae): соответствие между внутривидовым генетическим разнообразием и плоидностью. Вавиловский журнал генетики и селекции 2024. 28. 5. 563–570
21. Ямских И.Е., Мариничева А.Н., Новикова С.В., Степанов Н.В., Куцев М.Г. Молекулярные маркеры ITS и matK в исследовании филогении рода Anemone s. l. (Ranunculaceae). Проблемы Ботаники Южной Сибири И Монголии 2024. 23–2. 526–530
22. Agafonov A.V., Shabanova E.V., Asbaganov S.V. Genomic constitution and origin of the endemic intergeneric hybrid × Elyleymus magadanensis (Poaceae) from the Magadan Region (Russia). Botanica Pacifica: A Journal of Plant Science and Conservation 2024. 13. 2. 23–30
23. Andreeva I., Safatov A., Totmenina O., Olkin S., Rebus M., Buryak G., Alikina T., Baturina O., Kabilov M. Three-Year Monitoring of Microorganisms’ Composition and Concentration in Atmospheric Aerosols of Novosibirsk City and Suburbs. Microorganisms 2024. 12. 10. 2068
24. Bashmakova E.E., Kudryavtsev A.N., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Sokolov A.E., Frank L.A. Bioluminescent aptamer-based microassay for detection of melanoma inhibitory activity protein (MIA). Analytical Methods 2024. 16. 26. 4234–4239
25. Baturina O., Naumova N., Tupikin A., Dmitrienko E., Silnikov V., Kabilov M. Short-Term Changes in Fecal Bacteriobiome of Healthy Laboratory Mice After Antiviral Preparation Administration. Drugs and Drug Candidates 2024. 3. 4. 879–889
26. Bayramova E., Petrova D., Marchenkov A., Morozov A., Galachyants Y., Zakharova Y., Bedoshvili Y., Likhoshway Y. Differential Expression of Stress Adaptation Genes in a Diatom Ulnaria acus under Different Culture Conditions. International Journal of Molecular Sciences 2024. 25. 4. 2314
27. Belykh O.I., Krasnopeev A.Yu., Potapov S.A., Gutnik D.I., Sorokovikova E.G., Butina T.V., Tikhonova I.V. Ultramicrobacteria and filterable bacteria in the plankton of Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology 2024. 4. 795–820
28. Borisova T.V., Cherdonova A.M., Pshennikova V.G., Teryutin F.M., Morozov I.V., Bondar A.A., Baturina O.A., Kabilov M.R., Romanov G.P., Solovyev A.V., Fedorova S.A., Barashkov N.A. High prevalence of m.1555A > G in patients with hearing loss in the Baikal Lake region of Russia as a result of founder effect. Sci Rep 2024. 14. 1. 15342
29. Bulkhin A.O., Zykov V.V., Boyandin A.N., Marchenko D.N., Anishchenko O.V., Kabilov M.R., Rogozin D.Y. Polyunsaturated long-chain alkenones in the lake sediments of North-Minusinsk valley (southern Siberia) as a paleo-indicator of climate change. Limnology and Freshwater Biology 2024. 4. 286–291
30. Burakova L.P., Ivanisenko N.V., Rukosueva N.V., Ivanisenko V.A., Vysotski E.S. Design of Ctenophore Ca2+-Regulated Photoprotein Berovin Capable of Being Converted into Active Protein Under Physiological Conditions: Computational and Experimental Approaches. Life (Basel) 2024. 14. 11. 1508
31. Dementyeva E.V., Zaytseva A.K., Minina J.M., Melnik O.V., Zakian S.M., Kostareva A.A. Generation of an Induced Pluripotent Stem Cell Line ICGi045-A of a RASopathy Patient Carrying p.Glu329Lys Variant in SOS1. Russian Journal of Developmental Biology 2024. 55. 1. 26–33
32. Dyrkheeva N.S., Zakharenko A.L., Malakhova A.A., Okorokova L.S., Shtokalo D.N., Medvedev S.P., Tupikin A.A., Kabilov M.R., Lavrik O.I. Transcriptomic analysis of HEK293A cells with a CRISPR/Cas9-mediated TDP1 knockout. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects 2024. 1868. 7. 130616
33. Grigor’eva E.V., Malakhova A.A., Yarkova E.S., Minina J.M., Vyatkin Y.V., Nadtochy J.A., Khabarova E.A., Rzaev J.A., Medvedev S.P., Zakian S.M. Generation and characterization of two induced pluripotent stem cell lines (ICGi052-A and ICGi052-B) from a patient with frontotemporal dementia with parkinsonism-17 associated with the pathological variant c.2013T>G in the MAPT gene. Vavilov Journal of Genetics and Breeding 2024. 28. 7. 679–687
34. Khodyreva S.N., Ilina E.S., Dyrkheeva N.S., Kochetkova A.S., Yamskikh A.A., Maltseva E.A., Malakhova A.A., Medvedev S.P., Zakian S.M., Lavrik O.I. A Knockout of Poly(ADP-Ribose) Polymerase 1 in a Human Cell Line: An Influence on Base Excision Repair Reactions in Cellular Extracts. Cells 2024. 13. 4. 302
35. Kiselev I., Kulakova O., Baturina O., Kabilov M., Boyko A., Favorova O. Different genome-wide DNA methylation patterns in CD4+ T lymphocytes and CD14+ monocytes characterize relapse and remission of multiple sclerosis: Focus on GNAS. Multiple Sclerosis and Related Disorders 2024. 91. 105910
36. Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Saksaganskaia A.S., Kabilov M.R., Gorbunova M.K., Gorshkov A.N., Grudinin M.P., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Soil Giant Phage: Genome and Biological Characteristics of Sinorhizobium Jumbo Phage. International Journal of Molecular Sciences 2024. 25. 13. 7388
37. Krasitskaya V.V., Vereschagina T.A., Smoliarova T.E., Sokolov A.E., Tupikin A.E., Dominguez-Arca V., Frank L.A. Development and Characterization of Novel DNA Aptamers Specific to Heart-Type Fatty Acid Binding Protein (hFABP). Journal of Siberian Federal University. Biology 2024. 17. 3. 302–319
38. Kryukov V.Yu., Kosman E., Slepneva I., Vorontsova Y.L., Polenogova O., Kazymov G., Alikina T., Akhanaev Y., Sidorenko D., Noskov Y.A., Krivopalov A., Kabilov M.R., Yaroslavtseva O. Involvement of bacteria in the development of fungal infections in the Colorado potato beetle. Insect Science 2025. 32. 2. 600–620
39. Kurskaya O.G., Prokopyeva E.A., Dubovitskiy N.A., Solomatina M.V., Sobolev I.A., Derko A.A., Nokhova A.R., Anoshina A.V., Leonova N.V., Simkina O.A., Komissarova T.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Shestopalov A.M., Sharshov K.A. Genetic Diversity of the Human Adenovirus C Isolated from Hospitalized Children in Russia (2019–2022). Viruses 2024. 16. 3. 386
40. Lavrentyeva E.V., Radnagurueva A.A., Baturina O.A., Khakhinov V.V. Taxonomic Diversity of the Microbial Community in the Kuchiger Thermal Spring (Baikal Rift Zone). Contemp. Probl. Ecol. 2024. 17. 1. 24–31
41. Lukyanov V., Gaysina L., Bukin Y., Renganathan P., Tupikin A. DNA-metabarcoding of cyanobacteria and microalgae in chernozem soils of temperate continental climate of the forest-steppe zone of Eurasia under different degrees of agrotechnology intensification. World J Microbiol Biotechnol 2024. 40. 351
42. Maslov D.E., Timoshchuk A.N., Bondar A.A., Golubev M.P., Soplenkova A.G., Hanic M., Sharapov S.Z., Leonova O.N., Aulchenko Y.S., Golubeva T.S. Fast and Simple Protocol for N-Glycome Analysis of Human Blood Plasma Proteome. Biomolecules 2024. 14. 12. 1551
43. Melekhina E.N., Belykh E.S., Kanev V.A., Taskaeva A.A., Tarabukin D.V., Zinovyeva A.N., Velegzhaninov I.O., Rasova E.E., Baturina O.A., Kabilov M.R., Markarova M.Y. Soil Microbiome in Conditions of Oil Pollution of Subarctic Ecosystems. Microorganisms 2024. 12. 1. 80
44. Moroldoev I., Abramov S., Lopatina N., Krivopalov A., Zadubrovskiy P., Litvinov Y. New records of Alexandromys middendorffii (Rodentia, Arvicolinae) in the Sayan Mountains in Russia and Mongolia. Hystrix It. J. Mamm. 2024. 0
45. Murashkina T., Sharshov K., Gadzhiev A., Petherbridge G., Derko A., Sobolev I., Dubovitskiy N., Loginova A., Kurskaya O., Kasianov N., Kabilov M., Mine Ju., Uchida Yu., Tsunekuni R., Saito T., Alekseev A., Shestopalov A. Avian Influenza Virus and Avian Paramyxoviruses in Wild Waterfowl of the Western Coast of the Caspian Sea (2017–2020). Viruses 2024. 16. 4. 598
46. Naumova N., Barsukov P., Baturina O., Rusalimova O., Kabilov M. Addition of Chicken Litter Compost Changes Bacteriobiome in Fallow Soil. Applied Microbiology 2024. 4. 3. 1268–1282
47. Nawaz M.A., Pamirsky I.E., Golokhvast K.S. Bioinformatics in Russia: history and present-day landscape. Briefings in Bioinformatics 2024. 25. 6. bbae513
48. Nuzhdina N.S., Erofeeva A.S., Bondar A.A., Kovtonyuk N.K. DNA barcoding of some endangered plant species of the Altai Mountains based on five genetic markers. Botanica Pacifica: A Journal of Plant Science and Conservation 2024. 13. 1. 193–196
49. Pavlova S.V., Shulgina A.E., Minina J.M., Zakian S.M., Dementyeva E.V. Generation of Isogenic iPSC Lines for Studying the Effect of the p.N515del (c.1543_1545delAAC) Variant on MYBPC3 Function and Hypertrophic Cardiomyopathy Pathogenesis. International Journal of Molecular Sciences 2024. 25. 23. 12900
50. Pavlova S.V., Shulgina A.E., Zakian S.M., Dementyeva E.V. Studying Pathogenetic Contribution of a Variant of Unknown Significance, p.M659I (c.1977G > A) in MYH7, to the Development of Hypertrophic Cardiomyopathy Using CRISPR/Cas9-Engineered Isogenic Induced Pluripotent Stem Cells. International Journal of Molecular Sciences 2024. 25. 16. 8695
51. Potapov S.A., Tikhonova I.V., Krechetova E.L., Belykh O.I. T4-Like Cyanophages of Lake Baikal: Genetic Diversity and Biogeography. Microbiology 2024. 93. 2. 214–217
52. Potapov S.A., Tupikin A.E., Tikhonova I.V., Zhuchenko N.A., Belykh O.I. Search for putative complete and nearcomplete genomes of DNA-containing viruses in metagenomes obtained from the Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology 2024. 4. 1050–1065
53. Pristyazhnyuk I.E., Minina J.M., Voinova V.Y., Safonova M.P., Lagarkova M.A., Davidenko A.V., Volovikov E.A., Menzorov A.G. Generation of Three iPSC Lines from Fibroblasts of a Patient with Cohen Syndrome. Russ J Dev Biol 2024. 55. 3. 153–160
54. Roumiantseva M.L., Vladimirova M.E., Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Kozlova A.P., Afonin A.M., Baturina O.A., Simarov B.V. Detailed Genome Screening of a Highly Efficient Diploid Alfalfa Symbiont Ensifer meliloti L6-AK89, In: Research Advances and Challenges in Agricultural Sciences, B P International, 2024, 49–104
55. Shanshin D.V., Borisevich S.S., Shaprova O.N., Nesmeyanova V.S., Bondar A.A., Porozov Y.B., Khamitov E.M., Kolosova E.A., Shelemba A.A., Ushkalenko N.D., Protopopova E.V., Sergeev A.A., Loktev V.B., Shcherbakov D.N. Phage Display Revealed the Complex Structure of the Epitope of the Monoclonal Antibody 10H10. International Journal of Molecular Sciences 2024. 25. 19. 10311
56. Shanshin D.V., Nesmeyanova V.S., Protopopova E.V., Shelemba A.A., Loktev V.B., Shcherbakov D.N. Preparation and Construction of Chimeric Humanized Broadly Reactive Antibody 10H10 to Protein E of Tick-Borne Encephalitis Virus. Bull Exp Biol Med 2024. 177. 6. 770–773
57. Shatunova E.A., Rychkova A.S., Meschaninova M.I., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Kurochkina Y.D., Korolev M.A., Vorobyeva M.A. Novel DNA Aptamers to Dickkopf-1 Protein and Their Application in Colorimetric Sandwich Assays for Target Detection in Patients with Axial Spondyloarthritis. International Journal of Molecular Sciences 2024. 25. 22. 12214
58. Sheveleva O., Protasova E., Grigor’eva E., Butorina N., Kuziaeva V., Antonov D., Melnikova V., Medvedev S., Lyadova I. The Generation of Genetically Engineered Human Induced Pluripotent Stem Cells Overexpressing IFN-β for Future Experimental and Clinically Oriented Studies. International Journal of Molecular Sciences 2024. 25. 22. 12456
59. Sokolova E.A., Mishukova O.V., Hlistun I.V., Tromenschleger I.N., Chumanova E.V., Voronina E.N. Phenotypic and Genomic Analysis of Enterobacter ludwigii Strains: Insights into Mechanisms Enhancing Plant Growth Both Under Normal Conditions and in Response to Supplementation with Mineral Fertilizers and Exposure to Stress Factors. Plants 2024. 13. 24. 3551
60. Teryutin F.M., Pshennikova V.G., Solovyev A.V., Romanov G.P., Fedorova S.A., Barashkov N.A. Genotype–phenotype analysis of hearing function in patients with DFNB1A caused by the c.-23+1G>A splice site variant of the GJB2 gene (Cx26). PLOS ONE 2024. 19. 10. e0309439
61. Tian Y., Babaylova E.S., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A. Deficiency of the ribosomal protein uS10 (RPS20) reorganizes human cells translatome according to the abundance, CDS length and GC content of mRNAs. Open Biology 2024. 14. 1. 230366
62. Vaganov A.V., Sinitsyna T.A., Kutsev M.G., Skaptsov M.V., Zholnerova Y.A., Koltunova A.M., Zaikov V.F., Kosachev P.A., Kechaykin A.A., Smirnov S.V., Shmakov A.I. DNA barcodes of the vascular flora of the Altai Mountain Country: type material of the Herbarium ALTB. Part II. Turczaninowia 2024. 27. 2. 28–34
63. Yarkova E.S., Grigor’eva E.V., Medvedev S.P., Tarasevich D.A., Pavlova S.V., Valetdinova K.R., Minina J.M., Zakian S.M., Malakhova A.A. Detection of ER Stress in iPSC-Derived Neurons Carrying the p.N370S Mutation in the GBA1 Gene. Biomedicines 2024. 12. 4. 744
64. Zakalyukina Y.V., Alferova V.A., Nikandrova A.A., Kiriy A.R., Chernyshova A.P., Kabilov M.R., Baturina O.A., Biryukov M.V., Sergiev P.V., Lukianov D.A. Genomic and Phenotypic Characterization of Streptomyces sirii sp. nov., Amicetin-Producing Actinobacteria Isolated from Bamboo Rhizospheric Soil. Microorganisms 2024. 12. 12. 2628