Анализ нуклеиновых кислот [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]

Анализ нуклеиновых кислот

Agilent 2100 Bioanalyzer - это прибор для автоматического разделения нуклеиновых кислот (ДНК, РНК), использующий для этого электрофорез на микрофлюидном чипе. К преимуществам прибора следует отнести высокую чувствительность, высокое разрешение и автоматизированный процесс анализа и обсчета полученных данных.

Наиболее рациональным использованием Bioanalyzer 2100 является анализ образцов нуклеиновых кислот, для оценки качества которых не хватает чувствительности традиционного гель-электрофореза. В частности это касается анализа полученных библиотек для высокопроизводительного секвенирования, а также случаев когда исходного материала, из которого выделяются нуклеиновые кислоты, слишком мало. В таких случаях для анализа ДНК мы используем High Sensitivity DNA Kit (от 5 pg), а РНК - RNA 6000 Pico Kit (50 pg). Немаловажной особенностью последнего является возможность определение индекса целостности выделенной РНК (RNA Integrity Number (RIN)).

Характеристики	DNA 1000 Kit	DNA 12000 Kit	High Sensitivity DNA Kit	RNA 6000 Pico Kit	Small RNA
Диапазон, bp	25–1000	100-12000	50-7000	150-6000	6-150
Точность	25–100 bp ±5 bp 100–500 bp ±5% 500–1000 bp ±10%	100-1000 bp ±5% 1000-12000 bp ±15%	50-600 bp ±10% 600-7000 bp ±20%	-	-
Чувствительность	0.5-50 ng/µL	0.5-50 ng/µL	5-500 pg/µL	50-5000 pg/µL (total RNA) 250-5000 pg/µL (mRNA)	10-100 ng/µL (total RNA) >50 pg/µL (miRNA)
Кол-во образцов на чип	12	12	11	11	11
Время анализа, мин	35	30	45	30	30

Существуют и другие виды чипов для анализа ДНК и РНК.

Результаты анализа могут быть представлены как в виде хроматограмм, так и привычных электрофореграмм.
Для просмотра файлов необходимо воспользоваться 2100 Expert Software.