Фрагментный анализ [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]

Фрагментный анализ

Секвенаторы откалиброваны на 2 набора красок (Dye Set 32 и 33). Один из красителей (LIZ или ROX) в этих наборах зарезервирован для стандарта длин. В центре имеются стандарты длин GeneScan LIZ-120, 500, 600 и GeneScan ROX-500. В случае необходимости анализа более длинных фрагментов необходимо закупать соответствующий стандарт длин у Life Technologies.

Образцы на фрагментный анализ передаются в центр либо в высушенном виде без добавления стандарта длин или растворенными в формамиде с добавлением стандарта длин. Высушенные образцы могут храниться в холодильнике.

Растворенные образцы должны быть нанесены на секвенатор в день растворения поэтому необходимо передавать такие образцы в первой половине рабочего дня. Растворять образцы необходимо в 20 мкл деионизованного формамида и только от Applied Biosystems (можно получить в центре). При использовании формамида стороннего производителя нанесение образцов на секвенатор не гарантируется.
Если планируется передача целой плашки образцов, то одно место должно быть свободно для контроля, т.е. максимум это 95 образцов.

Образцы должны передаваться только в следующем типе пластика:

Стрипованные пробирки на 250 мкл для ПЦР (цельные, 8 пробирок/стрип, full profile) от Life Technologies, Axygen, Bio-Rad или Eppendorf.
Планшет на 250 мкл для ПЦР (96 лунок, semi-skirted, full profile) от Life Technologies, Axygen, Bio-Rad или Eppendorf.

Полученные результаты обсчитываются пользователем при помощи бесплатной программы Peak Scanner 2.0. Если ссылка перестала работать, то вы можете после регистрации скачать её на сайте Thermo Fisher.

Руководство пользователя по фрагментному анализу
Peakscanner_basic size analysis
Peakscanner_FAQ
Peakscanner_instructions