Kupryushkin M.S., Konevetz D.A., Vasilyeva S.V., Kuznetsova A.S., Stetsenko D.A., Pyshnyi D.V. Oligonucleotide Functionalization by a Novel Alkyne-Modified Nonnucleosidic Reagent Obtained by Versatile Building Block Chemistry. Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2013 V. 32 N 6 P.306-319.

Dmitriyenko E.V., Bulushev R.D., Haupt K., Kosolobov S.S., Latyshev A.V., Pyshnaya I.A., Pyshnyi D.V. A simple approach to prepare molecularly imprinted polymers from nylon-6. J. Mol. Recognit. 2013 V. 26(N8), P. 368-375.

Ломзов А.А., Иванова К.А., Пышная И.А., Дмитриенко Е.В., Пышный Д.В. Сравнительное исследование влияния водных растворов 2,2,2-трифторэтанола и этанола на структурную организацию, кинетические и термодинамические особенности формирования межмолекулярных комплексов олигодезоксирибонуклеотидов. Вестник НГУ. Серия Физика. 2013 Т. 8(№1), С. 115-124.

Romanov S.I., Pyshnyi D.V., Laktionov P.P. Sensors and filters based on nano- and microchannel membranes for biomedical technologies. Journal of Physics: Conference Series. 2012. 345(1), 1-6.

Красицкая В.В., Буракова Л.П., Пышная И.А., Франк Л.А. Выявление аллельных вариантов ДНК с помощью биолюминесцентных репортеров. Биоорганическая химия. 2012. 38(3), 342.

Абрамова Т.В., Касакин М.Ф., Тарасенко Ю.В., Ломзов А.А., Коваль В.В., Пышный Д.В., Сильников В.Н. Синтез и свойства метиленкарбоксамидных миметиков нуклеиновых кислот на основе морфолиновых нуклеозидов. Биоорганическая химия. 2012. 38(4), 458-471.

Пышный Д.В., Виноградова О.А. Принципы ДНК-архитектоники – конструирования нанообъектов на основе ДНК. Успехи химии. 2012. 81(2), 130-157.

Адекенов С.М., Шульц Э.Э., Гатилов Ю.В., Ломзов А.А., Атажанова Г.А., Куприянов Н.А. 15,16-Эпокси-3,13(16),14-Неоклеродатриен-17,12:18,19-Диолид - новое соединение из Galatella punctata. Химия природных соединений. 2012. 6, 841-843.

Ломзов А.А., Пышный Д.В. Учет внутримолекулярного структурирования олигонуклеотидов при термодинамическом анализе формирования ДНК-комплексов. Биофизика. 2012. 57(1), 27–44.

Купрюшкин М.С., Пышный Д.В. Гибридизационный анализ нуклеиновых кислот с помощью олигонуклеотидных производных. III. Синтез и исследование свойств олигонуклеотидов, несущих бифункционaльную ненуклеотидную вставку. Биоорганическая химия. 2012. 38(6), 706-720.

Власов В.В., Воробьев П.Е. Мир РНК: вчера и сегодня. Наука из первых рук. 2012. 45(3), 40-49.

Купрюшкин М.С., Пышный Д.В. Удобный метод получения амидофосфитов ненуклеотидных вставок для создания функционализированных олигонуклеотидов. Биоорганическая химия. 2012. 38(6), 745-749.

Дмитриенко Е.В., Пышная И.А., Пышный Д.В. Современные биосенсорные платформы для выявления нуклеотидных маркеров. Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2012. 10(4), 166-180.

Пышный Д.В., Веньяминова А.Г., Синяков А.Н., Зенкова М.А., Власов В.В. Нуклеиновый конструктор. Наука из первых рук. 2012. Спецвыпуск, 50-65.

Закабунин А.И, Камынина Т.П., Ходырева С.Н., Пышная И.А., Пышный Д.В., Филипенко М.Л. Клонирование генов и выделение рекомбинантных ДНК-лигаз термофильных археев Pyrococcus abyssi и Methanobacterium thermoautotrophicum. Молекуляр. биология. 2011. 45(2), 258–266.

Дмитриенко Е.В., Булушев Р.Д., Пышная И.А., Пышный Д.В. «Слепки» жизни – полимеры с молекулярной памятью. Наука из первых рук. 2011. 37(1), 86-93.

Lomzov A.A., Khalo I.V., Pyshnyi D.V. The influence of aliphatic alcohols on oligonucleotide hybridization. J. Biomol. Struct. Dyn. 2011. 28(6), 1130.

Власов В.В., Синяков А.Н., Пышный Д.В., Рыхлицкий С.В., Кручинин В.Н., Спесивцев Е.В., Пышная И.А., Костина Е.В., Дмитриенко Е.Д., Бессмельцев В.П. Эллипсометрический мониторинг в микрочиповых label-free биотехнологиях. Автометрия. 2011. 7(5), 67-77.

Kabilov M., Pyshnyi D. Analytical consideration of the selectivity of oligonucleotide hybridization. J. Biophys. Chem. 2011. 2(2), 75-91.

Способ получения амидофосфитного мономера ахиральной ненуклеотидной вставки для модификации олигонуклеотидов. Пышный Д.В., Купрюшкин М.С. № 2460721 Дата публикации 10.09.2012 г.

Способ селективного выделения популяции жизнеспособных клеток из биологических жидкостей. Лактионов П.П., Вайнер О.Б., Запорожченко И.А., Пышная И.А., Пышный Д.В., Дмитриенко Е.В., Романов С.И., Власов В.В. № 2423698 Дата публикации 10.07.2011 г.

Способ получения молекулярно-импринтированного полимера. Дмитриенко Е.В., Пышный Д.В., Рогоза А.В., Пышный Д.В. № 2385889 Дата публикации 10.04.2010 г.