Для прессы

11 сентября 2023 года начал работу международный научный форум по редактированию генома «CRISPR-2023», одним из организаторов которого стал Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

Это единственный научный форум, который будет посвящен применению в России технологии CRISPR/Cas9, позволяющей вносить изменения в геном высших организмов, в том числе человека.

«Тематический диапазон форума очень широк, от математики до химии и биологии через медицину, он не ограничивается геномным редактированием. В него входят персонализированная медицина, регенеративная медицина, клеточные технологии, big data анализ и синтетическая биология», - отмечает и.о.директора ИХБФМ СО РАН Владимир Коваль.
Программа

8 сентября 2023 года состоялось открытое расширенное заседание Ученого совета Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН. Почетное звание «Заслуженный ветеран Сибирского отделения РАН» присвоили Ольге Брызгуновой, Майе Дымовой, Никите Кузнецову, Александр Ломзову, Марии Харьковой и Вере Черноносовой.

И.о. директора Владимир Коваль вручил нагрудный знак «Почетный наставник», ведомственную награду Министерства науки и высшего образования РФ, члену-корреспонденту РАН Дмитрию Жаркову, Дарье Новопашиной и Александру Ломзову. Благодарность Минобрнауки РФ получили Елена Дмитриенко, Анна Зуева, Людмила Королева, Максим Филипенко и Андрей Шевела.

ПОЗДРАВЛЯЕМ!

1 сентября 2023 год стартовал новый учебный год. В стенах Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН начались лекции для студентов и аспирантов.

О том, как в Новосибирском научном центре работают со школьниками и студентами, которые заинтересованы в построении карьеры в области биомедицины, биотехнологий, биоинформатики, рассказал Сергей Седых, научный сотрудник лаборатории ферментов репарации ИХБФМ СО РАН, старший преподаватель НГУ.

Ученый отметил, что одним из успешных проектов ученых ННЦ, направленных одновременно на выявление талантов и научное волонтерство, является программа Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов», поддержанная грантом Минобрнауки РФ. В этом году больше 3 000 школьников и наставников собрали более 10 000 образцов почвы, в которых сегодня ученые ищут ферменты для геномного редактирования, бактериофаги и другие продуценты.
Подробнее

В рамках Х Международного форума «Технопром-2023» состоялось заседание круглого стола «Биофармацевтика и биомедицина. Актуальные проблемы и пути достижения цели», модератором которого выступил академик Валентин Власов, научный руководитель ИХБФМ СО РАН.
На заседании выступили Дмитрий Кудлай, вице-президент АО «Генериум», Владимир Коваль, и.о.директора ИХБФМ СО РАН, Владимир Рихтер, заведующий лабораторией биотехнологии, Нина Тикунова, заведующая лабораторией молекулярной микробиологии, Виталий Морозов, заведующий лабораторией технологий управления здоровьем, Сергей Седых, н.с. лаборатории ферментов репарации, Владимир Козлов, научный руководитель НИИФКИ, Елена Черных, заведующая лабораторией клеточной иммунотерапии, Елена Бирюкова, директор производства АО «ПФК Обновление», Андрей Покровский, директор Института психологии и медицины НГУ.
Участники заседания узнали о точке зрения «большой фармы» на возможности и перспективы отечественных разработок, проанализировали позицию медицинского сообщества по введению в практику новых отечественных препаратов, обсудили различные терапевтические препараты и отечественные медицинские изделия для диагностики in vitro.
Публикация на сайте газеты «Наука в Сибири»

Виктория Попова, младший научный сотрудник лаборатории структурной биологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, стала победителем конкурса «Академина» в номинации «Лучшее первое научное открытие».
Анна Юдкина, научный сотрудник лаботории геномной и белковой инженерии ИХБФМ СО РАН, стала лауреатом III степени конкурса «Академина» в номинации «Кандидат наук».
Пятая церемония награждения победителей конкурса «Академина» прошла в рамках X Международного форума технологического развития «Технопром». По словам организаторов, конкурс направлен на выявление и поддержку талантливых и успешных женщин, работающих в сфере науки, образования и экономики, а также популяризацию профессий ученого, педагога высшего образования.

Фото Валерия Панова
Публикация на сайте газеты «Наука в Сибири»

7 Августа 2023 года отмечает юбилей Ольга Ивановна Лаврик, академик РАН, профессор, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

Ольга Ивановна Лаврик – известный российский ученый, специалист в области физико-химической биологии. Ею внесен выдающийся вклад в изучение ферментов репликации и репарации ДНК. В частности, в её работах установлен механизм взаимодействия ДНК с факторами репликации и их вклад в функционирование ДНК-полимераз человека. Под ее руководством развит ряд оригинальных методов, позволяющих исследовать сложные белковые ансамбли репликации и репарации ДНК. Результаты исследований, выполненных Ольгой Ивановной, широко представлены в ведущих отечественных и зарубежных журналах, активно цитируются научной общественностью. Об этом свидетельствует один из самых высоких рейтингов цитирования работ О.И.Лаврик в своей области – более 7000. О.И.Лаврик имеет более 500 публикаций, из них 12 монографий и учебников. Индекс Хирша работ О.И.Лаврик равен 41.

Дорогая Ольга Ивановна! Примите самые теплые поздравления от руководства и коллектива Института. Новых побед, ярких открытий, крепкого здоровья, благополучия, заботы и внимания родных и близких! Пусть Ваши глубокие знания, уникальный научный и жизненный опыт помогают покорять новые вершины!

Статья «Усердием и воображением», приуроченная к юбилею Ольги Ивановны Лаврик, на научно-информационном портале «Поиск»

Номер газеты «Наука в Сибири»

Сибирские ученые представили первые пилотные результаты возможности применения искусственного интеллекта и нейросетей для построения прогностических моделей шизофрении. Участие в исследовании приняли сотрудники НИИ психического здоровья Томского НИМЦ, Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН и Института ядерной физики им. Г.И. Будкера СО РАН. Результаты работы опубликованы в высокорейтинговом научном журнале Biomedicines.

«Оказалось, что алгоритм на основе глубокой нейронной сети показал более высокую чувствительность и специфичность, чем другие алгоритмы. Кроме того, мы продемонстрировали, что объединение переменных в один классификатор сопровождается кумулятивным эффектом, превышающим роль каждого биомаркера в отдельности. Таким образом, использование одного биомаркера для диагностики шизофрении было бы неэффективным. Поэтому для разработки прогностических моделей диагностики шизофрении необходимо использовать комбинации нескольких биомаркеров. Дальнейшие исследования должны быть направлены на поиск наиболее информативных комбинаций биомаркеров», – комментирует научный сотрудник лаборатории ферментов репарации ИХБФМ СО РАН, канд. биол. наук Евгений Ермаков.
Пресс-релиз

Новость на сайте Министерства науки и высшего образования РФ

Специалисты Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН изучили изменение иммунных параметров при шизофрении. Ученые выявили, что среди пациентов выделяется группа больных с высоким уровнем воспаления. Для них в будущем может применяться дополнительная персонифицированная противовоспалительная терапия.

«Есть много исследований, которые показывают, что различные нарушения иммунной системы связаны с развитием шизофрении. Мы пытаемся найти эту связь между изменением конкретных иммунных параметров и симптомами шизофрении», - объясняет научный сотрудник лаборатории ферментов репарации ИХБФМ СО РАН Евгений Ермаков.

Публикация на сайте официального издания СО РАН "Наука в Сибири"
Интерфакс

Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами из онкологической больницы при Медицинском университете Гуанчжоу (Китай) создали нейлоновые нанокапсулы для доставки лекарств к опухолям. В основе одних капсул — магнитные наночастицы, что позволяет использовать их в МРТ-диагностике и лечении с помощью локальной гипотермии. Другие полые, и это дает возможность вмещать больше препарата и воздействовать на онкологические новообразования наименее токсично. Результаты исследования опубликованы в Magnetochemistry.

«В этом исследовании для работы с наночастицами мы использовали полимер нейлон-6 (он же капрон) — это тот самый материал, который применяется при изготовлении колготок. Он полностью биосовместим, биоразлагаем, нетоксичен и уже применяется в биомедицинских целях, например из него делают хирургические нити. Оказалось, если на наночастицу нанести капроновое покрытие, то, во-первых, можно стабилизировать поверхность. Во-вторых, нейлон-6 формирует трехмерную пористую матрицу. За счет того, что в этом полимере есть несколько хорошо реакционноспособных функциональных групп, к нему можно что-то химически присоединить», — рассказывает заведующая лабораторией биомедицинской химии ИХБФМ СО РАН кандидат химических наук Елена Дмитриенко.

Публикация на сайте официального издания СО РАН "Наука в Сибири"
ТАСС

Год назад в Национальном медицинском исследовательском центре онкологии им. Н.Н. Петрова началась I фаза клинических исследований препарата на основе генно-модифицированного онколитического вируса, применяемого для терапии рака молочной железы. Препарат разработан Институтом химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, центром «Вектор» Роспотребнадзора в партнерстве с ООО «Онкостар» .

Владимир Рихтер - один из разработчиков препарата, заведующий лабораторией биотехнологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, на онкофоруме «Белые ночи 2023» дал эксклюзивное интервью пресс службе НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова, в котором рассказал о механизме действия онколитического вируса, первых результатах исследований и др.

Подробнее

Новосибирские ученые открыли бактериофаг, который можно использовать для борьбы с аэромонадами – бактериями, способными вызывать острые кишечные и раневые инфекции. Исследование проведено научными сотрудниками Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ (соглашение № 075-15-2021-1085, программа «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов, как основа для поиска новых противомикробных продуцентов и ферментов с уникальными свойствами») в рамках реализации национального проекта «Наука и университеты».

«Фаг обладает геномом, состоящим из двухцепочечной ДНК, длина генома более 45 тысяч пар нуклеотидов, в геноме обнаружено пятьдесят девять генов и он не содержит генов, ответственных за устойчивость к антибиотикам и выработку токсинов. Помимо практического интереса, этот фаг представляет интерес для фундаментальной науки, поскольку является новым видом бактериальных вирусов семейства Autographiviridae», - отмечает Вера Витальевна Морозова, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии ИХБФМ СО РАН.

Подробнее:
ТАСС

ГАЗЕТА.РУ

Ольга Ивановна Лаврик, академик РАН, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, стала гостьей программы «Разговоры по существу». О.И.Лаврик рассказала о биохимии как свежей «авангардной» области науки, порядке вручения государственных премий, сотрудничестве с Францией и многом другом.

Проект ГПНТБ СО РАН «Разговоры по существу» представляет собой цикл специальных видеоинтервью, посвященных конкурсу женщин-ученых «Академина».

Проект «Разговор по существу»: Ольга Лаврик

Российский научный фонд подвел итоги конкурсов Президентской программы исследовательских проектов 2023 года на получение грантов по мероприятиям «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» и «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых».
По результатам конкурсов РНФ поддержал 431 инициативный проект молодых ученых грантами размером до 2 млн рублей ежегодно, 254 проекта молодежных научных групп с финансированием до 6 млн рублей ежегодно.

Победителями конкурса на получение грантов РНФ по мероприятию «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными, стали
Голышев Виктор Михайлович с проектом № 23-74-01116 «Фосфорамидные азольные олигонуклеотиды в составе несовершенных комплексов с ДНК: гибридизационные свойства и эффективность удлинения в ходе ПЦР»;
Ермаков Евгений Александрович с проектом № 23-75-01136 «Воспалительные механизмы в патогенезе алкогольного абстинентного синдрома: роль нетоза и повышенной проницаемости кишечника»;
Кечин Андрей Андреевич с проектом № 23-74-01138 «Новые алгоритмы выявления крупных геномных перестроек для диагностики дефицита гомологичной рекомбинации»;

Чепанова Арина Александровна с проектом № 23-74-01078 «Влияние ингибиторов Tdp1 на тип клеточной гибели и экспрессию белков репарации ДНК в клетках с нокаутом по генам Tdp1 и PARP1».

Победители конкурса на получение грантов РНФ по мероприятию «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными:

Юдкина Анна Владимировна с проектом № 23-74-10040 «Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи»;

Матвеев Андрей Леонидович с проектом № 23-74-10105 «Белки бактериофагов как основа для создания антитело-подобных молекул для биофармацевтики».

Поздравляем!

Новость на сайте РНФ

Валентин Викторович Власов, академик РАН, научный руководитель Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, председатель Объединенного ученого совета по биологическим наукам Сибирского отделения РАН, стал гостем программы «КПД Идеи».

«КПД Идеи» — авторская программа заместителя директора ГПНТБ СО РАН Антона Веселова о передовых рубежах сибирской науки. Крупнейшие ученые СО РАН рассуждают о ближайшем будущем нашей страны и мира, объясняют суть передовых технологий и фундаментальных открытий.

КПД Идеи. #11. Валентин Викторович Власов

В число победителей конкурса «УМНИК» Фонда содействия инновациям по итогам 2022 года вошло восемнадцать представителей Новосибирской области.
Информационно-аналитический портал «Академгородок» пообщался с некоторыми победителями конкурса, которые рассказали о своих исследованиях и планах. Ряд работ относятся к области медицины и биотехнологий, в их числе – проект Данилы Задворных, инженера лаборатории органического синтеза ИХБФМ СО РАН.

Интервью с Д. Задворных и другими победителями конкурса

Ольга Ивановна Лаврик, академик РАН, заведующая лабораторией биоорганической химии ИХБФМ СО РАН, дала интервью «Российской Газете» и поразмышляла о том, что может остановить отток молодых ученых.
Как отмечает автор статьи, заявление главы Сибирского отделения РАН академика Валентина Пармона, что за последние пять лет наша наука потеряла около 50 тысяч ученых, бурно обсуждается в научном сообществе.

Подробнее:
материал «Российской Газеты»

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН приняли участие в работе международной научной конференции «Биокатализ-2023», проходившей в Суздале с 25 по 29 июня 2023 года. Мероприятие приурочено к столетию со дня рождения учёного и организатора науки Ильи Васильевича Березина.

С пленарным докладом выступила академик РАН Ольга Лаврик, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов (ЛБХФ), член оргкомитета конференции.

Дарья Новопашина, заместитель директора Института по научно-образовательной деятельности, представила доклад на секции «Генетические технологии и белковая инженерия».

Председателем секции «Энзимология процессов репарации ДНК» стал член-корреспондент РАН Дмитрий Жарков, заведующий лабораторией геномной и белковой инженерии (ЛГБИ). В работе секции приняли участие Никита Кузнецов, заведующий лабораторией генетических технологий, и.о. заведующего лабораторией исследования модификации биополимеров (ЛИМБ) Александра Кузнецова, Ольга Кладова, научный сотрудник ЛИМБ, сотрудники ЛГБИ Анна Юдкина, Евгения Дятлова и Антон Ендуткин, сотрудники ЛБХФ Нина Моор, Надежда Речкунова, Александра Захаренко, Надежда Дырхеева и Михаил Кутузов.

В секции «ДНКзимы и аптамеры: сенсорные и визуализирующие агенты на их основе» выступила с докладом Мария Воробьева, заведующая лабораторией химии РНК (ЛХРНК), и научный сотрудник ЛХРНК Анна Давыдова. Иван Вохтанцев, инженер лаборатории геномного редактирования, представил доклад в рамках школы молодых учёных «Разработка генетических технологий создания штаммов-продуцентов для промышленной биотехнологии».

Евгения Дятлова стала победителем конкурса молодых ученых, проведенного в рамках конференции.

Новосибирские ученые разработали соединение, которое может рассматриваться в качестве нового лекарственного кандидата для терапии острого респираторного дистресс-синдрома человека (тяжелой дыхательной недостаточности), в том числе вызванного SARS-CoV-2. Исследование выполнено в рамках гранта РНФ № 19–74–30011, результаты опубликованы в журнале Biomedicine & Pharmacotherapy.
Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с Новосибирским институтом органической химии имени Н. Н. Ворожцова синтезировали ряд соединений на основе глицирретовой кислоты – природного тритерпеноида, выделенного из корня солодки. Данные соединения были схожи по структуре с полусинтетическим тритерпеноидом бардоксолон метилом, успешно прошедшим в США вторую фазу клинических испытаний на пациентах с COVID-19. Ученые провели скрининг полученных молекул на мышиной модели острого повреждения легких, имитирующей острый респираторный дистресс-синдром у человека при коронавирусной инфекции. В результате было отобрано одно соединение, которое эффективно подавляло развитие патологических изменений в тканях легкого, вызванных воспалением.

Подробнее:
Интерфакс

ТАСС

Наука в Сибири

Поздравляем победителей региональных конкурсов по программе конкурса «УМНИК»

Григорьеву Евгению Владимировну с проектом «Разработка универсальных наноконтейнеров на основе сывороточных белков крови в качестве системы упаковки и доставки терапевтических препаратов».
Задворных Данилу Андреевича с проектом «Разработка новых антибактериальных препаратов, активных в отношении антибиотикоустойчивых штаммов микроорганизмов для нужд ветеринарии».
Рогалеву Валерию Игоревну с проектом «Разработка нового ИК-флуоресцентного красителя с большим псевдостоксовым сдвигом для визуализации биологических объектов в режиме реального времени».
Подробнее

21 июня 2023 года ушел из жизни Игорь Владимирович Рабинов, ведущий инженер лаборатории биотехнологии ИХБФМ СО РАН, работавший в Институте с 2002 года. И.В. Рабинов - талантливый химик, один из авторов технологии производства природных и модифицированных нуклеозид-5’-трифосфатов, соединений, которые используют в качестве базовых компонентов диагностических тест-систем для выявления социально значимых заболеваний. За эту разработку в 2019 г. Игорь Владимирович Рабинов в составе авторского коллектива награжден Государственной премией Новосибирской области.
В нашей памяти Игорь Владимирович Рабинов останется как специалист высокого класса, надежный и преданный друг, честный и порядочный человек.
Коллектив Института глубоко скорбит по поводу кончины Игоря Владимировича и выражает искренние соболезнования родным и близким.

Каждую секунду каждая клетка нашего тела подвергается атакам химических и физических агентов, которые могут убить её или превратить в раковую. Нашу ДНК повреждает не только радиация, ультрафиолетовое излучение и опасные химикаты, но и вода и кислород. Для защиты генома от таких воздействий у человека имеются несколько систем репарации ДНК, которые исправляют повреждения и тем самым предотвращают их превращение в мутации. Сибирские ученые открыли новый вид повреждений ДНК и показали, как его можно исправлять. Работа поддержана грантом РНФ № 21-74-00061, результаты опубликованы в престижном международном журнале Nucleic Acids Research.

В группе чл.-корр. РАН Д. О. Жаркова из Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН разработали способ получения сшивок пептидов с АП-сайтом в ДНК и применили его для изучения мутагенных свойств таких повреждений и их репарации. Оказалось, что даже несмотря на пришивку к ДНК достаточно большого фрагмента белка, ДНК-полимеразы – ферменты, отвечающие за репликацию – воспринимают и просто АП-сайт, и пептидную сшивку примерно одинаково. Столкнувшись с повреждениями обоих видов, они на какое-то время останавливаются, но с некоторой эффективностью способны преодолевать его. Интересно, что разные полимеразы ведут себя по-разному – одни, несмотря на отсутствие «инструкции» в ДНК-матрице, упорно вставляют напротив этой точки аденин (или, реже, гуанин), а другие сгибают ДНК так, чтобы не замечать поврежденного места и продолжают синтез со следующего нормального нуклеотида. В обоих случаях, однако, это приводит к мутации – либо замене, либо выпадению одного нуклеотида.

Как видно, пептидные сшивки с АП-сайтами в ДНК опасны, и должны как можно быстрее подвергаться репарации. Но как именно это происходит? «Мы никак не ожидали, - говорит автор работы к. б. н. Анна Юдкина, - что те же ферменты репарации, которые исправляют обычные АП-сайты, будут прекрасно устранять и сшивки». В самом деле, белки АП-эндонуклеазы, которые в норме расщепляют АП-сайты в ДНК, специализированы именно для репарации этого типа повреждений, и пришитые к ДНК пептидные фрагменты размером 10-20 аминокислотных остатков по идее должны мешать их работе. Оказалось, однако, что АП-эндонуклеазы бактерий и дрожжей эффективно гидролизуют ДНК со сшивкой. Фермент человека показывал более низкую активность, но она все равно была сравнима с его активностью на некоторых отличных от обычного АП-сайта повреждениях ДНК. «Определять количество белковых сшивок с АП-сайтами научились лишь недавно, и оказалось, что таких повреждений в ДНК очень много, - отмечает Анна Юдкина. – Наша работа закрывает вопрос о том, как проходит их репарация в клетке».

Пресс-релиз

Интерфакс

ТАСС

Владимир Рихтер, заведующий лабораторией биотехнологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, выступил с докладом на сессии «Генная терапия: будущее начинается сегодня» Петербургского международного экономического форума (ПМЭФ) в Санкт-Петербурге. Ученый рассказал о том, как идут клинические испытания онколитического вируса на базе осповакцины.
«Мы достигли определенных успехов в рамках ныне проходящих испытаний нашей онколитической терапии для лечения рака молочной железы, что заставило нас задуматься об ее использовании для борьбы с другими формами опухолей. Мы надеемся, что в ближайший год мы начнем клинические испытания по использованию онколитических вирусов для лечения различных вариаций рака мозга», - сообщил Владимир Рихтер.

Подробнее:
ТАСС (материал № 1)

ТАСС (материал № 2)

В новом выпуске газеты «Наука в Сибири» вышел материал «Здоровое долголетие: право, привилегия или оксюморон?», который написан по мотивам беседы с академиком Валентином Викторовичем Власовым, научным руководителем Институте химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

Ученый отметил, что в Институте ведутся исследования генетических систем, связанных с долголетием, а Центр новых медицинских технологий, одно из подразделений института, в настоящее время разрабатывает программу медицинского обеспечения ученых, которая должна помочь им жить долго и сохранять при этом работоспособность.
Публикация на сайте официального издания СО РАН "Наука в Сибири"