Для прессы

Новосибирские ученые установили, что белок Cas9 при попадании в ДНК человека выполняет свою функцию и при этом не влияет на работу системы репарации, маскируя вызванное им повреждение. Эти данные можно использовать при применении инструментов редактирования генома в биотехнологии и медицине. Результаты исследования, поддержанного грантом Российского научного фонда (РНФ), опубликованы в журнале PLoS ONE.

Группа ученых Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН под руководством академика РАН Ольги Ивановны Лаврик и члена-корреспондента РАН Дмитрия Олеговича Жаркова выяснили, что после того, как Cas9 вносит разрыв в ДНК, белок маскирует это повреждение, делая его на долгое время невидимым для клеточных систем репарации. Эффективность редактирования в живых клетках не зависела от того, есть ли в них белок PARP1 — главный сенсор разрывов в обычной ситуации. Лишь фермент репарации PARP2, который в обычной ситуации «чувствует» разрыв ДНК и присоединяет к окружающим белкам специальную «сигнальную метку», поли(АДФ-рибозу), был способен таким же образом модифицировать и Cas9, но это не оказывало никакого влияния на активность геномного редактора. Не мешало ему работать и связывание белка YB-1 с направляющей РНК. Таким образом, по крайней мере с точки зрения процесса репарации разрывов, Cas9 в клетках человека действительно выступает как биоортогональный фермент. Что и хорошо: чем меньше неожиданных взаимодействий, тем проще контролировать активность системы геномного редактирования, когда она применяется (или будет применяться) в биотехнологии и медицине.

Пресс-релиз

Российский научный фонд подвел итоги двух региональных конкурсов: проектов отдельных научных групп и малых отдельных научных групп. В Фонд поступило более 2 тысяч заявок от исследователей из 44 регионов России. По итогам двух региональных конкурсов поддержано 476 проектов.
Победителями регионального конкурса по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами» стали:

Буркова Евгения Евгеньевна с проектом № 24-24-20074 «Дизайн генных конструкций, обеспечивающих экспонирование антигена на поверхности клеток»;

Попова Виктория Константиновна с проектом № 24-24-20105 «Создание стимул-чувствительных систем доставки нуклеиновых кислот на основе нанокомпозитов карбоната кальция».
Поздравляем!
Новость на сайте РНФ

«Биологи впервые определили химический состав цветков и листьев анемонопсиса крупнолистного — растения, встречающегося исключительно в лесах Японии. Авторы обнаружили более ста соединений, часть из которых — например кумарины и фенольные кислоты — представляют ценность для фармацевтики, поскольку обладают противовоспалительной активностью», - сообщает пресс-служба Российского научного фонда.

В исследовании приняли участие биологи из Центрального Сибирского ботанического сада СО РАН (Новосибирск), Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН (Новосибирск), Ботанического института имени В. Л. Комарова РАН (Санкт-Петербург) и коллеги из Института ботаники Китайской академии наук

Новость на сайте РНФ

27 февраля 2024 года состоялось заседание Президиума Российской академии наук. Президент РАН академик Геннадий Яковлевич Красников и вице-президент РАН академик Владислав Яковлевич Панченко поздравили учёных РАН с высокими достижениями и вручили им государственные награды Российской Федерации.
Академика РАН Ольгу Ивановну Лаврик, заведующую лабораторией биоорганической химии ферментов ИХБФМ СО РАН, наградили орденом Дружбы.

Новость на сайте РАН
Фото: Российская академия наук

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН провели большую экскурсию для школьников 9-х классов в рамках инициативы «Наука рядом» Десятилетия науки и технологий в России. Учащиеся посетили несколько лабораторий, увидели, как работают химики, физики и биологи, узнали о новейших разработках Института.
В лаборатории химии нуклеиновых кислот школьникам рассказали о фрагментах нуклеиновых кислот – олигонуклеотидах, которые способны воздействовать на определенные мишени в органах и тканях. Понимание механизма возникновения заболеваний, в который вовлечены нуклеиновые кислоты, дает возможность сконструировать лекарство, которое позволяет восполнить недостающую функцию или блокировать патологию.
Идею использования олигонуклеотидов для направленного воздействия на гены впервые выдвинули в лаборатории природных полимеров Дмитрия Георгиевича Кнорре, на основе которой и был создан Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, которому в 2024 году исполняется 40 лет. Именно в Новосибирске были сконструированы первые ген-направленные препараты, позволяющие избирательно инактивировать вирусные и некоторые клеточные РНК.
Одним из направлений работы ИХБФМ СО РАН является разработка препаратов, направленных на лечение онкологических заболеваний. Чтобы понять, как действует то или иное средство химио- или вирусной терапии, необходимо изучить опухолевые ткани до и после введения препарата. В экспериментах используются модельные животные.
В группе микроскопических исследований ученые рассказали школьникам о том, как подготавливаются к изучению образцы опухолевой ткани, зачем их обезвоживают и заливают в парафиновые блоки и что дает селективное окрашивание. Ребята увидели, как выглядят под микроскопом увеличенные в сто тысяч раз шипики вирусов и хвост бактериофага, рассмотрели поперечный срез хвоста крысы, ткани которого окрашены в разные цвета.
В лаборатории структурной биологии девятиклассникам рассказали о том, как ученые исследуют функции и биохимические свойства биополимеров, нуклеиновых кислот и белков. Используя методы компьютерного моделирования, ученые решают разные задачи. Так, например, в рамках сотрудничества с одной из российских компаний изучается структура рецептора сладкого вкуса человека и его взаимодействие с различными белками. Ребята с удивлением узнали о существовании белка браззеина, который в 2000 раз слаще, чем молекула сахара. Браззеин выделен из плодов африканского растения, не содержащего сахар, но имеющего сладкий вкус. Полученные данные помогут найти новые заменители сахара, не имеющие побочных эффектов.
О значении белков в живых организмах, размере генома человека, истории его изучения школьникам рассказал Владимир Коваль, исполняющий обязанности директора Института, руководитель Объединенного Центра геномных, протеомных и метаболомных исследований. Ученый продемонстрировал, как происходит расшифровка генома, с помощью чего ДНК разделяются на нити по размеру и многое другое.
В ходе экскурсии ребята увидели различное оборудование, в том числе приобретенное благодаря гранту по обновлению приборной базы Министерства науки и высшего образования Российской Федерации. Школьники узнали, как работают и какие задачи позволяют решить атомно-силовой, световой и электронный микроскопы, ДНК-синтезаторы, спектрофотометр, спектрополяриметр, изотермический титрационный калориметр, хроматографы, секвенаторы и масс-спектрометры.
Публикация на сайте Министерства науки и инновационной политики НСО

В честь Дня российской науки ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН провели для школьников несколько познавательных мероприятий. Первыми посетили институт ученики 5-х классов. Анастасия Тупицына и Алина Григорьева, сотрудники группы микроскопических исследований, рассказали ребятам о том, чем отличаются разные типы микроскопов, показали, как с ними работают ученые. Школьники увидели под микроскопом не только растительные и животные клетки, но и бактерии и вирусы, увеличенные в сто тысяч раз. Мария Канарская, младший научный сотрудник лаборатории структурной биологии, рассказала о том, какие есть нуклеиновые кислоты и для чего они нужны. Ребята узнали о методах исследования нуклеиновых кислот, таких как различные виды спектроскопии, гель-электрофорез, моделирование, увидели, как работает 3D-принтер. Под руководством Марии школьники получили спектр поглощения олигонуклеотида, поучаствовали почти во всех этапах работы, пользуясь пипетками, центрифугой и спектрофотометром.
Сотрудники лабораторий биомедицинской химии и структурной биологии Анастасия Булгакова, Виктория Попова, Анастасия Седельникова и Екатерина Горбунова провели для школьников старших классов квест «Машина времени», в ходе которого ребята пытались спасти молодого ученого, нарушившего целостность времени, и выполнить задания: восстановить фермент ДНК-полимеразу и досинтезировать нужную цепь ДНК, найти лекарство от вируса, подобрать антитело к вирусной частице и многие другие.
Открытую лекцию «Химические тайны в нашей жизни» для школьников 10—11-х классов прочел Сергей Жуков, сотрудник лаборатории химии нуклеиновых кислот. Школьники посмотрели на привычные всем процессы и явления с точки зрения химии, узнали о том, чем отличаются жир и масло, почему желтеет бумага, какого цвета настоящий йод, увидели, что произойдет, если к мылу добавить соль.
Дни российской науки — 2024 в Сибири (материал «Науки в Сибири»)
Новосибирские учёные открыли школьникам секреты химии (сюжет ОТС)

За большой вклад в развитие отечественной науки, подготовку научных кадров, многолетнюю плодотворную научно-исследовательскую и организационную деятельность и в связи с 300-летием Российской академии наук юбилейной медалью «300 лет Российской академии наук» награждены сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН:

Власов Валентин Викторович, академик РАН, научный руководитель Института,

Лаврик Ольга Ивановна, академик РАН, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов,

Зенкова Марина Аркадьевна, член-корреспондент РАН, заведующая лабораторией биохимии нуклеиновых кислот,

Жарков Дмитрий Олегович, член-корреспондент РАН, заведующий лабораторией геномной и белковой инженерии.

Поздравляем!

Академик РАН Ольга Ивановна Лаврик, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов ИХБФМ СО РАН, награждена орденом Дружбы за большой вклад в развитие отечественной науки, многолетнюю плодотворную деятельность и в связи с 300-летием со дня основания Российской академии наук.

Ольга Ивановна Лаврик – известный российский ученый, специалист в области физико-химической биологии. Ею внесен выдающийся вклад в изучение ферментов репликации и репарации ДНК. В частности, в её работах установлен механизм взаимодействия ДНК с факторами репликации и их вклад в функционирование ДНК-полимераз человека. Под ее руководством создана школа энзимологов, специализирующихся в области исследования структуры и функций надмолекулярных ферментативных систем. О.И. Лаврик пользуется большим авторитетом как в нашей стране, так и за рубежом.

Поздравляем!

В Институте химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН изучили уникальный фермент репарации, который способен напрямую удалять повреждения и восстанавливать структуру нуклеотидов ДНК и РНК без помощи других ферментов. Полученные данные могут быть использованы для разработки противоопухолевых лекарственных препаратов, а также подбора персонализированного лечения заболеваний, связанных с повреждением геномной ДНК. Результаты работы опубликованы в журнале International Journal of Molecular Sciences.
«Информацию о контактах между ферментом и поврежденной ДНК-мишенью обычно получают методом рентгеноструктурного анализа кристаллов белка. Такие кристаллы зачастую невозможно получить для структурно подвижных ферментов, содержащих слабо упорядоченные домены, каким и является диоксигеназа ALKBH3. Мы впервые показали, что снижение реакционной активности мутантных (искусственно измененных) форм диоксигеназы напрямую связано с понижением количества бета-складок и увеличением доли альфа-спиралей в структуре» - рассказывает Любовь Канажевская, научный сотрудник Центра масс-спектрометрического анализа ИХБФМ СО РАН, руководитель гранта РНФ № 22-24-00699.
ТАСС

Интерфакс
РИА.Новости

Научно-информационный портал «Поиск»

Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН исследовали влияние N1-метилпсевдоуридина в качестве модификации направляющей РНК на работу системы геномного редактирования. В результате работы ученым удалось увеличить точность генетических ножниц. Статья об этом опубликована в International Journal of Molecular Sciences.

«Мы решили изучить влияние природной модификации N1-метилпсевдоуридина на CRISPR/Cas9. Главной проблемой этой системы можно назвать баланс между точностью и эффективностью — сложно добиться хорошего уровня в обоих показателях. Одним из вариантов решения этой задачи считается создание модифицированных РНК. Мы вводили N1-метилпсевдоуридин в направляющие РНК системы CRISPR/Cas9. Этот компонент обладает нужными для нас свойствами: низкой токсичностью и обеспечивает высокую стабильность РНК. В системе геномного редактирования модификация показала себя более точной в сравнении с исследуемыми ранее. Полученный инструмент можно использовать в клетках человека. Зарубежные ученые уже разработали и применяют препарат на основе генетических ножниц, который позволяет лечить серьезное генетическое заболевание — серповидноклеточную анемию. Движение в этом научном направлении позволит усовершенствовать диагностику и лечение некоторых генетических заболеваний», — рассказывает младший научный сотрудник лаборатории геномного редактирования ИХБФМ СО РАН Дарья Вадимовна Прохорова.

Материал "Науки в Сибири"

«Наука в Сибири» традиционно представила список самых ярких открытий, технологий и разработок сибирских ученых, информация о которых была опубликована на страницах издания в 2023 году.

В рейтинг вошла новость о нейлоновых нанокапсулах для доставки лекарств к опухолям, созданных учеными Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами. Результаты исследования опубликованы в Magnetochemistry.

Подробнее

Российский научный фонд и «Ведомости» выбрали 10 самых ярких научных результатов года.

В список вошла публикация, выполненная в рамках гранта «Аптамеры как инструменты повышения противоопухолевой эффективности онколитического вируса VV-GMCSF-Lact для терапии злокачественных опухолей головного мозга». Руководитель - Елена Владимировна Кулигина, старший научный сотрудник лаборатории биотехнологии ИХБФМ СО РАН.

«Большой коллектив биологов и медиков из России в сотрудничестве с учеными из других стран создал аптамеры – короткие молекулы ДНК, способные находить раковые клетки и помогать диагностировать один из наиболее опасных типов опухолей головного мозга, глиобластому. При этом благодаря светящейся метке, присоединенной к аптамеру, опухоль можно обнаружить во время операции и точечно удалить без вреда для здоровой ткани. Эксперименты на животных показали абсолютную безопасность системы», - рассказывает пресс-служба РНФ.

Подробнее

Новогоднее поздравление Министра науки и высшего образования Российской Федерации Валерия Николаевича Фалькова.

Дорогие друзья, коллеги!
Стремительно уносится в историю 2023 год – год интересный и нерядовой. В уходящем году команда Института стала сильнее, сплочённее, твёрже характером, настойчивее в достижении целей. Наши научные успехи впечатляют и радуют, одновременно давая возможность выстроить направления дальнейшего развития и роста.

От всего сердца хочу поблагодарить каждого сотрудника ИХБФМ СО РАН, студента, аспиранта. Все наши достижения – результат общей тяжелой, но такой творческой и увлекательной работы.

Желаю вам в новом году крепкого здоровья, мирного неба над головой, исполнения всех мечтаний. Пусть в ваших семьях царит мир, благополучие и любовь.
С Новым годом!

С уважением,

Владимир Коваль, и.о. директора ИХБФМ СО РАН

Российский научный фонд и «Ведомости» выбрали 10 самых ярких научных результатов года.

В список вошла публикация, выполненная в рамках гранта «Аптамеры как инструменты повышения противоопухолевой эффективности онколитического вируса VV-GMCSF-Lact для терапии злокачественных опухолей головного мозга». Руководитель - Елена Владимировна Кулигина, старший научный сотрудник лаборатории биотехнологии ИХБФМ СО РАН.

«Большой коллектив биологов и медиков из России в сотрудничестве с учеными из других стран создал аптамеры – короткие молекулы ДНК, способные находить раковые клетки и помогать диагностировать один из наиболее опасных типов опухолей головного мозга, глиобластому. При этом благодаря светящейся метке, присоединенной к аптамеру, опухоль можно обнаружить во время операции и точечно удалить без вреда для здоровой ткани. Эксперименты на животных показали абсолютную безопасность системы», - рассказывает пресс-служба РНФ.

Подробнее

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН обнаружили штамм бактерий, которые помогают пшенице давать значительный прирост биомассы даже в условиях засухи и солевого стресса. Их использование может уменьшить потери урожая при дефиците осадков. Работа проведена при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ (соглашение № 075-15-2021-1085, программа «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов, как основа для поиска новых противомикробных продуцентов и ферментов с уникальными свойствами») в рамках реализации Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2027 гг. национального проекта «Наука и университеты».

«Получены интересные данные о том, что добавление наших бактерий активирует описанную систему в корнях растений и в нормальных условиях. Мы предполагаем, что бактерии при взаимодействии с растением увеличивают выработку АФК, и это активирует внутренние резервы растения. Если возникнет стрессовый фактор, то растение уже готово бороться с ним», -отмечает Елена Воронина, заведующая группой молекулярной генетики ИХБФМ СО РАН.

ТАСС

Интерфакс

Вышло пятое (!) издание учебника «Биологическая химия», который был написан академиком РАН Дмитрием Георгиевичем Кнорре, первым директором и организатором Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, и Светланой Дмитриевной Мызиной, долгое время работавшей заместителем директора Института по научно-образовательной деятельности.
Учебник рассчитан на студентов ВУЗов химических, биологических и медицинских специальностей.

О работе над учебником рассказывает Светлана Дмитриевна:
«Дмитрий Георгиевич всегда очень серьёзно относился к вопросам образования. В конце 1980-х годов мы столкнулись с нехваткой учебников, а по биологической химии их не было вовсе — ни зарубежных, ни отечественных. Д. Г. Кнорре принял решение написать такой учебник, ориентированный в большей степени на химиков, чем на биологов. На эту работу у нас ушёл целый год: каждый день в шесть часов вечера я приходила в кабинет Дмитрия Георгиевича с готовым черновиком и часа по три мы сидели у него, редактируя написанное и набирая чистовой вариант на печатной машинке. По субботам у меня были лекции, после них мы шли работать над учебником в институт. Завершили работу за год — начали в сентябре и в следующем сентябре отправили рукопись в издательство «Высшая школа». Ещё год пришлось подождать, прежде чем мы узнали, что учебник будет издан — и, как говорят, это ещё довольно быстро. Первое издание вышло в 1992 году.

В 2000 году рецензенты учебника Подглазов и Варфоломеев решили выдвинуть его на премию Правительства России — как первый российский учебник по биохимии. Но мы об этом ничего не знали. В один прекрасный день мне позвонили из Москвы и приветливая женщина сказала: «Так, Светлана Дмитриевна, срочно покупайте себе новый костюм! Сейчас обсуждается вопрос — вы представлены к награде, и, вероятно, вам придётся такого-то числа быть в Москве». Сразу же мне перезвонил Кнорре — ему был такой же звонок.

Когда мы приехали на вручение премии в Москву, в зале Дома Союзов к нам подошёл солидный мужчина и спросил: «Кто вас вёл?» Ни Кнорре, ни я этого вопроса не поняли. Имелось в виду — кто представлял нас на премию. Но мы были такими наивными, что даже не знали ответа. А от выхода учебника до присуждения ему премии прошло уже почти десять лет».

Академик Ольга Ивановна Лаврик, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов ИХБФМ СО РАН, получила Почётное звание «Заслуженный деятель науки СО РАН» с вручением нагрудного знака «Золотая Сигма».

Награду О. И. Лаврик вручил академик Валентин Николаевич Пармон, председатель Сибирского отделения РАН, на заседании Президиума.
Фото: Юлия Позднякова, Анжелика Виллиус

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами из Швеции и Москвы научились определять подвижную структуру белка. Они исследовали сериновую протеазу вируса Денге. Знания о структуре помогут создать противовирусные препараты. Исследование опубликовано в журнале Nature Communications Biology.

«Обычно, когда создают лекарство, берут пространственную структуру белка и смотрят, как к ней присоединить какую-либо молекулу, которая бы мешала работе активного центра белка и не давала вирусу нормально функционировать. Чаще всего белок имеет довольно стабильную структуру. В нашем же случае она очень подвижна, поэтому возникают проблемы», — рассказал заведующий лабораторией структурной биологии, заместитель директора по научной работе ИХБФМ СО РАН кандидат физико-математических наук Александр Анатольевич Ломзов.

Материал "Науки в Сибири"

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН и Новосибирского института органической химии им. Н. Н. Ворожцова подобрали соединение, которое подавляет действие гормона, усиливающего агрессивность нейробластомы. Полученные данные могут быть использованы для разработки новых противоопухолевых агентов, направленных на лечение злокачественных заболеваний центральной нервной системы.

Поиск активной молекулы ─ лишь первый этап проекта по гранту Российского научного фонда. Дальше ─ еще два годы работы, одна из целей которых – исследование структуры соединения, что очень важно для будущего лекарственного препарата. Именно он – конечная цель. Новые лекарства можно будет использовать вместе с классической химиотерапией, считают ученые.

«Мы предполагаем, что в нетоксичных дозах они будут блокировать способность опухолевых клеток к подвижности, к проникновению сквозь ткани и конечном счете ─ к метастазированию», ─ пояснил старший научный сотрудник Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Андрей Марков.
Вести.Новосибирск

Завершила работу молодежная школа-конференция «BioTop-2023. Достижения молодых ученых ИХБФМ СО РАН», организатором которой выступил Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

В течение двух дней молодые ученые рассказывали о результатах своих исследований, отвечали на многочисленные вопросы аудитории.

В рамках конференции были обсуждены вопросы диагностики заболеваний на молекулярном уровне, регуляция клеточных систем редактирования для контроля над патологическими состояниями, создание противоопухолевых препаратов, биомедицинское применение производных олигонуклеотидов и многое другое.

В Новосибирске завершил работу конгресс «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов», в котором приняли участие школьники, наставники и учёные, работавшие над проектом с 2021 года. На мероприятии научные волонтёры представили свои результаты, а учёные рассказали о том, какие открытия сделаны благодаря всем участникам Всероссийского атласа. Конгресс проведен Институтом химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ (соглашение № 075-15-2021-1085) в рамках реализации Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019–2027 гг. национального проекта «Наука и университеты».

Участие в мероприятии приняло более 300 человек, в том числе 60 команд юных исследователей из более, чем 35 (!) регионов России. В проведение масштабных экспериментов были привлечены школьники, педагоги и другие активные граждане. По разработанной в рамках проекта образовательной программе прошли обучение более 500 наставников, под руководством которых в дальнейшем работали ребята. Школьники приняли полноценное участие в сборе материалов и их анализе, провели исследовательскую работу. Доклады, которые команды представили на конгрессе, продемонстрировали высокий уровень вовлеченности ребят в проект. Многие из школьников отметили, что проект пробудил в них интерес к естественным наукам и профессии ученого.

«Результаты по-настоящему впечатляют. Благодаря научным волонтерам на сегодняшний день мы получили более 14 000 образцов почвы из самых разных регионов России. За время реализации проекта из них выращено уже более 15 000 микроорганизмов, а многие еще предстоит изолировать, чтобы изучить их свойства. Проект объединил множество людей, которые хотели попробовать себя в роли исследователей. Нельзя не отметить энтузиазм, с которым работали участники проекта! Они показали себя настоящими профессионалами, готовыми погрузиться в научную проблематику проекта, осваивать новые для них методы, преодолевать возникающие трудности, но упорно продвигаться по «неизведанным территориям» и в какой-то мере почувствовать на себе как возможности современных исследований, так и ответственность за полученный результат», - рассказывает Никита Кузнецов, д.х.н., руководитель исследовательской программы проекта «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов…».

Организацией работы научных волонтеров и проведением конгресса занимался Фонд «Образование».

Российский научный фонд подвел итоги конкурса на получение грантов для малых отдельных научных групп. По результатам экспертизы в рамках данного конкурса экспертным советом Фонда было отобрано 1392 проекта.

Основные задачи конкурса – развитие новых для научных коллективов тематик и формирование исследовательских команд. Общее число членов научного коллектива (вместе с руководителем проекта) должно составлять от 2 до 4 человек.

Победителями конкурса 2023 года на получение грантов Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами» стали:

Оскорбин Игорь Петрович с проектом № 24-24-00389 «Бактериальные поли(А)-полимеразы: поиск новых ферментов, сравнение их биохимических характеристик и эффективности в практических приложениях»;

Рар Вера Александровна с проектом № 24-24-00390 «Детальное изучение нового вида боррелий «Candidatus Borrelia sibirica» как предполагаемого возбудителя иксодового клещевого боррелиоза»;

Байков Иван Константинович с проектом № 24-24-00553 «Управление специфичностью клебсиельных бактериофагов методами синтетической биологии».
Поздравляем!

Новость на сайте РНФ

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН посетил министр науки и инновационной политики Новосибирской области Вадим Васильев и работники средств массовой информации.

В ходе пресс-тура журналисты пообщались с исполняющим обязанности директора Института Владимиром Ковалем, Александром Ломзовым, заведующим лабораторий структурной биологии, заместителем директора по научной работе, и Григорием Степановым, заведующим лабораторией геномного руководителя.

Новость на сайте Правительства НСО
Вести.Новосибирск

Видеосюжет ОТС
Материал «Науки в Сибири»

Исследователи Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН научились получать большое количество олигонуклеотидов в одном эксперименте. Раньше на этот процесс уходили недели напряженной работы. Эффективность синтеза удалось улучшить благодаря внедрению методов микроэлектроники и фотолитографии. Статьи об исследовании опубликованы в журнале «Journal of Saudi Chemical Society».
«В нашем синтезаторе есть стеклянная пластина, где находятся спейсеры для синтеза олигонуклеотидов. Спейсер — это цепочка атомов, присоединяющая первое звено олигонуклеотида к поверхности. Мы используем процесс, который называется фотолитография, освещаем поверхность пластины с помощью ультрафиолета. Компьютер, управляющий процессом синтеза, генерирует виртуальные фотомаски, с помощью которых засвечиваются определенные фрагменты стеклянной пластины. Там, где падает свет, удаляется фотолабильная защитная группа. В этом месте происходит пришивка нуклеотида. Дальше этот цикл наращивания олигонуклеотидной цепи повторяется», — пояснил ведущий научный сотрудник ИХБФМ СО РАН кандидат химических наук Александр Николаевич Синяков.
Работа была выполнена в тесном сотрудничестве с Новосибирским институтом органической химии им. Н. Н. Ворожцова, Международным томографическим центром, Институтом физики полупроводников им. А. В. Ржанова и Институтом автоматики и электрометрии СО РАН.
Материал «Науки в Сибири»

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН и Новосибирского института органической химии им. Н. Н. Ворожцова подобрали соединение, которое подавляет действие гормона, усиливающего агрессивность нейробластомы. Полученные данные могут быть использованы для разработки новых противоопухолевых агентов, направленных на лечение злокачественных заболеваний центральной нервной системы.
Исследование поддержано грантом Российского научного фонда № 23-14-00374, результаты опубликованы в журнале Pharmaceuticals.
«С помощью молекулярного моделирования было установлено, что солоксолон метил способен связываться с белками сигнального пути ERK1/2, играющими ключевую роль при передаче сигнала от лептина к опухолевой клетке. Данные были подтверждены нами экспериментально – тритерпеноид достоверно подавлял активность сигнального пути ERK1/2 в клетках нейробластомы, что приводило к снижению их чувствительности к лептину. Таким образом, солоксолон метил можно рассматривать в качестве перспективного средства противоопухолевой терапии, способного подавлять взаимосвязь «метаболические расстройства – злокачественный рост» - рассказывает Андрей Марков, старший научный сотрудник лаборатории биохимии нуклеиновых кислот ИХБФМ СО РАН.
ТАСС
Интерфакс

3 ноября 2023 года Российский научный фонд отметил 10-летие с момента основания!
Невозможно переоценить значение деятельности РНФ для научного сообщества. За 10 лет было поддержано 115 проектов Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, что позволило проводить научные исследования по различным тематикам и получать результаты мирового уровня.
Российский научный фонд активно участвует и в организации научно-популярных мероприятий, в числе которых различные фестивали науки, общероссийские просветительские акции, встречи с научной общественностью, проводит школы для потенциальных грантополучателей.
Результаты деятельности РНФ за 10 лет

Ученые подтвердили, что антитела, которые образуются после перенесенной коронавирусной инфекции и вакцинации препаратом «Спутник V», не только связывают коронавирус и препятствуют его попаданию в клетку, но и специфически разрушают его поверхностный белок. При этом оказалось, что, вопреки существовавшим беспокойствам, антитела, гидролизующие S-белок коронавируса, по-видимому, не вызывают симптомы аутоиммунных заболеваний. Результаты исследований, поддержанных грантом Президентской программы Российского научного фонда (РНФ), опубликованы в журналах Vaccines и International Journal of Molecular Science.

Коллектив ученых из Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН проверил, какие антитела к коронавирусу и в каком количестве образуются после вакцинации «Спутником V», а также подтвердил, что каталитические антитела способны уничтожать вирус.
Подробнее

Около ста лет назад началась «миссия» по спасению человечества от бактерий. Тогда мир узнал о пенициллине, первом антибиотике. Его открыл Александр Флеминг в 1928 году. Спустя еще 12 лет ученые получили этот препарат в чистом виде, а в 1941 году – сделали первую инъекцию человеку. Это было уникальное открытие, которое позволило спасти миллионы жизней – так началась эра антибиотиков.

Но, как показало время, панацеей антибиотики стать не смогли – оказалось, бактерии со временем просто переставали «бояться» их. Стартовала настоящая «гонка вооружений», которая продолжается до сих пор – ученые бросают вызов микроорганизмам, изобретая новые лекарства, а бактерии, в свою очередь, не планируют сдаваться без боя. Как в этой ситуации могут помочь бактериофаги? И кто же победит – вирусы или бактерии?

Об этом в интервью наука.рф рассказала кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной микробиологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Вера Морозова.

Интервью на официальном сайта Десятилетия науки и технологий Наука.рф

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН разработали тест-систему для проверки клеток на различные виды раковых мутаций.

«Это набор программ и методик по тому, как разработать новые тест-системы, чтобы выявлять мутации при онкологических заболеваниях, либо детектировать патогенов. Программу используют исследователи всего мира, поскольку она доступна, ее может скачать любой», ─ рассказал научный сотрудник лаборатории фармакогеномики ИХБФМ СО РАН Андрей Кечин.

Сюжет программы «Вести Новосибирск»

В Институте химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН рассказали, как работает система ремонта генома с помощью фермента АР-эндонуклеазы

«Существует по крайней мере шесть основных путей репарации ДНК. Узнавание и удаление необъемных повреждений ДНК происходит в ходе эксцизионной репарации оснований. Одним из ключевых ферментов, участвующих в этом процессе, является АР-эндонуклеаза. Ее основная биологическая роль состоит в распознавании и расщеплении такого вида повреждений ДНК, как АР-сайт, тем самым обеспечивается прохождение одного из этапов ремонта ДНК», - рассказывает Светлана Сенчурова, младший научный сотрудник лаборатории генетических технологий ИХБФМ СО РАН.

Материал «Науки в Сибири»

Лауреатами Нобелевской премии по физиологии и медицине в 2023 году стали венгерский и американский биохимики Каталин Карико и Дрю Вайсман. Награду им присудили за разработку технологии, которая легла в основу мРНК-вакцин против COVID-19.

Технология модификации мРНК позволяет создать не только вакцину от COVID-19, но и других инфекционных заболеваний. Кроме того, на их основе можно создавать терапевтические вакцины от онкозаболеваний.

О применении мРНК-технологий рассказал Григорий Степанов, заведующий лабораторией геномного редактирования Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

ГАЗЕТА.РУ
ТАСС
Коммерсантъ
Сюжет ОТС

27 сентября 2023 года в большом зале Правительства Новосибирской области прошло торжественное награждение победителей конкурсов на предоставление именных премий, именных стипендий, грантов Правительства Новосибирской области. Дипломы молодым ученым ИХБФМ СО РАН вручил губернатор НСО Андрей Травников.

Андрей Кечин, научный сотрудник лаборатории фармакогеномики, получил именную премию Правительства Новосибирской области за выдающиеся научные достижения в 2023 год в номинации «Лучший молодой изобретатель».

Получателями именных стипендий Правительства Новосибирской области для проведения перспективных научных исследований и разработок в 2023 году стали Дарья Чиглинцева, инженер лаборатории биохимии нуклеиновых кислот, и Марк Меламуд, инженер лаборатории ферментов репарации. ПОЗДРАВЛЯЕМ!

В Технопарке новосибирского Академгородка состоялось открытие всероссийской конференции «От микробиологии к генетическим технологиям», организатором которой стал Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

В ходе конференции состоится обсуждение вопросов поиска и получения новых штаммов-продуцентов перспективных продуктов, например ферментов с новыми свойствами; поиска почвенных микроорганизмов и конструирования искусственных микробных консорциумов стимулирующих рост растений, поиска новых антибиотиков и проблемы антибиотикорезистентности микроорганизмов, а также способов ее преодоления. Отдельная секция посвящена экологическим и прикладным аспектам бактериофагов, которые могут открыть новые возможности для решения проблемы борьбы с лекарственно-устойчивыми микроорганизмами.

Мероприятие проходит в рамках реализации проекта № 075-15-2021-1085 «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов, как основа для поиска новых противомикробных продуцентов и ферментов с уникальными свойствами».

11 сентября 2023 года начал работу международный научный форум по редактированию генома «CRISPR-2023», одним из организаторов которого стал Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

Это единственный научный форум, который будет посвящен применению в России технологии CRISPR/Cas9, позволяющей вносить изменения в геном высших организмов, в том числе человека.

«Тематический диапазон форума очень широк, от математики до химии и биологии через медицину, он не ограничивается геномным редактированием. В него входят персонализированная медицина, регенеративная медицина, клеточные технологии, big data анализ и синтетическая биология», - отмечает и.о.директора ИХБФМ СО РАН Владимир Коваль.
Программа

8 сентября 2023 года состоялось открытое расширенное заседание Ученого совета Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН. Почетное звание «Заслуженный ветеран Сибирского отделения РАН» присвоили Ольге Брызгуновой, Майе Дымовой, Никите Кузнецову, Александр Ломзову, Марии Харьковой и Вере Черноносовой.

И.о. директора Владимир Коваль вручил нагрудный знак «Почетный наставник», ведомственную награду Министерства науки и высшего образования РФ, члену-корреспонденту РАН Дмитрию Жаркову, Дарье Новопашиной и Александру Ломзову. Благодарность Минобрнауки РФ получили Елена Дмитриенко, Анна Зуева, Людмила Королева, Максим Филипенко и Андрей Шевела.

ПОЗДРАВЛЯЕМ!

1 сентября 2023 год стартовал новый учебный год. В стенах Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН начались лекции для студентов и аспирантов.

О том, как в Новосибирском научном центре работают со школьниками и студентами, которые заинтересованы в построении карьеры в области биомедицины, биотехнологий, биоинформатики, рассказал Сергей Седых, научный сотрудник лаборатории ферментов репарации ИХБФМ СО РАН, старший преподаватель НГУ.

Ученый отметил, что одним из успешных проектов ученых ННЦ, направленных одновременно на выявление талантов и научное волонтерство, является программа Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов», поддержанная грантом Минобрнауки РФ. В этом году больше 3 000 школьников и наставников собрали более 10 000 образцов почвы, в которых сегодня ученые ищут ферменты для геномного редактирования, бактериофаги и другие продуценты.
Подробнее

В рамках Х Международного форума «Технопром-2023» состоялось заседание круглого стола «Биофармацевтика и биомедицина. Актуальные проблемы и пути достижения цели», модератором которого выступил академик Валентин Власов, научный руководитель ИХБФМ СО РАН.
На заседании выступили Дмитрий Кудлай, вице-президент АО «Генериум», Владимир Коваль, и.о.директора ИХБФМ СО РАН, Владимир Рихтер, заведующий лабораторией биотехнологии, Нина Тикунова, заведующая лабораторией молекулярной микробиологии, Виталий Морозов, заведующий лабораторией технологий управления здоровьем, Сергей Седых, н.с. лаборатории ферментов репарации, Владимир Козлов, научный руководитель НИИФКИ, Елена Черных, заведующая лабораторией клеточной иммунотерапии, Елена Бирюкова, директор производства АО «ПФК Обновление», Андрей Покровский, директор Института психологии и медицины НГУ.
Участники заседания узнали о точке зрения «большой фармы» на возможности и перспективы отечественных разработок, проанализировали позицию медицинского сообщества по введению в практику новых отечественных препаратов, обсудили различные терапевтические препараты и отечественные медицинские изделия для диагностики in vitro.
Публикация на сайте газеты «Наука в Сибири»

Виктория Попова, младший научный сотрудник лаборатории структурной биологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, стала победителем конкурса «Академина» в номинации «Лучшее первое научное открытие».
Анна Юдкина, научный сотрудник лаботории геномной и белковой инженерии ИХБФМ СО РАН, стала лауреатом III степени конкурса «Академина» в номинации «Кандидат наук».
Пятая церемония награждения победителей конкурса «Академина» прошла в рамках X Международного форума технологического развития «Технопром». По словам организаторов, конкурс направлен на выявление и поддержку талантливых и успешных женщин, работающих в сфере науки, образования и экономики, а также популяризацию профессий ученого, педагога высшего образования.

Фото Валерия Панова
Публикация на сайте газеты «Наука в Сибири»

7 Августа 2023 года отмечает юбилей Ольга Ивановна Лаврик, академик РАН, профессор, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

Ольга Ивановна Лаврик – известный российский ученый, специалист в области физико-химической биологии. Ею внесен выдающийся вклад в изучение ферментов репликации и репарации ДНК. В частности, в её работах установлен механизм взаимодействия ДНК с факторами репликации и их вклад в функционирование ДНК-полимераз человека. Под ее руководством развит ряд оригинальных методов, позволяющих исследовать сложные белковые ансамбли репликации и репарации ДНК. Результаты исследований, выполненных Ольгой Ивановной, широко представлены в ведущих отечественных и зарубежных журналах, активно цитируются научной общественностью. Об этом свидетельствует один из самых высоких рейтингов цитирования работ О.И.Лаврик в своей области – более 7000. О.И.Лаврик имеет более 500 публикаций, из них 12 монографий и учебников. Индекс Хирша работ О.И.Лаврик равен 41.

Дорогая Ольга Ивановна! Примите самые теплые поздравления от руководства и коллектива Института. Новых побед, ярких открытий, крепкого здоровья, благополучия, заботы и внимания родных и близких! Пусть Ваши глубокие знания, уникальный научный и жизненный опыт помогают покорять новые вершины!

Статья «Усердием и воображением», приуроченная к юбилею Ольги Ивановны Лаврик, на научно-информационном портале «Поиск»

Номер газеты «Наука в Сибири»

Сибирские ученые представили первые пилотные результаты возможности применения искусственного интеллекта и нейросетей для построения прогностических моделей шизофрении. Участие в исследовании приняли сотрудники НИИ психического здоровья Томского НИМЦ, Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН и Института ядерной физики им. Г.И. Будкера СО РАН. Результаты работы опубликованы в высокорейтинговом научном журнале Biomedicines.

«Оказалось, что алгоритм на основе глубокой нейронной сети показал более высокую чувствительность и специфичность, чем другие алгоритмы. Кроме того, мы продемонстрировали, что объединение переменных в один классификатор сопровождается кумулятивным эффектом, превышающим роль каждого биомаркера в отдельности. Таким образом, использование одного биомаркера для диагностики шизофрении было бы неэффективным. Поэтому для разработки прогностических моделей диагностики шизофрении необходимо использовать комбинации нескольких биомаркеров. Дальнейшие исследования должны быть направлены на поиск наиболее информативных комбинаций биомаркеров», – комментирует научный сотрудник лаборатории ферментов репарации ИХБФМ СО РАН, канд. биол. наук Евгений Ермаков.
Пресс-релиз

Новость на сайте Министерства науки и высшего образования РФ

Специалисты Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН изучили изменение иммунных параметров при шизофрении. Ученые выявили, что среди пациентов выделяется группа больных с высоким уровнем воспаления. Для них в будущем может применяться дополнительная персонифицированная противовоспалительная терапия.

«Есть много исследований, которые показывают, что различные нарушения иммунной системы связаны с развитием шизофрении. Мы пытаемся найти эту связь между изменением конкретных иммунных параметров и симптомами шизофрении», - объясняет научный сотрудник лаборатории ферментов репарации ИХБФМ СО РАН Евгений Ермаков.

Публикация на сайте официального издания СО РАН "Наука в Сибири"
Интерфакс

Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами из онкологической больницы при Медицинском университете Гуанчжоу (Китай) создали нейлоновые нанокапсулы для доставки лекарств к опухолям. В основе одних капсул — магнитные наночастицы, что позволяет использовать их в МРТ-диагностике и лечении с помощью локальной гипотермии. Другие полые, и это дает возможность вмещать больше препарата и воздействовать на онкологические новообразования наименее токсично. Результаты исследования опубликованы в Magnetochemistry.

«В этом исследовании для работы с наночастицами мы использовали полимер нейлон-6 (он же капрон) — это тот самый материал, который применяется при изготовлении колготок. Он полностью биосовместим, биоразлагаем, нетоксичен и уже применяется в биомедицинских целях, например из него делают хирургические нити. Оказалось, если на наночастицу нанести капроновое покрытие, то, во-первых, можно стабилизировать поверхность. Во-вторых, нейлон-6 формирует трехмерную пористую матрицу. За счет того, что в этом полимере есть несколько хорошо реакционноспособных функциональных групп, к нему можно что-то химически присоединить», — рассказывает заведующая лабораторией биомедицинской химии ИХБФМ СО РАН кандидат химических наук Елена Дмитриенко.

Публикация на сайте официального издания СО РАН "Наука в Сибири"
ТАСС

Год назад в Национальном медицинском исследовательском центре онкологии им. Н.Н. Петрова началась I фаза клинических исследований препарата на основе генно-модифицированного онколитического вируса, применяемого для терапии рака молочной железы. Препарат разработан Институтом химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, центром «Вектор» Роспотребнадзора в партнерстве с ООО «Онкостар» .

Владимир Рихтер - один из разработчиков препарата, заведующий лабораторией биотехнологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, на онкофоруме «Белые ночи 2023» дал эксклюзивное интервью пресс службе НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова, в котором рассказал о механизме действия онколитического вируса, первых результатах исследований и др.

Подробнее

Новосибирские ученые открыли бактериофаг, который можно использовать для борьбы с аэромонадами – бактериями, способными вызывать острые кишечные и раневые инфекции. Исследование проведено научными сотрудниками Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ (соглашение № 075-15-2021-1085, программа «Всероссийский атлас почвенных микроорганизмов, как основа для поиска новых противомикробных продуцентов и ферментов с уникальными свойствами») в рамках реализации национального проекта «Наука и университеты».

«Фаг обладает геномом, состоящим из двухцепочечной ДНК, длина генома более 45 тысяч пар нуклеотидов, в геноме обнаружено пятьдесят девять генов и он не содержит генов, ответственных за устойчивость к антибиотикам и выработку токсинов. Помимо практического интереса, этот фаг представляет интерес для фундаментальной науки, поскольку является новым видом бактериальных вирусов семейства Autographiviridae», - отмечает Вера Витальевна Морозова, старший научный сотрудник лаборатории молекулярной биологии ИХБФМ СО РАН.

Подробнее:
ТАСС

ГАЗЕТА.РУ

Ольга Ивановна Лаврик, академик РАН, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, стала гостьей программы «Разговоры по существу». О.И.Лаврик рассказала о биохимии как свежей «авангардной» области науки, порядке вручения государственных премий, сотрудничестве с Францией и многом другом.

Проект ГПНТБ СО РАН «Разговоры по существу» представляет собой цикл специальных видеоинтервью, посвященных конкурсу женщин-ученых «Академина».

Проект «Разговор по существу»: Ольга Лаврик

Российский научный фонд подвел итоги конкурсов Президентской программы исследовательских проектов 2023 года на получение грантов по мероприятиям «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» и «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых».
По результатам конкурсов РНФ поддержал 431 инициативный проект молодых ученых грантами размером до 2 млн рублей ежегодно, 254 проекта молодежных научных групп с финансированием до 6 млн рублей ежегодно.

Победителями конкурса на получение грантов РНФ по мероприятию «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными, стали
Голышев Виктор Михайлович с проектом № 23-74-01116 «Фосфорамидные азольные олигонуклеотиды в составе несовершенных комплексов с ДНК: гибридизационные свойства и эффективность удлинения в ходе ПЦР»;
Ермаков Евгений Александрович с проектом № 23-75-01136 «Воспалительные механизмы в патогенезе алкогольного абстинентного синдрома: роль нетоза и повышенной проницаемости кишечника»;
Кечин Андрей Андреевич с проектом № 23-74-01138 «Новые алгоритмы выявления крупных геномных перестроек для диагностики дефицита гомологичной рекомбинации»;

Чепанова Арина Александровна с проектом № 23-74-01078 «Влияние ингибиторов Tdp1 на тип клеточной гибели и экспрессию белков репарации ДНК в клетках с нокаутом по генам Tdp1 и PARP1».

Победители конкурса на получение грантов РНФ по мероприятию «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными:

Юдкина Анна Владимировна с проектом № 23-74-10040 «Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи»;

Матвеев Андрей Леонидович с проектом № 23-74-10105 «Белки бактериофагов как основа для создания антитело-подобных молекул для биофармацевтики».

Поздравляем!

Новость на сайте РНФ

Валентин Викторович Власов, академик РАН, научный руководитель Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, председатель Объединенного ученого совета по биологическим наукам Сибирского отделения РАН, стал гостем программы «КПД Идеи».

«КПД Идеи» — авторская программа заместителя директора ГПНТБ СО РАН Антона Веселова о передовых рубежах сибирской науки. Крупнейшие ученые СО РАН рассуждают о ближайшем будущем нашей страны и мира, объясняют суть передовых технологий и фундаментальных открытий.

КПД Идеи. #11. Валентин Викторович Власов

В число победителей конкурса «УМНИК» Фонда содействия инновациям по итогам 2022 года вошло восемнадцать представителей Новосибирской области.
Информационно-аналитический портал «Академгородок» пообщался с некоторыми победителями конкурса, которые рассказали о своих исследованиях и планах. Ряд работ относятся к области медицины и биотехнологий, в их числе – проект Данилы Задворных, инженера лаборатории органического синтеза ИХБФМ СО РАН.

Интервью с Д. Задворных и другими победителями конкурса

Ольга Ивановна Лаврик, академик РАН, заведующая лабораторией биоорганической химии ИХБФМ СО РАН, дала интервью «Российской Газете» и поразмышляла о том, что может остановить отток молодых ученых.
Как отмечает автор статьи, заявление главы Сибирского отделения РАН академика Валентина Пармона, что за последние пять лет наша наука потеряла около 50 тысяч ученых, бурно обсуждается в научном сообществе.

Подробнее:
материал «Российской Газеты»

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН приняли участие в работе международной научной конференции «Биокатализ-2023», проходившей в Суздале с 25 по 29 июня 2023 года. Мероприятие приурочено к столетию со дня рождения учёного и организатора науки Ильи Васильевича Березина.

С пленарным докладом выступила академик РАН Ольга Лаврик, заведующая лабораторией биоорганической химии ферментов (ЛБХФ), член оргкомитета конференции.

Дарья Новопашина, заместитель директора Института по научно-образовательной деятельности, представила доклад на секции «Генетические технологии и белковая инженерия».

Председателем секции «Энзимология процессов репарации ДНК» стал член-корреспондент РАН Дмитрий Жарков, заведующий лабораторией геномной и белковой инженерии (ЛГБИ). В работе секции приняли участие Никита Кузнецов, заведующий лабораторией генетических технологий, и.о. заведующего лабораторией исследования модификации биополимеров (ЛИМБ) Александра Кузнецова, Ольга Кладова, научный сотрудник ЛИМБ, сотрудники ЛГБИ Анна Юдкина, Евгения Дятлова и Антон Ендуткин, сотрудники ЛБХФ Нина Моор, Надежда Речкунова, Александра Захаренко, Надежда Дырхеева и Михаил Кутузов.

В секции «ДНКзимы и аптамеры: сенсорные и визуализирующие агенты на их основе» выступила с докладом Мария Воробьева, заведующая лабораторией химии РНК (ЛХРНК), и научный сотрудник ЛХРНК Анна Давыдова. Иван Вохтанцев, инженер лаборатории геномного редактирования, представил доклад в рамках школы молодых учёных «Разработка генетических технологий создания штаммов-продуцентов для промышленной биотехнологии».

Евгения Дятлова стала победителем конкурса молодых ученых, проведенного в рамках конференции.

Новосибирские ученые разработали соединение, которое может рассматриваться в качестве нового лекарственного кандидата для терапии острого респираторного дистресс-синдрома человека (тяжелой дыхательной недостаточности), в том числе вызванного SARS-CoV-2. Исследование выполнено в рамках гранта РНФ № 19–74–30011, результаты опубликованы в журнале Biomedicine & Pharmacotherapy.
Сотрудники Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с Новосибирским институтом органической химии имени Н. Н. Ворожцова синтезировали ряд соединений на основе глицирретовой кислоты – природного тритерпеноида, выделенного из корня солодки. Данные соединения были схожи по структуре с полусинтетическим тритерпеноидом бардоксолон метилом, успешно прошедшим в США вторую фазу клинических испытаний на пациентах с COVID-19. Ученые провели скрининг полученных молекул на мышиной модели острого повреждения легких, имитирующей острый респираторный дистресс-синдром у человека при коронавирусной инфекции. В результате было отобрано одно соединение, которое эффективно подавляло развитие патологических изменений в тканях легкого, вызванных воспалением.

Подробнее:
Интерфакс

ТАСС

Наука в Сибири

Поздравляем победителей региональных конкурсов по программе конкурса «УМНИК»

Григорьеву Евгению Владимировну с проектом «Разработка универсальных наноконтейнеров на основе сывороточных белков крови в качестве системы упаковки и доставки терапевтических препаратов».
Задворных Данилу Андреевича с проектом «Разработка новых антибактериальных препаратов, активных в отношении антибиотикоустойчивых штаммов микроорганизмов для нужд ветеринарии».
Рогалеву Валерию Игоревну с проектом «Разработка нового ИК-флуоресцентного красителя с большим псевдостоксовым сдвигом для визуализации биологических объектов в режиме реального времени».
Подробнее

21 июня 2023 года ушел из жизни Игорь Владимирович Рабинов, ведущий инженер лаборатории биотехнологии ИХБФМ СО РАН, работавший в Институте с 2002 года. И.В. Рабинов - талантливый химик, один из авторов технологии производства природных и модифицированных нуклеозид-5’-трифосфатов, соединений, которые используют в качестве базовых компонентов диагностических тест-систем для выявления социально значимых заболеваний. За эту разработку в 2019 г. Игорь Владимирович Рабинов в составе авторского коллектива награжден Государственной премией Новосибирской области.
В нашей памяти Игорь Владимирович Рабинов останется как специалист высокого класса, надежный и преданный друг, честный и порядочный человек.
Коллектив Института глубоко скорбит по поводу кончины Игоря Владимировича и выражает искренние соболезнования родным и близким.

Каждую секунду каждая клетка нашего тела подвергается атакам химических и физических агентов, которые могут убить её или превратить в раковую. Нашу ДНК повреждает не только радиация, ультрафиолетовое излучение и опасные химикаты, но и вода и кислород. Для защиты генома от таких воздействий у человека имеются несколько систем репарации ДНК, которые исправляют повреждения и тем самым предотвращают их превращение в мутации. Сибирские ученые открыли новый вид повреждений ДНК и показали, как его можно исправлять. Работа поддержана грантом РНФ № 21-74-00061, результаты опубликованы в престижном международном журнале Nucleic Acids Research.

В группе чл.-корр. РАН Д. О. Жаркова из Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН разработали способ получения сшивок пептидов с АП-сайтом в ДНК и применили его для изучения мутагенных свойств таких повреждений и их репарации. Оказалось, что даже несмотря на пришивку к ДНК достаточно большого фрагмента белка, ДНК-полимеразы – ферменты, отвечающие за репликацию – воспринимают и просто АП-сайт, и пептидную сшивку примерно одинаково. Столкнувшись с повреждениями обоих видов, они на какое-то время останавливаются, но с некоторой эффективностью способны преодолевать его. Интересно, что разные полимеразы ведут себя по-разному – одни, несмотря на отсутствие «инструкции» в ДНК-матрице, упорно вставляют напротив этой точки аденин (или, реже, гуанин), а другие сгибают ДНК так, чтобы не замечать поврежденного места и продолжают синтез со следующего нормального нуклеотида. В обоих случаях, однако, это приводит к мутации – либо замене, либо выпадению одного нуклеотида.

Как видно, пептидные сшивки с АП-сайтами в ДНК опасны, и должны как можно быстрее подвергаться репарации. Но как именно это происходит? «Мы никак не ожидали, - говорит автор работы к. б. н. Анна Юдкина, - что те же ферменты репарации, которые исправляют обычные АП-сайты, будут прекрасно устранять и сшивки». В самом деле, белки АП-эндонуклеазы, которые в норме расщепляют АП-сайты в ДНК, специализированы именно для репарации этого типа повреждений, и пришитые к ДНК пептидные фрагменты размером 10-20 аминокислотных остатков по идее должны мешать их работе. Оказалось, однако, что АП-эндонуклеазы бактерий и дрожжей эффективно гидролизуют ДНК со сшивкой. Фермент человека показывал более низкую активность, но она все равно была сравнима с его активностью на некоторых отличных от обычного АП-сайта повреждениях ДНК. «Определять количество белковых сшивок с АП-сайтами научились лишь недавно, и оказалось, что таких повреждений в ДНК очень много, - отмечает Анна Юдкина. – Наша работа закрывает вопрос о том, как проходит их репарация в клетке».

Пресс-релиз

Интерфакс

ТАСС

Владимир Рихтер, заведующий лабораторией биотехнологии Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, выступил с докладом на сессии «Генная терапия: будущее начинается сегодня» Петербургского международного экономического форума (ПМЭФ) в Санкт-Петербурге. Ученый рассказал о том, как идут клинические испытания онколитического вируса на базе осповакцины.
«Мы достигли определенных успехов в рамках ныне проходящих испытаний нашей онколитической терапии для лечения рака молочной железы, что заставило нас задуматься об ее использовании для борьбы с другими формами опухолей. Мы надеемся, что в ближайший год мы начнем клинические испытания по использованию онколитических вирусов для лечения различных вариаций рака мозга», - сообщил Владимир Рихтер.

Подробнее:
ТАСС (материал № 1)

ТАСС (материал № 2)

В новом выпуске газеты «Наука в Сибири» вышел материал «Здоровое долголетие: право, привилегия или оксюморон?», который написан по мотивам беседы с академиком Валентином Викторовичем Власовым, научным руководителем Институте химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН.

Ученый отметил, что в Институте ведутся исследования генетических систем, связанных с долголетием, а Центр новых медицинских технологий, одно из подразделений института, в настоящее время разрабатывает программу медицинского обеспечения ученых, которая должна помочь им жить долго и сохранять при этом работоспособность.
Публикация на сайте официального издания СО РАН "Наука в Сибири"