Центр масс-спектрометрического анализа [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
ИХБФМ СО РАН » ru » Структура института » Лаборатории » Центр масс-спектрометрического анализа
Центр масс-спектрометрического анализа

Центр масс-спектрометрического анализа



Черноносов Александр Анатольевич
доктор химических наук
телефон: (383) 363-51-78




Сотрудники

ФИО Должность Звание Телефон Researcher ID
1. Черноносов Александр Анатольевич в.н.с. д.х.н. 363-51-78 D-4684-2013
2. Баранова Светлана Владимировна н.с. к.х.н. 363-51-78 J-6240-2015
3. Канажевская Любовь Юрьевна н.с. к.х.н. 363-51-78 J-2134-2015
4. Лукина Мария Владимировна м.н.с. 363-51-78 М-5820-2017
5. Олейник Галина Александровна м.н.с. 363-51-78
6. Аксенова Лилия Владимировна лаборант 363-51-78
7. Мазуренко Екатерина Олеговна лаборант 363-51-78

Основные направления исследований


  • Определение наследственных заболеваний, выявляемых в неонатальный период.
  • Фармако-кинетика лекарственных препаратов: разработка масс-спектрометрических методов детекции лекарств, определение концентраций в биологических жидкостях, расчет фармако-кинетических параметров.

Важнейшие научные результаты


  • Разработаны методики определения методом масс-спектрометрии варфарина, варфаринового спирта и гидроксиварфаринов в образцах плазмы крови пациентов, принимающих варфарин и, проведены предварительные исследования фармако-кинетики метаболизма варфарина.
  • Проведены фармако-кинетические исследования метаболизма комплекса варфарина с арабиногалактаном.
  • Оптимизирована методика количественного определения аминикислот в готовых блюдах (супах) методом масс-спектрометрии.
  • Разработаны методики определения методом масс-спектрометрии препаратов нифедипин, глимепирид, альфалипоевой кислоты и нового противовирусного средства НИОХ-14.
  • Определено влияние генотипа Vkorc1 на фармакокинетические параметры метаболизма варфарина в Западно-Сибирской популяции европеоидного этнического происхождения.

Текущие гранты


Базовый проект. ПФНИ ГАН

  • VI.62.2.2 Развитие методов персонализированной медицины. (2017-2020 гг.)
  • VI.57.1.2 Механизмы функционирования систем репарации, транскрипции и трансляции. Патологические процессы, связанные с этими системами. (2017-2020 гг.)
  • VI.62.1.4 Интеллектуальные материалы для биомедицины. (2017-2020 гг.)
  • ПФИ РАН по приоритетному направлению I.42 (ФИМТ, ГЗ № 0309-2018-0020) Создание тестов для мониторинга состояния здоровья и выявления сердечно-сосудистых патологий у лиц критически важных профессий: определение биомаркеров в сухих пятнах крови. (2018-2020 гг.)

Российский научный фонд

  • № 22-24-00697 «Метаболомный профиль новых антивирусных препаратов против оспы: разработка и валидация масс-спектрометрических методов анализа в плазме крови и сухих пятнах крови.»


Публикации 2021-2023 года


  1. The life motto of a young researcher: follow your dreams. Zakabkuk G.A. Biophysical Review. 2023. V. 15. N 5. P. 811 - 812. DOI: 10.1007/s12551-023-01157-3
  2. Metabolomic profiling of three Rhododendron species from Eastern Siberia by liquid chromatography with high-resolution mass spectrometry. Chernonosov A.A., Karpova E.A., Karakulov A.V. South African Journal of Botany. 2023. V. 157. P. 622-634. DOI: 10.1016/j.sajb.2023.04.043
  3. Tonasso-Calvi`ere L., Orlando L., Spengler R. Occupation of highland Central Asia: New evidence from Kurteke rockshelter, Eastern Pamir. Shnaider S., Zhilich S.V., Zotkina L.V., Boxleitner K.A., Taylor W.T.T., Sayfullaev N., Koval V.V., Baranova S.V., Chernonosov A.A., Kutnyakova L.A., Archaeol. Res. Asia. 2023. V. 34. P. 100443. DOI: 10.1016/j.ara.2023.100443
  4. Dataset for Spectroscopic, Structural and Dynamic Analysis of Human Fe(II)/2OG-Dependent Dioxygenase ALKBH3. Kanazhevskaya L.Y., Gorbunov A.A., Zhdanova P.V., Koval V.V. Data. 2023. V. 8. P. 57. DOI: 10.3390/data8030057
  5. A Mechanocomposite Based on Biogenic Silica and Green Tea Flavonoids Modulates Adaptability of Strawberry Microclones to In Vitro and Ex Vitro Conditions. Ambros E., Karpova E., Kotsupiy O., Trofimova E., Zakabkuk G.A., Chernonosov A.A., Koval V.V., Novikova T. J Soil Sci Plant Nutr. 2023. V. 23, P. 612-627. DOI: 10.1007/s42729-022-01069-3
  6. Safety and Pharmacokinetics of the Substance of the Anti-Smallpox Drug NIOCH-14 after Oral Administration to Laboratory Animals. Shishkina L.N., Mazurkov O.Yu., Bormotov N.I., Skarnovich M.O., Serova O.A., Mazurkova N.A., Skarnovich M.A., Chernonosov A.A., Selivanov B.A., Tikhonov A.Ya., Gamaley S.G., Shimina G.G., Sysoyeva G.M., Taranov O.S., Danilenko E.D., Agafonov A.P., Maksyutov R.A. Viruses. 2023. V. 15. N 1. P. 205. DOI: 10.3390/v15010205Shishkina
  7. LC-HRMS for the Identification of Quercetin and Its Derivatives in Spiraea hypericifolia (Rosaceae) and Anatomical Features of Its Leaves. Petrova, N.V., Chernonosov A.A., Koval V.V., Andreeva V.Yu., Erst A.S., Kuznetsov A.A., Kulikovskiy M.S., Wang W., Yu S-X., Kostikova V.A. Plants (Basel). 2023. V. 12. N 2. P. 381. DOI: 10.3390/plants12020381
  8. Dynamics and Conformational Changes in Human NEIL2 DNA Glycosylase Analyzed by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry. Zhdanova P.V., Chernonosov A.A., Zharkov D.O., Koval V.V. J. Mol. Biol. 2022. P. 167334. DOI: 10.1016/j.jmb.2021.167334
  9. Dataset for dynamics and conformational changes in human NEIL2 protein analyzed by integrative structural biology approach. Zhdanova P.V., Ishchenko A.A., Chernonosov A.A., Zharkov D.O., Koval V.V. Data in Brief. 2022. V. 40. P. 107760. DOI: 10.1016/j.dib.2021.107760
  10. Investigation of chemical constituents of eranthis longistipitata (Ranunculaceae): Coumarins and furochromones. Erst A.S., Chernonosov A.A., Petrova N.V., Kulikovskiy M.S., Maltseva S.Yu., Wang W., Kostikova V.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 1. P. 406. DOI: 10.3390/ijms23010406
  11. Probing the Dynamics of Streptococcus pyogenes Cas9 Endonuclease Bound to the sgRNA Complex Using Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry. Zhdanova P.V., Chernonosov A.A., Prokhorova D.V., Stepanov G.A., Kanazhevskaya L.Y., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 1129. DOI: 10.3390/ijms23031129
  12. Multispin Systems with a Rigid Ferrocene-1,1′-diyl-Substituted 1,3-Diazetidine-2,4-diimine Coupler: A General Approach. Gurskaya L.Y., Polienko Yu. F., Rybalova T.V., Gritsan N.P., Dmitriev A.A., Kazantsev M.S., Zaytseva E.V., Parkhomenko D.A., Beregovaya I.V., Zakabkuk G.A., Tretyakov E.V. European J Org Chem. 2022. V. 7. e202101234. DOI: 10.1002/ejoc.202101234
  13. Mitomycin-Treated Endothelial and Smooth Muscle Cells Suitable for Safe Tissue Engineering Appro. Zakharova I., Saaya Sh.B., Shevchenko A.I., Stupnikova A., Zhiven M.K., Laktionov P.P., Stepanova A.O., Romashchenko A., Yanshole L., Chernonosov A.A., Volkov A., Kizilova E., Zavjalov E., Chernyavsky A., Romanov A., Karpenko A., Zakiyan S.M. Front. bioengin. and Biotech. 2022. V. 10. 10.3389/fbioe.2022.772981
  14. Cover Feature: Multispin Systems with a Rigid Ferrocene‐1,1′‐diyl‐Substituted 1,3‐Diazetidine‐2,4‐diimine Coupler: A General Approach. Gurskaya L.Y., Polienko Yu. F., Rybalova T.V., Gritsan N.P., Dmitriev A.A., Kazantsev M.S., Zaytseva E.V., Parkhomenko D.A., Beregovaya I.V., Zakabkuk G.A., Tretyakov E.V. European J Org Chem. 2022. V. 7. 10.1002/ejoc.202200116 (статья на обложке)
  15. Development and Validation of a Method of Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry for Quantification of ST-246 (Tecovirimat) in Human Plasma. Zakabkuk G.A., Koval V.V., Usova S.V., Shishkina L.N., Chernonosov A.A. Molecules. 2022. V. 27. N 11. P. 3577. DOI: 10.3390/molecules27113577
  16. Шнайдер С.В., Абдыканова А., Баранова С.В., Срывкина Ю.В., Ершова О.В., Алишер кызы С., Черноносов А.А. Применение ZooMS анализа к материалам стоянки Айгыржал-2 (Нарынская долина, Кыргызстан). Проблемы археологии, этнографии, антропологии Сибири и сопредельных территорий. 2022. Т. XXVIII. С. 400-406. DOI: 10.17746/2658-6193.2022.28.0400-0406
  17. Structural features of DNA polymerases β and λ in complex with benzo[a]pyrene-adducted DNA cause a difference in lesion tolerance. Rechkunova N.I., Zhdanova P.V., Lebedeva N.A., Maltseva E.A., Koval V.V., Lavrik O.I. DNA Repair. 2022. V. 116. P. 103353. DOI: 10.1016/j.dnarep.2022.103353
  18. Parallel Reaction Monitoring Mode for Atenolol Quantification in Dried Plasma Spots by Liquid Chromatography Coupled with High-Resolution Mass Spectrometry. Aksenova L.V., Koval V.V., Chernonosov A.A. Processes. 2022. V. 10. P. 1240. 10.3390/pr10071240
  19. Application of Parallel Reaction Monitoring to the Development and Validation of a Quantitative Assay for ST-246 in Human Plasma. Chernonosov A.A., Zakabkuk G.A., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N. 14. P. 8021. DOI: 10.3390/ijms23148021
  20. Thermodynamic Swings: How Ideal Complex of Cas9-RNA/DNA Forms. Zhdanova P.V., Lomzov A.A., Prokhorova D.V., Stepanov G.A., Chernonosov A.A., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 16. P. 8891. DOI: 10.3390/ijms23168891
  21. Conformational Dynamics of Human ALKBH2 Dioxygenase in the Course of DNA Repair as Revealed by Stopped-Flow Fluorescence Spectroscopy. Kanazhevskaya L.Y., Smyshliaev D.A., Timofeyeva N.A., Ishchenko A.A., Saparbaev M.K., Kuznetsov N.A., Fedorova O.S. Molecules. 2022. V. 27. N 15. P. 4960. DOI: 10.3390/molecules27154960
  22. Leaf surface secretion of flavonoids in Myricaria bracteata and M. longifolia (Tamaricaceae). Karpova E.A., Krasnikov A.A., Lyakh E.M., Chernonosov A.A. Taiwania 2022. V. 67. N 3. P. 413-421. DOI: 10.6165/tai.2022.67.413
  23. Фармакокинетические показатели субстанци ниох-14 - нового противооспенного фармакологического вещества. Мазурков О.Ю., Шишкина Л.Н., Бормотов Н.И., Скарнович М.О., Серова О.А., Мазуркова Н.А., Скарнович М.А., Черноносов А.А., Тихонов А.Я., Селиванов Б.А. Экспериментальная и клиническая фармакология. 2022. Т. 84. № 5. С. 22-26. DOI: 10.30906/0869-2092-2021-84-5-22-26
  24. Levels of Acylcarnitines and Branched-Chain Amino Acids in Antipsychotic-Treated Patients with Paranoid Schizophrenia with Metabolic Syndrome. Mednova I.A., Chernonosov A.A., Kornetova E.G., Semke A.V., Bokhan N.A., Koval V.V., Ivanova S.A. Metabolites. 2022. V. 12. N 9. P. 850. DOI: 10.3390/metabo12090850
  25. Structure- and Content-Dependent Efficiency of Cas9-Assisted DNA Cleavage in Genome-Editing Systems. Baranova S.V., Zhdanova P.V., Lomzov A.A., Koval V.V., Chernonosov A.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. N 22. P. 13889. DOI: 10.3390/ijms232213889
  26. Костяная индустрия стоянки Сурунгур (Ферганская долина, Кыргызстан). Федорченко А., Шнайдер С., Баранова С.В., Черноносов А.А., Чаргынов Т., Рендю У., Марковский Г.И. Археология Казахстана. 2022. № 4 (18). С. 97–115. DOI: 10.52967/akz2022.4.18.97.115
  27. Multispin Systems with a Rigid Ferrocene‐1,1′‐diyl‐Substituted 1,3‐Diazetidine‐2,4‐diimine Coupler: A General Approach. Gurskaya L.Y., Polienko Yu. F., Rybalova T.V., Gritsan N.P., Dmitriev A.A., Kazantsev M.S., Zaytseva E.V., Parkhomenko D.A., Beregovaya I.V., Zakabkuk G.A., Tretyakov E.V. European J Org Chem. 2022. V. 2022. N 7. e202101. DOI: 10.1002/ejoc.202101234
  28. Human NEIL2 protein structure obtained with combination of computer modeling approaches and HDX-MS technique. Zhdanova P.V., Brier S., Chernonosov A.A., Koval V.V. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 235. DOI: 10.1002/2211-5463.1320 (тезисы конференции)
  29. Study of supramolecular complex of nifedipine with arabinogalactan on Wistar and ISIAH rats. Khvostov M., Chernonosov A.A., Borisov S.A., Borisova M.S., Meteleva E.S., Evseenko V.I., Polyakov N.E., Dushkin A.V., Tolstikova T.G. Therapeutic Delivery. 2021. V. 12. N 2. P. 119-131. DOI: 10.4155/tde-2020-0115
  30. The Development of a Liquid Chromatography High-Resolution Mass Spectrometric Method for Apixaban Quantification in Dried Plasma Spots in Parallel Reaction Monitoring Mode. Chernonosov A.A., Aksenova L.V., Koval V.V. Processes. 2021. V. 9. N 3. P. 450. DOI: 10.3390/pr9030450
  31. Amino Acid and Acylcarnitine Levels in Chronic Patients with Schizophrenia: A Preliminary Study. Mednova I.A., Chernonosov A.A., Kasakin M.F., Kornetova E.G., Semke A.V., Bokhan N.A., Koval V.V., Ivanova S.A. Metabolites. 2021. V. 11. N 34. P. 1-11. DOI: 10.3390/metabo11010034
  32. HIV-Infected Patients: Cross Site-Specific Hydrolysis of H3 and H4 Histones and Myelin Basic Protein with Antibodies against These Three Proteins. Baranova S.V., Dmitrenok P.S., Buneva V.N., Sedykh S.E., Nevinsky G.A. Molecules. 2021. V. 26. N 2. P. 316. DOI: 10.3390/molecules26020316
  33. Phenolic compounds in taxonomy of Myricaria longifolia and Myricaria bracteata (Tamaricaceae). Karpova E., Davlatov S.K., Chernonosov A.A. BIO Web of Conferences. 2021. V. 38. P. 00051. DOI: 10.1051/bioconf/20213800051
  34. Mechanically Activated Enzymatic Hydrolysis of Pea Seeds and Its Effects on Bakery Products. Bychkova E., Gosman D., Dome K., Beisel N., Chernonosov A.A. Appl. food Biotech. 2021. V. 8. N 3. P. 213-223. DOI: 10.22037/afb.v8i3.32756
  35. Polyfluorinated triphenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazoles with dendroid arylsulfanyl moieties as donor blocks in donor-acceptor chromophores. Ishchenko R.A., Kargapolova I.Yu., Orlova N.A., Shelkovnikov V.V., Maksimov A.M., Ryazanov N.D., Berezhnaya V.N., Chernonosov A.A. J. Fluorine Chem. 2021. V. 248. P. 109841. DOI: 10.1016/j.jfluchem.2021.109841
  36. Фармакокинетические показатели субстанции НИОХ-14 — нового противооспенного фармакологического вещества. Мазурков О.Ю., Шишкина Л.Н., Бормотов Н.И., Скарнович М.О., Серова О.А., Мазуркова Н.А., Скарнович М.А., Черноносов А.А., Тихонов А.Я., Селиванов Б.А. Экспериментальная и клиническая фармакология. 2021. Т. 84. № 5. С. 22-26. DOI: 10.30906/0869-2092-2021-84-5-22-26
  37. A structural mechanism of DNA polymerase lambda action that promotes error-free bypass of bulky modifications in DNA. Zhdanova P.V., Lomzov A.A., Rechkunova N.I., Koval V.V. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 180. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 (тезисы конференции)
  38. Structural features of Cas9 protein complex with RNA-DNA duplex based on the HDX-MS technique. Chernonosov A.A., Zhdanova P.V., Stepanov G.A., Koval V.V. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 234. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 (тезисы конференции)
  39. New biochemical markers of HIV infection – bispecific antibodies and its catalytic activity. Baranova S.V., Sedykh S.E., Nevinsky G.A. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 442. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 (тезисы конференции)
  40. Multiple sclerosis: Enzymatic cross site-specific hydrolysis of h1 histone by iggs against h1, h2a, h2b, h3, h4 histones, and myelin basic protein. Nevinsky G.A., Baranova S.V., Buneva V.N., Dmitrenok P.S. Biomolecules. 2021. V. 11. N 7. P. 1140. DOI: 10.3390/biom11081140
  41. Identification of flavonoids in the leaves of eranthis longistipitata (Ranunculaceae) by liquid chromatography with high-resolution mass spectrometry (LC-HRMS). Kostikova V.A., Chernonosov A.A., Kuznetsov A.A., Petrova N.V., Krivenko D.A., Chernysheva O.A., Wang W. Plants (Basel). 2021. V. 10. N 10. P. 2146. DOI: 10.3390/plants10102146
  42. Tropism of Extracellular Vesicles and Cell-Derived Nanovesicles to Normal and Cancer Cells: New Perspectives in Tumor-Targeted Nucleic Acid Delivery. Oshchepkova A.L., Markov O.V., Evtushenko E., Chernonosov A.A., Kiseleva E., Morozova K., Matveeva V., Artemyeva L.V., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Pharmaceutics. 2021. V. 13. P. 1911. 0.3390/pharmaceutics13111911
  43. DNA Demethylation in the Processes of Repair and Epigenetic Regulation Performed by 2-Ketoglutarate-Dependent DNA Dioxygenases. Kuznetsov N.A., Kanazhevskaya L.Y., Fedorova O.S. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. N 19. P. 10540. DOI: 10.3390/ijms221910540
  44. Результаты комплексного исследования памятника Куртеке (Восточный Памир). Шнайдер С.В., Ашастина К, А., Алишер кызы С., Сайфуллаев Н., Закаблук Г.А., Черноносов А.А., Спенглер Р., Зоткина Л.В. Теория и практика археологических исследований. 2021. Т. 33. № 4. С. 284-296. DOI: 10.14258/33(4).-16

Патенты

  • СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОНЦЕНТРАЦИИ ВАРФАРИНОВОГО СПИРТА В ПЛАЗМЕ КРОВИ. Черноносов А.А., Коваль В.В., Федорова О.С. 2013 г. № 2486521
  • СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ АПУРИН/АПИРИМИДИН-ЭНДОНУКЛЕАЗЫ ЧЕЛОВЕКА. Кузнецов Н.А., Коваль В.В., Федорова О.С. 2010 г. № 2389026
  • СРЕДСТВО ДЛЯ ИНГИБИРОВАНИЯ ФЕРМЕНТА 8-ОКСОГУАНИН-ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗЫ ЧЕЛОВЕКА. Кузнецов Н.А., Коваль В.В., Воробьев Ю.Н., Жарков Д.О., Сильников В.Н., Федорова О.С. 2010 г. № 2380417
  • СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ 8-ОКСОГУАНИН-ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗЫ ЧЕЛОВЕКА. Федорова О.С., Коваль В.В., Кузнецов Н.А. 2008 г. № 2321637

Оборудование


  • масс-спектрометры MALDI-TOF Autoflex Speed (Bruker Daltonics, Германия) и ESI LC/MS/MSD XCT (Agilent Technologies, США);
  • аппарат для капиллярного электрофореза (Agilent Technologies, США);
  • хроматографические системы (Series 1200) как для разделения и анализа пептидов, так и для препаративного разделения белковых молекул (Agilent Technologies, США).




© Copyright 2023. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика