Центр масс-спектрометрического анализа

Черноносов Александр Анатольевич
доктор химических наук
телефон: (383) 363-51-78
Email

• Определение наследственных заболеваний, выявляемых в неонатальный период.
• Фармако-кинетика лекарственных препаратов: разработка масс-спектрометрических методов детекции лекарств, определение концентраций в биологических жидкостях, расчет фармако-кинетических параметров.

• Разработаны методики определения методом масс-спектрометрии варфарина, варфаринового спирта и гидроксиварфаринов в образцах плазмы крови пациентов, принимающих варфарин и, проведены предварительные исследования фармако-кинетики метаболизма варфарина.
• Проведены фармако-кинетические исследования метаболизма комплекса варфарина с арабиногалактаном.
• Оптимизирована методика количественного определения аминикислот в готовых блюдах (супах) методом масс-спектрометрии.
• Разработаны методики определения методом масс-спектрометрии препаратов нифедипин, глимепирид, альфалипоевой кислоты и нового противовирусного средства НИОХ-14.
• Определено влияние генотипа Vkorc1 на фармакокинетические параметры метаболизма варфарина в Западно-Сибирской популяции европеоидного этнического происхождения.

Базовый проект. ПФНИ ГАН

• VI.62.2.2 Развитие методов персонализированной медицины. (2017-2020 гг.)
• VI.57.1.2 Механизмы функционирования систем репарации, транскрипции и трансляции. Патологические процессы, связанные с этими системами. (2017-2020 гг.)
• VI.62.1.4 Интеллектуальные материалы для биомедицины. (2017-2020 гг.)
• ПФИ РАН по приоритетному направлению I.42 (ФИМТ, ГЗ № 0309-2018-0020) Создание тестов для мониторинга состояния здоровья и выявления сердечно-сосудистых патологий у лиц критически важных профессий: определение биомаркеров в сухих пятнах крови. (2018-2020 гг.)

Российский научный фонд

• № 22-24-00697 «Метаболомный профиль новых антивирусных препаратов против оспы: разработка и валидация масс-спектрометрических методов анализа в плазме крови и сухих пятнах крови.»

1. Thermodynamic parameters obtained for the formation of the Cas12a-RNA/DNA complex. Baranova S.V., Zhdanova P.V., Golyshev V.M., Lomzov A.A., Pestryakov P.E., Chernonosov A.A., Koval V.V. Biochem. and Biophys.Res. Com. 2025. V. 743. P. 151176. DOI: 10.1016/j.bbrc.2024.151176
2. Untargeted Plasma Metabolomic Profiling in Patients with Depressive Disorders: A Preliminary Study. Chernonosov A.A., Mednova I.A., Levchuk L.A., Mazurenko E.O., Roschina O.V., Simutkin G.G., Bokhan N.A., Koval V.V., Ivanova S.A. Metabolites. 2024. V. 14. P. 110. DOI: 10.3390/metabo14020110
3. Chemical Composition of Methanol Extracts from Leaves and Flowers of Anemonopsis macrophylla (Ranunculaceae). Kostikova V.A., Petrova N.V., Chernonosov A.A., Koval V.V., Kovaleva E.R., Erst A.S. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. P. 989. DOI: 10.3390/ ijms25020989
4. The Role of Key Amino Acids of the Human Fe(II)/2OG-Dependent Dioxygenase ALKBH3 in Structural Dynamics and Repair Activity toward Methylated DNA. Kanazhevskaya L.Y., Gorbunov A.A., Lukina M.V., Smyshliaev D.A., Zhdanova P.V., Lomzov A.A., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. P. 1145. DOI: 10.3390/ ijms25021145
5. Structural and Dynamic Features of the Recognition of 8-oxoguanosine Paired with an 8-oxoG-clamp by Human 8-oxoguanine-DNA Glycosylase. Lukina M.V., Zhdanova P.V., Koval V.V. Curr. Issues Mol. Biol. 2024. V. 46. P. 4119–4132. DOI: 10.3390/cimb46050253
6. Synthesis and Spectral Properties of Iodo-Substituted Dyes Based on Benzothiazolium Salts. Malakhov I.A., Orlova N.A., Shelkovnikov V.V., Vasilyev E.V., Chernonosov A.A. Russ. J. of Organic Chemistry. 2024. V. 60. N 1. P. 47-55. DOI: 10.1134/S107042802401007X
7. Redox Transformations of the OX063 Radical in Biological Media: Oxidative Decay of Initial Trityl with Further Formation of Structurally-Modified TAM. Sergey S. Ovcherenko, Arthur E. Raizvich, Olga Yu. Rogozhnikova, Victor M. Tormyshev, Dmitry V. Trukhin, Koval V.V., Georgii E. Salnikov, Alexander M. Genaev, Andrey V. Shernyukov, Elena G. Bagryanskaya. Chemistry – A European Journal. 2024. V. 30. e202400718. DOI: 10.1002/chem.202400718
8. Результаты повторного изучения неолитических материалов со стоянки Ак-Таньги (Северный Таджикистан). Шнайдер С.В., Каспаров А.К., Филимонова Т.Г., Марковский Г.И., Баранова С.В., Черноносов А.А., Коваль В.В., Федорченко А.Ю. Вестник археологии, антропологии и этнографии. 2024. № 3 (66). С. 5-15. DOI: 10.20874/2071-0437-2024-66-3-1
9. Cleavage of DNA Substrate Containing Nucleotide Mismatch in the Complementary Region to sgRNA by Cas9 Endonuclease: Thermodynamic and Structural Features. Baranova S.V., Zhdanova P.V., Koveshnikova A.D., Pestryakov P.E., Vokhtantsev I.P., Chernonosov A.A., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. P. 10862. DOI: 10.3390/ijms251910862
10. Study of Hard Protein Corona on Lipid Surface of Composite Nanoconstruction. Epanchintseva A.V., Baranova S.V., Poletaeva Y., Bakhno I.A., Ryabchikova E.I., Dovydenko I.S. Nanomaterials. 2024. V. 14. N 21. P. 1767. DOI: 10.3390/nano14211767
11. Design of Aptamer Sandwich Pairs for Colorimetric Detection of TNFa, Interleukin-17A and Dickkopf-1 Proteins Associated with Ankylosing Spondylitis. Shatunova E.A., Davydova A.S., Danilin N.A., Golyshkin A.A., Korolev M.A., Vorobyeva M.A. J. Sib. Fed. Univ. Math. Phys. 2024. V. 17. N 6. P. 791-797.
12. Синтез и спектральные свойства йодозамещенных красителей на основе солей бензотиазолия. Малахов И, А., Орлова Н.А., Шелковников В.В., Васильев Е.В., Черноносов А.А. Журнал органической химии. 2024. Т. 60. № 1. C. 132-142. DOI: 10.31857/S0514749224010126
13. The Photomodification Method Allows for Determining the Composition of the Full and Soft Protein Corona on the Lipid Surface of Composite Nanoparticles. Epanchintseva A.V., Baranova S.V., Poletaeva Y., Tupitsyna A.V., Ryabchikova E.I., Dovydenko I.S. Nanomaterials. 2024. V. 14. P. 1976. DOI: 10.3390/nano14231976
14. The Role of Key Amino Acids of the Human Fe(II)/2OG-Dependent Dioxygenase ALKBH3 in Structural Dynamics and Repair Activity toward Methylated DNA. Kanazhevskaya L.Y., Gorbunov A.A., Lukina M.V., Smyshliaev D.A., Zhdanova P.V., Lomzov A.A., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N 2. P. 1145. DOI: 10.3390/ijms25021145
15. Метод генных сетей и метаболомный анализ позволили выявить специфические пути изменения профиля аминокислот и ацилкарнитинов в плазме крови при болезни Паркинсона и сосудистом паркинсонизме. Макарова А.А., Мельникова П.М., Рогачев А.Д., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Предтеченская Е.В., Карманов С.Ю., Коваль В.В., Покровский А.Г., Лаврик И.Н., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2024. Т. 28. № 8. С. 927-939. DOI: 10.18699/vjgb-24-100
16. A Mechanocomposite Based on Biogenic Silica and Green Tea Flavonoids Modulates Adaptability of Strawberry Microclones to In Vitro and Ex Vitro Conditions. Ambros E., Karpova E., Kotsupiy O., Trofimova E., Zakabkuk G.A., Chernonosov A.A., Koval V.V., Novikova T. J Soil Sci Plant Nutr. 2023. V. 23. P. 612-627. DOI: 10.1007/s42729-022-01069-3
17. Safety and Pharmacokinetics of the Substance of the Anti-Smallpox Drug NIOCH-14 after Oral Administration to Laboratory Animals. Shishkina L.N., Mazurkov O.Yu., Bormotov N.I., Skarnovich M.O., Serova O.A., Mazurkova N.A., Skarnovich M.A., Chernonosov A.A., Selivanov B.A., Tikhonov A.Ya., Gamaley S.G., Shimina G.G., Sysoyeva G.M., Taranov O.S., Danilenko E.D., Agafonov A.P., Maksyutov R.A. Viruses. 2023. V. 15. N 1. P. 205. DOI: 10.3390/v15010205Shishkina
18. LC-HRMS for the Identification of Quercetin and Its Derivatives in Spiraea hypericifolia (Rosaceae) and Anatomical Features of Its Leaves. Petrova, N.V., Chernonosov A.A., Koval V.V., Andreeva V.Yu., Erst A.S., Kuznetsov A.A., Kulikovskiy M.S., Wang W., Yu S-X., Kostikova V.A. Plants (Basel). 2023. V. 12. N 2. P. 381. DOI: 10.3390/plants12020381
19. Dataset for Spectroscopic, Structural and Dynamic Analysis of Human Fe(II)/2OG-Dependent Dioxygenase ALKBH3. Kanazhevskaya L.Y., Gorbunov A.A., Zhdanova P.V., Koval V.V. Data. 2023. V. 8. P. 57. DOI: 10.3390/data8030057
20. Occupation of highland Central Asia: New evidence from Kurteke rockshelter, Eastern Pamir. Shnaider S., Zhilich S.V., Zotkina L.V., Boxleitner K.A., Taylor W.T.T., Sayfullaev N., Koval V.V., Baranova S.V., Chernonosov A.A., Kutnyakova L.A., Tonasso-Calvi`ere L., Orlando L., Spengler R. Archaeol. Res. Asia. 2023. V. 34. P. 100443. DOI: 10.1016/j.ara.2023.100443
21. Abasic site–peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases. Yudkina A.V., Bulgakov N., Kim D.V., Baranova S.V., Ishchenko A.A., Saparbaev M.K., Koval V.V., Zharkov D.O. Nucleic Acids Res. 2023. V. 51. N 12. P. 6321-6336. DOI: 10.1093/nar/gkad423
22. Metabolomic profiling of three Rhododendron species from Eastern Siberia by liquid chromatography with high-resolution mass spectrometry. Chernonosov A.A., Karpova E.A., Karakulov A.V. South African Journal of Botany. 2023. V. 157. P. 622-634. DOI: 10.1016/j.sajb.2023.04.043
23. Природные обстановки позднего плейстоцена в Восточном Казахстане (по материалам стоянки Ушбулак). Анойкин А.А. , Павленок Г.Д., Силаев В.И., Шнайдер С.В., Коваль В.В., Девятова А.Ю., Васильев С.К., Бочарова Е.Н., Харевич В.М., Таймагамбетов Ж.К. Археология, этнография и антропология Евразии. 2023. Т. 51. № 3. С. 75-85. DOI: 10.17746/1563-0102.2023.51.3.000-000
24. Non-Targeted Screening of Metabolites in Aqueous-Ethanol Extract from Spiraea hypericifolia (Rosaceae) Using LC-HRMS. Kostikova V.A., Petrova N.V., Shaldaeva T.M., Koval V.V., Chernonosov A.A. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 13872. DOI: 10.3390/ijms241813872
25. Структура лед-связывающего белка из Myoxocephalus octodecemspinosus, полученная методом молекулярной динамики и на основе спектров кругового дихроизма. Закаблук Г.А., Жданова П., Коваль В.В., Черноносов А.А., Баранова С.В. Биофизика. 2023. Т. 68. № 4. C. 640–645. DOI: 10.31857/S0006302923040026
26. Late Pleistocene Environments of East Kazakhstan (Based on Ushbulak Site Materials). Anoikin A.A., Pavlenok G.D., Silaev V.I., Shnaider S.V., Koval V.V., Devyatova A.Y., Vasiliev S.K., Bocharova E.N., Kharevich V.M., Taimagambetov Z.K. Археология, этнография и антропология Евразии. 2023. V. 51. N 3. P. 75–85. DOI: 10.17746/1563-0110.2023.51.3.075-085 перевод
27. A leaf litter fermented product as a source of low-molecular-weight compounds with potential to enhance cold tolerance of Begonia grandis. Karpova E.A., Fershalova T.D., Petruk A.A., Shaldaeva T.M., Chernonosov A.A. Energy, Ecology and Environment. 2023. V. 8. N 6. P. 522 - 536. 10.1007/s40974-023-00292-7
28. The life motto of a young researcher: follow your dreams. Zakabkuk G.A. Biophysical Reviews. 2023. V. 15. N 5. P. 811 - 812. DOI: 10.1007/s12551-023-01157-3 тезисы конференции
29. Dynamic structural features of aqua complex formation for ice-binding protein from the fish Myoxocephalus octodecemspinosus based on the HDX-MS technique. Baranova S.V., Zhdanova P.V., Zakabkuk G.A., Chernonosov A.A., Koval V.V. Biophysical Reviews. 2023. V. 15. P. 1442-1443. DOI: 10.1007/s12551-023-01150-w тезисы конференции
30. Structure of an ice-binding protein from the fish longhorn sculpin Myoxocephalus octodecemspinosus based on circular dichroism spectra. Zakabkuk G.A., Baranova S.V., Zhdanova P.V., Chernonosov A.A., Koval V.V. Biophysical Reviews. 2023. V. 15. P. 1477. DOI: 10.1007/s12551-023-01150-w тезисы конференции
31. Fixation and Visualization of Full Protein Corona on Lipid Surface of Composite Nanoconstruction. Epanchintseva A.V., Poletaeva Y., Bakhno I.A., Белов V.V., Grigoryeva A.E., Baranova S.V., Ryabchikova E.I., Dovydenko I.S. Nanomaterials. 2023. V. 13. P. 3094. DOI: 10.3390/nano13243094
32. DNA damage processing by human 8-oxoguanine-DNA glycosylase mutants with substituted Ser-326. Lukina M.V., Zharkov D.O., Koval V.V. Febs Open Bio. 2023. V. 13. S. 2. P. 180. 10.1002/2211-5463.13646 тезисы конференции
33. Biostimulant Based on Silicon Chelates Enhances Growth and Modulates Physiological Responses of In Vitro-Derived Strawberry Plants to In Vivo Conditions. Ambros E., Kotsupiy O., Karpova E., Panova U., Chernonosov A.A., Trofimova E., Goldenberg B. Plants (Basel). 2023. V. 12. N 24. P. 4193. DOI: 10.3390/plants12244193
34. Structure of an Ice-Binding Protein from Myoxocephalus octodecemspinosus Determined by Molecular Dynamics and Based on Circular Dichroism Spectra. Zakabkuk G.A., Zhdanova P.V., Koval V.V., Chernonosov A.A., Baranova S.V. Биофизика. 2023. V. 68. P. 513–518. DOI: 10.1134/s0006350923040152 перевод
35. A New Human Uveal Melanoma Cell Line: Melanin Production andMolecular Markers for Targeted Therapy. Zhilnikova M., Novak D.D., Troitskaya O.S., Nushtaeva A.A., Biryukov M.M., Zvereva S., Varlamov M., Koval V.V., Stanishevskaya O.M., Chernykh D.V., Kononova N.V., Atamanov V.V., Koval O.A. Biochemistry (Moscow). 2023. V. 17. N 4. P. 165–171. DOI: 10.1134/S1990750823600607 перевод

• СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОНЦЕНТРАЦИИ ВАРФАРИНОВОГО СПИРТА В ПЛАЗМЕ КРОВИ. Черноносов А.А., Коваль В.В., Федорова О.С. 2013 г. № 2486521
• СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ АПУРИН/АПИРИМИДИН-ЭНДОНУКЛЕАЗЫ ЧЕЛОВЕКА. Кузнецов Н.А., Коваль В.В., Федорова О.С. 2010 г. № 2389026
• СРЕДСТВО ДЛЯ ИНГИБИРОВАНИЯ ФЕРМЕНТА 8-ОКСОГУАНИН-ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗЫ ЧЕЛОВЕКА. Кузнецов Н.А., Коваль В.В., Воробьев Ю.Н., Жарков Д.О., Сильников В.Н., Федорова О.С. 2010 г. № 2380417
• СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ 8-ОКСОГУАНИН-ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗЫ ЧЕЛОВЕКА. Федорова О.С., Коваль В.В., Кузнецов Н.А. 2008 г. № 2321637

• масс-спектрометры MALDI-TOF Autoflex Speed (Bruker Daltonics, Германия) и ESI LC/MS/MSD XCT (Agilent Technologies, США);
  
• аппарат для капиллярного электрофореза (Agilent Technologies, США);
  
• хроматографические системы (Series 1200) как для разделения и анализа пептидов, так и для препаративного разделения белковых молекул (Agilent Technologies, США).