Лаборатория структурной биологии

Ломзов Александр Анатольевич
к.ф.-м.н.

телефон: (383) 363-51-35
Email

• Разработка и синтез новых производных нуклеиновых кислот.
• Исследования структуры и динамики комплексов нуклеиновых кислот, их производных и аналогов.
• Термодинамический анализ формирования комплексов нуклеиновых кислот и их производных и аналогов.
• ДНК-наноархитектоника – исследование самоорганизующихся супрамолекулярных ансамблей на основе нуклеиновых кислот и их применение в биомедицине.
• Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными, структура и динамика таких комплексов.
• Изучение структуры и динамика белков, белково-нуклеиновых комплексов и комплексов белков с низкомолекулярными соединениями.

• Разработаны принципы рационального конструирования олигонуклеотидов, их производных и аналогов – необходимого инструментария для молекулярной диагностики, молекулярной биологии, биофизики, а также НК-направленных агентов как перспективных терапевтических препаратов
• Разработаны и впервые синтезированы новые производных нуклеиновых кислот, модифицированных по фосфатному остатку – фосфорамидные бензоальзоные олигонуклеотиды. Показана перспективность использования модифицированных по фосфатному остатку олигонуклеотидов для решения сложных задач в системах ПЦР диагностики.
• Изучены физико-химические особенности образования тандемных комплексов олигонуклеотидных с ДНК, конкатамерных и самоограниченных комплексов. Разработаны подходы к направленному изменению пространственной организации супрамолекулярных конкатамерных и самоограничченных ДНК/ДНК, ДНК/РНК и РНК/РНК комплексов.
• Исследованы физико-химические свойства комплексов олигонуклеотидов, несущих разнообразные модификации рибозофосфатного остов. Разработаны подходы позволяющие создавать олигонуклеотидные зонды с направленно измененной гибридизационной способностью и производить расчет стабильности их комплексов в различных буферных условиях.
• С использованием методов молекулярного моделирования разработаны подходы к прогностическому расчету структуры, динамики и термодинамической стабильности ДНК/ДНК, ДНК/РНК и РНК/РНК комплексов.
• Разработан подход для определения реалистичных конформационных ансамблей конформационно-подвижных белков. С его использованием определена структура комплекса сериновой протеазы NS2b/NS3pro вируса Денге.

Базовые проекты
Программа фундаментальных научных исследований государственных академий наук

• № 123021600208-7 Определение структуры биологических мишеней для решения задач биофармацевтики

Гранты Российского научного фонда

• № 24-24-20105 «Создание стимул-чувствительных систем доставки нуклеиновых кислот на основе нанокомпозитов карбоната кальция» (2024-2025 гг.)
• № 23-14-00358 «Синтез, физико-химические и молекулярно-биологические свойства олигодезоксирибонуклеотидов, несущих замещенные азольные фосфорамидные группы» (2023-2025 гг.)
• № 23-74-01116 «Фосфорамидные азольные олигонуклеотиды в составе несовершенных комплексов с ДНК: гибридизационные свойства и эффективность удлинения в ходе ПЦР» (2023-2025 гг.)

1. Thermodynamic parameters obtained for the formation of the Cas12a-RNA/DNA complex. Baranova S.V., Zhdanova P.V., Golyshev V.M., Lomzov A.A., Pestryakov P.E., Chernonosov A.A., Koval V.V. Biochem. and Biophys.Res. Com. 2025. V. 743. DOI: P. 151176. 10.1016/j.bbrc.2024.151176
2. Position-dependent effect of AP sites within an hTERT promoter G-quadruplex scaffold on quadruplex stability and repair activity of the APE1 enzyme. Savitskaya V.Y., Novoselov K.A., Dolinnaya N.G., Monakhova M.V., Snyga V.G., Diatlova E., Peskovatskova E.S., Golyshev V.M., Kitaeva M.I., Eroshenko D.A., Zvereva M.I., Zharkov D.O., Kubareva E.A. Int. J. Mol. Sci. 2025. V. 26. N 1. P. 337. DOI: 10.3390/ijms26010337
3. Cold Atmospheric Plasma Jet and Conjugates of Gold Nanoparticles with Tyrp1 Antibodies Efficiently Suppress Growth of B16 Tumor. Biryukov M.M., Schweigert I., Polyakova A.A., Kryackova N.V., Varlamov M., Gorbunova E.A., Epanchintseva A.V., Pyshnaya I.A., Zakrevsky D., Milakhina E., Wang R., Koval O.A. Plasma Medicine. 2025. V. 15. N 1. P. 1-16. DOI: 10.1615/PlasmaMed.2025057895
4. first_pagesettingsOrder Article Reprints Open AccessArticle Synthesis of Magnetic Nanoparticles Coated with Human Serum Albumin and Loaded by Doxorubicin. Petrov K.D., Ryabova E.S., Dmitrienko E.V., Chubarov A.S. Magnetochemistry. 2025. V. 11. N 2. P. 13. DOI: 10.3390/magnetochemistry11020013
5. Synthesis and Physicochemical Properties of New Phosphoramide Oligodeoxyribonucleotides. I. N-Caffeine Derivatives. Novgorodceva A.I., Vorob’ev, A.Y., Lomzov A.A., Vasilyeva S.V. Bioorg. Chem. 2025. V. 157. P. 108313. DOI: 10.1016/j.bioorg.2025.108313
6. Pulsed voltage cold atmospheric plasma jet and gold nanoparticles enhance cytotoxic anticancer effects. Schweigert I.V., Biryukov M.M., Polyakova A.A., Gorbunova E.A., Epanchintseva A.V., Pyshnaya I.A., Zakrevsky D., Milakhina E., Koval O.A. J. Phys. D: Appl. Phys. 2024. V. 57. N. 25. P. 255205. DOI: 10.1088/1361-6463/ad34df
7. Diversity of self-assembled RNA complexes: from nanoarchitecture to nanomachines. Kanarskaya M.A., Pyshnyi D.V., Lomzov A.A. Molecules. 2024. V. 29. N 1. P. 10. DOI: 10.3390/molecules29010010
8. Properties of phosphoramide benzoazole oligonucleotides (PABAOs). I. Structure and hybridization efficiency of N-benzimidazole derivatives. Golyshev V.M., Yushin I.I., Gulyaeva O.A., Baranovskaya E.E., Lomzov A.A. Biochem. and Biophys.Res. Com. 2024. V. 693. P. 149390. DOI: 10.1016/j.bbrc.2023.149390
9. Phosphoramidate Azole Oligonucleotides for Single Nucleotide Polymorphism Detection by PCR. Chubarov A.S., Baranovskaya E.E., Oscorbin I.P., Yushin I.I., Filipenko M.L., Pyshnyi D.V., Vasilyeva S.V., Lomzov A.A. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N 1. P. 617. DOI: 10.3390/ijms25010617
10. The Role of Key Amino Acids of the Human Fe(II)/2OG-Dependent Dioxygenase ALKBH3 in Structural Dynamics and Repair Activity toward Methylated DNA. Kanazhevskaya L.Y., Gorbunov A.A., Lukina M.V., Smyshliaev D.A., Zhdanova P.V., Lomzov A.A., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. P. 1145. DOI: 10.3390/ ijms25021145
11. Characterizing Aptamer Interaction with the Oncolytic Virus VV-GMCSF-Lact. Dymova M.A., Malysheva D.O., Popova V.K., Dmitrienko E.V., Endutkin A.V., Drokov D.V., Mukhanov V.S., Byvakina A.A., Kochneva G.V., Artyushenko P.V., Shchugoreva I.A., Rogova A.V., Tomilin F.N., Kichkailo A.S., Richter V.A., Kuligina E.V. Molecules. 2024. V. 29. P. 848. DOI: 10.3390/molecules29040848
12. Contrast Agents Based on Human Serum Albumin and Nitroxides for 1H-MRI and Overhauser-enhanced MRI. Mitin D.E., Bullinger F., Dobrynin S., Engelmann J., Scheffler K., Kolokolov M., Krumkacheva O., Buckenmaier L., Kirilyuk I., Chubarov A.S. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N 7. P. 4041. DOI: 10.3390/ijms25074041
13. Pulsed Dipolar EPR for Self-Limited Complexes of Oligonucleotides Studies. Chubarov A.S., Endeward B., Kanarskaya M.A., Polienko Y.F., Prisner T., Lomzov A.A. Biomolecules. 2024. V. 14. N 8. P. 887. DOI: 10.3390/biom14080887
14. Аберрантная репарация 8-оксогуанина в коротких выпетливаниях ДНК. Ерошенко Д.А., Дятлова Е.А., Голышев В.М., Ендуткин А.В., Жарков Д.О. Доклады Академии Наук (науки о жизни). 2024. т. 515. № 2. С. 14–18. DOI: 10.31857/S2686738924020031
15. Aberrant repair of 8-oxoguanine in short DNA bulges. Eroshenko D.A., Diatlova E., Golyshev V.M., Endutkin A.V., Zharkov D.O. Доклады Академии Наук (науки о жизни). 2024. V. 513. Suppl. 1. P. S82–S86. DOI: 10.1134/S1607672923600355 перевод
16. Synthesis and Properties of α-Phosphate-Modified Nucleoside Triphosphates. Novgorodceva A.I., Lomzov A.A., Vasilyeva S.V. Molecules. 2024. V. 29. N 17. P. 4121. DOI: 10.3390/molecules29174121
17. Error-Prone DNA Synthesis on Click-Ligated Templates. Endutkin A.V., Yakovlev A.V., Zharkov T.D., Golyshev V.M., Yudkina A.V., Zharkov D.O. Doklady Biochemistry and Biophysics. 2024. P. 1-6. DOI: 10.1134/s1607672924600416 перевод
18. Синтетические повреждения с флуоресцеинкарбамоильной группировкой как аналоги объемных повреждений, удаляемых системой эксцизионной репарации нуклеотидов. Сравнительное исследование свойств. Попов А.А., Голышев В.М., Королева Л.С., Назаров К.Д., Анарбаев Р.О., Петрусева И.О. Acta Naturae. 2024. Т. 16. № 3(62). С. 74-82. DOI: 10.32607/actanaturae.27419
19. Synthetic Lesions with a Fluorescein Carbamoyl Group As Analogs of Bulky Lesions Removable by Nucleotide Excision Repair: A Comparative Stady on Properties. Popov A.A., Golyshev V.M., Koroleva L.S., Nazarov K.D., Anarbayev R.O., Petruseva I.O. Acta Naturae. 2024. V.16. N3 (62). P. 74-82. DOI: 10.32607/actanaturae.27419 перевод
20. Высокоошибочный синтез ДНК на клик-лигированных матрицах. Ендуткин А.В., Яковлев А.О., Жарков Т.Д., Голышев В.М., Юдкина А.В., Жарков Д.О. Доклады Академии Наук (науки о жизни). 2024. Т. 518. № 5. С. 101–107. DOI: 10.31857/S2686738924050186
21. An Approach to Identifying Single-Nucleotide Mutations Using Noncovalent Associates of Gold Nanoparticles with Fluorescently Labeled Oligonucleotides. Epanchintseva A.V., Gorbunova E.A., Nekrasov M.D., Poletaeva Y., Pyshnaya I.A. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. P. 13230. DOI: 10.3390/ijms252413230
22. Адаптация протокола автоматического твердофазного фосфитамидного синтеза олигодезоксирибонуклеотидов для получения их N-незамещенных амидофосфатных аналогов (P-NH2). Малова Е.А., Пышная И.А., Мещанинова М.И., Пышный Д.В. Биоорганическая химия. 2024. № 6. С. 788-804. DOI: 10.31857/S0132342324060065
23. Hybrid RNA/DNA Concatemers and Self-Limited Complexes: Structure and Prospects for Therapeutic Applications. Kanarskaya M.A., Novikova S.V., Lomzov A.A. Molecules. 2024. V. 29. N 24. P. 5896. DOI: 10.3390/molecules29245896
24. The Role of Key Amino Acids of the Human Fe(II)/2OG-Dependent Dioxygenase ALKBH3 in Structural Dynamics and Repair Activity toward Methylated DNA. Kanazhevskaya L.Y., Gorbunov A.A., Lukina M.V., Smyshliaev D.A., Zhdanova P.V., Lomzov A.A., Koval V.V. Int. J. Mol. Sci. 2024. V. 25. N 2. P. 1145. DOI: 10.3390/ijms25021145
25. Optimization of Automatic Synthesis of Benzoxazole Phosphoramidate Oligonucleotides. Baranovskaya E.E., Poddubnyakova S.A., Lomzov A.A., Vasilyeva S.V. Journal of Siberian Federal University. Mathematics & Physics. 2024. V. 17. N 6. P. 776–782.
26. Adaptation of the Protocol of the Automated Solid-Phase Phosphoramidite Synthesis of Oligodeoxyribonucleotides for Preparing Their N-Unsubstituted Phosphoramidate Analogs (P–NH2). Malova E.A., Pyshnaya I.A., Meschaninova M.I., Pyshnyi D.V. Russ. J. Bioorganic Chem. 2024. V. 50. P. 2455–2472. DOI: 10.1134/S106816202406027X перевод
27. Enhancement of the Anticancer Effect during the Simultaneous Treatment of Cells by a Cold Atmospheric Plasma Jet and Gold Nanoparticles. Schweigert I.V., Zakrevsky D., Milakhina E., Gugin P., Biryukov M.M., Polyakova A.A., Kryachkova N., Gorbunova E.A., Epanchintseva A.V., Pyshnaya I.A., Koval O.A. Физика плазмы. 2024. V. 50. N 11. P. 1375–1387. DOI: 10.1134/S1063780X24601597 перевод
28. Properties of phosphoramide benzoazole oligonucleotides (PABAOs). II. Structure and hybridization efficiency of N-benzoxazole derivatives. Yushin I.I., Golyshev V.M., Novgorodceva A.I., Lomzov A.A. Biochem. and Biophys.Res. Com. 2024. V. 740. P. 150997. DOI: 10.1016/j.bbrc.2024.150997
29. All Domains of SARS-CoV-2 nsp1 Determine Translational Shutoff and Cytotoxicity of the Protein. Frolov I., Agback T., Palchevska O., Dominguez F., Lomzov A.A., Agback P., Frolova E.I. Journal of Virology. 2023. e0186522. DOI: 10.1128/jvi.01865-22
30. Allele-Specific PCR for PIK3CA Mutation Detection Using Phosphoryl Guanidine Modified Primers. Chubarov A.S., Oskorbin I.P., Novikova L.M., Filipenko M.L., Lomzov A.A., Pyshnyi D.V. Diagnostics. 2023. V. 13. N 2. P. 250. DOI: 10.3390/diagnostics13020250
31. Magnetic Nanocomposites and Imprinted Polymers for Biomedical Applications of Nucleic Acids. Popova V.K., Dmitrienko E.V., Chubarov A.S. Magnetochemistry. 2023. V. 9. N 1. P. 12. DOI: 10.3390/magnetochemistry9010012
32. Высокоёмкие частицы карбоната кальция как основа для рН-чувствительных контейнеров для доксорубицина. Паллаева Т.Н., Михеев А.В., ХмелениН Д.Н., Еуров Д.А., Курдюков Д.А., Попова В.К., Дмитриенко Е.В., Трушина Д.Б. Кристаллография. 2023. Т. 68. № 2. С. 298-305. DOI: 10.31857/S0023476123020121
33. Synthesis of Oligonucleotides Carrying Inter-nucleotide N‑(Benzoazole)-phosphoramide Moieties. Vasilyeva S.V., Baranovskaya E.E., Dyudeeva E., Lomzov A.A., Pyshnyi D.V. ACS Omega. 2023. V. 8. N 1. P. 1556−1566. DOI: 10.1021/acsomega.2c07083
34. Effect of Sterilization Methods on Electrospun Scaffolds Produced from Blend of Polyurethane with Gelatin. Chernonosova V.S., Kuzmin I.E., Shundrina I.K., Korobeynikov M.V., Golyshev V.M., Chelobanov B.P., Laktionov P.P. Journal of Functional Biomaterials. 2023. V. 14. N 2. P. 70. DOI: 10.3390/jfb14020070
35. Solution pH Effect on Drain-Gate Characteristics of SOI FET Biosensor. Bulgakova A.E., Berdyugin A.A., Naumova O., Fomin B., Pyshnyi D.V., Chubarov A.S., Dmitrienko E.V., Lomzov A.A. Electronics. 2023. V. 12. N 3. P. 777. DOI: 10.3390/electronics12030777
36. Doxorubicin-Loaded Silica Nanocomposites for Cancer Treatment. Popova V.K., Poletaeva Y., Chubarov A.S., Pyshnyi D.V., Dmitrienko E.V. Coatings. 2023. V. 13. N 2. C. 324. DOI: 10.3390/coatings13020324
37. Fluorinated Human Serum Albumin as Potential 19F Magnetic Resonance Imaging Probe. Mitin D.E., Chubarov A.S. Molecules. 2023. V. 28. N 4. P. 1695. DOI: 10.3390/molecules28041695
38. pH-Responsible Doxorubicin-Loaded Fe3O4@CaCO3 Nanocomposites for Cancer Treatment. Popova V.K., Poletaeva Y., Chubarov A.S., Dmitrienko E.V. Pharmaceutics. 2023. V. 15. N 3. P. 771. DOI: 10.3390/pharmaceutics15030771
39. Nylon-6-Coated Doxorubicin-Loaded Magnetic Nanoparticles and Nanocapsules for Cancer Treatment. Bobrikova E.N., Poletaeva Y., Zheng Y, Chubarov A.S., Dmitrienko E.V. Magnetochemistry. 2023. V. 9. N 4. P. 106. DOI: 10.3390/magnetochemistry9040106
40. Long non-coding RNA DINO promotes cisplatin sensitivity in lung adenocarcinoma via the p53-Bax axis. Liu Z., Wang O., Chubarov A.S., Li Y., Yang X., Dmitrienko E.V., Zheng Y. J Thorac Dis. 2023. V. 15. N 4. P. 2198-2212. DOI: 10.21037/jtd-23-465
41. Novel TDP1 Inhibitors: Disubstituted Thiazolidine-2,4-Diones Containing Monoterpene Moieties. Ivankin D.I., Kornienko T.E., Mikhailova M.A., Dyrkheeva N.S., Zakharenko A.L., Achara C., Reynisson J., Golyshev V.M., Luzina O.A., Volcho К.P., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 4. P. 3834. DOI: 10.3390/ijms24043834
42. Комплексы и высокомолекулярные ассоциаты додецил-содержащих олигонуклеотидов с сывороточным альбумином. Павлова А.С., Илющенко В.В., Купрюшкин М.С., Жарков Т.Д., Дюдеева Е.С., Бауэр И.А., Чубаров А.С., Пышный Д.В., Пышная И.А. Биохимия. 2023. V. 88. N 8. С. 1423 – 1440. DOI: 10.31857/S0320972523080109
43. Revealing Light-Induced Structural Shifts in G-QuadruplexPorphyrin Complexes: A Pulsed Dipolar EPR Study. Sannikova N., Kolokolov M.I., Khlynova T.A., Chubarov A.S., Polienko Y., Fedin M., Krumkacheva O. Phys. Chem. Chem. Phys. 2023. V. 25. N 33. P. 22455-22466. DOI: 10.1039/d3cp01775c
44. Noncovalent Adsorption of Single-Stranded and Double-Stranded DNA on the Surface of Gold Nanoparticles. Gorbunova E.A., Epanchintseva A.V., Pyshnyi D.V., Pyshnaya I.A. Applied Sciences (Basel). 2023. V. 13. P. 7324. DOI: 10.3390/app13127324
45. PARP3 Affects Nucleosome Compaction Regulation. Ukraintsev A.A., Kutuzov M.M., Belousova E.A., Joyeau M., Golyshev V.M., Lomzov A.A., Lavrik O.I. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. N 10. P. 9042. DOI: 10.3390/ijms24109042
46. Effects of Bis(imino)acenaphthene (Bian)-Derived Ligands on the Cytotoxicity, DNA Interactions, and Redox Activity of Palladium(II) Bipyridine Complexes. Komlyagina V.I., Romashev N.F., Besprozvannykh V.K., Arakelyan J., Wu C., Chubarov A.S., Bakaev I.V., Soh Y.K., Abramov P.A., Cheung K.L., Kompankov N.B., Ryadun A., Babak M.V., Gushchin A.L. Inorganic Chemistry. 2023. V. 62. P. 11541−11553. DOI: 10.1021/acs.inorgchem.3c01172
47. Preparation of Magnetic Molecularly Imprinted Polymer for Methylene Blue Capture. Sedelnikova A.Y., Poletaeva Y., Golyshev V.M., Chubarov A.S., Dmitrienko E.V. Magnetochemistry. 2023. V. 9. P. 196. DOI: 10.3390/magnetochemistry9080196
48. 19F electron nuclear double resonance (ENDOR) spectroscopy for distance measurements using trityl spin labels in DNA duplexes. Asanbaeva N.B., Novopashina D.S., Rogozhnikova O.Yu., Tormyshev V.M., Kehl A., Sukhanov A., Shernyukov A.V., Genaev A., Lomzov A.A., Bennati M., Meyerde A., Bagryanskaya E.G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2023. V. 25. P. 23454–23466. DOI: 10.1039/d3cp02969g
49. Complexes and Supramolecular Associates of Dodecyl-Containing Oligonucleotides with Serum Albumin. Pavlova A.S., Iliusenko V.V., Kupryushkin M.S., Zharkov T.D., Dyudeeva E., Bauer I.A., Chubarov A.S., Pyshnyi D.V., Pyshnaya I.A. Biochemistry (Moscow). 2023. V. 88. P. 1165-1180. DOI: 10.1134/S0006297923080102
50. Combined NMR and molecular dynamics conformational filter identifies unambiguously dynamic ensembles of Dengue protease NS2B/NS3pro. Agback T., Lesovoy D., Han X., Lomzov A.A., Sun R., Sandalova T., Orekhov V.Yu., Achour A., Agback P. Commun Biol. 2023. V. 6. N 1. P. 1193. DOI: 10.1038/s42003-023-05584-6
51. Высокочувствительный биосенсор для безметочной детекции биомаркеров. Булгакова А.Е., Ломзов А.А., Дмитриенко Е.В., Пышный Д.В. Наука и технологии Сибири. 2023. № 8. С. 118-121.
52. Application of the weighted histogram method for calculating the thermodynamic parameters of the formation of oligodeoxyribonucleotide duplexes. Yushin I.I., Golyshev V.M., Pyshnyi D.V., Lomzov A.A. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023. V. 27. N 7. P. 807-814. 10.18699/VJGB-23-93. перевод
53. Self-Penetrating Oligonucleotide Derivatives: Features of Self-Assembly and Interactions with Serum and Intracellular Proteins. Bauer I.A., Ilina E.S., Zharkov T.D., Grigoryeva E.V., Chinak O.A., Kupryushkin M.S., Golyshev V.M., Mitin D.E., Chubarov A.S., Khodyreva S.N., Dmitrienko E.V. Pharmaceutics. 2023. V. 15. N 12. P. 2779. DOI: 10.3390/pharmaceutics15122779
54. High-Capacity Calcium Carbonate Particles As pH-Sensitive Containers for Doxorubicin. Bоrodina T.N., Mikheev A., Khmelenin A., Eurov D.A., Kurdyukov D.A., Popova V.K., Dmitrienko E.V., Trushina D.B. Кристаллография. 2023. V. 68. N 2. P. 309–315. DOI: 10.1134/s1063774523020128 перевод
55. Применение метода взвешенных гистограмм для расчета термодинамических параметров формирования комплексов олигодезоксирибонуклеотидов. Юшин И.И., Голышев В.М., Пышный Д.В., Ломзов А.А. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023. Т. 27. № 7. С. 807-814. DOI: 10.18699/VJGB-23-93

1. Васильева С.В., Барановская Е.Е., Чубаров А.С., Ломзов А.А., Пышный Д.В. Фосфорамидные азольные олигонуклеотиды, способ синтеза фосфорамидных азольных олигонуклеотидов и способ матричного ферментативного синтеза ДНК с их использованием 2823099 (18.07.2024)
2. Дмитриенко Е.В., Порываева А.В., Смолина Е.В., Рубан А.А., Пышный Д.В., Ломзов А.А. Способ автоматизации параллельной безметочной детекции биологического маркера и устройство для его реализации 2762360 (20.12.2021)
3. Пышный Д.В., Пышная И.А., Ломзов А.А., Дмитриенко Е.В. «Ноу-хау». Устройство для параллельного автоматического измерения КНИ-сенсоров

• ДНК-синтезатор ASM-800 (БИОССЕТ, Россия).
• Высокоэффективный жидкостный хроматограф Shimadzu (Shimadzu, Япония).
• Спектрофотометр Cary 300 Biomelt (Varian, Австралия), оснащенный терморегулируемой 6-ти кюветной приставкой.
• Спектрофотометр Cary 3500 Biomelt (Agilent, США), оснащенный терморегулируемой 8-ми кюветной приставкой.
• Спектрополяриметр J-600 (Jasco, Япония).
• Изотермический титрационный калориметр Nano ITC (TA Instruments, США).
• ЯМР спектрометр Spinsolve 60 (Magritek GmbH, Германия).
• БИК-Фурье спектрометр MPA (Bruker Optics, Германия).
• Aтомно-силовой микроскоп Multimode 8 (Bruker, Германия).
• Оборудование для тонкого химического синтеза.
• Высокопроизводительный вычислительный комплекс с видеокартами Nvidia.

Синтез производных олигодезксирибонуклеотидов

Физико-химические исследования:
Оптическая спектроскопия
Оборудование: Shimadzu UV-2100, Cary 300 Bio (Varian, Австралия), Cary3500 (Agilent, США)
Спектры поглощения и пропускания в диапазоне 180-1100 нм

Флуоресцентная спектроскопия
ClarioStar (BMG, Германия)
Спектры оптического поглощения в диапазоне 320-800 нм, спектры флуоресценции в диапазоне 320-800 нм

ИК-Фурье спектроскопия
БИК-Фурье спектрометр MPA (Bruker Optics, Германия)

Спектроскопия кругового дихроизма (исследование вторичной структуры нуклеиновых кислот, белков, их комплексов и взаимодействий)
Jasco J-600 (Jasco, Япония)

Атомно-силовая микроскопия
Атомно-силовая спектроскопия
Aтомно-силовой микроскоп Multimode 8 (Bruker, Германия).

ЯМР-спектроскопия
ЯМР спектрометр Spinsolve 60 (Magritek GmbH, Германия)

Исследование термической стабильности биополимеров методами оптической спектроскпии и спектрополяриметрии
Спектрофотометры с терморегулируемыми ячейками Cary 300 Bio (Varian, Австралия), Cary3500 (Agilent, США)
Спектрополяример Jasco J-600 (Jasco, Япония)

Изотермическая калориметрия смешения
Изотермический титрационный калориметр Nano ITC (TA Instruments, США).

Исследования биополимеров методами молекулярного моделирования и анализа
Высокопроизводительный вычислительный комплекс с видеокартами Nvidia