Публикации ЦКП [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
» ЦКП "Геномика" СО РАН » Научные публикации » Публикации ЦКП
Публикации ЦКП

Публикации ЦКП



2005-2011

2012-2013

2014

2015

2016

2017

2018

2019

Метагеномика

  • Kozhieva M., Naumova N.B., Alikina T.Y., Boyko A.N., Vlassov V.V., Kabilov M.R. Primary progressive multiple sclerosis in a Russian cohort: relationship with gut bacterial diversity. BMC Microbiol. 2019. V. 19. N 1. P. 309
  • Polenogova O.V., Kabilov M.R., Tyurin M.V., Rotskaya U.N., Krivopalov A.V., Morozova V.V., Mozhaitseva K., Kryukova N.A., Alikina T.Y., Kryukov V.Yu., Glupov V.V. Parasitoid envenomation alters the Galleria mellonella midgut microbiota and immunity, thereby promoting fungal infection. Scientific Reports. 2019. V. 9. № 1. P. 4012
  • Kryukov Y., Kabilov M.R., Smirnova N., Tomilova O.G., Tyurin M.V., Akhanaev Y.B., Polenogova O.V., Danilov V.P., Zhangissina S.K., Alikina T.Y., Yaroslavtseva O.N., Glupov V.V. Bacterial decomposition of insects post-Metarhizium infection: Possible influence on plant growth. Fungal biology. 2019. V. 123. P. 927-935
  • Naumova N.B., Savenkov O.A., Alikina T.Y., Kabilov M.R. Rhizosphere Bacteriobiome of the Husk Tomato Grown in the Open Field in West Siberia. Agriculture. 2019. V. 65. N 4. С. 12-16
  • Potapov S.A., Tikhonova I.V., Krasnopeev A.Yu., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Chebunina N.S., Zhuchenko N.A., Belykh O.I. Metagenomic Analysis of Virioplankton from the Pelagic Zone of Lake Baikal. Viruses. 2019. V. 11. P. 991
  • Butina T.V., Bukin Y.S., Krasnopeev A.S., Belykh O.I., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Sakirko M.V., Belikov S.I. Estimate of the diversity of viral and bacterial assemblage in the coastal water of Lake Baikal. FEMS Microbiol. Lett. 2019. V. 366. N 9. pii: fnz094
  • Butina T.V., Bukin Y.S., Khanaev I.V., Kravtsova L.S., Maikova O.O., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Belikov S.I. Metagenomic analysis of viral communities in diseased Baikal sponge Lubomirskia baikalensis. Limnology and Freshwater Biology. 2019. N 1. P. 155-162
  • Mincheva E.V., Peretolchina T.E., Kravtsova L.S., Tupikin A.E., Pudovkina T.A., Ananyeva I.A., Triboy T.I., Voylo M.A., Bukin Yu.S. Hidden diversity of micro-eukaryotes in Lake Baikal: a metagenomic approach150. Limnology and Freshwater Biology. 2019. N 1. P. 150–154
  • Zakharenko А.S., Galachyants Y.P., Morozov I.V., Ivanov V.G., Pimenov N.V., Krasnopeev A.Y., Zemskaya T.I. Bacterial Communities in Areas of Oil and Methane Seeps in Pelagic of Lake Baikal. Microbial Ecology. 2019. V. 78. N 21. P. 269-285
  • Bukin Y.S., Galachyants Y.P., Morozov I.V., Bukin S.V., Захаренко А.S., Zemskaya T.I. The effect of 16S rRNA region choice on bacterial community metabarcoding results. Sci Data. 2019. V. 6. P. 190007
  • Lavrentyeva E.V., Banzaraktsaeva T.G., Radnagurueva A.A., Buryukhaev S.P., Dambaev V.B., Baturina O.A., Kozyreva L.P., Barkhutova D.D. Microbial Community of Umkhei Thermal Lake (Baikal Rift Zone) in the Groundwater Discharge Zone. Contemp Probl Ecol. 2019. V. 12. N 6. P. 584-593
  • Лаврентьева Е.В., Банзаракцаева Т.Г., Раднагуруева А.А., Бурюхаев С.П., Дамбаев В.Б., Батурина О.А., Козырева Л.П., Бархутова Д.Д. Микробное сообщество термального озера умхей (Байкальская рифтовая зона) в зоне разгрузки подземных вод. Сибирский экологический журнал. 2019. Т. 26. № 6. С. 715-726
  • Дрюккер В.В., Белых О.И., Горшкова А.С., Бондарь А.А., Сыкилинда Н.Н. Автохтонные бактериофаги в структуре «микробной петли» различных биотопов озера Байкал. Сибирский экологический журнал. 2019. Т. 26. № 2. C. 177–191


Геномика бактерий и вирусов

  • Morozova V.V., Bokovaya O.V., Kozlova Y.N., Kurilschikov A.M., Babkin I.V., Tupikin A.E., Bondar A.A., Ryabchikova E.I., Brayanskaya A., Peltek S.E., Tikunova N.V. A novel thermophilic Aeribacillus bacteriophage AP45 isolated from the Valley of Geysers, Kamchatka, Russia. Extremophiles. 2019. P. 1-14
  • Chirak E.R., Kimeklis A.K., Karasev E.S., Kopat V.V., Safronova V.I., Belimov A.A., Aksenova T.S., Kabilov M.R., Provorov N.A., Andronov E.E. Search for Ancestral Features in Genomes of Rhizobium leguminosarum bv. viciae Strains Isolated from the Relict Legume Vavilovia formosa. Genes. 2019. V. 10. P. 990
  • Sharshov K., Kurskaya O., Sobolev I., Leonov S., Kabilov M.R., Alikina T.Y., Alekseev A., Derko A., Yushkov Y., Saito T., Uchida Y., Mine J., Irza V., Shestopalov A. First detection of a G1-like H9N2 virus in Russia, 2018. Korean Journal of Veterinary Research. 2019. V. 59. N 1. P. 37-42
  • Glushchenko A.V., Alikina T.Y., Yurchenko K.S., Shekunov E.V., Gulyaeva M.A., Matsuno K., Okamatsu M., Kabilov M.R., Shestopalov A.M. Nearly Complete Genome Sequence of a Newcastle Disease Virus Strain Isolated from a Wild Garganey (Spatula querquedula) in Russia. Microbiol. Resour. Ann. 2019. V. 8. N 50. e01072-19
  • Sharshov K., Mine J., Sobolev I., Kurskaya O., Dubovitskiy N., Kabilov M.R., Alikina T.Y., Nakayama M., Tsunekuni R., Derko A., Prokopyeva E., Alekseev A., Shchelkanov M., Druzyaka A., Gadzhiev A., Uchida Y., Shestopalov A., Saito T. Characterization and Phylodynamics of Reassortant H12Nx Viruses in Northern Eurasia. Microorganisms. 2019. V. 7. P. 643
  • Muntyan V.S., Baturina O.A., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Laktionov Yu.V., Saksaganskaya A.S., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti AK555. Microbiol. Resour. Ann. 2019. V. 8. N 2. e01567-18
  • Baturina O.A., Muntyan V.S., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Simarov B.V., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti Strain CXM1-105. Microbiol. Resour. Ann. 2019. V. 8. N 2. e01621-18
  • Карасев Е.С., Андронов Е.Е., Аксенова Т.С., Чижевская Е.П., Тупикин А.Е., Проворов Н.А. Эволюции ризобий козлятника (Neorhizobium galegae): анализ полиморфизма генов фиксации азота и развития клубеньков. Генетика. 2019. Т. 55. № 2. C. 234–238


Молекулярная биология и биотехнология

  • Vorobyev P.E., Epanchintseva A.V., Lomzov A.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Pyshnaya I.A., Pyshnyi D.V. DNA Binding to Gold Nanoparticles through the Prism of Molecular Selection: Sequence – Affinity Relation. Langmuir. 2019. V. 35. N 24. P. 7916-7928
  • Ochkasova A., Kabilov M.R., Karpova G.G., Graifer D.M. Exploring the Interaction of Human Ribosomal Protein uS3 with Single-Stranded DNAs Having Different Sequences. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 6. P. 619–624
  • Krasitskaya V.V., Timoshenko V.V., Abroskina M.V., Vorobjeva M.A., Ilminskaya A.A., Kabilov M.R., Prokopenko S.V., Nevinsky G.A., Venyaminova A.G., Frank L.A. Bioluminescent aptamer-based sandwich-type assay of anti-myelin basic protein autoantibodies associated with multiple sclerosis. Anal Chim Acta. 2019. V. 1064. P. 112-118
  • Davydova A.S., Vorobjeva M.A., Bashmakova E.E., Vorobyev P.E., Krasheninina O.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Krasitskaya V.V., Frank LA, Venyaminova A.G. Development and characterization of novel 2′-F-RNA aptamers specific to human total and glycated hemoglobins. Anal Biochem. 2019. V. 570. P. 43–50
  • Очкасова А.С., Кабилов М.Р., Карпова Г.Г., Грайфер Д.М. Изучение взаимодействия рибосомного белка us3 человека с одноцепочечными ДНК с разными последовательностями. Биоорганическая химия. 2019. Т. 45. № 6.
  • Давыдова А.С., Крашенинина О.А., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Веньяминова А.Г., Воробьева М.А. Cинтез ДНК-библиотек для in vitro-селекции и анализ равномерности их состава. Биоорганическая химия. 2019. T. 45. № 6.


Геномика эукариот

  • Baturina O.A., Tupikin A.E., Goroshkevich S.N., Petrova E.A., Kabilov M.R. The complete chloroplast genome sequences of Pinus sibirica Du Tour. Mitochondrial DNA Part B. 2019. V. 4. N 1. P. 286-287
  • Tamkovich S.N., Grigoryeva A.E., Eremina A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Chernykh V., Vlassov V.V., Ryabchikova E.I. What information can be obtained from the tears of a patient with primary open angle glaucoma?. Clin. Chim. Acta. 2019. V. 495. P. 529-537
  • Kichigin I.G., Lisachov A.P., Giovannotti M., Makunin A.I., Kabilov M.R., O’Brien P.C. M., Ferguson‑Smith M.A., Graphodatsky A.S., Trifonov V.A. First report on B chromosome content in a reptilian species: the case of Anolis carolinensis. Mol. Genet. Genomics. 2019. V. 294. P. 13–21


Другие направления

  • Nilsson L.M., Zhang L., Bondar A.A., Svensson D., Wernerson A., Brismar H., Scott L., Aperia A. Prompt apoptotic response to high glucose in SGLT-expressing renal cells. Am J Physiol Renal Physiol. 2019. V. 316. N 5. F1078-F1089
  • Katkova L.E., Baturina G.S., Bondar A.A., Jagirdar R.M., Hatzoglou C., Gourgoulianis K.I., Solenov E.I., Zarogiannis S.G. Benign pleural mesothelial cells have higher osmotic water permeability than malignant pleural mesothelioma cells and differentially respond to hyperosmolality. Cell Physiol Biochem. 2019. V. 52. P. 869-878
  • Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Unique Mutational Spectrum of the GJB2 Gene and its Pathogenic Contribution to Deafness in the Tyva Republic (Southern Siberia, Russia): a High Prevalence of Rare Variant c.516G>C (p.Trp172Cys) among Tuvinians. Genes. 2019. V.10. N 6. pii: E429
  • Pshennikova V.G., Teryutin F.M., Bondar A.A., Morozov I.V., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Burtseva T.E., Odland J.O., Fedorova S.A. A rare case of Waardenburg syndrome with unilateral hearing loss caused by nonsense variant c.772C>T (p.Arg259*) in the MITF gene in Yakut patient from the Eastern Siberia (Sakha Republic, Russia) International Journal of Circumpolar Health. Int J Circumpolar Health. 2019. V. 78. N 1. P. 1630219
  • Pshennikova V.G., Barashkov N.A., Romanov G.P., Teryutin F.M., Solovyev A.V., Gotovtsev N.N., Nikanorova A.A., Nakhodkin S.S., Sazonov N.N., Morozov I.V., Bondar A.A., Dzhemileva L.U., Khusnutdinova E.K., Posukh O.L., Fedorova S.A. Comparison of Predictive in silico Tools on Missense Variants in GJB2, GJB6 and GJB3 Genes Associated with Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A). ScientificWorldJournal. 2019. V. 2019. N 20. P. 5198931
  • Батурина О.А., Черноносов А.А., Коваль В.В., Морозов И.В. Оценка степени проявления фенилкетонурии, обусловленной гомозиготной мутацией p.R155H, при помощи массспектрометрического анализа метаболитов крови. Acta Naturae. 2019. Т. 11. № 2 (41). С. 42-46
  • Агафонов А.В., Асбаганов С.В., Шабанова (Кобозева)Е.В., Морозов И.В., Бондарь А.А. Геномная конституция и дифференциация субгеномов эндемичных cибирских и дальневосточных видов рода Elymus (Poaceae) по данным секвенирования ядерного гена waxy. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2019. Т. 23. № 7. С. 817-826
  • Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Николаева Т.М., Терютин Ф.М., Борисова Т.В., Комарьков И.Ф., Антонец А.В., Соловьев А.В., Кларов Л.А., Бондарь А.А., Морозов И.В., Посух О.Л., Хуснутдинова Э.К., Федорова С.А., Барашков Н.А. Новая нонсенс-мутация с.1121G>A (p.Trp374*) гена CLIC5 - основная причина ювенильной аутосомно-рецессивной формы глухоты (DFNB103), очаги накопления которой обнаружены в арктических районах Якутии. Медицинская генетика. 2019. Т. 18. №10. С.36-48


C 2005 г. проанализировано

445329

образцов


© Copyright 2020. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика