Публикации ЦКП

2023

Метагеномика

• Chertkova E., Kabilov M.R., Yaroslavtseva O., Polenogova O., Kosman E., Sidorenko D., Alikina T., Noskov Y., Krivopalov A., Glupov V.V., Kryukov V.Y. Links between Soil Bacteriobiomes and Fungistasis toward Fungi Infecting the Colorado Potato Beetle. Microorganisms 2023. 11. 4. 943
• Maslennikova V.S., Tsvetkova V.P., Shelikhova E.V., Selyuk M.P., Alikina T.Y., Kabilov M.R., Dubovskiy I.M. Bacillus subtilis and Bacillus amyloliquefaciens Mix Suppresses Rhizoctonia Disease and Improves Rhizosphere Microbiome, Growth and Yield of Potato (Solanum tuberosum L.). Journal of Fungi 2023. 9. 12. 1142
• Naumova N.B., Barsukov P.A., Baturina O.A., Rusalimova O.A., Kabilov M.R. Soil Alveolata diversity in the undisturbed steppe and wheat agrocenoses under different tillage. Vavilov Journal of Genetics and Breeding 2023. 27. 6. 703–711
• Naumova N., Barsukov P., Baturina O., Rusalimova O., Kabilov M. West-Siberian Chernozem: How Vegetation and Tillage Shape Its Bacteriobiome. Microorganisms 2023. 11. 10. 2431
• Naumova N.B., Baturina O.A., Lokteva A.S., Pleshakova V.I., Lescheva N.A., Lorengel T.I., Zolotova N.S., Alekseeva I.G., Kabilov M.R. The effect of dextranal on the gut bacteriobiome of calves. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture 2023. 15. 6
• Polenogova O.V., Klementeva T.N., Kabilov M.R., Alikina T.Y., Krivopalov A.V., Kruykova N.A., Glupov V.V. A Diet with Amikacin Changes the Bacteriobiome and the Physiological State of Galleria mellonella and Causes Its Resistance to Bacillus thuringiensis. Insects 2023. 14. 11. 889
• Коробова Л.Н., Риксен В.С., Батурина О.А. Микробиоценоз солонца как индикатор изменения среды при замене кормовых севооборотов сеяным лугом. Сибирский Вестник Сельскохозяйственной Науки 2023. 53. 8. 5–14
• Кравцова Л.С., Перетолчина Т.Е., Трибой, Небесных И.А., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р. Исследование сообществ макробеспозвоночных животных в бухте Большие Коты озера Байкал с использованием ДНК метабаркодинга. Вавиловский Журнал Генетики и Селекции 2023. 27. 6. 694–702
• Лаврентьева Е.В., Раднагуруева А.А., Иванов В.Л., Батурина О.А., Бархутова Д.Д. Таксономическое разнообразие микробного сообщества в различных термальных зонах горячего источника Гарга (байкальская рифтовая зона). Природа Внутренней Азии 2023. 3(25). 58–67
• Наумова Н.Б., Беланов И.П., Савенков О.А., Степанова М.В., Щемелева Г.В., Батурина О.А., Кабилов М.Р. Почвенный и ризосферный бактериобиом пшеницы при комбинировании гуматов и золы уноса. Почвы и Окружающая Среда 2023. 6. 3. 1–16
• Никитина Е.П., Буянтуева Л.Б., Батурина О.А., Гынинова А.Б., Лаврентьева Е.В. Пространственная и таксономическая структура микробных сообществ почв сухостепной зоны селенгинского среднегорья (Западное Забайкалье). Аридные Экосистемы 2023. 29. 3(96). 111–123
• Цыренова Д.Д., Зайцева С.В., Дагурова О.П., Батурина О.А., Бархутова Д.Д. Структура фототрофных сообществ пресных озер прибайкалья в условиях интенсивной эвтрофикации. Природа Внутренней Азии 2023. 3(25). 85–99

Геномика бактерий и вирусов

• * Grizanova E.V., Krytsyna T.I., Kalmykova G.V., Sokolova E., Alikina T., Kabilov M., Coates C.J., Dubovskiy I.M. Virulent and necrotrophic strategies of Bacillus thuringiensis in susceptible and resistant insects, Galleria mellonella. Microbial Pathogenesis 2023. 175. 105958
• Kryukova N.A., Kryukov V.Y., Polenogova O.V., Chertkova Е.А., Tyurin M.V., Rotskaya U.N., Alikina T., Kabilov М.R., Glupov V.V. The endosymbiotic bacterium Wolbachia (Rickettsiales) alters larval metabolism of the parasitoid Habrobracon hebetor (Hymenoptera: Braconidae). Archives of Insect Biochemistry and Physiology 2023. 114. 4. e22053
• Pavlova O.N., Tupikin A.E., Chernitsyna S.M., Bukin Y.S., Lomakina A.V., Pogodaeva T.V., Nikonova A.A., Bukin S.V., Zemskaya T.I., Kabilov M.R. Description and Genomic Analysis of the First Facultatively Lithoautotrophic, Thermophilic Bacteria of the Genus Thermaerobacter Isolated from Low-temperature Sediments of Lake Baikal. Microb Ecol 2023. 86. 3. 1604–1619
• Prokopyeva E.A., Kurskaya O.G., Solomatina M.V., Sobolev I.A., Saroyan T.A., Dubovitskiy N.A., Derko A.A., Kozhin P.M., Alikina T.Y., Kabilov M.R., Shestopalov A.M., Sharshov K.A. Virological and genetic characteristics of human respiratory syncytial viruses isolated in Russia, 2017-2018. The Journal of Infection in Developing Countries 2023. 17. 02. 251–259
• Vlasenko A.V., Novozhilov Yu.K., Bondar A.A., Vlasenko V.A. Phylogeny of trichia brunnea and new names in the genus arcyria (trichiales, myxomycetes). Mikologiya I Fitopatologiya 2023. 57. 6. 385–393

Молекулярная биология и биотехнология

• Balabova D.V., Belash E.A., Belenkaya S.V., Shcherbakov D.N., Belov A.N., Koval A.D., Mironova A.V., Bondar A.A., Volosnikova E.A., Arkhipov S.G., Sokolova O.O., Chirkova V.Y., Elchaninov V.V. Biochemical Properties of a Promising Milk-Clotting Enzyme, Moose (Alces alces) Recombinant Chymosin. Foods 2023. 12. 20. 3772
• Bulkhin A.O., Zykov V.V., Marchenko D.N., Kabilov M.R., Baturina O.A., Boyandin A.N., Anishchenko O.V., Rogozin D.Y. Long-chain alkenones in the lake sediments of North-Minusinsk Valley (southern Siberia): implications for paleoclimate reconstructions. Organic Geochemistry 2023. 176. 104541
• Ochkasova A., Arbuzov G., Kabilov M., Tupikin A., Karpova G., Graifer D. AP lyase activity of the human ribosomal protein uS3: The DNA cleavage sequence specificity and the location of the enzyme active center. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 2023. 1871. 2. 140880
• Мурашкин Д.Е., Беленькая С.В., Бондарь А.А., Ельчанинов В.В., Щербаков Д.Н. Анализ некоторых биохимических свойств рекомбинантного химозина сибирской косули (Capreolus Pygargus), полученного в культуре клеток млекопитающих (cho-k1). Биохимия 2023. 88. 9. 1556–1569
• Шарабрин С.В., Бондарь А.А., Старостина Е.В., Кисаков Д.Н., Кисакова Л.А., Задорожный А.М., Рудометов А.П., Ильичев А.А., Карпенко Л.И. Удаление примесной дцРНК из препарата синтезированной матричным синтезом мРНК. Бюллетень Экспериментальной Биологии и Медицины 2023. 176. 12. 723–728

Геномика эукариот

• Agafonov A.V., Shabanova E.V., Emtseva M.V., Asbaganov S.V., Morozov I.V., Bondar A.A., Dorogina O.V. Phylogenetic and taxonomic relationships between morphotypes related to Elymus caninus (Poaceae) based on sequence of a nuclear gene GBSS1 (waxy) and sexual hybridization. Journal of Systematics and Evolution 2023. 1–14
• Bryzgunova O., Bondar A., Ruzankin P., Tarasenko A., Zaripov M., Kabilov M., Laktionov P. Locus-Specific Bisulfate NGS Sequencing of GSTP1, RNF219, and KIAA1539 Genes in the Total Pool of Cell-Free and Cell-Surface-Bound DNA in Prostate Cancer: A Novel Approach for Prostate Cancer Diagnostics. Cancers 2023. 15. 2. 431
• Dyrkheeva N.S., Malakhova A.A., Zakharenko A.L., Okorokova L.S., Shtokalo D.N., Pavlova S.V., Medvedev S.P., Zakian S.M., Nushtaeva A.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Khodyreva S.N., Luzina O.A., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I. Transcriptomic Analysis of CRISPR/Cas9-Mediated PARP1-Knockout Cells under the Influence of Topotecan and TDP1 Inhibitor. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 6. 5148
• Frolov A., Lobov A., Kabilov M., Zainullina B., Tupikin A., Shishkova D., Markova V., Sinitskaya A., Grigoriev E., Markova Y., Kutikhin A. Multi-Omics Profiling of Human Endothelial Cells from the Coronary Artery and Internal Thoracic Artery Reveals Molecular but Not Functional Heterogeneity. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 19. 15032
• Kiselev I.S., Kulakova O.G., Baturina O.A., Kabilov M.R., Boyko A.N., Favorova O.O. DNA Methylation Profile of CD14+ Monocytes Changes in Primary Progressive Multiple Sclerosis. Mol Biol 2023. 57. 5. 836–842
• Pshennikova V.G., Teryutin F.M., Cherdonova A.M., Borisova T.V., Solovyev A.V., Romanov G.P., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L., Fedorova S.A., Barashkov N.A. The GJB2 (Cx26) Gene Variants in Patients with Hearing Impairment in the Baikal Lake Region (Russia). Genes 2023. 14. 5. 1001
• Yunusova N., Dzhugashvili E., Yalovaya A., Kolomiets L., Shefer A., Grigor’eva A., Tupikin A., Kondakova I., Tamkovich S. Comparative Analysis of Tumor-Associated microRNAs and Tetraspanines from Exosomes of Plasma and Ascitic Fluids of Ovarian Cancer Patients. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 1. 464
• Zakharova Y., Marchenkov A., Petrova D., Bukin Y., Morozov A., Bedoshvili Y., Podunay Y., Davidovich O., Davidovich N., Bondar A., Kahlert M., Likhoshway Y. Delimitation of Some Taxa of Ulnaria and Fragilaria (Bacillariophyceae) Based on Genetic, Morphological Data and Mating Compatibility. Diversity 2023. 15. 2. 271
• Zakharenko A.L., Malakhova A.A., Dyrkheeva N.S., Okorokova L.S., Medvedev S.P., Zakian S.M., Kabilov M.R., Tupikin A.A., Lavrik O.I. PARP1 Gene Knockout Suppresses Expression of DNA Base Excision Repair Genes. Dokl Biochem Biophys 2023. 508. 1. 6–11
• Zolotenkova E.A., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A. Mutation at the Site of Hydroxylation in the Ribosomal Protein uL15 (RPL27a) Causes Specific Changes in the Repertoire of mRNAs Translated in Mammalian Cells. International Journal of Molecular Sciences 2023. 24. 7. 6173
• Киселев И.С., Кулакова О.Г., Батурина О.А., Кабилов М.Р., Бойко А.Н., Фаворова О.О. Сравнение профилей метилирования ДНК мононуклеарных клеток крови больных рассеянным склерозом в стадиях ремиссии и обострения. Журнал Неврологии и Психиатрии им. С.С. Корсакова. Спецвыпуски. 2023. 123. 7–2. 60–64
• Синицкий М.Ю., Синицкая А.В., Шишкова Д.К., Асанов М.А., Хуторная М.В., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р. Маркеры эндотелиальной дисфункции в клеточных культурах эндотелия при генотоксической нагрузке. Атеросклероз 2023. 19. 3. 313–315