Публикации ЦКП [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
» ЦКП "Геномика" СО РАН » Научные публикации » Публикации ЦКП
Публикации ЦКП

Публикации ЦКП



2005-2011

2012-2013

2014

2015

2016

2017

2018

2019


2020

Метагеномика

  • Лаврентьева Е.В., Эрдынеева Е.Б., Банзаракцаева Т.Г., Коцюрбенко О.Р., Батурина О.А., Хахинов В.В., Козырева Л.П. Разнообразие прокариот в биотопах соленого щелочного озера Гуджирганское (Баргузинская долина, Бурятия). Микробиология. 2020. Т. 89. N 3. C. 356–366
  • Рогозин Д.Ю., Бульхин А.О., Зыков В.В., Иванова Е.А., Дарьин А.В., Калугин И.А., Батурина О.А., Кабилов М.Р. Длинноцепочечные алкеноны в соленых меромиктических озерах Северо-Минусинской котловины (юг Сибири): первые сведения и возможная связь с динамикой уровня. Сибирский Экологический Журнал. 2020. N 6. C. 768–782
  • Kryukov V.Yu., Kosman E., Tomilova O., Polenogova O., Rotskaya U., Tyurin M., Alikina T., Yaroslavtseva O., Kabilov M., Glupov V. Interplay between fungal infection and bacterial associates in the wax moth Galleria mellonella under different temperature conditions. Journal of Fungi. 2020. Т. 6. N 3. P. 170
  • Lipko I.A., Krasnopeev A.Y., Tikhonova I.V., Timoshkin O.A., Kabilov M.R., Belykh O.I. Genetic diversity of Actinobacteria inhabiting water and sponges of Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 998–999
  • Mincheva Е.V., Peretolchina T.E., Bukin Yu.S., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Kravtsova L.S., Kupchinsky A.B., Sherbakov D.Yu. The composition of the communities of green algae and microeukaryotes at the sites of Lake Baikal contrasting in anthropogenic pressure. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 729–730
  • Naumova N., Alikina T., Tupikin A., Kalmykova А., Soldatova G., Vlassov V., Kabilov M. Human gut microbiome response to short-term Bifidobacterium-based probiotic treatment. Indian J Microbiol. 2020. Т. 60. N 4. P. 451–457
  • Noskov Y.A., Kabilov M.R., Polenogova O.V., Yurchenko Y.A., Belevich O.E., Yaroslavtseva O.N., Alikina T.Y., Byvaltsev A.M., Rotskaya U.N., Morozova V.V., Glupov V.V., Kryukov V.Y. A neurotoxic insecticide promotes fungal infection in Aedes aegypti larvae by altering the bacterial community. Microb Ecol. 2020. Т. 81. P. 493–505
  • Polyakova M.S., Mincheva Е.V., Pudovkina Т.А., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Ishchenko А.А., Kurakov A.V., Sherbakov D.Yu. The first data on fungi and fungus-like organisms in Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 741–742
  • Potapov S.A., Tikhonova I.V., Krasnopeev A.Yu., Kabilov M.R., Tupikin A.E., Chebunina N.S., Zhuchenko N.A., Belykh O.I. Characteristics of the viromes in the pelagic zone of Lake Baikal. Limnology and Freshwater Biology. 2020. N 4. P. 1013–1014
  • Sorokovikova E., Belykh O., Krasnopeev A., Potapov S., Tikhonova I., Khanaev I., Kabilov M., Baturina O., Podlesnaya G., Timoshkin O. First data on cyanobacterial biodiversity in benthic biofilms during mass mortality of endemic sponges in Lake Baikal. Journal of Great Lakes Research. 2020. Т. 46. N 1. P. 75–84


Геномика бактерий и вирусов

  • Борисова Т.В., Готовцев Н.Н., Барашков Н.А., Пак М.В., Алексеева М.П., Иннокентьева Н.Н., Морозов И.В., Бондарь А.А., Лоскутова К.С., Соловьев А.В., Пшенникова В.Г., Рафаилов А.М., Леханова С.Н., Федорова С.А. Филогенетический анализ штаммов Helicobacter pylori, циркулирующих в Якутии, по данным трех генов домашнего хозяйства atpA, mutY, ppa. Медицинская Генетика. 2020. T. 19. N 7. C. 105–106
  • Shneider M.M., Lukianova A.A., Evseev P.V., Shpirt A.M., Kabilov M.R., Tokmakova A.D., Miroshnikov K.K., Obraztsova E.A., Baturina O.A., Shashkov A.S., Ignatov A.N., Knirel Yu.A., Miroshnikov K.A. Autographivirinae bacteriophage Arno 160 Infects Pectobacterium carotovorum via depolymerization of the bacterial O-polysaccharide. International Journal of Molecular Sciences. 2020. Т. 21. N 9. P. 3170


Молекулярная биология и биотехнология

  • Беленькая С.В., Бондарь А.А., Кургина Т.А., Ельчанинов В.В., Бакулина А.Ю., Рухлова Е.А., Лаврик О.И., Ильичев А.А., Щербаков Д.Н. Идентификация гена химозина алтайского марала [cervus elaphus sibiricus (severtzov, 1873)], наработка его рекомбинантного аналога в прокариотической системе экспрессии и анализ некоторых биохимических свойств полученного фермента. Биохимия. 2020. Т. 85. N 7. C. 916–928
  • Великанова Е.А., Кутихин А.Г., Матвеева В.Г., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Антонова Л.В. Сравнение профиля генной экспрессии колониеформирующих эндотелиальных клеток из периферической крови человека и эндотелиальных клеток коронарной артерии. Комплексные проблемы сердечно-сосудистых заболеваний. 2020. Т. 9. N 2. C. 74–81
  • Babaylova E.S., Gopanenko A.V., Bulygin K.N., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. mRNA regions where 80S ribosomes pause during translation elongation in vivo interact with protein uS19, a component of the decoding site. Nucleic Acids Res. 2020. Т. 48. N 2. P. 912–923
  • Babaylova E.S., Kolobova A.V., Gopanenko A.V., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. The human ribosomal protein eL29 binds in vivo to the cognate mRNA by interacting with its coding sequence, as revealed from in-cell cross-linking data. Biochimie. 2020. Т. 177. P. 68–77
  • Davydova A., Krasitskaya V., Vorobjev P., Timoshenko V., Tupikin A., Kabilov M., Frank L., Venyaminova A., Vorobyeva M. Reporter-recruiting bifunctional aptasensor for bioluminescent analytical assays. RSC Adv. 2020. Т. 10. N 54. P. 32393–32399
  • Gopanenko A.V., Kolobova A.V., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Malygin A.A., Karpova G.G. Knockdown of the ribosomal protein eL29 in mammalian cells leads to significant changes in gene expression at the transcription level. Cells. 2020. Т. 9. N 5. P. 1228
  • Gopanenko A.V., Malygin A.A., Kossinova О.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Karpova G.G. Degenerate consensus sequences in the 3′-untranslated regions of cellular mRNAs as specific motifs potentially involved in the YB-1-mediated packaging of these mRNAs. Biochimie. 2020. Т. 170. P. 152–162
  • Krasitskaya V.V., Goncharova N.S., Biriukov V.V., Bashmakova E.E., Kabilov M.R., Baykov I.K., Sokolov A.E., Frank L.A. The Ca2+-regulated photoprotein obelin as a tool for SELEX monitoring and DNA aptamer affinity evaluation. Photochemistry and Photobiology. 2020. Т. 96. N 5. P. 1041–1046
  • Kutikhin A.G., Tupikin A.E., Matveeva V.G., Shishkova D.K., Antonova L.V., Kabilov M.R., Velikanova E.A. Human peripheral blood-derived endothelial colony-forming cells are highly similar to mature vascular endothelial cells yet demonstrate a transitional transcriptomic signature. Cells. 2020. Т. 9. N 4. P. 876
  • Osterman I.A., Chervontseva Z.S., Evfratov S.A., Sorokina A.V., Rodin V.A., Rubtsova M.P., Komarova E.S., Zatsepin T.S., Kabilov M.R., Bogdanov A.A., Gelfand M.S., Dontsova O.A., Sergiev P.V. Translation at first sight: the influence of leading codons. Nucleic Acids Research. 2020. Т. 48. N 12. P. 6931–6942
  • Terekhov S.S., Eliseev I.E., Ovchinnikova L.A., Kabilov M.R., Prjibelski A.D., Tupikin A.E., Smirnov I.V., Belogurov A.A., Severinov K.V., Lomakin Y.A., Altman S., Gabibov A.G. Liquid drop of DNA libraries reveals total genome information. PNAS. 2020. Т. 117. N 44. P. 27300–27306


Геномика эукариот

  • Dryomov S.V., Starikovskaya E.B., Nazhmidenova A.M., Morozov I.V., Sukernik R.I. Genetic legacy of cultures indigenous to the Northeast Asian coast in mitochondrial genomes of nearly extinct maritime tribes. BMC Evolutionary Biology. 2020. Т. 20. N 83. P. 1–8
  • Nuzhdina N.S., Dorogina O.V., Bondar A.A. Chloroplast and nuclear ribosomal DNA variation in two geographically and ecologically overlapping Hedysarum species. Annales Botanici Fennici. 2020. Т.57. N 4–6. P. 299–308
  • Vasilyeva G., Bondar A., Goroshkevich S. What does a mixed population of Pinus sibirica and P. pumila from the southern Baikal region suggest about the structure of their hybrid zone? Eur J Forest Res. 2020. Т. 139. N 2. P. 311–319
  • Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Morozov I.V., Bondar A.A., Posukh O.L. High rates of three common GJB2 mutations c.516G>C, c.-23+1G>A, c.235delC in deaf patients from southern Siberia are due to the founder effect. Genes. 2020. Т. 11. N 7. P. 833


C 2005 г. проанализировано

470471

образцов


© Copyright 2021. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика