Тема № VI.62.1.5 «Синтетическая биология: разработка средств манипуляции генетическим материалом и создание перспективных препаратов для терапии и диагностики»
Регистрационный номер ФАНО ПАРУС (0309-2016-0003)
Руководитель - к.б.н. Рихтер Владимир Александрович

Реферат выполнения 2017 год

- Построена модель активации аутофагии под действием лактаптина и его рекомбинантного аналога лактаптина RL2.
- Изучено влияния на процесс старения комбинации рекомбинантного аналога лактаптина RL2 и спермидина в экспериментах in vitro и in vivo.
- Созданы ферменты, специфически гидролизующие ДНК по заданным последовательностям или неканоническим парам оснований. Разработаны ДНК-гликозилазы с измененной специфичностью.
- Разработаны принципы сборки полиферментных мультифункциональных ДНК-белковых наноконструкций.
- Исследованы свойства белков стабильных комплексов молока и плаценты человека. Проведен анализ гидролиза гистонов специфическими антителами из крови больных рассеянным склерозом, системной красной волчанкой, шизофренией и ВИЧ-инфицированных.
- Созданы и охарактеризованы новые химерные ДНК-полимеразы на основе большого фрагмента ДНК-полимеразы I Geobacillus sp. 777.
- Сконструированы два бицистронных плазмидных шаттл-вектора, позволяющие быстро и эффективно встраивать в одну плазмидную ДНК два разных генов, кодирующих мультисубъединичный белок. Была оптимизирована методика трансфекции суспензионных эукариотических клеток с использованием сконструированных плазмид.

1. Чинак О.А., Шернюков А.В., Голубицкая Е.А., Пышная И.А., Коваль О.А., Кулигина Е.В., Рихтер В.А. Противоопухолевый пептид лактаптин. Особенности структуры и взаимодействия с клетками Международная научная конференция по биоорганической химии «XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова» VIII Российский симпозиум «Белки и пептиды». Москва, ИБХ РАН, 18-22 сентября 2017г. Acta natura. - Спецвыпуск. - 2017. - С. 78.
2. Оскорбин И.П., Белоусова Е.А., Боярских У.А., Закабунин А.И., Храпов Е.А., Филипенко М.Л. Химерные производные Bst-полимеразы с улучшенной процессивностью и устойчивостью к ингибиторам Международная научная конференция по биоорганической химии «XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова» VIII Российский симпозиум «Белки и пептиды». Москва, ИБХ РАН, 18-22 сентября 2017г. ActaNaturae. – 2017. – C. 192.
3. Чинак О.А., Юнусова А.Ю, Шернюков А.В., Пышная И.А., Кулигина Е.В., Коваль О.А., Нуштаева А.А., Рихтер В.В. Лактаптин - мембраноактивный пептид, способный к прямому проникновению в клетки эукариот Международный конгресс: Биотехнология: состояние и перспективы развития. 20-22 февраля 2017 г, г. Москва.
4. Tkachenko A.V., Troitskaya O.S., Yunusova A.Y., Richter V.A., Koval O.A. Cytotoxic antitumor activity of lactaptin in combination with autophagy inducers or inhibitors Advanced lecture course on oncometabolism from conceptual knowledge to clinical applicatios. 18-24 июня 2017, Фигейра-де-Фош, Португалия.
5. Diatlova E., Zharkov D. O. Target search processivity of uracil-DNA glycosylase from vaccinia virus Международная конференция «6th EU–US Conference on Repair of Endogenous DNA Damage» 24–28.09.2017, Удине, Италия. - University of Udine, 2017. – P. 33.
6. Zharkov D. O., Endutkin A. V., Lomzov A. A., Kuznetsov N. A., Simmerling C., Smirnov S. L. Conformational gating as a strategy for 8-oxoguanine discrimination by DNA repair enzymes Международная конференция «6th EU–US Conference on Repair of Endogenous DNA Damage» 24–28.09.2017, Удине, Италия. - University of Udine, 2017. – P. 43.
7. Жарков Д. О. Новые инструменты и подходы в редактировании эпигенома Биотехнология – медицине будущего. Материалы всероссийской конференции с международным участием. - 24–26.07.2017, Новосибирск. - Новосибирск: Офсет-ТМ, 2017. – С. 52.
8. Makasheva K., Zharkov D. DNA repair in transcription intermediates by helix–two-turn–helix family DNA glycosylases Международная конференция «42nd FEBS Congress: From Molecules to Cells and Back», 10–14.09.2017, Иерусалим, Израиль. - FEBS J. – 2017. – V. 284. – No. S1. – P. 114.
9. Endutkin A., Popov A., Yudkina A., Makasheva K., Afonnikov D., Simmerling C., Zharkov D. Dynamics of multistep damage recognition by 8-oxoguanine–DNA glycosylases Международная конференция «42nd FEBS Congress: From Molecules to Cells and Back», 10–14.09.2017, Иерусалим, Израиль. - FEBS J. – 2017. – V. 284. – No. S1. – P. 114.
10. Ermakov E.A., Smirnova L.P., Ivanova S.A., Zaharova O.D., Buneva V.N., Nevinsky G.A. IgG antibodies with nuclease activity in serum of patients with schizophrenia 30th European College of Neuropsychopharmacology Congress 02.09.2017-05.09.2017 Paris, France. - S633-S634
11. Ермаков Е.А. Каталитически активные антитела как индикатор иммунологических нарушений при шизофрении XX Международная медико-биологическая конференция молодых исследователей Фундаментальная наука и клиническая медицина 22.04.2017-22.04.2017 Санкт-Петербург, Россия. - С. 189-190
12. Буркова Е.Е. Протеомный анализ и биологические свойства стабильного высокомолекулярного белкового комплекса плаценты человека 21-ая международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология – наука XXI века» 17.04.2017-21.04.2017 Пущино, Россия. - C. 127
13. Голубицкая Е.А. Лактаптин как белок со свойствами CPP пептида 55-я Международная научная студенческая конференция МНСК-2017. 17-20 апреля, 2017 Новосибирск.
14. Буркова Е.Е. Протеомный анализ стабильного высокомолекулярного белкового комплекса и экзосом плаценты человека 55-ая Международная научная студенческая конференция 16.04.2017-20.04.2017 Новосибирск, Россия. - C. 115