Публикации 2011 года [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]




top.jpg

Структура института Научная деятельность Образование Мероприятия Об институте Для прессы

ИХБФМ СО РАН » ru » Научная деятельность » Публикации » Публикации 2011 года
Публикации 2011 года

Публикации 2011 года


Книги и монографии

  1. Ак. Кнорре Д.Г., Годовикова Т.С., Мызина С.Д., Федорова О.С. Биоорганическая химия. Учебник. Новосибирск: Изд. НГУ, 2011. 480с. (Уч.-изд. л. 30).
  2. Николаева А.А., Николаев К.Ю., Лифшиц Г.И., Попова Л.В. Сосудистая реактивность при коронарном атеросклерозе и социально значимых факторах риска (курение и алкоголь): возможности её использования для профилактики, скрининга и лечения. Новосибирск: Изд. ГПНТБ СО РАН, 2011. 218с. (Уч.-изд. л. 12).
  3. Медведев С.П., Шевченко А.И., Сухих Г.Т., Закиян С.М. Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки. Новосибирск: Изд. СО РАН, 2011. 215с. (Уч.-изд. л. 17).

Учебные и учебно-методические пособия

  1. Грайфер Д.М., Моор Н.А. «Биосинтез белка». (Учебное пособие). НГУ. Новосибирск: 2011. 104с. (Уч.-изд. л. 13).
  2. Тикунова Н.В., Хлусевич Я.А., Вихрова М.А., Нетесов С.В. «Выявление и исследование нуклеиновых кислот гастровирусов». Практикум по молекулярной вирусологии. (Методическое пособие). НГУ. Новосибирск. 2011. 74с. (Уч.-изд. л. 4,6).
  3. Кудряшова Н.В., Мызина С.Д. Физиологическая химия. Химические аспекты биологических процессов. Часть 6. (Учебное пособие). НГУ. Новосибирск. 2011. 153с. (Уч.-изд. л. 9,5).

Главы в книгах

  1. Ромащенко А.В., Ратушняк А.С., Запара Т.А., Ткачев С.Е., Мошкин М.П. Факторы изменчивости поведенческих и электрофизиологических реакций таежных клещей (Ixodes persulcatus) на половые феромоны человека. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 20-34.
  2. Козлова И.В., Верхозина М.М., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Рар В.А., Фоменко Н.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Злобин В.И. Эпидемиология, профилактика и диагностика трансмиссивных клещевых инфекций на примере Восточной Сибири. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 51-70.
  3. Верхозина М.М., Козлова И.В., Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Карань Л.С., Ткачев С.Е., Злобин В.И. Молекулярно-эпидемиологическая и эколого-географическая характеристика вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 84-107.
  4. Ткачев С.Е., Бахвалова В.В., Панов В.В., Ромащенко А.В., Мошкин М.П. Исследование генетической структуры популяции вируса клещевого энцефалита, выявляемого на территории лесопарковой зоны Новосибирского научного центра. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 108-116.
  5. Демина Т.В., Джиоев Ю.П., Верхозина М.М., Козлова И.В., Ткачев С.Е., Дорощенко Е.К., Лисак О.В., Злобин В.И. Генотипирование вируса клещевого энцефалита в природных и антропургических очагах Евразии по результатам мультилокусной гибридизации. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 139-153.
  6. Лбов Г.С., Полякова Г.Л., Гусев В.А., Бахвалова В.Н., Морозова О.В., Банникова Л.М., Козловский Л.И., Михеев В.Н., Шульгина Н.И., Глупов В.В. Математический анализ влияния астрофизических и метеорологических природных факторов на заболеваемость клещевым энцефалитом населения Новосибирской области. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 163-173.
  7. Дейнеко Е.В., Ткачев С.Е. Перспективы создания вакцин против клещевого энцефалита на основе генетически модифицированных растений. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 174-181.
  8. Ткачев С.Е., Матвеева В.А., Митрофанова Е.Э., Бахвалова В.Н. Генная иммунизация против вируса клещевого энцефалита. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 182-196.
  9. Фоменко Н.В. Иксодовые и аргасовые клещевые боррелиозы. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 197-214.
  10. Морозова О.В., Морозов И.В., Кабелло Ф.К. Изучение функций генов боррелий. Инфекции, передаваемые клещами в Сибирском регионе. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 238-253.
  11. Рар В.А., Епихина Т.И., Боляхина С.А. Распростроненность и генетическое разнообразае бабезий на территории Северного Урала, Западной Сибири и Дальнего Востока. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 296-308.
  12. Рар В.А., Ливанова Н.Н., Пуховская Н.М., Козлова И.В., Иванов Л.И. Генетическое разнообразие эрлихий и анаплазм на территории азиатской части России. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под ред. Власова В.В., Репина В.Е. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 309-320.
  13. Морозова О.В., Петрожицкая Л.В, Мирзаева А.Г., Кабелло Ф.К., Морозов И.В. Детекция и идентификация бартонелл у клещей, комаров и больных людей в Северной Азии и Америке. Инфекции, передаваемые клещами в Сибирском регионе. Интеграционные проекты СО РАН, вып. 30. Под. ред. Власова В.В. - Изд-во СО РАН, Новосибирск: 2011, С. 321-331.
  14. Морозова О., Бахвалова В. Вакцины против клещевого энцефалита: прошлое, настоящее и будущее Инактивированные формалином вакцины, ДНК- и РНК-вакцины, рекомбинантные бактерии, множественные антигенные пептиды из В- и Т-клеточных эпитопов. - Lambert Academic Publishing (LAP), 2011, 108с. ISBN 978-3-8433-1159-5.
  15. Godovikova T.S., Gerasimova Yu.V., Knorre D.G. Catalytic activities of serum albumin: mechanism, biological function and practical applications. Serum albumin: structure, functions, and health impacts. / In: Alekseev R.J. and Rebane A.I. (eds.) Nova Science Publishers, Inc. 2011, P. 1-15.
  16. Khodyreva S.N. and Lavrik O.I. New players in recognition of intact and cleaved AP sites: Implication in DNA repair in mammalian cells. Selected Topics in DNA repair. / Ed. C.C. Chen: In Tech, P. 13-22.
  17. Maslov M.A., Zenkova M.A. Non-viral gene delivery systems based on cholesterol cationic lipids: structure-activity relationships Non-viral Gene Delivery / Ed.by Xu-bo Yuan. - Croatia: InTech, 2011. – P.349-380.
  18. Non-Flavivirus Encephalitis. (Ed. by: Sergey Tkachev) - Publisher: InTech, 2011 ISBN 978-953-307-720-8, 360 p.
  19. Tkachev S.E., Demina T.V., Dzhioev Yu.P., Kozlova I.P., Verkhozina M.M., Doroshchenko E.K., Lisak O.V., Bakhvalova V.N., Paramonov A.I., Zlobin V.I. Genetic studies of tick-borne encephalitis virus strains from Western and Eastern Siberia. Flavivirus encephalitis /Daniel Růžek. - InTech. 2011. P. 236-254.
  20. Skvortsova T.E., Bryzgunova O.E., Lebedeva A.О., Mak V.V., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Methylated Cell-free DNA in Vitro and in Vivo. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, Part 5 / Gahan P. - Springer Science. 2011. P. 185-194.
  21. Cherepanova V.A., Bushuev A.V., Vlassov V.V, Laktionov P.P. Cell-Surface-Bound DNA Inhibits Poly(I:C)-Activated IL-6 and IL-8 Production in Human Primary Endothelial Cells and Fibroblasts. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, Part 5 / Gahan P. - Springer Science. 2011. P. 207-211.
  22. Morozkin E.S., Loseva E.M., Mileyko V.A., Zadesenets K.S., Rubtsov N.B., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Comparative study of extracellular DNA by FISH. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, Part 5 / Gahan P. - Springer Science. 2011. P. 143-146.
  23. Ponomaryova A.A., Rykova E.Y., Cherdyntseva N.V., Skvortsova T.E., Cherepanova A.V., Morozkin E.S., Mileiko V.А., Litvjakov N.V., Dobrodeev А.Y., Zav’yalov A. А., Tuzikov S.A., Chikova E.D., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Concentration and distribution of single-copy β-actin gene and LINE-1 repetitive elements in blood of lung cancer patients. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, Part 5 / Gahan P. - Springer Science. 2011. P. 41-45.
  24. Elistratova E.V., Shelestyuk P.I., Permyakova V.I., Chikova E.D., Tuzikov S.A., Vlassov V.V., Laktionov P.P., Rykova E.Y. Blood-based methylated DNA and tumor-specific protein analysis in gastric cancer diagnostics. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, Part 5 / Gahan P. - Springer Science. 2011. P. 57-61.
  25. Bakhvalova V.N., Panov V.V., Morozova O.V. Tick-borne encephalitis virus quasispecies rearrangements in ticks and mammals. «Flavivirus encephalitis», Daniel Růžek (Ed.) Daniel Ruzek: ISBN: 978-953-307-669-0. P. 213-234.

Препринт

  • Лаврик О.И., Моор Н.А., Толочко Б.П., Кулипанов Г.Н. Белки-участники процессов репарации ДНК как важнейшие объекты для рентгеноструктурных исследований. Препринт ИЯФ СО РАН. Новосибирск, 2011, Т. 17, С. 305–330.

Статьи в зарубежных рецензируемых журналах

  1. Vorobjev Y.N. Advances in Implicit Models of Water Solvent to Compute Conformational Free Energy and Molecular Dynamics of Proteins at Constant pH. Adv. Protein Chem. Struct. Biol. 2011. V. 85, Р. 281-322.
  2. Bryzgunova O., Bondar A., Morozkin E., Mileyko V., Vlassov V., Laktionov P. A reliable method to concentrate circulating DNA. Analytical Biochemistry. 2011. V. 408(2), Р. 354-356.
  3. Fedorova A.A., Azzami K., Ryabchikova E.I., Spitsyna Y.E., Silnikov V.N., Ritter W., Gross H.J., Tautz J., Vlassov V.V., Beier H., Zenkova M.A. Inactivation of a non-enveloped RNA virus by artificial ribonucleases: Honey bees and Acute bee paralysis virus as a new experimental model for in vivo antiviral activity assessment. Antiviral Research. 2011. V. 91(3), Р. 267–277.
  4. Morozova O.B., Saprygina N.N., Fedorova O.S., Yurkovskaya A.V. Deprotonation of Transient Guanosyl Cation Radical Catalyzed by Buffer in Aqueous Solution: TR-CIDNP Study. Appl. Magn. Reson. 2011. V. 41(2\3), Р. 239-250.
  5. Goryunov L.I., Zhivetyeva S.I., Nevinsky G.A., Shteingarts V.D. Synthesis of diphenyl(X)phosphonium betaines (X = CH3, C6H5, 2,5-F2C6H3) from hexafluoro-1,4-naphthoquinone. ARKIVOC. 2011. V. VIII(viii), Р. 185-191.
  6. Gulevich A.V., Koroleva L.S., Morozova O.V., Bakhvalova V.N., Silnikov V.N. and Nenajdenko V.G. Multicomponent synthesis of artificial nucleases and their RNase and DNase activity. Beilstein Journal. Organic Chemistry. 2011. V. (7), P. 1135–1140.
  7. Ilin A.A., Malygin A.A., Karpova G.G. Ribosomal protein S18e as a putative molecular staple for the 18S rRNA 3’-major domain core. Biochem. Biophys. Acta. 2011. V. 1814(4), Р. 505-512.
  8. Mechetin G.V., Zharkov D.O. Mechanism of translocation of uracil-DNA glycosylase from Escherichia coli between distributed lesions. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011. V. 414(2), P. 425-430.
  9. Malygin A.A., Babaylova E.S., Loktev V.B., Karpova G.G. A region in the C-terminal domain of ribosomal protein SA required for binding of SA to the human 40S ribosomal subunit. Biochimie. 2011. V. 93(3), Р. 612-617.
  10. Patutina O.A., Mironova N.L., Ryabchikova E.I., Popova N.A., Nikolin V, Kaledin V., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Inhibition of metastasis development by daily administration of ulrtalow doses of RNase A and DNase I. Biochemie. 2011. V. 93(4), Р. 689-696.
  11. Zakharova O.D., Ovchinnikova L.P., Goryunov L.I., Troshkova N.M., Shteingarts V.D., Nevinsky G.A. Cytotoxicity of new polyfluorinated 1,4-naphtoquinones with diverse substituents in the quinone moiety. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011. V. 19(1), Р. 256-260.
  12. Maslov M.A., Medvedeva D.A., Rapoport D.A., Serikov R.N., Morozova N.G., Serebrennikova G.A., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Synthesis and transfection activity of novel galactosylated polycationic lipid. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011. V. 21(10), Р. 2937-2940.
  13. Chubarov A.V., Shakirov M.M., Koptyug I.V., Sagdeev R.Z., Knorre D.G., Godovikova T.S. Synthesis and characterization of fluorinated homocysteine derivatives as potential molecular probes for 19F magnetic resonance spectroscopy and imaging. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011. V. 21(13), Р. 4050-4053.
  14. Kutuzov M.M., Ame J.-C., Khodyreva S.N., Schreiber V., Lavrik. O.I. Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates. Biopolymers & Cell. 2011. V. 27(5), Р. 383-386.
  15. Dymova M.A., Liashenko O.A., Poteiko P.I., Krutko V.S., Khrapov E.A., Filipenko M.L. Genetic variation of Mycobacterium tuberculosis circulating in Kharkiv Oblast, Ukraine. BMC Infect. Dis. 2011. V. 11(1), Р. 77.
  16. Blom H., Ronnlund D., Scott L., Spicarova Z., Widengren J., Bondar A., Aperia A., Brismar H. Spatial distribution of Na+-K+-ATPase in dendritic spines dissected by nanoscale superresolution STED microscopy. BMC Neurosci. 2011. V. 12(16)
  17. Moor N., Klipcan L., Safro M.G. Bacterial and Eukaryotic Phenylalanyl-tRNA Synthetases Catalyze Misaminoacylation of tRNA(Phe) with 3,4-Dihydroxy-L-Phenylalanine. Chem. Biol. 2011. V. 18(10), Р. 1221-1229.
  18. Logashenko E.B., Salomatina O.V., Markov A.V., Korchagina D.V., Salakhutdinov N.F., Tolstikov G.A., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Synthesis and Pro-Apoptotic Activity of Novel Glycyrrhetinic Acid Derivatives. ChemBioChem. 2011. V. 12(5), Р. 784-794.
  19. Krasheninina O.A., Novopashina D.S., Lomzov A.A., Venyaminova A.G. 2'-Bispyrene oligo(2'-O-methylribonucleotides) as novel fluorescent probes for RNA detection. Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid. Components. 2011. V. 12, Р. 424-426.
  20. Morozkin E.S., Loseva E.M., Karamysheva T.V., Babenko V.N., Laktionov P.P., Vlassov V.V., Rubtsov N.B. A Method for Generating Selective DNA Probes for the Analysis of C-Negative Regions in Human Chromosomes. Cytogenetic and Genome Research. 2011. V. 135(1), Р. 1-11.
  21. Sukhanova M., D'Herin C., van Der Kemp P.A., Koval V., Boiteux S., Lavrik O. Ddc1 checkpoint protein and DNA polymerase ε interact with nick-containing DNA repair intermediate in cell extracts of Saccharomyces cerevisiae. DNA Repair (Amst). 2011. V. 10(8), Р. 815-825.
  22. Borgoyakov V.Yu., Fomenko N.V., Panov V.V., Chikova E.D. Infestation of Taiga Ticks with Borrelias in the Territory of Novosibirsk Scientific Center (Siberian Branch, Russian Academy of Sciences). Entomological Review. 2011. V. 91(3), Р. 396-404.
  23. Ponomaryova A.A., Rykova E.Y., Cherdyntseva N.V., Skvortsova T.E., Dobrodeev А.Y., Zav’yalov A.А., Tuzikov S.A., Vlassov V.V., Laktionov P.P. RARβ2 gene methylation level in the circulating DNA from lung cancer patient blood. Eur. J. Canc. Prev. 2011. V. 20(6), Р. 453-455.
  24. Gabibov A.G., Belogurov A.A., Lomakin Y.A., Zakharova M.Y., Avakyan M.E., Dubrovskaya V.V., Smirnov I.V., Ivanov A.S., Molnar A.A., Gurtsevitch V.E., Diduk S.V., Smirnova K.V., Avalle B., Sharanova S.N., Tramontano A., Friboulet A., Boyko A.N., Ponomarenko N.A., Tikunova N.V. Combinatorial antibody library from multiple sclerosis patients reveals antibodies that cross-react with myelin basic protein and EBV antigen. FASEB J. 2011. V. 25(12), P. 4211-4221.
  25. Lebedeva N.A., Rechkunova N.I., Lavrik O.I. AP-site cleavage activity of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1. FEBS Letters. 2011. V. 585(4), Р. 683-686.
  26. Petrova N.S., Meschaninova M.I., Venyaminova A.G., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L. Silencing activity of 2-O-methyl modified anti-MDR1 siRNAs with mismatches in the central part of the duplex.FEBS Letters. 2011. V. 585(14), Р. 2352-2356.
  27. Guselnikov S.V., Laktionov P.P., Najakshin A.M., Baranov K.O., Taranin A.V. Expansion and diversification of the signaling capabilities of the CD2/SLAM family in Xenopodinae amphibians. Immunogenetics. 2011. V. 63(10), Р. 679-689.
  28. Rar V., Golovljova I. Anaplasma, Ehrlichia, and «Candidatus Neoehrlichia» bacteria: Pathogenicity, biodiversity, and molecular genetic characteristics, a review. Infection, Genetics and Evolution. 2011. V. 11(8), P. 1842-1861.
  29. Zenkova M.A., Pyshnyi D.V., Zalloum W.A., Gebrezgiabher M.B., Bichenkova E.V. New approaches for the development of nucleic acid-based therapeutics: challenges and opportunities in RNA targeting. Intern. Drug Disc. 2011. V. 6(5), P. 28-33.
  30. Odintsova E.S., Baranova S.V., Dmitrenok P.S., Rasskazov V.A., Calmels C, Parissi V., Andreola M.L., Buneva V.N., Zakharova O.D., Nevinsky G.A. Antibodies to HIV integrase catalyze site-specific degradation of their antigen.International Immunology. 2011. V. 23(10), Р. 601-612.
  31. Maiborodin I., Yakimova N., Matveeva V., Shevela A., Maiborodina E., Pekareva E., Tkachuk O. Angiogenesis in rat uterine scar after introduction after autological mesenchymal stem cells of bone marrow origin. J. Biomedical Science and Engineering. 2011. V. 4(3), Р. 164-172.
  32. Serikov R., Petyuk V., Vorobijev Yu., Koval V., Fedorova O., Vlassov V., Zenkova M.A. Mechanism of antisense oligonucleotide interaction with natural RNAs. J. Biomol. Struct. Dyn. 2011. V. 29(1), Р. 27-50.
  33. Gruntenko N.Е., Bogomolova E.V., Adonyeva N.V., Karpova E.K., Menshanov P.N., Alekseev A.A., Romanova I.V., Li S., Rauschenbach I.Yu. Decrease in juvenile hormone level as a result of genetic ablation of the corpus allatum cells affects the synthesis and metabolism of stress related hormones in Drosophila.J. Insect Phisiol. V. 58(1), P. 49-55.
  34. Odintsova E.S., Zaksas N.P., Buneva V.N., Nevinsky G.A. Metal dependent hydrolysis of β-casein by sIgA antibodies from human milk.J. Mol. Recognit. 2011. V. 24(1), Р. 45-59.
  35. Kostrikina I.A., Kolesova M.E., Orlovskaya I.A., Buneva V.N., Nevinsky G.A. Diversity of DNA-hydrolyzing antibodies from the sera of autoimmune-prone MRL/MPJ-lpr mice. J. Mol. Recognit. 2011. V. 24(4), Р. 557-569.
  36. Nevinsky G.A. Structural, thermodynamic, and kinetic basis for the activities of some nucleic acid repair enzymes. J. Mol. Recognit. 2011. V. 24(4), Р. 656-677.
  37. Bezuglova A.V., Konenkova L.P., Doronin B.M., Buneva V.N., Nevinsky G.A. Affinity and catalytic heterogeneity and metal-dependence of polyclonal myelin basic protein-hydrolyzing IgGs from sera of patients with systemic lupus erythematosus. J. Mol. Recognit. 2011. V. 24(6), Р. 960-974.
  38. Odintsova E.S., Baranova S.V., Buneva V.N.,Calmels C., Parissi V., Andreola M.-L., Zakharova O.D., Nevinsky G.A. Catalytic antibodies from HIV-infected patients specifically hydrolyzing viral integrase suppress the enzyme catalytic activities. J. Mol. Recognit. 2011. V. 24(6), Р. 1067-1076.
  39. Beloglazova N.G., Fabani M.M., Polushin N.N., Silnikov V.N., Vlassov V.V., Bichenkova E.V., Zenkova M.A. Site-selective artificial ribonucleases: oligonucleotide conjugates containing multiple imidazole residues in the catalytic domain. J. of Nucleic Acids. 2011. V. 2011, e748632
  40. Kabilov M., Pyshnyi D. Analytical Consideration of the Selectivity of Oligonucleotide Hybridization. Journal of Biophysical Chemistry. 2011. V. 2(2), Р. 75-91.
  41. Dymova M.A., Kinsht V.N., Cherednichenko A.G., Khrapov E.A., Svistelnik A.V., Filipenko M.L. Highest prevalence of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype isolates in patients newly diagnosed for tuberculosis.Journal of Medical Microbiology. 2011. V. 60(7), Р. 1003-1009.
  42. Tolstikov T.G., Khvostov M.V., Lifshits G.I., Dushkin A.V., Meteleva E.S. Alteration of Warfarin's pharmacologic properties in clathrates with glycyrrhizic acid and arabinogalactan. Letters in Drug Design and Discovery 2011. V. 8(3), Р. 201-204.
  43. Weiner A.S., Beresina O.V., Voronina E.N., Voropaeva E.N., Boyarskih U.A., Pospelova T.I., Filipenko M.L. Polymorphisms in folate-metabolizing genes and risk of non-Hodgkin's lymphoma. Leuk Res. 2011. V. 35(4), Р. 508-515.
  44. Chernonosov A.A., Solov'eva L.I., Luk'yanets E.A., Knorre D.G., Fedorova O.S. Dimeric Fe-Co phthalocyanine complex as a reagent for the selective damage of nucleic acids. Macroheterocycles. 2011. V. 4(2), Р. 135-137.
  45. Kuznetsov, N.A., Milov, A.D., Isaev, N.P., Vorobjev, Y.N., Koval, V.V., Dzuba, S.A., Fedorova, O.S., Tsvetkov, Y.D. PELDOR analysis of enzyme-induced structural changes in damaged DNA duplexes. Molecular BioSystems. 2011. V. 7(9), Р. 2670-2680.
  46. Kudryavtseva E.A., Rozhdestvenskii A.S., Kakulya A.V., Khanokh E.V., Delov R.A., Malkova N.A., Korobko D.S., Platonov F.A., Aref'eva E.G., Zagorskaya N.N., Aliferova V.M.,Titova M.A., Babenko S.A., Smagina I.V., El'chaninova S.A., Zolovkina A.G., Lifshits G.I., Puzyrev V.P., Filipenko M.L. Polymorphic locus rs10492972 of the KIF1B gene association with multiple sclerosis in Russia: case control study. Molecular Genetics and Metabolism. 2011. V. 104(3), Р. 390-394.
  47. Kirpota O.O., Endutkin A.V., Ponomarenko M.P., Ponomarenko P.M., Zharkov D.O., Nevinsky G.A. Thermodynamic and kinetic basis for recognition and repair of 8-oxoguanine in DNA by human 8-oxoguanine-DNA glycosylase.Nucleic Acids Research. 2011. V. 39(11), P. 4836-4850.
  48. Bulygin K.N., Khairulina Y.S., Kolosov P.M., Ven'yaminova A.G., Graifer D.M., Vorobjev Y.N., Frolova L.Y., Karpova G.G. Adenine and guanine recognition of stop codon is mediated by different N domain conformations of translation termination factor eRF1. Nucleic Acids Research. 2011. V. 39(16), Р. 7134-7146.
  49. Owen N., Zhou H., Malygin A.A., Sangha J., Smith L.D., Muntoni F., Eperon I.C. Design principles for bifunctional targeted oligonucleotide enhancers of splicing. Nucleic Acids Research. 2011. V. 39(16), Р. 7194-7208.
  50. Vasilyeva S, Budilkin B, Konevetz D., Silnikov V. Synthesis of novel nucleoside 5'-triphosphates and phosphoramidites containing alkine or amino groups for the post-synthetic functionalization of nucleic acids. Nucleosides&Nucleotides Nucleic Acids. 2011. V. 30(10), Р. 753-767.
  51. Rar V.A., Epikhina T.I., Livanova N.N., Panov V.V. Genetic diversity of Babesia in Ixodes persulcatus and small mammals from North Ural and West Siberia, Russia. Parasitology. 2011. V. 138(2), Р. 175-82.
  52. Stegmaier P., Voss N., Meier T., Kel A., Wingender, E., Borlak J. Advanced computational biology methods identify molecular switches for malignancy in an EGF mouse model of liver cancer. PloS ONE. 2011. V. 6(3), e17738
  53. Ryabinin V.A., Kostina E.V., Maksakova G.A., Neverov A.A., Chumakov K.M., Sinyakov A.N. Universal oligonucleotide microarray for sub-typing of influenza a virus. PloS ONE. 2011. V. 6(4), e17529
  54. Timofeyeva N.A., Koval V.V., Ishchenko A.A., Saparbaev M.K., Fedorova O.S. Lys98 Substitution in Human AP Endonuclease 1 Affects the Kinetic Mechanism of Enzyme Action in Base Excision and Nucleotide Incision Repair Pathways. PloS ONE. 2011. V. 6(9), e24063
  55. Vila J.A., Arnautova Y.A., Vorobjev Y., Scheraga H.A. Assessing the fractions of tautomeric forms of the imidazole ring of histidine in proteins as a function of pH. PNAS 2011. V. 108(14), Р. 5602-5607.
  56. Smirnov I., Carletti E., Kurkova I., Nachon F., Nicolet Y., Mitkevich V.A., Deb́at H., Avalle B., Belogurov Jr., A.A., Kuznetsov N., Reshetnyak A., Masson P., Tonevitsky A.G., Ponomarenko N., Makarov A.A., Friboulet A., Tramontano A., Gabibov A. Reactibodies generated by kinetic selection couple chemical reactivity with favorable protein dynamics. PNAS 2011. V. 108(38), Р. 15954-15959.
  57. Rar V.A., Epikhina T.I., Livanova N.N., Panov V.V., Doroschenko E.K., Pukhovskaia N.M., Vysochina N.P., Ivanov L.I. Genetic variability of Anaplasma phagocytophilum in Ixodes persulcatus ticks and small mammals in the Asian part of Russia. Vector-Borne and Zoonotic Diseases. 2011. V. 11(8), Р. 1013-1021.
  58. Olejnik J., Ryabchikova E., Corley R.B., Muhlberger E. Intracellular Events and Cell Fate in Filovirus Infection. Viruses. 2011. V. 3(8), Р. 1501-1531.

Статьи в российских рецензируемых журналах

  1. Акимов И.А., Черноловская Е.Л., Спицына Ю.Е., Рябчикова Е.И., Зенкова М.А. Подавление экспрессии генов Her2, CCNB1 и PKC с помощью siРНК снижает скорость пролиферации клеток нейробластомы человека на длительное время. Acta Naturae. 2011. T. 3(3), С. 31-41.
  2. Давыдова А.С., Воробьева М.А., Веньяминова А.Г. Эскорт-аптамеры: новые инструменты для направленной доставки лекарственных препаратов в клетки.Acta Naturae. 2011. T. 3(4), С. 31-49.
  3. Власов В.В., Синяков А.Н., Пышный Д.В., Рыхлицкий С.В., Кручинин В.Н., Спесивцев Е.В., Пышная И.А., Костина Е.В., Дмитриенко Е.Д., Бессемельцев В.П. Эллипсометрический мониторинг в микрочиповых label-free биотехнологиях. Автометрия. 2011. T. 47(5), С. 67-77.
  4. Клименко Е.С., Милейко В.А., Морозкин Е.С., Лактионов П.П., Константинов Ю.М. Характеристика импорта и экспорта ДНК в митохондриях картофеля (solanum tuberosum) с использованием метода количественной ПЦР. Биологические мембраны. 2011. T. 28(3), С. 199-205.
  5. Роцкая У.Н., Овчинникова Л.П., Васюнина Е.А., Синицина О.И., Кандалинцева Н.В., Просенко Е.А., Невинский Г.А. Оценка цитотоксичности и эффективности антиоксидант-ных свойств гидрофильных производных 2,4,6-триалкилфенолов в клетках Escherichia coli. Биомедицинская химия. 2011. T. 57(3), С. 326-334.
  6. Ходырева С.Н., Лаврик О.И. Аффинная модификация в протеомном исследовании ансамблей репарации ДНК. Биоорганическая химия. 2011. T. 37(1), С. 91-107.
  7. Крашенинина О.А., Новопашина Д.С., Веньяминова А.Г. Олиго(2'-О-метилрибонуклеотиды) со вставками 2'-биспиренилметилфосфодиамидных производных нуклеозидов как перспективные флуоресцентные зонды для детекции РНК.Биоорганическая химия. 2011. T. 37(2), С. 273- 277.
  8. Вихрова М.А., Батанова Т.А., Лебедев Л.Р., Шингарова Л.Н., Франк Л.А., Кирпичников М.П., Тикунова Н.В. Одноцепочечные антитела человека, направленные к фактору некроза опухолей.Биоорганическая химия. 2011. T. 37(3), С. 334-343.
  9. Рябинин В.А., Костина Е.В., Синяков А.Н. Влияние природы аминокислоты в положении 273 нейраминидазы вируса гриппа A (H1N1), циркулирующего в человеческой популяции, на резистентность к озельтамивиру. Биоорганическая химия. 2011. T. 37(5), C. 711-714.
  10. Костина Е.В., Рябинин В.А., Агафонов А.П., Терновой В.А., Синяков А.Н. Микрочип для диагностики субтипов вируса гриппа А, патогенных для человека. Биоорганическая химия. 2011. T. 37(5), С. 715-717.
  11. Касакин М.Ф., Абрамова Т.В., Сильников В.Н. Синтез 2’-аминометил-морфолиновых аналогов нуклеозидов двух разных типов.Биоорганическая химия. 2011. T. 37(6), С. 830-835.
  12. Лаврик О.И. Репарация ДНК - ключевой механизм обеспечения стабильности генома. Биохимия. 2011. T. 76(1), С. 7.
  13. Речкунова Н.И., Красикова Ю.С., Лаврик О.И. Эксцизионная репарация нуклеотидов: узнавание повреждений ДНК и формирование предрасщепляющего комплекса. Биохимия. 2011. T. 76(1), С. 32-45.
  14. Грин И.Р., Жарков Д.О. Эукариотические гомологи эндонуклеазы VIII: новые элементы системы эксцизонной репарации оснований ДНК.Биохимия. 2011. T. 76(1), C. 99-114.
  15. Невинский Г.А. Основные факторы, обеспечивающие специфичность действия ферментов репарации.Биохимия. 2011. T. 76(1), С. 115-141.
  16. Кузнецов Н.А., Коваль В.В., Федорова О.С. Механизмы ферментативного катализа и узнавания поврежденных участков ДНК 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазой человека hOgg1.Биохимия. 2011. T. 76(1), С. 142-156.
  17. Кутузов М.М., Ильина Е.С., Суханова М.В., Пышная И.А., Пышный Д.В., Лаврик О.И., Ходырева С.Н. Взаимодействие поли(ADP-рибозо)полимеразы-1 с апуриновыми/апиримидиновыми сайтами в составе кластерных повреждений ДНК.Биохимия. 2011. T. 76(1), С. 176-187.
  18. Евдокимов А.Н., Петрусева И.О., Пестряков П.Е., Лаврик О.И. Фотоактивируемые ДНК-аналоги субстратов системы эксцизионной репарации нуклеотидов и их взаимодействие с белками NER-компетентного экстракта клеток HeLa. II. Синтез и применение протяженных модельных ДНК.Биохимия. 2011. T. 76(1), С. 188-195.
  19. Тимофеева Н.А., Коваль В.В., Ищенко А.А., Сапарбаев М.К., Фёдорова О.С. Кинетический механизм действия апуриновой-апиримидиновой эндонуклеазы человека в процессе инцизионной репарации нуклеотидов.Биохимия. 2011. T. 76(2), С. 211-222.
  20. Красноруцкий М.А., Бунева В.Н., Невинский Г.А. ДНКазная, РНКазная и фосфатазная активности антител, образующихся при иммунизации ДНК, ДНКазой I и ДНКазой II.Биохимия. 2011. T. 76(9), С. 1305-1314.
  21. Баранова С.В., Бунева В.Н., Харитонова М.А., Сизякина Л.П., Захарова О.Д., Невинский Г.А. Многообразие интеграза-гидролизующих IgG и IgM антител из крови ВИЧ-инфицированных больных.Биохимия. 2011. T. 76(12), С. 1615-1628.
  22. Ханох Е.В., Рождественский А.С., Кудрявцева Е.А., Какуля А.В., Делов Р.А., Филипенко М.Л. Влияние полиморфных локусов rs1800629 (TNFa), rs6074022 (CD40), rs187238 (IL-18), rs10492972 (KIF1B),rs4149584 (TNFRSF1A) на особенности клинических проявлений рассеянного склероза с учетом гендерной принадлежности в этнической группе русских. Бюллетень сибирской медицины. 2011. T. (2), С. 50-56.
  23. Корчагина Р.П., Осипова Л.П., Вавилова Н.А., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Генетический полиморфизм цитохрома Р450 2С9, участвующего в метаболизме лекарственных препаратов, в популяциях коренных жителей Северной Сибири.Бюллетень СО РАМН. 2011. №2, С. 39-46.
  24. Дымова М.А., Кушугулова А.Р., Рахимова С.Е., Раманкулов Е.М., Жусупова Р.Ж., Храпов Е.А., Филипенко М.Л. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов M. Tuberculosis у больных туберкулезом легких г. Астана.Бюллетень СО РАМН. 2011. T. 31(1), С. 107-112.
  25. Ханох Е.В., Рождественский А.С., Кудрявцева Е.А., Какуля А.В., Делов Р.А., Филипенко М.Л. Исследование наследственных факторов в предрасположенности к рассеянному склерозу и особенностям его течения в русской этнической группе.Бюллетень СО РАМН. 2011. T. 31(1), С. 113-118.
  26. Березина О.В., Вайнер А.С., Поспелова Т.И., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Ассоциация полиморфных вариантов генов фолатного цикла с риском развития индолентных и агрессивных лимфом.Бюллетень СО РАМН. 2011. T. 31(2), С. 20-25.
  27. Сенькова А.В., Агеева Т.А., Зенкова М.А. Взаимоотноше-ние процессов прогрессирования множественной лекарственной устойчивости в опухоли и морфологических изменений в печени у мышей с перевиваемой лимфосаркомой RLS40 в условиях полихимиотерапии.Бюллетень СО РАМН. 2011. T. 31(2), С. 87-93.
  28. Логинова Л.В., Смирнова Л.П., Коваль В.В., Федорова О.С., Семке А.В., Иванова С.А. Масс-спектрометрический анализ белков сыворотки крови больных шизофренией.Бюллетень СО РАМН. 2011. T. 31(5), С. 63-68.
  29. Вайнер А.С., Оськина Н.А., Лазарев А.Ф., Петрова В.Д., Ганов Д.И., Боярских У.А., Тоначева О.Г., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Роль полиморфных вариантов A2756G гена MTR и с1420t гена SHMT1 в развитии рака предстательной железы у жителей Западно-Сибирского региона России.Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2011. T. 52(10), С. 448-452.
  30. Патутина О.А., Миронова Н.Л., Логашенко Е.Б., Попова Н.А., Николин В.П., Васильев Г.В., Каледин В.И., Зенкова М.А., Власов В.В. Метаболит циклофосфамида, запускающий апоптоз в клетках лимфосаркомы мыши RLS, является субстратом для Р-гликопротеина.Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2011. T. 152(9), С. 318-322.
  31. Корчагина Р.П., Осипова Л.П., Вавилова Н.А., Ермоленко Н.А., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Полиморфизм генов биотрансформации ксенобиотиков GSTM1, GSTT1, CYP2D6, вероятных маркеров риска онкологических заболеваний, в популяциях коренных этносов и русских северной Сибири.Вавиловский журнал генетики и селекции. 2011. T. 15(3), С. 448-461.
  32. Селютина И.Я., Уртегешев Н.С., Летягин А.Ю., Шевела А.И. Характеристики артикуляторных баз тюркских этносов южной Сибири (по данным цифровой рентгенографии и магнитно-резонансной томографии).Вестник ВЭГУ. 2011. T. (1), С. 123-133.
  33. Филиппов Н.С., Ломзов А. А., Пышный Д.В. Влияние олигонуклеотида-стоппера на размер и термическую стабильность конкатемерных ДНК-комплексов.Вестник НГУ. Серия: Физика. 2011. T. 6(4), С. 115-124.
  34. Новопашина Д.С., Холодарь С.А., Апарцин Е.К., Мещанинова М.И., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Веньяминова А.Г. Новые инструменты для детекции точечных мутаций ДНК.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(1), С. 15-20.
  35. Тарасенко К.Л., Седых С.Е., Бунева В.Н., Невинский Г.А. Каталитическая полиреактивность абзимов молока человека.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(1), С. 30-35.
  36. Березовой А.Э., Шевела А.И., Гатилов А.В. Современные функциональные методы исследования в колопроктологии.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(1), С. 208-217.
  37. Майбородин И.В., Якимова Н.В., Матвеева В.А., Ткачук О.К., Майбородина Е.И., Пекарева Е.О. Рубец матки крыс после введения мезенхимальных стволовых клеток.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 24-31.
  38. Макогон А.В., Вараксин Н.А., Пикалов И.В., Андрюшина И.В. Коагуляционный статус и системная воспалительная реакция у плода с гемолитической болезнью.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 70-74.
  39. Махотин А.А., Махотина Н.Е., Шевела А.И. Оптимизация протокола ранней неинвазивной диагностики эктопической беременности.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 82-86.
  40. Дмитриенко Е.В., Булушев Р.Д., Ломзов А.А., Косолобов С.С., Латышев А.В., Пышная И.А., Пышный Д.В. Наноструктурированные полимерные матриксы для селективного распознавания биомолекул. Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 100-108.
  41. Виноградова О.А., Щеглов Д.В., Латышев А.В., Пышный Д.В. Изучение структурной организации конкатамерных комплексов на основе нативных и модифицированных дцДНК-блоков. Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 109-117.
  42. Антипов В.А., Красильников С.Э., Сисакян В.Г., Майбородин И.В., Герасимов А.В. Особенности подвздошных лимфатических узлов при раке шейки матки после абдоминальной трахелэктомии.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 147-150.
  43. Майбородин И.В., Шеплев Б.В., Дровосеков М.Н., Колесников И.С., Козодий Д.М., Выборнов М.С., Колмакова И.А., Тодер М.С. Использование фибринового сгустка для регенерации поврежденной кости в эксперименте.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 195-202.
  44. Кох Н.В., Воронина Е.Н., Пасман Н.М., Филипенко М.Л., Лифшиц Г.И. Исследование ассоциации полиморфизмов генов наследственной тромбофилии с развитием осложнений беременности.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(2), С. 257-257.
  45. Марченко А.К., Попова Н.А., Рябчикова Е.И. Изучение морфофункциональных особенностей асцитной формы гепатомы А-1.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(4), С. 83-92.
  46. Майбородин И.В., Шевела А.И., Береговой Е.А., Матвеева В.А., Баранник М.И., Дровосеков М.Н., Кузнецова И.В. Результаты внутрисуставной имплантации пленок из полигидроксиалканоата в эксперименте.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(4), С. 93-99.
  47. Кох Н.В., Цветовская Г.А., Новикова Я.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Лифшиц Г.И. Вклад генетических маркеров в изменение терапевтической дозировки варфарина.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(4), С. 148-155.
  48. Ткачева Н.А., Черноносов А.А., Кох Н.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Лифшиц Г.И., Федорова О.С. Исследование влияния генотипа VKORC1 c1173t и CYP2C9*2, *3 на фармакокинетические параметры метаболизма варфарина.Вестник НГУ. Серия: Биология, клиническая медицина. 2011. T. 9(4), С. 155-160.
  49. Михайлова Г.Р., Мазуркова Н.А., Подчерняева Р.Я., Рябчикова Е.И., Трошкова Г.П., Шишкина Л.Н. Морфологическая и кариологическая характеристики клеток MDCK и VERO (B) при культивировании в питательных средах на основе растительных гидролизатов.Вопросы вирусологии. 2011. T. 56(2), С. 9-14.
  50. Джиоев Ю.П., Парамонов А.И., Демина Т.В., Козлова И.В., Верхозина М.М., Ткачев С.Е., Приставка А.А., Саловарова В.П., Злобин В.И. Обнаружение рекомбинаций у вируса клещевого энцефалита с помощью компьютерного анализа вирусных геномов Вопросы вирусологии. 2011. T. 56(2), P. 14-18.
  51. Морозова О.В., Гришечкин А.Е., Карань Л.С., Исаева Е.И., Щучинова Л.Д., Логинова Н.В., Злобин В.И. Детекция вируса клещевого энцефалита в иксодовых клещах, собранных в природном очаге Горного Алтая.Вопросы вирусологии. 2011. T. 56(2), С. 23-26.
  52. Пономарева А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Скворцова Т.Э., Добродеев А.Ю., Литвяков Н.В., Завьялов А.А., Тузиков С.А., Власов В.В., Лактионов П.П. Анализ уровня метилирования гена RARβ2 в циркулирующих ДНК крови у больных раком легкого как потенциального прогностического маркера.Вопросы онкологии. 2011. T. 57(3), C. 302-307.
  53. Ермоленко Н.А., Боярских У.А., Сушко А.Г., Воронина Е.Н., Селезнева И.А., Синкина Т.В., Лазарев А.Ф., Петрова В.Д., Филипенко М.Л. Исследование влияния однонуклеотидных замен в генах MNSOD, GPX1 и GSTP1 на риск развития семейного и спорадического рака молочной железы у жительниц Алтайского края Российской Федерации.Генетика 2011. T. 46(12), С. 1685-1691.
  54. Кабилова Т.О., Владимирова А.В., Зенкова М.А., Черноловская Е.Л., Власов В.В. Антипролиферативное и интерферон-индуцирующее действие уникальной короткой двуцепочечной РНК.Доклады Академии Наук. 2011. T. 436(3), С. 412-416.
  55. Мечетин Г.В., Жарков Д.О. Механизм поиска субстратов ферментами эксцизионной репарации оснований.Доклады Академии Наук. 2011. T. 437(5), C. 695-698.
  56. Субота И.Ю., Арзиев А.Ш., Невинский Г.А., Константинов Ю.М. Влияние редокс-условий на синтез и фосфорилирование β-субъединицы F0F1-АТФ-синтазы митохондрий кукурузы (Zea mays).Доклады Академии Наук. 2011. T. 438(5), С. 711-713.
  57. Карпова Е.К., Грунтенко Н.Е., Шумная Л.В., Романова И.В, Раушенбах И.Ю. Роль Д2-подобных рецепторов в регуляции метаболизма ювенильного гормона у самок Drosophila в норме и при повышении уровня дофамина. Доклады Академии Наук. 2011. T. 439(1), С. 126-129.
  58. Нечепуренко И.В., Боярских У.А., Комарова Н.И., Половинка М.П., Филипенко М.Л., Лифшиц Г.И., Салахутдинов Н.Ф., Толстиков Г.А. Влияние берберина и его бром- и иодпроизводных на уровень экспрессии гена рецептора ЛПНП в клетках HepG2. Доклады Академии Наук. 2011. T. 439(3), С. 346-350.
  59. Кузнецов Н.А., Козырь А.В., Дронина М.А., Смирнов И.В., Калиберда Е.Н., Михайлова А.Г., Румш Л.Д., Фёдорова О.С., Габибов А.Г., Колесников А.В. Предстационарная кинетика взаимодействия протеазы вируса иммунодефицита человека и ее мультирезистентного мутанта с ингибиторами I и II поколений.Доклады Академии Наук. 2011. T. 440(6), С. 842-847.
  60. Смагина И.В., Ельчанинова С.А., Золовкина А.Г., Игнатова Ю.Н., Кудрявцева Е.А. Генетические факторы риска рассеянного склероза в популяции Алтайского края.Журнал неврологии и психиатрии им. Корсакова. 2011. T. 5, С. 42-45.
  61. Осадчий С.А., Шубин В.Г., Козлова Л.П., Варламенко, В.С., Филипенко М.Л., Боярских У.А. Усовершенствование способов получения этидия бромистого и синтез этидия этилсульфата - нового флуоресцентного красителя для обнаружения нуклеиновых кислот.Журнал прикладной химии 2011. T. 84(9), С. 1491-1498.
  62. Сапрыгина Н.H., Морозова О.Б., Грицан Н.П., Федорова О.С., Юрковская А.В. Исследование кинетики и механизма обратимой реакции фотоиндуцированного окисления дипептида триптофил-триптофан в водных растворах методом 1Н ХПЯ.Известия АН. Серия химическая. 2011. T. 60(12), C. 2529-2536.
  63. Иванов К.Л., Коваль В.В., Лукзен Н.Н. Кинетический анализ поиска ферментом репарации повреждённых оснований ДНК: теоретическое исследование диффузионно-контролируемых стадий. Известия АН. Серия химическая. 2011. T. 60(12), С. 2569-2572.
  64. Шелковников В.В., Лоскутов В.А., Васильев Е.В., Шеклеина Н.В., Рябинин В.А., Синяков А.Н. Новые фотогенераторы кислоты на основе сульфониевых производных тиоксантенон-9-она для детритилирова-ния в процессе синтеза олигонуклеотидов. Известия АН. Серия химическая. 2011. T. (3), C. 548-556.
  65. Лифшиц Г.И., Данилкина С.Т., Гуськова Е.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Ассоциация генов, кодирующих белки гемостаза, с параметрами периферического гемостаза и предрасположенностью к атеротромбозам у пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями.Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2011. T. 10(4), С. 90-95.
  66. Майбородин И.В., Шевела А.И., Колесников И.С., Дровосеков М.Н., Тодер М.С., Шевела А.А., Бромбин А.И., Береговой Е.А. Особенности применения стволовых клеток для регенерации костной и хрящевой ткани.Клеточные технологии в биологии и медицине. 2011. T. (3), С. 123-131.
  67. Вайнер А.С., Жечев Д.А., Кечин А.А., Кудрявцева Е.А., Гордеева Л.А., Воронина Е.Н., Шабалдин А.В., Филипенко М.Л. Метаболизм фолатов и врожденные аномалии развития. Мать и дитя в Кузбассе. 2011. T. 2(45), С. 3-10.
  68. Вайнер А.С., Кудрявцева Е.А., Жечев Д.А., Кечин А.А., Гордеева Л.А., Воронина Е.Н., Боярских У.А., Шабалдин А.В., Филипенко М.Л. Исследование ассоциации полиморфизма генов фолатного обмена с риском врожденных аномалий развития.Мать и дитя в Кузбассе. 2011. T. 3(46), С. 10-16.
  69. Махотин А.А., Рябиков А.Н., Кормилкин А.И., Шевела А.И. Интракавитальное ультразвуковое исследование в алгоритме ультразвуковой диагностики каменной обструкции мочеточников.Медицинская визуализация. 2011. T. (1), С. 83-96.
  70. Мезенцева М.В., Морозова О.В., Антошина И.Ф., Подчерняева Р.Я., Шаповал И.М., Злобин В.И. Экспрессия генов цитокинов при клещевом энцефалите у людей.Медицинская иммунология. 2011. T. 13(4-5), С. 399-400.
  71. Вихрова М.А., Морозова В.В., Хлусевич Я.А., Тикунова Н.В. Комбинаторные библиотеки фаговых антител: использование для анализа генных сегментов, кодирующих вариабельные домены аутоантител к фактору некроза опухолей.Молекулярная биология. 2011. T. 45(1), С. 96-107.
  72. Пономарева А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Чойнзонов Е.Л., Лактионов П.П., Власов В.В. Молекулярно-генетические маркеры в диагностике рака легкого.Молекулярная биология. 2011. T. 45(2), C. 203-217.
  73. Закабунин А.И., Камынина Т.П., Ходырева С.Н., Пышная И.А., Пышный Д.В., Храпов Е.А., Филипенко М.Л. Клонирование генов и выделение рекомбинантных ДНК-лигаз термофильных археев Pyrococcus abyssi и Methanobacterium thermoautotrophicum.Молекулярная биология. 2011. T. 45(2), С. 258-266.
  74. Жигайлов А.В., Бабайлова Е. С., Полимбетова Н. С., Грайфер Д.М., Карпова Г.Г., Искаков Б.К. Возможное участие 3’-концевого сегмента 18S рРНК в процессе инициации трансляции некепированных мРНК у растений.Молекуляр. биология. 2011. T. 45(2), С. 325-334.
  75. Воробьев Ю.Н. Метод молекулярной динамики белков с учетом ионизационно-конформационной связи и равновесного титрования.Молекуляр. Биология. 2011. T. 45(2), С. 346-355.
  76. Боярских У.А., Кондрахин Ю.В., Евшин И.С., Шарипов Р.Н., Комельков А.В.,Мусаткина Е.А., Чевкина Е.М., Сукоян М.А., Колпаков Ф.А., Кашкин К.Н., Филиппенко М.Л. Прогнозирование чувствительности клеток немелкоклеточного рака легких к действию цисплатина и паклитаксела на основании уровня экспрессии маркерных генов.Молекулярная Биология. 2011. T. 45(3), С. 1-10.
  77. Захаренко А.Л., Суханова М.В., Ходырева С.Н., Новиков Ф.Н., Стройлов В.С., Нилов Д.К., Чилов Г.Г., Швядас В.К., Лаврик О.И. Усовершенствованная процедура поиска потенциальных ингибиторов поли(АДФ-рибозо)полимеразы 1 с использованием молекулярного докинга.Молекуляр. Биология. 2011. T. 45(3), С. 565–569.
  78. Иванов А.В., Малыгин А.А., Карпова Г.Г. Связывание рибосомного белка S13 человека с центральным доменом 18S рРНК.Молекуляр. биология. 2011. T. 45(6), С. 1046-1054.
  79. Дымова М. А., Ляшенко А.А., Потейко П.И., Кашуба Д.А., Стадникова А.В., Крутько В.С., Филипенко М.Л. Генетическое разнообразие штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории г. Харьковской области в Украине.Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 1, С. 19-23.
  80. Кушнир А. В., Муминов Т.А., Баев А.И., Храпов Е.А., Филипенко М.Л. Использование метода VNTR-типирования для оценки генетического разнообразия изолятов Neisseria gonorrhoeae.Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 1, С. 24-30.
  81. Морозова О.В., Гришечкин А.Е., Конькова-Рейдман А.Б. Количественные оценки ДНК боррелий и бартонелл и РНК вируса клещевого энцефалита в клещах Ixodes persulcatus, собранных в Челябинской обл. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 1, С. 35-38.
  82. Фоменко Н.В., Боргояков В.Ю., Панов В.В. Генетические особенности ДНК боррелий Borrelia miyamotoi, выявляемых в таежных клещах.Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 2, С. 12-17.
  83. Рар В.А., Епихина Т.И., Ливанова Н.Н., Панов В.В., Дорощенко Е.К., Пуховская Н.М., Высочина Н.П., Иванов Л.И. Изучение гетерогенности гена 16S рРНК и groESL оперона в образцах ДНК Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia muris и “Candidatus Neoehrlichia mikurensis”, выявленных в таежных клещах на территории Урала, Сибири и Дальнего Востока.Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 2, С. 17-23.
  84. Апалько С.В., Лунин В.Г., Филипенко М.Л., Матвеева В.А., Лящук А.М., Лаврова Н.В., Шерина Е.А., Аверьянов А.В., Костянко М.В., Глушков А.Н. Получение и характеристика рекомбинантного белка, содержащего пептид-иммуномиметик бензо[а]пирена.Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2011. № 2, С. 24-30.
  85. Вайнер А.С., Березина О.В., Воропаева Е.Н., Воронина Е.Н., Боярских У.А., Поспелова Т.И., Филипенко М.Л. Анализ ассоциации аллельных вариантов генов фолатного цикла с риском развития неходжкинской злокачественной лимфомы.Молекулярная медицина. 2011. T. 2, С. 39-47.
  86. Майбородин И.В., Егоров Д.В., Родишева Т.М., Стрельцова Е.И., Шевела А.И. Изменения тканей и регионарных лимфатических узлов крыс при хроническом воспалительном процессе в условиях применения интерлейкина-2.Морфология. 2011. T. 139(1), С. 43-48.
  87. Майбородин И.В., Шевела А.И., Анищенко В.В., Матвеева В.А., Шевела А.А., Дровосеков М.Н., Власов В.В. Особенности реакции тканей крыс на внутрибрюшинные имплантаты из биодеградируемого полигидроксиалканоата.Морфология. 2011. T. 139(2), С. 62-66.
  88. Дмитриенко Е.В., Булушев Р.Д., Пышная И.А., Пышный Д.В. «Слепки» жизни – полимеры с молекулярной памятью.Наука из первых рук. 2011. T. 37(1), 86-93.
  89. Рябчикова Е.И., Пышная И.А., Спицына Ю.Е. «Позолотить клетку». Наука из первых рук. 2011. T. 40(4), С. 10-13.
  90. Ливанова Н.Н., Ливанов С.Г., Панов В.В. Особенности распределения клещей Ixodes Persulcatus и Ixodes Pavlovskyi на границе лесной и лесостепной зон приобья.Паразитология. 2011. T. 45(2), С. 94-103.
  91. Лотков А.И., Псахье С.Г., Мейснер Л.Л., Матвеева В.А., Артемьева Л.В., Мейснер С.Н., Матвеев А.Л. Влияние химического состава и шероховатости поверхности никелида титана на пролиферативные свойства мезенхимальных стволовых клеток.Перспективные материалы. 2011. T. (4), С. 42-53.
  92. Шушарин А.Г., Прохоренко В.М., Шевела А.И. Лечение коксартроза с использованием синовиального протезирования.Политравма. 2011. T. (2), С. 20-25.
  93. Щеглова Т.В., Толмачева А.С., Овчинникова Л.П., Синицина О.И., Василенко Н.Л., Бунева В.Н., Невинский Г.А. Супероксидисмутазная, каталазная, пероксидазная и Н2О2-независимая оксидоредуктазная активности антител из крови здоровых крыс WISTAR.Российский иммунологический журнал. 2011. T. 5(1), С. 11-20.
  94. Безуглова А.М., Бунева В.Н., Невинский Г.А. Системная красная волчанка: моноклональные легкие цепи иммуноглобулинов против основного белка миелина обладают протеолитической и ДНКазной активностью.Российский иммунологический журнал. 2011. T. 5(3-4), С. 215-227.
  95. Юшков Ю.Г., Филипенко М.Л., Афонюшкин В.Н., Вольф В.Т., Дударева Е.В.,Тронева А.В., Леонов С.В. Анализ вариабельных тандемных повторов для типирования Salmonella enterica.Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. 2011. T. (3-4), С. 94-99.
  96. Глотова Т.И., Сильников В.Н., Кунгурцева О.В., Тихонов В.Л., Донченко А.С., Глотов А.Г. Пептидоподобное соединение, обладающие противовирусной активностью.Сиб. Вестник Сельскохозяйственной науки. 2011. T. (9-10), С. 90-95.
  97. Пономарева А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Cкворцова Т.Е., Добродеев А.Ю., Литвяков Н.В., Завьялов А.А., Тузиков С.А., Власов В.В., Лактионов П.П. Сравнительный анализ эпигенетических и белковых маркеров в крови больных немелкоклеточным раком легкого.Сибирский онкологический журнал. 2011. T. 5(47), С. 40-45.
  98. Березина О.В., Вайнер А.С., Воропаева Е.Н., Воронина Е.Н., Поспелова Т.И., Филиппенко М.Л. Влияние однонуклеотидных замен в генах фолатного цикла на риск развития агрессивных неходжкинских лимфом.Сибирское медицинское обозрение. 2011. T. 69(3), С. 22-26.
  99. Майбородин И.В, Колесников И.С., Шевела А.И., Шеплев Б.В., Дровосеков М.Н., Тодер М.С. Влияние фибринового сгустка при повреждении кости нижней челюсти в эксперименте.Стоматология. 2011. T. 90(4), С. 9-12.
  100. Майбородин И.В., Шевела А.И., Береговой Е.А., Матвеева В.А., Ангельский А.А., Дровосеков М.Н. Внутрисуставная имплантация материалов из биодеградируемых полигидроксиалканоатов в эксперименте.Травматология и ортопедия России. 2011. T. 59(1), С. 67-75.
  101. Воробьева М.А., Давыдова А.С., Веньяминова А.Г. Искусственные рибозимы «головка молотка»: дизайн и применение.Успехи химии. 2011. T. 80(2), С. 139-156.
  102. Абрамова Т.В., Сильников В.Н. Синтез и свойства модифицированных по углеводофосфатному остову аналогов олигонуклеотидов и миметиков нуклеиновых кислот.Успехи химии 2011. T. 80(5), C. 452-476.
  103. Майбородин И.В., Шевела А.И., Баранник М.И., Кузнецова И.В., Егоров Д.В., Стрельцова Е.И. Действие интерлейкина-2 и имплантации инородного тела на состояние тканей и регионарных лимфатических узлов крыс.Фундаментальные исследования. 2011. T. (11), С. 60-66.
  104. Майбородин И.В., Колесников И.С., Козодий Д.М., Выборнов М.С., Шевела А.И., Шевела А.А., Шеплев Б.В., Дровосеков М.Н., Колмакова И.А., Тодер М.С. Возможность ускорения репаративных процессов в костных тканях в результате применения фибрина.Фундаментальные исследования. 2011. T. (2), С. 98-105.
  105. Майбородин И.В., Дровосеков М.Н., Тодер М.С., Матвеева В.А., Колесников И.С., Шевела А.И. Регенерация поврежденной кости нижней челюсти крыс на фоне введения аутологичных мезенхимальных стволовых клеток костномозгового происхождения.Фундаментальные исследования. 2011. T. (9), С. 264-269.
  106. Майбородин И.В., Шевела А.И., Береговой Е.А., Дровосеков М.Н., Матвеева В.А., Баранник М.И., Кузнецова И.В. Имплантация биодеградируемого полигидроксиалканоата в полость поврежденного сустава крысы.Фундаментальные исследования. 2011. T. (10), С. 107-114.
  107. Королева Л.С., Свищёва Н.С., Буракова Е.А., Грибкова Н.В., Шмелева Н.П., Рустамова Л.М., Сабынин В.М., Сильников В.Н. Синтез и противогрипозная активность искусственных рибонуклеаз.Химико-фармацевтический журнал 2011. T. 44(12), C. 31-34.
  108. Майбородин И.В., Шевела А.И., Шевела А.А., Шеплев Б.В., Колесников И.С., Дровосеков М.Н., Тодер М.С., Баранник М.И., Марчуков С.В. Результаты использования полигидроксиалканоатов при повреждении кости нижней челюсти в эксперименте.Хирургия, морфология, лимфология. 2011. T. 8(15), С. 69-74.
  109. Гришечкин А.Е., Морозова О.В., Щучинова Л.Д., Исаева Е.И., Логинова Н.В., Злобин В.И. Анализ клещевых инфекций в Республике Алтай.Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2011. T. 57(2), С. 12-16.
  110. Осаковский В.Л.,Филипенко М.Л., Сивцева Т.М., Платонов Ф.А. Генетика больных рассеянным склерозом, проживающих на территории Якутии.Якутский медицинский журнал. 2011. T. (2), С. 38-39.

Статьи в российских сборниках

  1. Репин В.Е. Межинститутский Центр коллективного пользования СО РАН. Коллекция экстремофильных микроорганизмов и типовых культур. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 24-25.
  2. Тикунова Н.В., Курильщиков А.М., Кабилов М.Р. Метагеномика кишечного микробиома человека. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 37.
  3. Курильщиков А.М., Бреннер Е.В., Фоменко Н.В. De novo реконструкция бактериальных геномов при комбинации секвенирующих платформ 454 FLX и ABI SOLiD. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 38-39.
  4. Дымова М.А., Храпов Е.А., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Исследование генетического разнообразие изолятов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории СНГ. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 41.
  5. Бреннер Е.В., Курильщиков А.М., Стронин О.В., Епанцинцев А.А., Фоменко Н.В. Секвенирование генома Borrelia garinii. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 42.
  6. Чикова Е.Д., Рыкова Е.Ю., Шкода О.С. Генетическая гетерогенность видов рода боррелия в Новосибирской области. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 43.
  7. Помазной М.Ю., Афонников Д.А., Васильев Г.В., Бреннер Е.В., Гусельников С.В., Брусенцов И.И., Наякшин А.М., Катохин А.В., Фурман Д.П., Сивков А.Ю., Татьков С.И., Мордвинов В.А. Секвенирование транскриптома возбудителя описторхоза Opistorchis felineus Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 47.
  8. Корчагина Р.П., Осипова Л.П., Вавилова Н.А., Ермоленко Н.А., Воронина Н.Е, Филипенко М.Л. Полиморфизм генов биотрансформации ксенобиотиков GSTM1, GSTT1, CYP2D6, вероятных маркеров риска онкологических заболеваний, в популяциях коренных этносов и русских Северной Сибири Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 74.
  9. Миронова Н.Л., Бреннер Е.В., Курильщиков А.М., Власов В.В., Зенкова М.А. Выявление циркулирующих микроРНК, регулирующих процессы метастазирования, как мишеней РНКазы А. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 75.
  10. Лифшиц Г.И., Кирс Е., Малахина Е.С., Филипенко М.Л. Геномика онкологических заболеваний человека. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 76-77.
  11. Вайнер А.С., Воронина Е.Н., Боярских У.А., Филипенко М.Л. Поиск вариантов генов фолатного цикла, ассоциированных с риском развития неходжкинской злокачественной лимфомы. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 78.
  12. Оськина Н.А., Боярских У.А., Филипенко М.Л. Исследование генетической предрасположенности к раку предстательной железы у мужчин, проживающих в Западно-Сибирском регионе Российской Федерации. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 79.
  13. Боярских У.А., Храпов Х.Е., Филипенко М.Л. Исследование структуры генетической предрасположенности к раку молочной железы у женщин, проживающих в Западно-Сибирском регионе Российской Федерации. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 80.
  14. Семенов Д.В., Барякин Д.Н., Бреннер Е.В., Курильщиков А.М., Васильев Г.В., Чикова Е.Д., Филиппова Ю.А., Брызгалов Л.А., Кулигина Е.В., Рихтер В.А. Внеклеточные РНК человека в норме и при онкологии. Анализ массовым параллельным секвенированием на платформе SOLiD» Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 81.
  15. Морозкин Е.С., Лосева Е.М., Морозов И.В., Курильщиков А.М., Лактионов П.П., Власов В.В. Сравнительное исследование геномной и апоптической ДНК методом масштабного геномного секвенирования на платформе SOLiD™ (Applied Biosystems). Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 82-83.
  16. Скворцова Т.Э., Лебедева А.О., Морозкин Е.С., Власов В.В., Лактионов П.П. Влияние внеклеточной ДНК клеток HeLa на метилирование геномной ДНК первичных клеток. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 84.
  17. Невинский Г.А., Дмитренок П.С., Бунева В.Н. многообразие интеграза-гидролизующих IgG и IgM антител из крови ви ч-инфицированных больных. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 106.
  18. Бабайлова Е.С., Малыгин А.А., Хайрулина Ю.С., Шатский И.Н., Грайфер Д.М., Карпова Г.Г. Протеомные исследования белоксинтезирующего аппарата человека. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 107.
  19. Ходырева С.Н., Ильина Е.С., Суханова М.В., Кутузов М.М., Лаврик О.И. Масс-спектрометрия в протеомном анализе систем репарации ДНК в клетках человека. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 108-109.
  20. Коваль В.В., Смирнова Л.П., Иванова С.А., Федорова О.С. Протеомные маркеры социально значимых психических расстройств. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 110-111.
  21. Грин И.Р., Жарков О.Д., Ригер R.A. Р. Выявление функционально важного участка в структуре белка NEIL2 человека методами аффинной модификации и протеомного анализа. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 112.
  22. Воробьев Ю.Н. Механизм взаимодействия олигонуклеотидов с 3′-концевой областью тРНК-фен. Исследование методами компьютерного моделирования. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 142.
  23. Воробьев Ю.Н., Попов А.В. Разработка программных средств для биоинформатики и протеомики: программный комплекс BISON. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 143.
  24. Воробьев Ю.Н., Киселев Л.Л. Модель комплекса фактора терминации трансляции eRF1 в А-сайте со стоп-кодоном мРНК и тРНК в Р-сайте рибосомы. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 144-145.
  25. Попов А.В., Воробьев Ю.Н. Разработка программных средств для биоинформатики и протеомики: Интернет-версия программы метода молекулярной динамики GUI-BioPASED». Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 146.
  26. Попов А.В., Воробьев Ю.Н. Разработка программных средств для биоинформатики и протеомики: Интернет-версия программы полного слепого докинга: GUI-HBDock. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 147.
  27. Попов А.В., Воробьев Ю.Н. Разработка программных средств для биоинформатики и протеомики: интерактивная программа обработки молекулярно-динамических траекторий: MDTRA. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 148-149.
  28. Попов А.В., Воробьев Ю.Н. Разработка программных средств для биоинформатики и протеомики: интерактивная программа конструирования лигандов: Ligand-Constructor. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 150.
  29. Майбородин И.В., Шевела А.И., Морозов В.В., Новикова Я.В., Куликов В.Г., Севостьянова К.С. Разработка технологии управления процессами регенерации костных тканей с применением биодеградируемых полимеров. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 216-217.
  30. Майбородин И.В., Шевела А.И., Морозов В.В., Матвеева В.А., Новикова Я.В., Куликов В.Г., Севостьянова К.С. Фундаментальные основы клеточных технологий для регенеративной медицины. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 218.
  31. Фёдорова О.С., Лифшиц Г.И., Филипенко М.Л. Метаболомные подходы в лечении тромбозов и персонализированной терапии. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 222-223.
  32. Лифшиц Г.И., Новикова Я.В., Кох Н.В., Цветовская Г.А., Слепухина А.А., Белеванцева А.В. Геномный подход к персонализированной терапии непрямыми антикоагулянтами. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 224.
  33. Шевела А.И., Цветовская Г.А., Новикова Я.В., Севостьянова К.С., Куликов В.Г., Ненарочнов С.В., Махотин А.А., Чикова Е.Д. Диагностика тромбофилических состояний – артериальных и венозных тромбозов на стадии предболезни. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 225.
  34. Шевела А.И., Морозов В.В. Скрининг метаболических расстройств у детей. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 226.
  35. Рихтер В.А. Противоопухолевый препарат на основе пептида молока человека – лактаптина. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 227.
  36. Бабко А.Н. Летучие соединения в выдыхаемом воздухе и слюне при разном морфофизиологическом состоянии людей. Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»: инфраструктура и результаты. Новосибирск: ИЦиГ СО РАН, 2011.С. 228.

Материалы конференций
Материалы зарубежных конференций
Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components, Prague, 5-10th June, 2011 (сборник трудов)

  1. Novopashina D., Kholodar S., Venyaminova A. The method for the synthesis of new bifunctional conjugates of oligonucleotides. Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components, ISBN 978-80-86241-37-1. V. 12, P. 413-415.
  2. Davydova A., Vorobjeva M., Novopashina D., Francois J.-C., Venyaminova A. Optimization of cell SELEX protocol for 2'-F-modified RNA Aptamers. Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components, ISBN 978-80-86241-37-1. V. 12, P. 416-418.
  3. Tivanova A.S., Vorobjeva M.A., Novopashina D.S., Bezuglova A.M., Fokina A.A., Nevinsky G.A., Venyaminova A.G. RNA aptamer against autoreactive immunoglobulins assosiated with multiple sclerosis. Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components, ISBN 978-80-86241-37-1. V. 12, P. 419-420.
  4. Apartsin E., Novopashina D., Venyaminova A. Non-covalent hybrids of carbon nanotubes with oligonucleotides. Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components, ISBN 978-80-86241-37-1. V. 12, P. 421-423.
  5. Krasheninina O.A., Novopashina D.S., Lomzov A.A., Venyaminova A.G. 2'-Bispyrene oligo(2'-O-methylribonucleotides) as novel fluorescent probes for RNA detection. Coll. Symp. Ser. Chemistry of Nucleic Acid Components, ISBN 978-80-86241-37-1. V. 12, P. 424-426.

«Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum (CNAPS VII)». Madrid, 24-25th October, 2011

  1. Van der Vaart M., Semenov D.V., Kuligina E.V., Richter V.A., Pretorius P.J. Parallel tagged 454 sequensing for the characterization of circulating DNA. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, 2011. P. 29-34.
  2. Van der Vaart M., Semenov D.V., Kuligina E.V., Richter V.A., Pretorius P.J. Advanced Analysis of Human Plasma DNA Sequences Produced by Parallel Tagged Sequencing on the 454 Platform. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, 2011. P. 35-40.
  3. Semenov D.V., Stepanov G.A., Baryakin D.N., Koval O.A., Kuligina E.V., Richter V.A. Extracellular RNA as Regulators of Cellular Processes. Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum, 2011. P. 233-237.

Материалы российских конференций
«Рассеянный склероз: 30 лет спустя» V Сибирская межрегиональная научно-практическая конференция. Новосибирск, 4-6 февраля, 2011

  1. Кудрявцева Е.А., Рождественский А.С., Какуля А.В., Ханох Е.В., Делов Р.А., Малкова Н.А., Коробко Д.С., Платонов Ф.А., Арефьева Е.Г., Загорская Н.Н. Алиферова А.М., Бабенко С.А., Смагина И.В., Ельчанинова С.А., Золовкина А.Г., Пузырев В.П., Филипенко М.Л. Генетика рассеянного склероза. C. 32-33.
  2. Коробко Д.С., Кудрявцева Е.А., Малкова Н.А., Филипенко М.Л. Исследование роли полиморфизмов генов цитокинов как предикторов тяжести рассеянного склероза. С. 34-40.
  3. Ханох Е.В., Рождественский А.С., Кудрявцева Е.А., Какуля А.В., Делов Р.А., Филипенко М.Л. Влияние полиморфных вариантов генов TNF, KIF1B, CD40, TNFRS1A, IL-18 на особенности проявлений рассеянного склероза с учетом гендерной принадлежности в этнической группе русских. C. 41-44.
  4. Какуля А.В., Рождественский А.С., Ханох Е.В., Кудрявцева Е.А., Делов Р.А., Филипенко М.Л. Клинические и молекулярно-генетические особенности раннего дебюта рассеянного склероза в Омской области. С. 49-52

6-й Международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 21-24 марта, 2011

  1. Фомин А.С., Семенов Д.В., Коваль О.А., Кулигина Е.В., Рихтер В.А. Механизм индукции апоптоза клеток MCF-7под действием рекомбинантного аналога потенциального ротивоопухолевого пептида – лактаптина. 6-й Международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 21-24 марта, 2011. С. 52-55.
  2. Барякин Д.Н., Семенов Д.В. ALU и 7SL РНК индуцируют про-апоптотические процессы в клетках MCF-7 in vitro. 6-й Международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 21-24 марта, 2011. С. 48-49.
  3. Stepanov G.A., Semenov D.V., Koval O.A., Kuligina E.V., Richter V.A. Box C/D RNA Analogs as an Instrument of Regulation of Gene Expression in Human Cells. 6-й Международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 21-24 марта, 2011. С. 101-102.

XIV Всероссийская медико-биологическая конференция молодых исследователей «Фундаментальная наука и клиническая медицина – человек и его здроровье». Санкт-Петербург, 16 апреля, 2011

  • Фаттахов Н.С., Пархоменко Т.А. Каталитические активности абзимов у больных шизофренией. С. 277-278.

II Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Медико-биологические аспекты мультифакториальной патологии» Курск, 17-19 мая, 2011

  • Корчагина Р.П., Осипова Л.П., Воронина Е.Н., Ермоленко Н.А., Филипенко М.Л.Распределение частот полиморфных вариантов генов CYP2D6, GSTM1, GSTT1 – вероятных маркеров предрасположенности к развитию онкопатологий в популяциях нганасан Таймыра. C. 68-69.

XIV Всероссийский научный Форум с международным участием имени академика В.И. Иоффе «Дни иммунологии в Санкт-Петербурге». Санкт-Петербург, 23-26 мая, 2011

  • Бунева В.Н., Пархоменко Т.А., Одинцова Е.С., Невинский Г.А. Абзимы как маркеры вирусных иммунопатологий. Медицинская иммунология. Т. 13. № 4-5. С. 361-362.

«Интерфероны 2011», сборник научных трудов ФГБУ «НИИ ЭМ им. H.Ф.Гамалеи» Минздравсоцразвития России. Москва, 24 июля, 2011

  • Морозова О.В., Бахвалова В.Н., Чичерина Г.С., Потапова О.Ф., Е.И. Исаева. Экспрессия генов цитокинов у мышей в результате инфекции вирусом клещевого энцефалита или иммунизации инактивированными вакцинами против клещевого энцефалита. «Интерфероны 2011», сборник научных трудов ФГБУ «НИИ ЭМ им. H.Ф.Гамалеи» Минздравсоцразвития России. Москва, 24 июля, 2011. С. 51-57.

Международная конференция «Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний». Улан-Удэ, 5 -16th September, 2011

  • Морозова О.В., Рогозин Д.Ю., Саранина И.В., Зыков В.В., Калугин И.А. Анализ бактерий озера Шира. С. 133-134.

Научно-практическая конференция с международным участием «Современные аспекты природной очаговости болезней», посвященной 90-летию ФГУН ОмскНИИПОИ Роспотребнадзора. г. Омск, 1-3 ноября 2011 (сборник трудов)

  • Козлова, М.М. Верхозина, Т.В, Демина, Ю.П. Джиоев, Л.С. Карань, С.Е. Ткачев, Е.К. Дорощенко, О.В. Лисак, В.А. Борисов, М.К. Туваков, В.И. Злобин. Этиология клещевого энцефалита в Иркутской области. Национальные приоритеты России. Специальный выпуск. С. 146-147.

Тезисы докладов на конференциях и симпозиумах
Тезисы конференций, опубликованные в журналах, цитируемых в Web of Science

  1. Markov A.V., Logaschenko E.B., Kaledin V.I., Nikolin V.P., Popova N.A., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Anticancer and anti-inflammatory activities of novel derivative of glycyrrhetinic acid (SG). Febs J. 2011. V. 278. P. 16.
  2. Ilina E.S., Sukhanova M.V., Kutuzov M.M., Lavrik O.I., Khodyreva S.N. New players in recognition of intact and cleaved AP sites: searching and identification with AP DNA.Febs J. 2011. V. 278. P. 23.
  3. Belousova E.A., Lebedeva N.A., Maga G., Lavrik O.I. TLS activity of X-family DNA polymerase beta and lambda.Febs J. 2011. V. 278. P. 97.
  4. Dyakonova E., Fedorova O., Koval V. Dynamic characteristics of S.cerevisiae Apn 1 interaction with DNA investigated by stopped-flow fluorescence method.Febs J. 2011. V. 278. P. 103.
  5. Dyrkheeva N.S., Khodyreva S.N., Lavrik O.I. 3’-5’ Exonuclease and DNA-binding activity of Ape1: impact of interaction with other proteins.Febs J. 2011. V. 278. P. 104.
  6. Lukina M.V., Koval V.V., Zharkov D.O., Fedorova O.S. Stopped-flow FRET analysis of DNA structural dynamics upon interaction with mutant form C253I of human 8-oxoguanine DNA glycosylase.Febs J. 2011. V. 278. P. 116.
  7. Mironova N., Patutina O., Vlassov V., Zenkova M. Anticancer therapeutics on the base of RNase A and DNase 1.Febs J. 2011. V. 278. P. 221.
  8. Cherepanova А., Bushuev А., Taranin А., Vlassov V., Laktionov P. DNA inhibition of dsRNA-dependent immune response in gingival fibroblasts.Febs J. 2011. V. 278. P. 295.
  9. Koval O.A., Fomin A.S., Kaledin V.I., Potapenko M.O., Semenov D.V., Kuligina E.V., Richter V.A. Therapy of mouse cancer models using a recombinant analogue of lactaptin.Febs J. 2011. V. 278. P. 330.
  10. Serpokrylova I.Y., Koroleva L.S., Sil’nikov V.N. Design of peptide-oligonucleotide conjugates as site-specific artificial ribonucleases.Febs J. 2011. V. 278. P. 337.
  11. Kuznetsov N., Fedorova O. Mechanism of DNA repair by 8-oxoguanine-DNA-glycosylase.Febs J. 2011. V. 278. P. 463.
  12. Markov O.V., Maslov M.A., Mironova N.L., Serebrennikova G.A., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Novel derivatives of cationic lipids for delivery of DNA and RNA into dendritic cells.Febs J. 2011. V. 278. P.466.
  13. Vorobjev Yu. N. Method of Molecular Dynamics for Proteins in the Ionization-Conformation Phase Space at Equilibrium Conditions at Constant pH.J. Biomol. Struct. Dyn. 2011. V. 28(6), P. 991-992.
  14. Kuznetsov N.A. and Fedorova O.S. Characterization of Fpg protein binding to DNA lesions using pyrrolocytosine fluorescence.J. Biomol. Struct. Dyn. 2011. V. 28(6), Р. 1099-1100.
  15. Lomzov A.A., Khalo I.V., Pyshnyi D.V. The Influence of Aliphatic Alcohols on Oligonucleotide Hybridization Albany 2011: J. Biomol. Struct. Dyn. 2011. V. 28(6), Р. 1130.

Тезисы зарубежных конференций «Cell Signal-omics 2011: Integrated cellular pathology Systems biology of human disease». Luxzemburg, 26-28th January, 2011

  1. Akimov I.A., Kabilova T.O., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L. Retardation of human cancer cells proliferation by siRNA targeted to the c-myc, N-myc, Her2, Cyclin B1 and PKC genes. P. 141.
  2. Logashenko E.B., Markov A.V., Salomatina O.V., Salakhutdinov N.F., Popova N.A., Kaledin V.I., Nikolin V.P., Zenkova M.A. Mechanism of action and anti-cancer activity of novel derivative of glycyrrhetic acids. P. 160.
  3. Mironova N.L., Markov O.A., Popova N.A., Kaledin B.B., Nikolin V.P., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Dendritic cells-based antitumor vaccines: opposite effects depending on application scheme. P. 161.
  4. Кovtonyuk L.V., Kabilova T.O., Ryabchikova E.I., Popova N.A., Nikolin V.P., Kaledin V.I., Zenkova M.A., Vlassov V.V., Chernolovskaya E.L. Immunostimulatory and anti-tumor effects of 22-nt double stranded RNA. P. 212.

EMBO/EMBL Symposium: Seeing is Believing – Imaging the Processes of Life. Heidelberg, Germany, 17-20th March, 2011

  • Liebmann T., Kruusmagi M., Bondar A., Scott L., Brismar H., Aperia A. An Uncharted Route for the Serotonin 1B Receptor in the Dendritic Tree. (постер, труды не печатались)

Responses to DNA damage: from molecular mechanism to human disease. Egmond aan Zee, The Netherlands, 3-8th April, 2011

  • Lavrik O.I., Krasikova Y.S., Sugasawa K., Rechkunova N.I. Molecular assembly of GGR-NER complexes studied by chemical approaches. P. 97.

Proteomic forum 2011. Berlin, Germany, 3-8th April, 2011

  • Khodyreva S.N., Ilina E.S., Sukhanova M.V., Kutuzov M.M., Lavrik O.I. Chemically reactive DNA-intermediates of DNA repair in study of DNA repair ensembles and in search/identification of new players. P. 281.

Albany 2011: The 17th Conversation. Albany, NY, USA, 14-18th June, 2011

  • Endutkin A.V., Derevyanko A.G., Zharkov D.O. Kinetics of the initial step of base excision repair in trinucleotide repeats. P. 1101-1102.

Annual Meeting of European Environmental Mutagen Society. Barcelona, Spain. 4-7th July 2011

  1. Lavrik O. New tools to track DNA repair proteins responsible for cell radiosensitivity. P. 93.
  2. Lebedeva N., Rechkunova N.I. Lavrik O.I. AP-site cleavage activity of Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1. P. 112.
  3. Alekseeva I. V., Koval V. V., Chernonosov F. F., Lukyanova T. V., Fedorova O. S. ESI-MS/MS for analysis of dried blood spots collected from infants with phenylketonuria. P. 124.
  4. Timofeyeva N.A., Koval V.V., Ishchenko A.A., Saparbaev M.K., Fedorova O.S. Kinetic mechanisms of APE1, APE1K98A and NΔ61APE1 in base excision repair and nucleotide incision repair pathways. P. 126.
  5. Kuznetsov N., Fedorova O. Insight into the catalytic mechanism of human 8-oxoguanine-DNA-glycosylase hOgg1. P. 133.

Gordon research conference. Genetic toxicology Lucca (Barga), Italy, 10-15th July, 2011

  • Lavrik O.I. The new activity of Tdp1 and its contribution to the repair of AP site.

12th International Congress on Amino Acids, Peptides and Proteins. Beijing, China. 01-05th August, 2011

  • Yarinich, L.A., Chubarov, A.S., Koroleva, L.S., Serpokrylova, I.Y., Silnikov, V.N., Godovikova, T.S. Cathepsin B-sensitive Peptide-Oligonucleotide Conjugates for Cancer Therapy. P. 61.

4th European Conference on Chemistry for Life Sciences Budapest, Hungary, 31th August-3th September, 2011

  1. Koroleva, L.S., Morozova, O.V., Burakova, E.A., Svisheva, N.S., Grishechkin, A.E., Isaeva, E.I., Bakhvalova, V.N., Silnikov, V.N. Cleavage of tick-born encephalitis virus RNA with artificial ribonucleases. P. 211.
  2. Popova T.V., Lisitsky V.A., Godovikova T.S. Synthesis of conjugates of polyunsaturated fatty acids with mono- and oligodeoxynucleotides. P. 215.
  3. Popova T.V., Lisitsky V.A., Chubarov A.S., Kasatkina N.S., Koptyug I.V., Knorre D.G., Godovikova T.S. Design of compounds having an enhanced tumor uptake, with polyethyleneimine as a carrier. P. 220.

6th Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology. Cambridge, UK, 4-7th September, 2011

  1. Abramova, T.V., Lomzov, A.A., Silnikov, V.N. Synthesis and properties of novel morpholine analogues of nucleic acids. P. 2
  2. Chernolovskaya E.L., Petrova N.S., Meshaninova M.I., Venyaminova A.G., Zenkova M.A., Vlassov V.V. Chemically modified siRNAs: structure-function relations. P. 17.
  3. Godovikova T.S., Popova Т.V., Chubarov A.S., Lisitsky V.A., Kasatkina N.S., Koptyug I.V., Knorre D.G., Silnikov V.N. Polyethylenemine-modified nucleic acids for tumor-targeting and intracellular delivery. P. 31.
  4. Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V. New approach for synthesis of achiral non-nucleotide phosphoramidite synthons for preparation of oligonucleotide derivities with different functional groups. P. 51.
  5. Silnikov V.N., Vasilyeva S.V., Konevetz D.A., Abramova T.V., Koroleva L.S. Synthesis of novel nucleoside derivatives containing for the post-synthetic functionalization of nucleic acids. P. 82.
  6. Vorobyeva M.A., Davydova A.S., Zenkova M.A., Francois J.-C., Venyaminova A.G. Cell-based SELEX of 2*-modified RNA aptamers against IGF-IR receptor. P. 94.
  7. Zenkova M., Nechaev S., Lutay A., Vlassov V. Non-enzymatic recombination of RNA. P. 102.

4th Oxford International Influenza Conference «Influenza 2011. Zoonotic influenza and human health» Oxford, 7-9th September, 2011

  • Goncharova E.P., Fedorova A.A., Vlassov V.V., Zenkova M.A. Inactivation of influenza virus with artificial ribonucleases. P. 41.

21st Annual Congress of European Respiratory Society. Amsterdam, 24-28th September, 2011

  • Ponomaryova A.A., Rykova E.Y., Cherdyntseva N.V., Skvortsova T.E., Dobrodeev A.Y., Zav’yalov A.A., Tuzikov S.A., Vlassov V.V., Laktionov P.P. RARβ2 methylation level in blood for lung cancer assessment. P. 339.

13th International ATPase Conference Na, K-ATPase and Related P-ATPase: Structure, Biology and Medicine. Pacific Grove, CA, USA, 27th September-02th October, 2011

  • Liebmann T., Bondar A., Kruusmagi M., Rigos C., Brismar H., Aperia A. A new look at Na+, K+-ATPase; on the move in the postsynaptic membrane. Poster #1830

2-ая Международная конференция. Астана Биотех 2011 Астана, 10-11 октября, 2011

  1. Дымова М.А., Филипенко М.Л., Храпов Е.А., Кудрявцева Е. Исследование генетического разнообразие изолятов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории стран СНГ.
  2. Дымова М.А., Филипенко М.Л. Исследование генетического разнообразие изолятов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории стран бывшего СНГ.
  3. Кушнир А.В. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов Neisseria gonorrhoeae, выделенных от пациентов, проживающих в городе Алматы (Казахстан).

Current Opinion in Structural Biology & DNA Repair Conference Amsterdam, the Netherlands, 16-18th October, 2011

  • Zharkov D.O., Mechetin G.V. Correlated cleavage of multiply damaged substrates by base excision repair enzymes: Assays, mechanisms, and interpretation. P. 010.

«Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum (CNAPS VII)». Madrid, 24-25th October, 2011

  1. Ponomaryova A.A., Rykova E.Y., Cherdyntseva N.V., Skvortsova T.E., Dobrodeev A.Y., Zav’yalov A.A., Tuzikov S.A., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Methylation status of RASSF1A and RARβ2 genes in the circulating DNA from lung cancer patients’ blood. P. 21.
  2. Morozkin E.S., Loseva E.M., Morozov I.V., Kuril’shikov A.M., Bondar A.A., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Comparative study of apoptotic and genomic DNA using massive parallel sequencing. P. 30.
  3. Cherepanova A.V., Kharkova M.V., Pogrebnoy P.V., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Inhibition of dsRNA-induced immune response by ODN analogs of circulating DNA. P. 32.
  4. Skvortsova T.E., Lebedeva A.O., Morozkin E.S., Vlassov V.V., Laktionov P.P. Tumor-derived extracellular DNA as factor affecting primary cell methylation. P. 33.
  5. Bryzgunova O.E., Laktionov P.P., Skvortsova T.E., Bondar A.A., Morozkin E.S., Lebedeva A.O., Vlassov V.V., Miller K., Krause H. Efficacy of bisulfite modification and DNA recovery in clinical samples with minute amounts of circulating DNA. P. 34.

Neuroscience 2011. Washington DC, USA, 12-16th November, 2011

  • Liebmann T., Bondar A., Kruusmagi M., Rigos C., Renner M., Triller A., Brismar H., Aperia A. Dynamics of Na,K-ATPase trafficking and synaptic targeting in dendrites. Poster #: 235.07/C34

Тезисы устных докладов на зарубежных конференциях The 3rd Asia Pacific Protein Association (APPA) Conference. Protein and beyond. Шанхай (КНР), 6-9th May, 2011

  • Karpova G.G. Human ribosome: structural organization of the functional sites. P. 47.

Annual Meeting of European Environmental Mutagen Society. Barcelona, Spain. 4-7th July 2011

  • Ilina E.S. Chemically reactive DNA in study of DNA repair proteins. Annual Meeting of European Environmental Mutagen Society. P. 40.

2nd Joint NIAID-ISTC Workshop on Bioinformatics Tools and Innovation through Collaboration. Москва, 29 августа-01 сентября, 2011

  • Рябинин В.А. A pandemic potential of type A influenza virus (H1N1) isolates circulating in human population. P. 35.

Albany 2011: The 17th Conversation. Albany, NY, USA, 14-18th June, 2011

  1. Zharkov D.O. Search of damaged bases by DNA repair enzymes: Random walks in one and three dimensions. P. 1095.
  2. Lomzov A.A. The Influence of Aliphatic Alcohols on Oligonucleotide Hybridization.

Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum (CNAPS VII). Madrid, 24-25th October, 2011

  • Rykova E.Y. Cell-free and cell-bound circulating nucleic acid complexes: mechanisms of generation, concentration and content. P. 3.
  • Semenov D.V. Profile of the circulating RNA in apparently healthy individuals obtained with massive parallel sequencing of total plasma RNA on SOLiD platform. P. 3-4.

International Conference «Ecology and Geochemical Activity of Microorganisms», Ulaanbaatar, Mongolia, 17-19th November, 2011

  • Morozova O.V. Analysis of culturable eubacteria of Antarctic. P. 160.

IV International meeting «Early events in human pathologies», Yerevan, Armenia, 12-16th October, 2011

  1. Kutuzov M.M. Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates. P. 383-386.
  2. Lavrik O.I. AP site recognition by poly(ADP-ribose) polymerase 1 and other key proteins of human cells. P. 415.

Leiden International Medical Student Conference «Key to the Future», Leiden, 17-20th March, 2011

  • Kovtonyuk L. Immunostimulatory and anti-tumor effects of 22-nt doublestrand RNA. P. 88.

Safed Summer Workshop «DNA search: from biophysics to cells», Israel, 11-14th September, 2011

  • Fedorova O.S. Understanding the mechanisms of damage recognition by DNA repair enzyme Fpg protein from E. coli.

The 3rd Asia Pacific Protein Association (APPA) Conference. Protein and beyond. Шанхай (КНР), 6-9th May, 2011

  • Karpova G. Human ribosome: structural organization of the functional sites. P. 47.

Wilhelm Bernhard Workshop. Riga, Latvia, 25-29th August, 2011

  • Khodyreva S.N. DNA repair mechanisms providing human genome stability: new activities and pathways. P. 61.

XVth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components. Cesky Krumlov, Czech Republic, 5-10th Juny, 2011

  • Vasilyeva S.V. Synthesis of novel nucleoside derivatives containing precursor alkyne or amino groups for the post-synthetic fictionalization of nucleic acids. P. 130-134.

Международная конференция «Молекулярная биология – медицине». Киев, Украина, 12-16th September, 2011

  • Зенкова М.А. Геномные и постгеномные технологии преодоления MDR1-опосредованной множественной лекарственной устойчивости опухолевых клеток. C. 4.
  • Черноловская Е.Л. Специфические ингибиторы экспрессии генов на основе интерферирующих РНК. C. 5.
  • Ходырева С.Н. Новые белковые факторы, узнающие апуриновые/апиримидиновые сайты в ДНК в процессах репарации. C. 6.

СBMTS Industry VII, World Congress on Chemical, Biological and Radiological Threat and Terrorism. Cavtat, Croatia, 5-10th April, 2011

  • Ryabchikova E. Interaction of gold nanoparticles with HeLa cells. P. 50.

13th International ATPase Conference Na, K-ATPase and Related P-ATPase: Structure, Biology and Medicine. Pacific Grove, CA, USA, 27th September-02th October, 2011

  • Liebmann T., Bondar A., Kruusmagi M., Rigos C., Brismar H., Aperia A. A new look at Na+, K+-ATPase; on the move in the postsynaptic membrane. P. 129.

Фундаментальные и прикладные аспекты воспаления. Минск (Беларусь), 27-28th October, 2011

  1. Майбородин И.В. Воспалительные изменения в подвздошных лимфатических узлах при первой стадии рака шейки матки. C. 12-16.
  2. Майбородин И.В. Хронический воспалительный процесс в условиях применения интерлейкина-2. C. 117-121.
  3. Майбородин И.В. Ангиогенез у крыс после введения мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток в участок хронического воспаления. C. 156-159.

Российские конференции Всероссийская научная конференция «Национальное достояние России» в рамках мероприятий Общероссийской общественной организации «Национальная система развития научно, творческой и инновационной деятельности молодежи России». Москва, 23-25 марта, 2011

  • Чубаров А.С. Молекулярные зонды для исследования процессов, протекающих при гипергомоцистеинемии, методами ЯМР-спектроскопии и магнитно-резонансной томографии. C. 921.

VI региональная конференция молодых ученых-онкологов, посвященная памяти академика РАМН Н.В. Васильева «Актуальные вопросы экспериментальной и клинической онкологии» Томск, 28 апреля 2011

  • Оськина Н.А., Боярских У.А., Лазарев А.Ф., Петрова В.Д., Ганов Д.И., Тоначева О.Г., Лифшиц Г.И., Филипенко М.Л. Исследование влияния полиморфных замен, локализованных в хромосомной области 8q24, на риск рака предстательной железы в Западно-Сибирском регионе России; мета-анализ.

Международная конференция «Модели инновационного развития фармацевтической и медицинской промышленности на базе интеграции университетской науки и индустрии». Долгопрудный, 12-13 мая, 2011

  1. Дымова М.А., Филипенко М.Л. Исследование генетического разнообразия изолятов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории стран бывшего СНГ.
  2. Кушнир А.В. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов Neisseria gonorrhoeae, выделенных от пациентов, проживающих в городе Алматы (Казахстан).

Российская Международная конференция «Дни иммунологии». Санкт-Петербург, 18-20 мая, 2011

  • Мезенцева М.В., Морозова О.В., Антошина И.Ф., Подчерняева Р.Я., Шаповал И.М., Злобин В.И. Экспрессия генов цитокинов при клещевом энцефалите у людей. С. 399.

Российская научно-практическая конференция: Current Topics in Organic Chemistry Новосибирск, 06-10 июня, 2011

  1. Popova T.V., Lisitsky V.A., Godovikova T.S. Synthesis of conjugates of polyunsaturated fatty acids with mono- and oligodeoxynucleotides. C. 45.
  2. Yarinich L.A., Koroleva L.S., Godovikova T.S., Silnikov V.N. Synthesis of fluorescently labeled peptides – substrates for the tumor accociated protease. C. 207.

IX Российская конференция иммунологов Урала, посвященная 90-летию профессора Л.Я. Эберта. Екатеринбург, 21-24 июня, 2011

  • Гордеева Ю.В., Симонова Т.А., Воронина Е.Н., Сутулина И.М., Филипенко М.Л. Сочетание материнских полиморфизмов генов IL1AR И GST T1 с врожденными пороками развития у плода и новорожденного.

II Международная конференция, посвященная 85-летию Академика Д.Г. Кнорре, Новосибирск, 25–29 июля, 2011 (сборник тезисов) (проведена ИХБФМ СО РАН)

  1. Лихолобов В.А., Пьянова Л.Г., Седанова А.В., Годовикова Т.С., Кнорре Д.Г. Аффинный углеродный сорбент для сорбционной терапии. С. 90.
  2. Godovikova T.S., Gerasimova Yu.V., Popova T.V., Chubarov A.S., Lisitsky V.A., Kasatkina N.S., Koroleva L.S., Silnikov V.N., Knorre D.G. Human Serum Albumin: Catalytic Activities and Practical Applications. С. 93.
  3. Абрамова Т.В., Ломзов А.А., Тарасенко Ю.В., Касакин М.Ф., Сильников В.Н. Морфолиновые аналоги нуклеиновых кислот. Дизайн, синтез, свойства и применение. С. 94.
  4. Шевелев Г., Епанчинцева А., Воробьев П. Разработка подхода к получению ДНК-аптамеров к рекомбенантному интерлейкину-4 человека. С. 99.
  5. Ломзов А.А., Хало И.В., Пышный Д.В. Влияние алифатических спиртов на гибридизационные свойства олигодезоксирибонуклеотидов. С. 100.
  6. Лукзен Н.Н., Иванов К.Л., Коваль В.В. Диффузионно-контролируемые стадии, предшествующие репарации ДНК, детектируемые по флуоресценции внутреннего триптофана репарирующего фермента. С. 101.
  7. Харитонов М., Воробьев П. Получение ДНК-аптамеров к пероксидазе из Armoracia rusticana. С. 103.
  8. Амирханов Р.Н., Зарытова В.Ф., Амирханов Н.В. Иммобилизация дуплексных фрагментов ДНК и пептидных нуклеиновых кислот на наночастицы двуокиси титана и коллоидного золота. С. 104.
  9. Амирханов Н.В., Амирханов Р.Н., Зарытова В.Ф. Доставка пептидных нуклеиновых кислот в клетки с помощью наночастиц двуокиси титана. С. 105.
  10. Апарцин Е.К., Новопашина Д.С., Зенкова М.А., Веньяминова А.Г. Подходы к получению нековалентных гибридов конкатамерных комплексов олигонуклеотидов с углеродными нанотрубками С. 106.
  11. Виноградова О.А., Щеглов Д.В., Латышев А.В., Пышный Д.В. Исследование структурной организации конкатамерных ДНК-комплексов методом атомно-силовой микроскопии. С. 107.
  12. Крашенинина О.А., Новопашина Д.С., Веньяминова А.Г. РНК-специфичные флуоресцентные зонды на основе 2'-биспиренильных конъюгатов олиго(2'- О-метилрибонуклеотидов) С. 110.
  13. Купрюшкин М.С., Пышный Д.В. Удобный способ получения ахиральных ненуклеотидных вставок для создания олигонуклеотидных производных. С. 111.
  14. Lisitsky V.A., Popova T.V., Godovikova T.S. Synthesis of conjugates of polyunsaturated fatty acids with mono- and oligonucleotides. С. 112.
  15. Kuznetsov N.A., Milov A.D., Isaev N.P., Vorobjev Yu.N., Koval V.V.,Dzuba S.A., Fedorova O.S., Tsvetkov Yu.D. Lesion-induced DNA structural changes detected by PELDOR spectroscopy. С. 113.
  16. Popova T.V., Lisitsky V.A., Chubarov A.S., Kasatkina N.S., Koptyug I.V., Knorre D.G., Godovikova T.S. Design of the polyethyleneimine-based nucleic acids conjugates having an enhanced tumor uptake. С. 115.
  17. Savelyeva A.V., Semenov D.V., Koval O.A., Kuligina E.V., Richter V.A. xpression, purification and characterization of recombinant analogue of human nucleophosmin 1 for subsequent transfection of mammalian cells by small non-coding RNAs. С. 117.
  18. Chernonosov A.A., Solov’eva L.I., Luk’yanets E.A., Fedorova O.S. Oxidative properties of dimeric oppositely charged Fe-Co phthalocyanine complex towards DNA. С. 119.
  19. Чубаров А.С., Шакиров М.М., Коптюг И.В., Кнорре Д.Г., Годовикова Т.С. Молекулярные зонды для исследования процессов, протекающих при гипергомоцистеинемии, методом ЯМР-спектроскопии. С. 120.
  20. Дмитриенко Е.В., Булушев Р.Д., Пышная И.А., Пышный Д.В. Отработка подхода к получению молекулярно импринтированных полимеров на биомолекулы. С. 121.
  21. Искаков Б.К., Жигайлов А.В., Грайфер Д.М., Бабайлова Е.С., Полимбетова Н.С., Карпова Г.Г. Комплементарные взаимодействия между мРНК и определенными участками 18S рРНК, экспонированными в составе 40S субчастиц рибосом пшеницы, повышают эффективность трансляции. С. 122.
  22. Репкова М.Н., Левина А.С., Исмагилов З.Р., Шикина Н.В., Нетесова Н.А., Евдокимов А.А., Мазуркова Н.А., Загребельный С.Н., Зарытова В.Ф. Противовирусные препараты на основе дезоксирибозимов и наночастиц диоксида титана. С. 124.
  23. Stepanov G.A., Semenov D.V., Koval O.A., Kuligina E.V., Richter V.A. rtificial Box C/D RNA as Regulators of RNA-processing machineries in human cells. С. 125.
  24. Alekseeva I.V., Meschaninova M.I., Koval V.V., Gabibov A.G., Fedorova O.S. Analysis of kinetic features of onconase by stopped flow method. С. 129.
  25. Dyakonova E., Koval V., Fedorova О. Dynamics and kinetics of interaction between S. cerevisiae Apn 1 and DNA. С. 130.
  26. Evdokimov A.N., Petruseva I.O., Pestryakov P.E., Lavrik O.I. Application of extended artificial DNA in study of NER machinery. С. 131.
  27. Иванов А.В., Малыгин А.А., Карпова Г.Г. Фрагменты рибосомного белка S13 человека, участвующие в его связывании с 18S рРНК и собственной пре-мРНК. С. 132.
  28. Ильин А.А., Яньшина Д.Д., Малыгин А.А., Карпова Г.Г. Связывание рибосомных белков S5, S16 и S18 человека с большим 3'-концевым доменом 18S рРНК. С. 133.
  29. Kutuzov M.M., Ame J.-C., Khodyreva S.N., Schreiber V., Lavrik O.I. Interaction of PARP2 with DNA structures mimicking DNA repair intermediates. С. 134.
  30. Lukina M.V., Koval V.V., Zharkov D.O., Fedorova O.S. DNA structural dynamics upon interaction with mutant form C253I of human 8-oxoguanine DNA glycosylase: fast kinetic stopped-flow FRET studies. С. 135.
  31. Морозова О.Б., Федорова О.С., Коваль В.В., Юрковская А.В. Моделирование «химической» репарации ДНК в реакции восстановления радикала гуанозина цистеином: изучение методом ХПЯ с временным разрешением. С. 136.
  32. Хайрулина Ю.С., Булыгин К.Н., Грайфер Д.М., Веньяминова А.Г., Воробьев Ю.Н., Фролова Л.Ю., Карпова Г.Г. Фрагменты фактора терминации трансляции eRF1, соседствующие со стоп-сигналом мРНК в декодирующем центре и с 3’-стороны от него. С. 137.
  33. Шарифулин Д.Е., Грайфер Д.М., Хайрулина Ю.С., Иванов А.В., Веньяминова А.Г., Карпова Г.Г. Фрагмент рибосомного белка S26, формирующий участок связывания мРНК на рибосоме человека. С. 138.
  34. Апалько С.В., Бакунина А.Ю., Матвеева В.А., Костянко М.В., Филипенко М.Л., Храпов Е.А., Глушков А.Н. ммунохимическая характеристика моноклонального антитела В2 in vitro и in silico. С. 139. (заочно)
  35. Baryakin D.N., Semenov D.V., Koval O.A., Kuligina E.V., Richter V.A. Alu and 7SL RNA affects viability of adenocarcinoma cells MCF-7. С. 140.
  36. Вайнер О.Б., Ковынев И.Б., Поспелова Т.И., Романов С.И., Вандышева Н.В., Лактионов П.П. Эффективная диагностика B-крупноклеточных лимфом, основанная на размер-специфичной сепарации клеток при помощи микроканальных кремниевых матриц. С. 141.
  37. Давыдова А.С., Воробьева М.А., Зенкова М.А., Франса Ж.-К., Веньяминова А.Г. Создание РНК-аптамеров к рецептору IGF-IR на поверхности клеток С. 142.Левина А.С., Репкова М.Н., Шацкая Н.В., Исмагилов З.Р., Шикина Н.В., Зарытова В.Ф. Получение нанокомпозитов, состоящих из TiO2-наночастиц с иммобилизованными олигонуклеотидами. С. 144.
  38. Matveeva V.A., Lotkov A.I. Meisner L.L., Artem’eva L.V., Matveev A.L., Meisner C.H. Influence of nickel titanium surface treated with single-component beams of zirconium, silicon or titanium ions on mesenchimal stem cells in vitro. С. 145.
  39. Лихолобов В.А., Пьянова Л.Г., Седанова А.В., Годовикова Т.С. Исследование поверхности модифицированных углеродных гемосорбентов физико-химическими методами. С. 148.
  40. Тиванова А.С., Воробьева М.А., Безуглова А.М., Фокина А.А., Невинский Г.А., Веньяминова А.Г. НК-аптамеры к аутоантителам, ассоциированным с рассеянным склерозом. С. 149.
  41. Fomin A.S., Semenov D.V., Koval O.A., Kuligina E.V., Potapenko M.O., Richter V.A. Biochemical features of MCF-7 cells apoptosis induced by recombinant analog of lactaptin. С. 150.
  42. Chernonosov A.A., Tkacheva N.A., Kokh N.V., Lifshits G.I., Fedorova O.S. MS/MS pharmacokinetic monitoring of oral anticoagulant warfarin in Siberia residents. С. 152.
  43. Шацкая Н.В., Левина А.С., Байбородин С.И., Репкова М.Н., Зарытова В.Ф. Наноразмерная система доставки блеомицина А5 в клетки. С. 153.
  44. Kanazhevskaya L.Yu., Koval V.V., Vorobjev Yu.N., Fedorova O.S. Conformational dynamics of abasic DNA upon interactions with AP endonuclease 1 revealed by stopped-flow fluorescence analysis. С. 155.

V Российский симпозиум «Белки и пептиды» Петрозаводск, 8-12 августа, 2011

  • Хайрулина Ю.С., Булыгин К.Н., Грайфер Д.М., Веньяминова А.Г., Воробьев Ю.Н., Фролова Л.Ю., Карпова Г.Г. Пептиды фактора eRF1, соседствующие со стоп-сигналом в составе терминационного комплекса 80S рибосом человека. C. 387.

Международная конференция по физической мезомеханике, компьюторному конструированию и разработке новых материалов. Томск, 5-9 сентября, 2011

  1. Матвеева В.А., Лотков А.И., Мейснер Л.Л., Артемьева Л.В., Мейснер С.Н., Матвеев А.Л. Влияние модификации поверхности никелида титана ионами циркония, кремния или титана на мезенхимальные клетки крысы in vitro. С. 381.
  2. Мейснер Л.Л., Лотков А.И., Матвеева В.А., Артемьева Л.В., Мейснер С.Н., Матвеев А.Л. Влияние ионного легирования и шероховатости поверхности на биосовместимость никелида титана. С. 382.

XI Всероссийская конференция с участием иностранных ученых «Проблемы мониторинга окружающей среды (EM-2011)», Кемерово, 24-28 Октября, 2011

  • аБериков В.Б., Пестунов И.А., Морозова О.В., Полякова Г.Л., Бахвалова В.Н., Панов В.В. Логико-вероятностное моделирование динамики заболеваемости клещевым энцефалитом в зависимости от природных факторов. С. 138.

«Актуальные вопросы онкогенетики». Москва, 26-27 Октября, 2011

  • Пономарева А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Скворцова Т.Э., Добродеев А.Ю., Литвяков Н.В., Завьялов А.А., Тузиков С.А., Власов В.В., Лактионов П.П. Оценка информативности эпигенетических и белковых маркеров в крови для диагностики немелкоклеточного рака легкого. C. 19.

Международный форум по нанотехнологиям. Москва, 26-28 октября, 2011

  • Romanov S.I., Pyshnyi D.V., Laktionov P.P. IV Sensors and filters based on silicon nano- and microchannel membranes for biomedical technologies.

Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Современные аспекты природной очаговости болезней», посвященная 90-летию ФГУН «Омский научно-исследовательский институт природноочаговых инфекций» Роспотребнадзора. Омск, 1-2 ноября, 2011

  1. Морозова О.В., Бахвалова В.Н., Потапова О.Ф., Гришечкин А.Е., Исаева Е.И. Исследование иммуногенного и защитного эффектов инактивированных вакцин против клещевого энцефалита (КЭ) по отношению к современным штаммам вируса КЭ.
  2. Бахвалова В.Н., Панов В.В., Чичерина Г.С., Морозова О.В. Анализ параметров паразитарной системы клещевого энцефалита в окрестностях Новосибирска и их влияния на заболеваемость населения с 1980 по 2010 гг.

I Всероссийская студенческая научная конференция с международным участием «Медико-биологические науки: достижения и перспективы» Томск, 10-11 ноября, 2011

  • Суровцева М.Н., Кудрявцева Е.А., Воронина Е.Н., Батухтина Е.И., Невидимова Т.И., Филипенко М.Л. Ассоциация 54-нуклеотидного тандемного повтора в гене hPer3 с зависимостью от психоактивных веществ у жителей Западно-Сибирского региона.

II научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика». Новосибирск, 14-17 ноября, 2011 (сборник тезисов)
(проведена ИХБФМ СО РАН)

  1. Белозерцева Л.А., Воронина Е.Н., Лифшиц Г.И., Кох Н.В., Филипенко М.Л. Исследование фармакогенетических основ резистентности к варфарину в западно-сибирском регионе России. C. 25.
  2. Вайнер А.С., Гордеева Л.А., Боярских У.А., Воронина Е.Н., Шабалдин А.В., Филипенко М.Л. Анализ ассоциации полиморфизма генов фолатного обмена с риском врожденных пороков развития. C. 27.
  3. Зарытова В.Ф., Левина А.С., Репкова М.Н., Шацкая Н.В., Амирханов Н.В., Амирханов Р.Н., Исмагилов З.Р., Шикина Н.В., Зиновьев В.В., Евдокимов А.А., Нетесова Н.А., Мазуркова Н.А., Загребельный С.Н., Байбородин С.И. Сайт-специфическая активность препаратов на основе наноматериалов и иммобилизованных ДНК и их аналогов. C. 38.
  4. Клименко Е.С., Запорожченко И.А., Милейко В.А., Морозкин Е.С., Кулинченко М.В., Лактионов П.П., Константинов Ю.М. Ксенотрансплантация митохондрий: перенос нагруженных чужеродной ДНК растительных митохондрий в клетки человека. С. 44.
  5. Кох Н.В., Цветовская Г.А., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Лифшиц Г.И. Вклад генетических маркеров в изменение индивидульной терапевтической дозировки варфарина. С. 50.
  6. Кушнир А.В., Храпов Е.А., Муминов Т.А., Баев А.И., Филипенко М.Л. Молекулярно-генетическая характеристика изолятов Neisseria gonorrhoeae, выделенных от пациентов из г. Алматы. C. 52
  7. Левина А.С., Васильева С.В., Сильников В.Н., Шацкая Н.В., Репкова М.Н., Зарытова В.Ф. Нанобиокомпозиты на основе наночастиц диоксида кремния, содержащие нуклеозид трифосфаты. C. 53.
  8. Репкова М.Н., Левина А.С., Исмагилов З.Р., Шикина Н.В., Евдокимов А.А., Мазуркова Н.А., Загребельный С.Н., Зарытова В.Ф. Нанобиокомпозиты, состоящие из наночастиц диоксида титана и антисенс-олигонуклеотидов. C. 66.
  9. Пономарева А.А., Рыкова Е.Ю., Чердынцева Н.В., Скворцова Т.Э., Морозкин Е.С., Добродеев А.Ю., Завьялов А.А., Тузиков С.А., Власов В.В., Лактионов П.П. Анализ ДНК-маркеров рака легкого в метагеноме крови. C. 67.
  10. Алексеева И.В., Коваль В.В., Черноносов А.А., Фёдорова О.С. Скрининг метаболических расстройств у детей. C. 77.
  11. Смирнова Л.П., Коваль В.В., Логинова Л.В., Федорова О.С. Протеомика сыворотки крови больных шизофренией выявила маркеры эндотелиальной дисфункции. С. 98.
  12. Амирханов Н.В., Мазуркова Н.А., Зарытова В.Ф. Противовирусная активность антисмысловых пептидных нуклеиновых кислот (PNA), иммобилизованных на наночастицы диоксида титана (TiO2). C. 150.
  13. Дымова М.А., Храпов Е.А., Киншт В.Н.,Чередниченко А.Г., Ляшенко А.А, Филипенко М.Л. Выявление генетического разнообразия Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на некоторых территориях стран СНГ. C. 200.
  14. Корчагина Р.П., Осипова Л.П., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Генетический полиморфизм цитохрома Р450 2С9, ответственного за метаболизм варфарина, в популяциях лесных и тундровых ненцев. С. 203.

Тезисы устных докладов на российских конференциях VI Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития». Москва, 21-25 Марта, 2011

  • Зенкова М.А. Терапевтические препараты на основе нуклеиновых кислот. C. 17-18.

XLIX Международная научная студенческая конференция «Студент и научно-технический прогресс». Новосибирск, 16-20 апреля, 2011

  1. Харитонов М.О. Получение ДНК-аптамеров к пероксидазе из armoracia rusticana. C. 97.
  2. Чубаров А.С. Молекулярные зонды на основе продуктов метаболизма гомоцистеина для ЯМР-спектроскопии и магнитно-резонансной томографии. C. 97.
  3. Лисицкий В.А. Синтез конъюгатов моно- и олигонуклеотидов с полиэтиленимином, несущим остатки полиненасыщенной жирной кислоты. C. 91.
  4. Шевелев Г.Ю. Получение ДНК-аптамеров к рекомбинантному интерлейкину-4 человека. C. 100.
  5. Торгашёва Н.А. Исследование эксцизионной репарации оснований ДНК в эмбриональном развитии морского ежа Strongylocentrotus intermedius. C. 207.
  6. Марченко А.К. Изучение структурно-функциональных особенностей асцитной формы гепатомы А-1. C. 242.
  7. Спицына Ю.Е. Изучение интернализации наночастиц золота клетками культуры HeLa. C. 253.

Российская (итоговая) конкурс-конференция студентов и молодых ученых «АВИЦЕННА–2011». Новосибирск, 14 апреля, 2011

  • Фаттахов Н.С. Связь каталитической активности антител у больных шизофренией с поздней дискенизией. С. 356-357.

VII Российская конференция по фундаментальной онкологии «Петровские чтения-2011». Санкт-Петербург, 22 апреля, 2011

  1. Оськина Н.А. Исследование генетической предрасположенности к развитию рака предстательной железы в Западно-Сибирском регионе Российской Федерации. C. 51-52.
  2. Рыкова Е.Ю. Уровень метилирования гена RARβ2 в циркулирующих ДНК как потенциальный фактор прогноза при раке легкого. C. 52-53.

Российско– немецкая конференция в рамках российско– немецкого года образования, науки и инноваций «Молекулярные основы инфекционных заболеваний». Новосибирск, 14-15 июня, 2011

  1. Миронова Н.Л. Антиметастатическая активность РНКазы и ДНКазы I. C 15.
  2. Черноловская Е.Л. Регуляция экспрессии генов, связанных с заболеванием, с помощью малых интерферирующих РНК. C. 16.
  3. Рябчикова Е.И. Патогенные вирусы: портреты и «автографы». C. 20.
  4. Зенкова М.А. Искусственная рибонуклеаза как универсальные вирусные активирующие агенты. C. 21.

II Международная конференция, посвященная 85-летию Академика Д.Г. Кнорре, Новосибирск, 24-29 июля, 2011

  1. Карпова Г.Г. Структурные основы узнавания стоп-кодона фактором терминации трансляции eRF1. С. 31.
  2. Грайфер Д.М. Фрагменты рибосомных белков, формирующие тонкую структуру мРНК-связывающего центра рибосомы млекопитающих. C. 32.
  3. Малыгин А.А. РНК-белковые взаимодействия при сборке головы малой субчастицы рибосомы человека. C. 33.
  4. Зарытова В.Ф. Доставка лекарственных средств в клетки с использованием наноматериалов. C. 37.
  5. Sinyakov A.N. Universal Oligonucleotide Microarray for Sub-typing of Influenza A Virus. C. 41.
  6. Amirkhanov N. Antisense peptide nucleic acids for early diagnosis of cancer by the methods of non-invasive molecular imaging. C. 42.
  7. Пышный Д.В. Молекулярные инструменты на основе составных олигонуклеотидных конструкций. C. 40.
  8. Морозкин Е.С. Сравнительный анализ внеклеточной и геномной ДНК с помощью флуоресцентной гибридизации in situ. C. 44.
  9. Черепанова А.В. Дезоксирибоолигонуклеотиды – эффективные ингибиторы иммунного ответа на дцРНК. C. 45.
  10. Глушков С.А., Брагин А.Г., Дымшиц Г.М., Ходырева С.Н., Лаврик О.И. Исследование влияний ДНК-полимеразы β на эффективность расщепления олигонуклеотидных структур флэпэндонуклеазой-1 (FEN-1). C. 46.
  11. Lavrik O.I. DNA repair mechanisms providing stability of human genome: new interactions, activities and pathways. C. 52.
  12. Nevinsky G.A., Dimitrienok P.S., Buneva V.N. Catalytic antibodies with proteolytic activity in norm and different pathologies. C. 53.
  13. Fedorova O.S. Physico-chemical characterization of DNA-glycosylase interaction with DNA by rapid flow fluorescence analysis. C. 54.
  14. Khodyreva S.N. New players in recognition of intact and cleaved AP sites: implication in DNA repair. C. 55.
  15. Жарков Д.О., Мечетин Г.В., Грин И.Р., Ендуткин А.В., Деревянко А.Г., Торгашёва Н.А. Репарация окислительных повреждений ДНК в клетках про- и эукариот: структуры, механизмы и функции. C. 57.
  16. Воробьёв Ю.Н. Исследование структурно-динамических особенностей ДНК-N-гликозилаз Fpg L. lactis и OGG1 человека методом молекулярной динамики. C. 58.
  17. Rechkunova N.I. Damage recognition and assembly of preincision complex in nucleotide excision repair pathway. C. 59.
  18. Pestryakov P. Effect of repair-associated proteins RPA, XPC and YB-1 on the cleavage of AP-site containing DNA by DNA-glycosylases NEIL1, NEIL2, AP-endonuclease 1 and tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1. C. 60.
  19. Sukhanova M.V. Ddc1 checkpoint protein and DNA polymerase ɛ interact with nick-containing DNA repair intermediate in cell free extracts of Saccharomyces cerevisiae. C. 61.
  20. Moor N.A. Kingdom-specific structure organization, active sites design and tRNA binding modes of phenylalanyl-tRNA synthetases. C. 62.
  21. Kuznetsov N.A. Insights into the mechanism of methionine γ-lyase from stopped-flow kinetics. C. 65.
  22. Timofeyeva N.A. Kinetics of APE1 and its mutants APE1K98A and NΔ61APE1 in BER and NIR pathways. C. 66.
  23. Lebedeva N.A., Rechkunova N.I., Lavrik O.I. AP-site cleavage activity of Tyrosyl DNA phosphodiesterase 1. C. 67.
  24. Belousova E.A. Multiple damage sites repair: participation of BER proteins. C. 68.
  25. Krasikova Y.S. Localization of XPC-HR23-B, XPA and RPA on damaged DNA in nucleotide excision repair. C. 69.
  26. Ilina E.S. Search of cell proteins reactive to apurinic/apyrimidinic sites reveals Ku antigen. C. 70.
  27. Новопашина Д.С. Флуоресцентные олигонуклеотидные зонды и их гибриды с углеродными нанотрубками для детекции и доставки НК. C. 71.
  28. Рыкова Е.Ю. Оценка статуса метилирования генов опухолевой супрессии RASSF1A и RARβ2 в циркулирующих ДНК крови у больных немелкоклеточным раком легкого. C. 72.
  29. Зенкова М.А. Доставка терапевтических нуклеиновых кислот в клетки млекопитающих. C. 76.
  30. Черноловская Е.Л. Интерферирующие РНК- ингибиторы экспрессии генов, связанных с заболеваниями. C. 77.
  31. Petruseva I.O. Bulky substituted DNA as analogs of NER substrates and affinity probes. C. 78.
  32. Морозова О.В. Генетические особенности квазивида вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) у иксодовых клещей, диких и лабораторных млекопитающих, а также человека. C. 80.
  33. Ткачев С.Е. Связь между аминокислотным составом белков штаммов вируса клещевого энцефалита и их биологическими свойствами. C. 81.
  34. Тикунова Н.В. Особенности гуморального ответа при рассеянном склерозе. C. 82.
  35. Koval O.A. Recombinant analogue of lactaptin supresses tumor growth and metastasis. C. 83.
  36. Рябчикова Е.И. Изучение взаимодействия наночастиц золота с эукариотическими клетками in vitro и vivo. C. 87.
  37. Миронова Н.Л. Поиск молекулярных мишеней РНКазы А, определяющих ее противоопухолевую и антиметастатическую активность. C. 88.
  38. Logashenko E.B. In vivo and in vitro activities of novel glycyrrhetinic acid derivative methyl 2-cyano-3,12-dioxo-11deoxo-18SH-glycyrrhet-1(2), 9(11)-dienoate (SG). C. 89.
  39. Semenov D.V. Profile of the Circulating RNA in Apparently Healthy Individuals Obtained with Massive Parallel Sequencing of Total Plasma RNA on SOLiD Platform. C. 95.
  40. Vasilyeva S.V. Synthesis of modified nucleoside monomers containing new linker group for functionalization of nucleic acids. C. 96.
  41. Петрова Н.С. Влияние длины линкера в составе холестериновых производных анти-MDR1 siРНК на эффективность их накопления в клетках и биологическую активность. C. 146.

V Российский симпозиум «Белки и пептиды». Петрозаводск, 8-12 августа, 2011

  • Рихтер В.А. Пептид молока человека лактаптин как потенциальный противораковый препарат. C. 144.

2-ая Международная летняя научная школа «Наноматериалы и нанотехнологии в живых системах. Безопасность и наномедицина». Пансионат «Заря», Московская область, 19-24 сентября, 2011

  • Рябчикова Е.И. Особенности интернализации металлических наночастиц эукариотическими клетками in vitro и in vivo. С. 40.

Международная конференция научно-образовательных центров. Иркутск, 20-21 Сентября, 2011

  • Тамкович С.Н. Развитие навыков планирования и организации международных исследовательских проектов: Опыт НОЦ-008.

Школа молодых специалистов по синхротронному излучению (Школа-11) «Экспериментальные методы синхротронного излучения». Новосибирск, 10-13 Октября, 2011

  • Khodyreva S.N. Structure-functional analysis of supramolecular complexes of DNA repair.

Регенеративная биология и медицина. Москва, 14-15 октября, 2011

  1. Майбородин И.В. Регенерация рубца миометрия на фоне использования введения аутологичных мезенхимальных стволовых клеток костномозгового происхождения в эксперименте. C. 101-102.
  2. Майбородин И.В. Результаты имплантации полигидроксиалканоата в различные ткани организма. C. 103-104.
  3. Майбородин И.В. Регенерация поврежденной кости нижней челюсти крыс после введения аутологичных мезенхимальных стволовых клеток костномозгового происхождения. C. 104-105.

Научно-практическая конференция с международным участием «Современные аспекты природной очаговости болезней», посвященной 90-летию ФГУН ОмскНИИПОИ Роспотребнадзора. г. Омск, 1-3 ноября 2011 (сборник трудов)

  1. Рар В.А., Епихина Т.И. Изучение генетической вариабельности A.phagocytophilum. Национальные приоритеты России. Специальный выпуск. С. 165-167.
  2. Ткачев С.Е., Боргояков В.Ю., Чикова Е.Д., Панов В.В. Генетическое разнообразие вируса клещевого энцефалита на территории Новосибирского научного центра. Национальные приоритеты России. Специальный выпуск. С. 154-155.

II научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика». Новосибирск, 14-17 ноября, 2011

  1. Бреннер Е.Б. Секвенирование генома боррелий borrelia garinii, переносимых таежными клещами ixodes persulcatus на территории России. С. 26.
  2. Миронова Н.Л. Поиск молекулярных мишеней РНКазы А путем секвенирования кДНК- библиотек ми РНК на платформе solid С. 58.
  3. Морозкин Е.С. Сравнительный анализ cвободной апоптотической и геномной ДНК методом массового параллельного секвенирования. С. 60.
  4. Коваль В.В. Масс-спектрометрический подход к поиску протеомных маркеров социально-значимых психических расстройств. C. 86.
  5. Лаврик О.И. Протеомика систем репарации ДНК человека. C. 89.
  6. Тикунова Н.В. Особенности репертуара антицитокиновых аутоантител при рассеянном склерозе. C. 101.
  7. Черноносов А.А. Персонализированный подбор антикоагулянтного препарата варфарина методом масс-спектрометрии. C. 104.
  8. Семенов Д.В. Внеклеточные РНК плазмы крови здоровых доноров и пациентов с немелкоклеточным раком легкого. Анализ массовым параллельным секвенированием на платформе SOLiD. С. 167.
  9. Невинский Г.А. Многообразие интеграза-гидролизующих IgG и IgM антител из крови ВИЧ-инфицированных больных. C. 177.
  10. Воробьев Ю.Н. Method of Molecular Dynamics for Proteins in the Ionization-Conformation Phase Space in water at Constant pH. C. 180.
  11. Курильщиков А.М. Особенности реконструкции DE NOVO бактериальных геномов с использованием секвенирующих платформ 454 FLX genome sequencer и abi SOLID. C. 184.

Актуальные вопросы онкогенетики. Москва, 26-27 Ноября, 2011

  • Лактионов П.П. Неинвазивная молекулярно-генетическая диагностика злокачественных новообразований. C. 20.

IX научная конференция «Генетика человека и патология: Актуальные проблемы современной цитогенетики». Томск, 28-30 ноября, 2011

  • Рыкова Е.Ю. Анализ эпигенетических и белковых онкомаркеров в крови больных немелкоклеточным раком легкого. C. 124.


Публикации ОМКБ

Статьи в зарубежных рецензируемых журналах

  1. Cioffi M.B., Sánchez A., Marchal J.A., Kosyakova N., Liehr T., Trifonov V., Bertollo L.A.C. Cross-species chromosome painting tracks the independent origin of multiple sex chromosomes in two cofamiliar Erythrinidae fishes.BMC Evolutionary Biology. 2011. V. 11(1), Р. 186.
  2. Demakov S.A., Vatolina T.Yu., Babenko V.N., Semeshin V.F., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Protein composition of interband regions in polytene and cell line chromosomes of Drosophila Melanogaster.BMC Genomics. 2011. V. (12), Р. 566.
  3. Ivankin A.V., Kolesnikova T.D., Demakov S.A., Andreenkov O.V., Bildanova E.R., Andreenkova N.G., Zhimulev I.F. Analysis of DNA replication parameters in isolated organs of Drosophila melanogaster by molecular combing.Cell and Tissue Biology. 2011. V. 5, Р. 1-8.
  4. Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Shilov A.G., Nesterova T.B., Vandeberg J.L., Zakian S.M. Histone H3 trimethylation at lysine 9 marks the inactive metaphase X chromosome in the marsupial Monodelphis domestica.Chromosoma. 2011. V. 120(2), P. 177-183.
  5. Escribá M.C., Greciano P.G., Méndez-Lago M., De Pablos B., Trifonov V.A., Ferguson-Smith M.A., Goday C., Villasante A. Molecular and cytological characterization of repetitive DNA sequences from the centromeric heterochromatin of Sciara coprophila.Chromosoma. 2011. V. 120(4), P. 387-397.
  6. Pokorná M., Giovannotti M., Kratochvíl L., Kasai F., Trifonov V.A., O'Brien P.C.M., Caputo V., Olmo E., Ferguson-Smith M.A., Rens W. Strong conservation of the bird Z chromosome in reptilian genomes is revealed by comparative painting despite 275 million years divergence.Chromosoma. 2011. V. 120(5), Р. 455-468.
  7. Koryakov D.E., Walther M., Ebert A., Lein S., Zhimulev I.F., Reuter G. The SUUR protein is involved in binding of SU(VAR)3-9 and methylation of H3K9 and H3K27 in chromosomes of Drosophila Melanogaster.Chromosome Research. 2011. V. 19(2), Р. 235–249.
  8. Kulemzina A.I., Yang F., Trifonov V.A., Ryder O.A., Ferguson-Smith M.A., Graphodatsky A.S. Chromosome painting in Tragulidae facilitates the reconstruction of Ruminantia ancestral karyotype.Chromosome Research. 2011. V. 19(4), Р. 531-539.
  9. Beklemisheva V.R., Romanenko S.A., Biltueva L.S., Trifonov V.A., Vorobieva N.V., Serdukova N.A., Rubtsova N.V., Brandler O.V., O'Brien P.C.M., Yang F., Stanyon R., Ferguson-Smith M.A., Graphodatsky A.S. Reconstruction of karyotype evolution in core Glires. I. The genome homology revealed by comparative chromosome painting.Chromosome Research. 2011. V. 19(4), Р. 549-565.
  10. Duke Becker S.E., Thomas R., Trifonov V.A., Wayne R.K., Graphodatsky A.S., Breen M. Anchoring the dog to its relatives reveals new evolutionary breakpoints across 11 species of the Canidae and provides new clues for the 10.role of B chromosomes.Chromosome Research. 2011. V. 19(6), P. 685-708.
  11. Ye J., Nie W., Wang J., Su W., Jing M., Graphodatsky A.S., Yang F. Genome-wide comparative chromosome map between human and the Forrest's pika (Ochotona forresti) established by cross-species chromosome painting: Further support for the glires hypothesis Cytogenetic and Genome Research. 2011. V. 132(1-2), Р. 41-46.
  12. Kulemzina A.I., Nie W., Trifonov V.A., Staroselec Y., Vasenkov D.A., Volleth M., Yang F., Graphodatsky A.S. Comparative chromosome painting of four Siberian vespertilionidae species with aselliscus stoliczkanus and human probes.Cytogenetic and Genome Research. 2011. V. 134(3), Р. 200-205.
  13. Biltueva L., Vorobieva N., Perelman P., Trifonov V., Volobouev V., Panov V., Ilyashenko V., Onischenko S., O'Brien P., Yang F., Ferguson-Smith M., Graphodatsky A. Karyotype evolution of Eulipotyphla (Insectivora): The genome homology of seven sorex species revealed by comparative chromosome painting and banding data.Cytogenetic and Genome Research. 2011. V. 135(1), P. 51-64.
  14. Baxley R.M., Soshnev A.A., Koryakov D.,Zhimulev I.,Geyer K. The role of the Suppressor of Hairy-wing insulator protein in Drosophila oogenesis.Developmental Biology. 2011. V. 356(2), Р. 398-410.
  15. Kolesnikova T.D., Semeshin V.F., Andreyeva E.N., Zykov I.A., Kokoza E.B., Kalashnikova D.A., Belyaeva E.S. and Zhimulev I.F. Induced decondensation of heterochromatin in Drosophila melanogaster polytene chromosomes under condition of ectopic expression of the Supressor of underreplication gene.Fly(Austin) 2011. V. 5(3), Р. 181-190.\\de Bello Cioffi M., Sánchez A., Marchal J.A., Kosyakova N., Liehr T., Trifonov V., Bertollo L.A.C. Whole chromosome painting reveals independent origin of sex chromosomes in closely related forms of a fish species.Genetica. 2011. V. 139(8), Р. 1065-1072.
  16. Kulemzin S.V., Zamoshnikova A.Y., Yurchenko M.Y., Vitak N.Y., Najakshin A.M., Fayngerts S.A., Chikaev N.A., Reshetnikova E.S., Kashirina N.M., Peclo M.M., Rutkevich P.N., Shevelev A.Y., Yanushevskaya E.V., Baranov K.O., Mamonkin M., Vlasik, T.N., Sidorenko S.P., Taranin A.V., Mechetina L.V. FCRL6 receptor: Expression and associated proteins Immunology letters. 2011. V. 134(2), P. 174-182.
  17. Santiago T., Kulemzin S.V., Reshetnikova E.S., Chikaev N.A., Volkova O.Y., Mechetina L.V., Zhao M., Davis R.S., Taranin A.V., Najakshin A.M.,
  18. Hendershot L.M., Burrows P.D. FCRLA is a resident endoplasmic reticulum protein that associates with intracellular Igs, IgM, IgG and IgA International Immunology. 2011. V. 23(1), Р. 43-53.
  19. Ghedira K., Hornischer K., Konovalova T., Jenhani A.-Z., Benkahla A., Kel A. Identification of key mechanisms controlling gene expression in Leishmania infected macrophages using genome-wide promoter analysis.Infection, Genetics and Evolution. 2011. V. 11(4), P. 769-777.
  20. Tchurikov N.A, Kretova O.V, Sosin D.V., Zykov I.A., Zhimulev I.F., Kravatsky Yu.V. Genome-wide profiling of forum domains in Drosophila Melanogaster.Nucleic Acids Research. 2011. V. 39(9), P. 3667–3685.
  21. Perelman P., Johnson W.E., Roos C., Seuánez H.N., Horvath J.E., Moreira M.A.M., Kessing B., Pontius J., Roelke M., Rumpler Y., Schneider M.P.C., Silva, A., O'Brien S.J., Pecon-Slattery J. A molecular phylogeny of living primates.PLoS Genetics. 2011. V. 7(3), e1001342
  22. Hancock A.M., Witonsky D.B., Alkorta-Aranburu G., Beall C.M., Gebremedhin A., Sukernik R., Utermann G., Pritchard J.K., Coop G., Di Rienzo A. Adaptations to climate-mediated selective pressures in humans.PLoS Genetics. 2011. V. 7(4), e1001375
  23. Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Elisaphenko E.A., Mazurok N.A., Nesterova T.B., Brockdorff N., Zakian S.M. Variability of sequence surrounding the xist gene in rodents suggests taxon-specific regulation of X chromosome inactivation.PloS ONE. 2011. V. 6(8), e22771
  24. Vatolina T.Yu, Boldyreva L.V., Demakova O.V., Demakov S.A., Kokoza E.B., Semeshin V.F., Babenko V.N., Goncharov F.P., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Identical functional organization of cell line interphase and polytene chromosomes in Drosophila melanogaster.PloS ONE. 2011. V. 6(10), e25960
  25. Shamina N.V. «Bouquet arrest», monopolar chromosomes segregation, and correction of the abnormal spindle.Protoplasma. 2011. V. 249(1), Р. 43-51.
  26. Medvedev S.P., Grigor'Eva E.V., Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Dementyeva E.V., Shilov A.A., Pokushalov E.A., Zaidman A.M., Aleksandrova M.A., Plotnikov E.Y., Sukhikh G.T., Zakian S.M. Human induced pluripotent stem cells derived from fetal neural stem cells successfully undergo directed differentiation into cartilage.Stem Cells and Development. 2011. V. 20(6), P. 1099-1112.
  27. Smetanina M.A., Pakharukova M.Y., Kurinna S.M., Dong B., Hernandez J.P., Moore D.D., Merkulova T.I. Ortho-aminoazotoluene activates mouse constitutive androstane receptor (mCAR) and increases expression of mCAR target genes.Toxicology and Applied Pharmacology 2011. V. 255(1), Р. 76-85.

Статьи в отечественных рецензируемых журналах

  1. Кудрявцева Н.Н., Шурлыгина А.В., Мельникова Е.В., Тендитник М.В., Бондарь Н.П., Пантелеева Н.Г., Смагин Д.А., Колесников Н.Н., Труфакин В.А. Нарушение клеточного цикла в тимусе и селезенке у самцов мышей под влиянием хронического социального стресса: эффекты диазепама.Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2011. T. 151(4), 391-394
  2. Чикинев Ю.В., Дробязгин Е.А., Куликов В.Г., Кутепов А.В., Судовых И.Е. Эндоскопическое ультразвуковое исследование искусственного пищевода, сформированного из желудка.Вестник НГУ. Серия: Биология, клин. медицина. 2011. T. 9(1), С. 118-122.
  3. Шелемба-Чепурнова А.А., Омельянчук Л.В., Чепурнов А.А. Изучение функциональной роли мутации в геноме адаптированного к морским свинкам вируса эбола на модели Drosophila Melanogaster.Вопросы вирусологии. 2011. T. 56(1), С. 37-40.
  4. Квон Е.З., Демаков С.А., Жимулев И.Ф. Декомпактизация хроматина в междисках политенных хромосом дрозофилы не коррелирует с высоким уровнем транскрипции.Генетика 2011. T. 47(6), С. 765-773.
  5. Омельянчук Л.В., Юдина О.С. Drosophila Melanogaster как модель для изучения функционирования белков вирусов животных.Генетика 2011. T. 47(7), С. 869-873.
  6. Ватолина Т.Ю., Демаков С.А., Семешин В.Ф., Макунин И.В., Бабенко В.Н., Беляева Е.С., Жимулев И.Ф. Идентификация молекулярно-генетическая характеристика междисков политенных хромосом Drosophila Melanogaster.Генетика 2011. T. 47(5), С. 597-609.
  7. Шамина Н.В., Шацкая О.А. Два оригинальных механизма мейотической реституции у гаплоидов кукурузы (Zea mays l.)Генетика. 2011. T. 47(4), С. 499-507.
  8. Дубатолова Т.Д., Дорогова Н.В., Омельянчук Л.В., Чанг Л.Ш. Определение длительности фаз клеточного цикла у мутантов по опухолевому супрессору merlin Drosophila Melanogaster.Генетика. 2011. T. 47(4), С. 460-465.
  9. Холодаръ А.В., Амикишиева А.В., Анисимов М.П. Влияние интраназального введения дофамина на тревожность и локомоторную активность двух линий мышей.Российский физиологический журнал им. И.М.Сеченова. 2011. T. 97(7), С. 690-699.
  10. Лебедева Л.И., Дубатолова Т.Д., Омельянчук Л.В. Флуориметрические измерения позволяют выявить уровень упаковки хроматина, лежащий за пределами разрешения световой микроскопии.Цитология. 2011. T. 53(1), С. 44-48.
  11. Иванкин А.В., Колесникова Т.Д., Демаков С.А., Андреенков О.В., Бильданова Е.Р., Андреенкова Н.Г., Жимулев И.Ф. Метод молекулярного комбинга в исследовании параметров репликации ДНК в изолированных органах Drosophila Melanogaster.Цитология. 2011. T. 53(1), С. 75-82
  12. Шамина Н.В., Белых О.В., Замковой Г.А., Шевченко И.В. Процессы, обеспечивающие центробежное движение фрагмопласта в мейозе у злаков.Цитология. 2011. T. 53(2), С. 142-149.
  13. Шамина Н.В., Мухина Ж.М., Ковалева Н.М., Филюрина В.А. Стадии формирования подвижного фрагмопласта в мейозе с последовательным цитокенезом.Цитология. 2011. T. 53(2), С. 150-158.
  14. Семешин В.Ф., Омельянчук Л.В., Алексеева А.Л., Иванкина Е.А., Шевелева Н.Г., Жимулев И.Ф. Содержание ДНК в ядрах Cyclops kolensis и C. insignis (Crustacea, Copepoda) Цитология. 2011. T. 53(3), С. 285-289.

Зарубежные конференции
2nd Annual Drosophila Research Conference. San Diego, CA, USA, 30th March-3th April, 2011

  • Posukh O.V., Gortchakov A.A., Yurlova A.A., Zhimulev I.F. SUUR copurifies with proteins in replication, DSB repair, cell cycle control, and heterochromatin maintenance. P. 54.

The EMBO Meeting. Vienna, Austria, 10-13th September, 2011

  1. Posukh O., Koryakov D., Zhimulev I., Belyakin S. The role of ORC1 in regulation of DSB repair in drosophila salivary gland cells. P. 94.
  2. Koryakov D.E., Pokholkova G.V., Boltengagen M.I., Maksimov D.A., Belyakin S.N., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F. Induced transcription of transposons in a site of intercalary heterochromatin results in local changes in chromatin structure and DNA replication timing. P. 17.

Российские конференции
II научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика». Новосибирск, 14-17 ноября, 2011 (сборник тезисов)

  1. Дементьева П.В. Молекулярная организация В-хромосом Сибирской косули. С. 33.
  2. Жираковская Е.В. Секвенирование генов, кодирующих капсидные белки VP4, VP2 и VP7 ротавирусов, циркулировавших в Новосибирске в 2009-2010 годах. С. 35.
  3. Колесников Н.Н., Титов С.Е., Карпинская Е.В., Шевченко С.П., Веряскина Ю.А., Ахмерова Л.Г., Иванов М.К., Гуляева Л.Ф., Жимулев И.Ф. Онкомир. роль микроРНК в диагностике, прогнозе и потенциальной терапии онкологических заболеваний человека. С. 43.
  4. Сукерник Р.И., Стариковская Е.Б., Володько Н.В. Анализ изменчивости митохондрильаного (мтДНК) генома человека на стыке Сибири, Северной Японии и Аляски в эволюционном контексте. С. 169.

Устные доклады на зарубежных конференциях
2nd Annual Drosophila Research Conference. San Diego, CA, USA, 30th March-3th April, 2011

  • Zhimulev I.F. Chromosomal organization of Drosophila melanogaster genome. P. 23.

X International Conference on Drosophila Heterochromatin. Gubbio, Italy, 12-18th June, 2011

  • Zhimulev I.F. Chromosomal organization of genome: intercalary heterochromatin as a marker for determination of bands and interbands in polytene chromosomes of Drosophila melanogaster. P. 3.

Устные доклады на российских конференциях
II научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика». Новосибирск, 14-17 ноября, 2011 (сборник тезисов)

  • Графодатский А.С. Сравнительная хромосомика и 10 тысяч геномов. C. 32.





© Copyright 2023. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика