Лаборатория фармакогеномики [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
ИХБФМ СО РАН » ru » Структура института » Лаборатории » Лаборатория фармакогеномики
Лаборатория фармакогеномики

Лаборатория фармакогеномики

Заведующий лабораторией



Филипенко Максим Леонидович
кандидат биологических наук, г.н.с.

телефон: (383) 363-51-70




Сотрудники

ФИО Должность Звание Телефон E-mail Researcher ID
1.Афонюшкин Василий Николаевич вед. инженер к.б.н. 363-51-71
2.Белышева Нина Васильевналаборант 363-51-71
3.Боярских Ульяна Александровна м.н.с. к.б.н. 363-51-71
4.Воронина Елена Николаевна н.с.к.б.н. 363-51-71 G-9834-2013
5.Золотухин Игорь Анатольевич вед. инженер 363-51-71
6.Кель Александр Эдуардович с.н.с. к.б.н. 363-51-71
7.Кечин Андрей Андреевич м.н.с. 363-51-71 K-2411-2017
8.Мишукова Ольга Викторовна м.н.с. 363-51-71
9.Оскорбин Игорь Петрович м.н.с. 363-51-71
10.Оськина Наталья Александровна вед. инженер 363-51-71 G-9830-2013
11.Пашкова Зоя Афанасиевна ст. лаборант 363-51-71
12.Сипин Федор Александрович лаборант 363-51-71
13.Сметанина Мария Александровна м.н.с.к.б.н. 363-51-71 I-9741-2014
14.Соколова Екатерина Алексеевнам.н.с. к.б.н. 363-51-71
15.Троменшлегер Ирина Николаевна вед. инженер 363-51-71
16.Филипенко Максим Леонидович Зав. лабораторией к.б.н. 363-51-70
17.Хлистун Инна Викторовна вед.инженер 363-51-71
18.Храпов Евгений Александрович м.н.с. 363-51-71
19.Шадрина Александра Сергеевна м.н.с.к.б.н. 363-51-71 G-9753-2013
20.Шамовская Дарья Вадимовна ст.лаборант 363-51-71
21.Ширшова Арина Николаевна ст. лаборант 363-51-71

Основные направления исследований


  • Разработка методов выявления структурного полиморфизма геномов:

- молекулярно-генетическая диагностика наследственных и мультифакториальных заболеваний человека, фармакогенетические исследования - выявление соматических мутаций в опухолях и внеклеточных жидкостях при онкологических заболеваниях человека - молекулярно-генетическое типирование бактерий (Mycobacterium tuberculosis, Salmonella, Lactobacillus и другие).

  • Дизайн, клонирование и экспрессия рекомбинантных белков:

- рекомбинантные цитокины и антигены для дендритно-клеточной терапии - новые ферменты для модификации и амплификации ДНК

  • Системная биология и анализ геномных и транскриптомных данных:

- исследование молекулярных механизмов возникновения заболеваний человека и действия лекарственных препаратов - системная биология и биоинформатика микроорганизмов


Важнейшие научные результаты:

  • Совместно с ИКИ СО РАМН созданы рекомбинантные плазмиды для экспрессии искусственного белка, содержащего 11 эпитопов опухоль-ассоциированных антигенов для колоректального рака. Трансфекция рекомбинантных плазмид в дендритные клетки человека позволила достичь стимуляции специфических Т-хелперов и цитотоксических Т-лимфоцитов. [Заявка на изобретение № 2012119658, 2012 г.].
  • Выявлены 6 наиболее частых мутаций генов BRCA1, обуславливающих развитие рака молочной железы у женщин, проживающих в западно-сибирском регионе РФ. Разработана и апробирована система скрининга мутаций BRCA1 (5382 insC, 300 T>G, 3819del5, 3875del4, 185 del AG, 4153 delA, 2800delAA и BRCA2 (6174delT, 9318del4 и 1528del4) с помощью «real-time» ПЦР и последующего анализа кривых плавления с высоким разрешением (HRM). Обнаружено, что носительство аллеля Т (rs1050450) гена GPX1 является протективным в отношении спорадического рака молочной железы. [Ермоленко и др., Генетика, 2010 г.].
  • Проведено исследование механизмов резистентности клеток немелкоклеточного рака легких (НМРЛ) к действию таргетных противоопухолевых препаратов Nutlin-3, tenovin-6 и RITA, активирующих транскрипционный фактор р53. Определены сигнальные пути, активирующиеся в клетках резистентных к действию этих препаратов и ключевые регуляторные молекулы этих сигнальных путей (преимущественно компоненты Act и NFkB сигнальных путей). Найденные ключевые молекулы могут рассматриваться как потенциальные молекулы-мишени для комплексной противоопухолевой терапии. [Боярских У.А. и др., Молекулярная биология, 2011 г.].
  • Создана и охарактеризована представительная коллекция изолятов M.tuberculosis, циркулирующих на различных территориях бывшего СНГ [Dymova et al., BMS, 2011 г]. Показано, что некоторые генетические семейства имеют ассоциацию с множественной лекарственной устойчивостью [Dymova et al., 2011г., JMM; Дымова М.А. и соавт., 2012г., MEDLINE.RU]. Проведено полногеномное секвенирование 10 изолятов M.tuberculosis. Разработан быстрый и эффективный способ скрининга известных и неизвестных мутаций с использованием HRM-PCR анализа в генах rpoB, katG и pncA, отвечающих за лекарственную устойчивость к рифампицину, изониазиду и пиразинамиду, соответственно [Заявка на изобретение № 2012108730/10, 2012 г].
  • Проведено исследование влияния различных генов и негенетических параметров на вариабельность дозы варфарина среди жителей Западно-Сибирского региона. Показано, что только полиморфные локусы генов VKORC1(-1639 G>A) и CYP2C9 (*3) оказывают статистически значимое влияние на подобранную дозу варфарина в исследованной выборке (22,3% межиндивидуальной вариабельности) [Belozerceva L.A., et al,. EPMA J., 2012 г.].
  • Создана программа ProcAnnot, позволяющая производить аннотацию SNP, полученных при анализе геномов разных прокариотических организмов. Помимо картирования этих снипов на гены и определения их синонимичности или несинонимичости, новая программа способна осуществлять Gene set enrichment analysis (GSEA), что позволяет определять, какие метаболические пути были преимущественно затронуты данным списком SNP.
  • Проведено клонирование и экспрессия в клетках E.coli ряда термостабильных ферментов: ДНК лигаза из Pyrococcus abyssi [Закабунин и др., Молекуляр. Биология. 2011 г.]; FEN1 нуклеаза Pyrococcus abyssi, РНКаза HII и эндонуклеаза V из Thermus thermophiles, нативные и гибридные ДНК полимеразы из Geobacillus ssp 777 и Thermococcus celer. Полученные ферменты используются для разработки новых методов анализа ДНК и РНК.

Текущие гранты


Базовые проекты ПФНИ ГАН

  • Проект КП ФНИ СО РАН II.1 (ГЗ № 0309-2018-0018) Блок: «Разработка мультиплексной методологии выявления SNP в геномах с.-х. животных на основе ПЦР в режиме реального времени». Проект: «Новые подходы высоко-производительного типирования структурных вариантов ДНК для селекционных исследований и разведения крупного рогатого скота, свиней и кур». (2018-2020 гг.)
  • Гос. задание, проект 0309-2017-0009 (Коллекция КБМЗ) «Инвентаризация и развитие коллекции биоматериала (ДНК, РНК и плазма) пациентов, страдающих мультифакторными социально-значимыми заболеваниями» (2017-2020 гг.)
  • ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.62.2.2, 0309-2016-0007 «Развитие методов персонализированной медицины» (2017-2020 гг.)
  • ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.55.1.1, 0309-2016-0002 «Биология бактериально-вирусных сообществ» (2017-2020 гг.)
  • ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.62.1.5, 0309-2016-0003 «Синтетическая биология: разработка средств манипуляции генетическим материалом и создание перспективных препаратов для терапии и диагностики» (2017-2020 гг.)

Гранты Российского научного фонда

  • № 17-75-20223 «Исследование механизмов ремоделирования стенки вены при ее варикозном расширении». (2017-2020 гг.)

Гранты Российского фонда фундаментальных исследований

  • № 18-515-05004/18 Арм_а Механизмы развития устойчивости к терапии ингибиторами PPARP при BRCA1-зависимом раке яичников. (2018-2019 гг.)
  • № 16-34-60106 «Исследование механизмов патогенности новой бактерии рода Lactobacillus, вызывающей эндокардит у кур» (2016-2018 гг.)


Отчеты по проектам МинОбрНауки России


Публикации 2016-2018 года


  1. Mycoplasma hyorhinis reduces sensitivity of human lung carcinoma cells to Nutlin-3 and promotes their malignant phenotype. Boyarskikh U.A., Shadrina A.S., Smetanina M.A., Tsepilov Y.A., Oscorbin I.P., Kozlov V.V., Kel A.E., Filipenko M.L. J Cancer Res Clin Oncol 2018 V. 144 N 7 P. 1289-1300.
  2. Polymorphisms of genes involved in inflammation and blood vessel development influence the risk of varicose veins. Shadrina A.S., Tsepilov Y.A., Smetanina M.A., Voronina E.N., Seliverstov E., Ilyukhin E., Kirienko A., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Clin Genet. 2018 V. 94 N 2 P. 191-199
  3. Genome-wide association study in ethnic Russians suggests an association of the MHC class III genomic region with the risk of primary varicose veins. Shadrina A.S., Tsepilov Y.A., Sokolova E.A., Smetanina M.A., Voronina E.N., Pakhomov E., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Ilyukhin E., Seliverstov E., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Gene 2018 V. 659 P. 93-99
  4. Эффекты ранней материнской изоляции на поведение и стрессорную реактивность у взрослых потомков ручных и агрессивных серых крыс. Коношенко М.Ю., Кожемякина Р.В.,Шихевич С.Г., Оськина Н.А., Плюснина И.З. Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2018 Т. 67 № 6 С. 814–830 .
  5. Полиморфизм генов CYP1A1 и CYP2D6 в популяциях бурят, телеутов и у русских Восточной Сибири. Табиханова Л.Э., Осипова Л.П., Чуркина Т.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2018 Т. 22 № 2.
  6. Allele-Specific Biased Expression of the CNTN6 Gene in iPS Cell-Derived Neurons from a Patient with Intellectual Disability and 3p26.3 Microduplication Involving the CNTN6 Gene. Gridina M.M., Matveeva N.M., Fishman V.S., Menzorov A.G., Kizilova H.A.,Beregovoy N.A., Kovrigin I.I.,Pristyazhnyuk I.E., Oscorbin I.P., Filipenko M.L., Kashevarova A.A., Skryabin N.A.,Nikitina T.V., Sazhenova E.A., Nazarenko L.P., Lebedev I.N., Serov O.L. Molecular Neurobiology. 2018 принята к печати.
  7. Роль межгенных взаимодействий в формировании хромосомных нарушений у работников угольных теплоэлектростанций. Савченко Я.А., Минина В.И., Баканова М.Л., Рыжкова А.В., Соболева О.А.,Кулемин Ю.Е., Воронина Е.Н., Глушков А.Н., Вафин И.А. Генетика 2018 Т. 54 Выпуск № С. 96-108.
  8. Significance of mir-146a quantification in human blood plasma for the diagnosis of colorectal cancer. Shirshova A., Shamovskaya D.A., Boyarskikh U.A., Apalko S.V., Leskov L.S., Sokolov A.V., Kovalenko S.A., Scherbak S.G., Pikalov I.V., Kel A.E., Filipenko M.L. Вестник РГМУ. 2017. Т. 4. P. 31-35.
  9. Контролируемая аппаратная гипотермия зоны операции после комбинированной флебэктомии: результаты сравнительного нерандомизированного исследования. Солдатский Е.Ю., Селиверстов Е.И., Ефремова О.И., Ан Е.С., Лебедев И.С., Золотухин И.А. Флебология. 2017. Т. 11. № 3. С. 142-145.
  10. «Моделирование антибактериальной активности кормовых добавок «новират» и «новибак» в зобу у птицы». Хоменко Ю.С., Давыдова Н.А., Епанчинцев А.А., Афонюшкин В.Н. Ветеринария и кормление. 2017. № 6. С. 29-32.
  11. Идентификация нетипичного бактериального вида STREPTOCOCCUS INTERMEDIUS, вызвавшего абсцесс головного мозга, секвенированием по сэнгеру гена 16S РРНК из ДНК образца гноя. Гордукова М.А., Дивилина Ю.В., Мишукова О.В., Галеева Е.В., Продеус А.П., Филипенко М.Л. Вестник РГМУ. 2017. № 4. С. 59-62.
  12. Оценка значимости определения количества MIR-146A в плазме крови человека для диагностики колоректального рака. Ширшова А.Н., Шамовская Д.А., Боярских У.А., Апалько С.В., Лесков Л.С., Соколов А.В., Ходырева С.Н., Коваленко С.А., Щербак С.Г., Пикалов И.В., Кель А.Э., Филипенко М.Л. Вестник РГМУ. 2017. № 4. С. 31-35.
  13. Диагностический потенциал внеклеточной ДНК в качестве жидкостной биопсии. Филипенко М.Л. Вестник РГМУ. 2017 .№ 4. С. 5-13.
  14. Исследование внеклеточных нуклеолитических ферментов штаммов Bacillus thuringiensis методом зимографии. Андреева И.С., Закабунин А.И. Colloquium-journal. 2017. № 2(2). С.7-14.
  15. Матриксные металлопротеиназы: структура, функция и генетический полиморфизм. Шадрина А.С., Терешкина И.В., Плиева Я.З., Кушлинский Д.Н., Уткин Д.О., Морозов А.А., Филипенко М.Л., Кушлинский Н.Е. Патогенез. 2017. Т. 15. № 2. С. 14-23.
  16. Shadrina A.S., Voronina E.N., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Allele and genotype frequencies of polymorphisms in cytokine genes in ethnic Russian individuals from Moscow, Russia. Human Immunology. 2017. V. 78. N2. P. 190-191.
  17. Shadrina A.S., Smetanina M.A., Sevostyanova K.S., Seliverstov E.I., Ilyukhin E.A., Voronina E.N., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Functional polymorphism rs1024611 in the MCP1 gene is associated with the risk of varicose veins of lower extremities. J. Vasc. Surg. Venous Lymphatic Disord. 2017. V. 5. N 4. P. 561-566.
  18. Shadrina A.S., Smetanina M.A., Sokolova E.A., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Seliverstov E.I., Zakharova E., Ilyukhin E.A., Voronina E.N., Makarov D., Kirienko A., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Top SNPs from the phenome-wide association study catalog and the risk of varicose veins of lower extremities: A replication study. Meta Gene. 2017. V. 12. P. 47 – 49.
  19. Yevshin I., Sharipov R., Valeev T., Kel A.E., Kolpakov F. GTRD: A database of transcription factor binding sites identified by ChIP-seq experiments. Nucleic Acids Res. 2017. V. 45. D1. D61-D67.
  20. Шадрина А.С., Плиева Я.З., Кушлинский Д.Н., Морозов А.А., Филипенко М.Л., Чанг В.Л., Кушлинский Н.Е. Классификация, регуляция активности, генетический полиморфизм матриксных металлопротеиназ в норме и при патологии. Альманах клинической медицины. 2017. Т. 45. № 4. С. 266-279.
  21. Филипенко М.Л., Оськина Н.А., Оскорбин И.А., Мишукова О.В., Овчинникова Л.К., Герштейн Е.С., Кушлинский Н.Е. Взаимосвязь соматических мутаций гена PIK3CA в опухолях с клинико-морфологическими характеристиками больных раком молочной железы. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2017. Т. 163. № 2. С. 216-220.
  22. Афонюшкин В.Н., Дударева Е.В., Черепушкина В.С., Филипенко М.Л., Козлова Ю.Н., Березин С.М.Перспективы использования бактериофагов в качестве альтернативы антибиотиков. Ветеринария. 2017. № 7. С. 14-17.
  23. Злобин А.С., Шарапов С.Ж., Гурьев В.П., Бевова М.Р., Цепилов Я.А., Сивцева Т.М., Боярских У.А., Соколова Е.А., Аульченко Ю.С., Филипенко М.Л., Осаковский В.Л. Популяционно-генетический анализ экзомов представителей якутского этноса. Доклады Академии Наук (биохимия, биофизика, молекулярная биология). 2017.
  24. Ночевная О.М., Переверзева О.В., Соколова Е.А., Филипенко М.Л., Замятина С.В., Палашенко А.С., Жданова Е.С., Ельчанинова С.А., Смагина И.В. Ассоциация полиморфизма гена FAS/APO-1 (RS2234767) с риском развития и быстрого прогрессирования рассеянного склероза. Журнал неврологии и психиатрии им. Корсакова. 2017. Т .11. № 2-2. С. 10-13.
  25. Чуманова О.В., Пасман Н.М., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Оценка роли полиморфизма генов системы гемостаза и генов, отвечающих за формирование дисфункции эндотелия, в развитии гестационных осложнений. Медицинская генетика. 2017. Т. 16 № 5. С. 48-51.
  26. Гордеева Л.А., Попова О.С., Воронина Е.Н., Шаталина И.В., Оленникова Р.В., Нерсесян С.Л., Филипенко М.Л., Глушков А.Н. Ассоциации полиморфизма генов ферментов биотрансформации ксенобиотиков с невынашиванием беременности в ранние сроки. Молекулярная медицина. 2017. Т. 15. № 3. С. 37-44.
  27. Бондарь И.А., Шабельникова О.Ю., Соколова Е.А., Филипенко М.Л. Результаты исследования ассоциации полиморфного локуса rs11212617 гена ATM с ответом на терапию метформином у больных сахарным диабетом 2 типа. Проблемы Эндокринологии. 2017. Т. 63. № 1. С. 9-16.
  28. Березина О.В., Поспелова Т.И., Филипенко М.Л., Воропаева Е.Н., Овчинников В.С. Поиск молекулярно-генетических предикторов развития агрессивных лимфом. Сибирский медицинский журнал (г. Иркутск). 2017. Т. 32 № 2. С. 14-17.
  29. Пасечник О.А., Дымова М.А., Стасенко В.Л., Татаринцева М.П., Колесникова Л.П., Ляпина Е.С.Генетическое разнообразие лекарственно-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis в Омской области. Туберкулез и болезни легких. 2017. Т. 95. № 7. С. 33-39.
  30. Кононов А.В., Мозговой С.И., Поморгайло Е.Г., Потрохова Е.А., Шиманская А.Г., Федотова Ю.А., Маркелова М.В., Рубцов В.А., Керученко М.А., Парыгина М.Н., Грищенко Р.К., Панюшкин Л.В., Филипенко М.Л., Иванов М.К., Грищенко Р.К. Молекулярно-клеточные основы предикции рака желудка. опыт мультидисциплинарного исследования. Уральский медицинский журнал. 2017. № 4 (148). С. 9-18.
  31. Шадрина А.С., Золотухин И.А., Филипенко М.Л. Молекулярные механизмы развития варикозной болезни нижних конечностей. Флебология. 2017. Т. 11. № 2. С. 71-75.
  32. Allele and genotype frequencies of polymorphisms in cytokine genes in ethnic Russian individuals from Moscow, Russia. Shadrina A.S., Voronina E.N., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Human Immunology. 2016. V. 78 N2 P. 190-191.
  33. Epidemiology of Brucellosis and Genetic Diversity of Brucella abortus in Kazakhstan. Shevtsova E., Shevtsov A., Mukanov K., Filipenko M.L., Kamalova D., Sytnik I., Syzdykov M., Kuznetsov A., Akhmetova A., Zharova M., Karibaev T., Tarlykov P., Ramanculov E. PloS ONE. 2016. V. 11. N 12 e0167496.
  34. Молекулярная эпидемиология туберкулезной инфекции в Омской области. Пасечник О.А., Дымова М.А., Филипенко М.Л., Стасенко В.Л., Татаринцева М.П., Павлик А.А. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2016. № 4(89). С. 26-36.
  35. Фенотипические и генетические особенности больных сахарным диабетом 2 типа с различным ответом на терапию метформином в Новосибирской области. Бондарь И.А., Шабельникова О.Ю., Соколова Е.А., Пьянкова О.В., Филипенко М.Л.Сахарный диабет 2016 Т. 19. № 2 С. 125-131.
  36. Allele rs2010963 C of the VEGFA gene is associated with the decreased risk of primary varicose veins in ethnic Russians. Shadrina A.S., Smetanina M.A., Sokolova E.A., Shamovskaya D.V., Sevost'ianova K.S., Shevela A.I., Soldatsky E.Y., Seliverstov E.I., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin E.A., Voronina E.N., Pikalov I.V., Zolotukhin I.A., Kirienko A.I., Filipenko M.L. Phlebology. 2016 принята к печати.
  37. Effect of Modified Heptamethyltrisiloxane on the Efficiency of Agrobacterium-mediated Transformation and Expression of Recombinant Structure in Plant Cell and Tissue Culture. Skaptsov M., Kutsev M., Filipenko M.L., Khrapov E.A., Shinoyama H.Key Engineering Materials 2016 V. 683 P. 506-510
  38. Polymorphisms in the MTHFR and MTR genes and the risk of varicose veins in ethnical Russians. Shadrina A.S., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Soldatsky E.Y., Seliverstov E.., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin E.A., Smetanina M.A., Voronina E.N., Pikalov I.V., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Biomarkers 2016 V. 21 N 7 P. 619-624.
  39. Comparison of fluorescent intercalating dyes for quantitative loop-mediated isothermal amplification (qLAMP). Oscorbin I.P., Belousova E.A., Zakabunin A.I., Boyarskikh U.A., Filipenko M.L.BioTechniques 2016 V. 61 N 1 P. 20-25.
  40. GTRD: a database of transcription factor binding sites identified by ChIP-seq experiments. Yevshin I., Sharipov R.N., Valeev T., Kel A.E., Kolpakov F.Nucleic Acids Res.2016 P. 1-7.
  41. No Evidence of a Common DNA Variant Profile Specific to World Class Endurance Athletes. Rankinen., Fuku N., Wolfarth B., Wang G., Sarzynski M.A., Alexeev D.G., Ahmetov I.I., Boulay M.R., Cieszczyk P., Eynon N., Filipenko M.L., Garton F.C. Generozov E.V., Govorun V.M., Houweling P.J., Kawahara T., Kostryukova E.S., Kulemin N.A., Larin A.K., Maciejewska-Karłowska A., Miyachi M., Muniesa C.A., Murakami H., Ospanova E.A., Padmanabhan S., Pavlenko A.V., Pyankova O.N., Santiago C., Sawczuk M., Scott R.A., Uyba V.V., Yvert T., Perusse L., Ghosh S., Rauramaa R., North K.N., Lucia A., Pitsiladis Y., Bouchard C. PloS ONE 2016 V. 11 N 1 e0147330.
  42. Выявление полиморфных вариантов генов, ассоциированных с риском варикозной болезни нижних конечностей у русских жителей Российской Федерации. Шадрина А.С., Сметанина М.А., Севостьянова К.С., Соколова Е.А., Шевела А.И., Солдатский Е.Ю., Селиверстов Е.И., Демехова М.Ю., Шонов О.А., Илюхин Е.А., Воронина Е.Н., Пикалов И.В., Золотухин И.А., Кириенко А.И., Филипенко М.Л. Флебология 2016 Т. 10 № 2 С. 68-76.
  43. Молекулярно-генетическая характеристика лекарственно-устойчивых штаммов M.TUBERCULOSIS В Омской области. Пасечник О.А., Стасенко В.Л., Дымова М.А., Татаринцева М.П., Колесникова Л.П. Инфекционные болезни 2016 Т. 14 S1 С. 224.
  44. Полиморфные варианты rs13155212 (T/C) и rs7704267 (G/C) гена AGGF1 и риск развития варикозного расширения вен нижних конечностей в популяции этнических русских. Шадрина А.С., Сметанина М.А., Севостьянова К.С., Соколова Е.А., Шевела А.И., Селиверстов Е.И., Демехова М.Ю., Шонов О.А., Илюхин Е.А., Воронина Е.Н., Золотухин И.А., Кириенко А.И., Филипенко М.Л.Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2016 Т. 161 № 5 С. 642-646.
  45. Антагонистическая активность лактобактерий из кишечника сельскохозяйственной птицы в отношении клинических изолятов salmonella enterica. Афонюшкин В.Н., Троменшлегер И.Н., Филипенко М.Л., Храпов Е.А., Дударева Е.В. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2016 Т. 161 № 6 С. 757-760.
  46. Cтруктурный анализ биосинтезированной целлюлозы (наноцеллюлозы) по результатам конфокальной микроскопии. Ларионов П.М., Филипенко М.Л., Ступак В.В., Харченко А.В., Афонюшкин В.Н., Терещенко В.П., Баринов А.А. Сибирский научный медицинский журнал. 2016. Т. 36. № 4 С. 5-9.
  47. Генетические основы хронических заболеваний вен нижних конечностей: обзор современных представлений. Сметанина М.А., Шадрина А.С., Золотухин И.А., Филипенко М.Л. Флебология. 2016 Т. 10 № 4 С. 199-213.
  48. Chromosome aberrations in peripheral blood lymphocytes of lung cancer patients exposed to radon and air pollution. Minina V.I., Sinitsky M.Y., Druzhinin V.G., Fucic A., Bakanova M.L., Ryzhkova A.V., Savchenko Y.A., Timofeeva A.A., Titov R.A., Voronina E.N., Titov V.A. Eur. J. Cancer. Prev. 2016 V. 25 N 4 P. 70-77.
  49. Этиология и патогенез гепатитов кур. Козлова Ю.Н., Афонюшкин В.Н., Черепушкина В.С., Хоменко Ю.С., Березин С.С. Птицеводство. 2016 № 10С. 25-32
  50. Prediction of protein-DNA interactions of transcription factors linking proteomics and transcriptomics data. Kondrakhin Yu., Valeev T., Yevshin I., Kolpakov F.A., Kel A.E. EuPA Open Proteomics. 2016 V. 13P. 14-23
  51. Use of the VH6-1 gene segment to code for anti-interleukin-18 autoantibodies in multiple sclerosis. Tumentseva M., Morozova V.V., Zakabunin A.I., Korobko D., Malkova N., Filipenko M.L., Tikunova N.V.Immunogenetics 2016 V. 68 N 4 P. 237-246.
  52. НАНОайболиты. Бактериофаги как альтернатива антибиотикам в ветеринарии. Филипенко М.Л., Афонюшкин В.Н., Козлова Ю.Н. Наука из первых рук. 2016 Т. 70 № 4 С. 82-87.
  53. Multi-omics “upstream analysis” of regulatory genomic regions helps identifying targets against methotrexate resistance of colon cancer. Kel A.E., Stegmaier P., Valeev T., Koschmann J., Poroikov V., Kel-Margoulis O., Wingender E. EuPA Open Proteomics. 2016 V. 11 P. 1-13.
  54. HFE p.C282Y gene variant is associated with varicose veins in Russian population. Sokolova E.A., Shadrina A.S., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Soldatsky E.Y., Seliverstov E.I., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin B.A., Smetanina M.A., Voronina E.N., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L.Clinical and Experimental Medicine. 2016 V. 16 N 3 P. 463-470
  55. Полиморфизм гена APOE как фактор риска дислипидемии, атеротромбоза и потенциальный фармакогенетический маркер терапии статинами у пациентов высокого риска сердечно-сосудистых осложнений. Кох Н.В., Воронина Е.Н., Лифшиц Г.И. Атеросклероз и дислипидемии. 2016 № 3 (24) С. 107-115.
  56. Distribution of EGFR Mutations in 10,607 Russian Patients with Lung Cancer. Imyanitov E.N., Demidova I.A., Gordiev M.G., Filipenko M.L., Kekeyeva T.V., Moliaka Y.K., Gervas P.A., Kozhemyako V.B., Vodolazhskiy D.I., Sergeyeva L.A., Fattakhova D.U., Iyevleva A.G., Mitiushkina N.V., Kuligina E.S., Barinov A.A., Mommaeva M.S., Aleksakhina S.N., Tsimafeyeu I.V., Tjulandin S.A.Molecular Diagnosis & Therapy 2016 V. 20 N 4 P. 401-406
  57. Identification of mechanism of semisynthetic derivative of glycyrrhetinic acid Soloxolone methyl on cancer cell. Logashenko E.B., Markov A.V., Kel A.E., Кель-Маргулис О., Zenkova M.A.New Horizons in Translational Medicine. 2016 V. 3 N 2 P. 147.
  58. Association of polymorphisms near the FOXC2 gene with the risk of varicose veins in ethnic Russians. Shadrina A.S., Smetanina M.A., Sokolova E.A., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin E.A., Voronina E.N., Zolotukhin I.A, Kirienko A.I., Filipenko M.L. Phlebology 2016 V. 31 N 9 P. 640-648
  59. Полиморфизм гена цитохрома Р450 CYP1A1 (ILE462VAL) в популяциях тундровых ненцев Ямало-Ненецкого автономного округа, нганасан Таймыра и русских Сибири. Тийс Р.П., Осипова Л.П., Чуркина Т.В., Табиханова Л.Э., Личман Д.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Вавиловский журнал генетики и селекции.2016 Т. 20 № 1 С. 16-22.
  60. Нейроподобный текст-майнинг для выявления и характеризации самых популярных микроРНК. Кечин А.А., Кель А.Э., Кушлинский Н.Е., Филипенко М.Л. Нейрокомпьютеры: разработка, применение. 2016 № 9 С. 1-12.
  61. Полиморфные варианты гена системы биотрансформации ксенобиотиков GSTP1 у ненцев и нганасан тундры по сравнению с русскими. Тийс Р.П., Осипова Л.П., Личман Д.В., Табиханова Л.Э., Чуркина Т.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Кривощеков С.Г. Физиология человека. 2016 Т. 42 № 2 P. 112-120.
  62. Генотипирование и определение масти древних лошадей Бурятии. Куслий М.А., Дружкова А.С., Попова К.О., Воробьева Н.В., Макунин А.И., Юрлова А.А., Тишкин А.А., Миняев С.С., Трифонов В.А., Графодатский А.С., Дымова М.А., Филипенко М.Л. Цитология 2016 Т. 58 № 4 С. 304-308
  63. Designing the method for optical in vitro monitoring of the cell-mediated scaffold technology for bone regeneration based on laser-induced fluorescence spectroscopy. Larionov P. M., Maslov N.A., Papaeva E.O., Tereshchenko V.P., Khlestkin V.K., Bogachev, S.S., Proskurina A.S., Titov A.T., Filipenko M.L., Pavlov V.V., Kudrov G.A., Orishich A.M.AIP Conference Proceedings 2016 V. 176 pii. 020041.

Патенты


  1. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ УСТОЙЧИВЫХ К ПИРАЗИНАМИНУ ИЗОЛЯТОВ Mycobacterium tuberculosis. Филипенко М.Л., Дымова М.А., Храпов Е.А., Боярских У.А. 2015 г. № 2552214.
  2. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИТЕЛ К БАКТЕРИАЛЬНЫМ АНТИГЕНАМ. Афонюшкин В.Н., Филипенко М.Л., Киревичева Анна Сергеевна, Мишукова О.В., Черепушкина В.С., Ширшова А.Н. 2015 г. № 2563885.
  3. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЯ ТРАНСКРИПЦИИ ГЕНА, КОДИРУЮЩЕГО ХЕМОКИН CCL2 (МСР-1) ЧЕЛОВЕКА И НАБОР ДЛЯ ЕГО ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ. Филипенко М.Л., Боярских У.А., Храпов Е.А., Силков А.Н., Сенников С.В. 2014 г. № 2522801.
  4. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCI-UB-POLYEPI, СОДЕРЖАЩАЯ ЭПИТОПЫ ОПУХОЛЬ-АССОЦИИРОВАННЫХ АНТИГЕНОВ ДЛЯ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА, И СПОСОБ ЕЕ ПРИМЕНЕНИЯ ДЛЯ СТИМУЛЯЦИИ СПЕЦИФИЧЕСКОГО ПРОТИВООПУХОЛЕВОГО ИММУННОГО ОТВЕТА ПРОТИВ КЛЕТОК КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА. Сенников С.В., Филипенко М.Л., Курилин В.В., Куликова Е.В., Храпов Е.А., Шевченко Ю.А., Шорохов Р.В., Якушенко В.К., Соколов А.В. 2014 г. № 2507265.
  5. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ МЕТОДИКА ОЦЕНКИ РИСКА ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К ТРОМБОЗУ. «Ноу-хау» (Секрет-производства). Лифшиц Г.И., Кох Н.В., Слепухина А.А., Белеванцева А.В., Филипенко М.Л., Воронина Е.Н. 2014 г.
  6. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ КЛЕТОК НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКИХ К ДЕЙСТВИЮ ПРЕПАРАТОВ, РЕАКТИВИРУЮЩИХ БЕЛОК р53. Филипенко М.Л., Боярских У.А., Сметанина М.А., Кель А.Э. 2014 г. № 2509808.
  7. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ УСТОЙЧИВЫХ К РИФАМПИЦИНУ ИЗОЛЯТОВ Mycobacterium tuberculosis. Филипенко М.Л., Дымова М.А., Боярских У.А., Храпов Е.А., Петренко Т.И., Альховик О.И. 2013 г. № 2485177.
  8. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИГЕНОВ БАКТЕРИЙ. Афонюшкин В.Н., Филипенко М.Л., Юшков Ю.Г. 2012 г. № 2451083.
  9. ЭТИДИЙ ЭТИЛСУЛЬФАТ - ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ. Осадчий С.А., Филипенко М.Л., Боярских У.А. 2011 г. № 2415842.
  10. СПОСОБ СЕКРЕЦИИ ЗЕЛЕНОГО ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО БЕЛКА (GFP) ИЗ РАСТИТЕЛЬНЫХ КЛЕТОК. Филипенко М.Л., Храпов Е.А. 2011 г. № 2415936.
  11. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ОРНИТОБАКТЕРИОЗА У СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОЙ ПТИЦЫ. Филипенко М.Л., Хрипко Ю.И., Афонюшкин В.Н., Дударева Е.В. 2010 г. № 2407801.
  12. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pBinPLUS-ARS-EPSPS, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ ЭКСПРЕССИЮ ГЕНА АГРОБАКТЕРИАЛЬНОЙ 5-ЕНОЛПИРУВИЛ-ШИКИМАТ-3-ФОСФАТ-СИНТЕТАЗЫ В ТРАНСГЕННЫХ МИКРОВОДОРОСЛЯХ РОДА ХЛОРЕЛЛА. Филипенко М.Л., Храпов Е.А., Тронева А.В. 2010 г. № 2407794.
  13. СОСТАВ ДЛЯ ОБРАБОТКИ ПТИЦЕВОДЧЕСКИХ ПОМЕЩЕНИЙ. Афонюшкин В.Н., Филипенко М.Л., Дударева Е.В., Морозов К.В. 2010 г. № 2407545.
  14. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ РОДА SALMONELLA. Филипенко М.Л., Хрипко Ю.И., Афонюшкин В.Н., Боярских У.А., Дударева Е.В. 2009 г. № 2360004.
  15. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ КУР К ВИРУСНЫМ ИНФЕКЦИЯМ. Филипенко М.Л., Хрипко Ю.И., Морозов К.В., Афонюшкин В.Н. 2009 г. № 2352640.
  16. СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К ТРОМБОФИЛИИ. Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. 2009 г. № 2352641.
  17. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pBi101-IL18, КОДИРУЮЩАЯ СИНТЕЗ ИНТЕРЛЕЙКИНА-18 ЧЕЛОВЕКА В ТРАНСГЕННЫХ РАСТЕНИЯХ. Турчинович А.А., Дейнеко Е.В., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Храпов Е.А., Сенников С.В. 2007 г. № 2302460
  18. СПОСОБ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТИПИРОВАНИЯ ШТАММОВ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗНОГО КОМПЛЕКСА. Филипенко М.Л., Норкина О.В., Краснов В.А., Киншт В.Н. 2004 г. № 2237090

Оборудование


  • Амплификатор Real-time CFX384 (Bio-Rad);
  • амплификатор Real-time CFX96 (Bio-Rad);
  • пиросеквенатор (QIAGEN);
  • центрифуга Avanti J-26 XP I (Beckman Coulter);
  • хроматограф DuoFlow (Bio-Rad); автоматизированная система Biomek2000 (Beckman Coulter);
  • микробилогический бокс, сертифицированный по 3-4 группе биобезопасности.




© Copyright 2018. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика