Лаборатория фармакогеномики [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
ИХБФМ СО РАН » ru » Структура института » Лаборатории » Лаборатория фармакогеномики
Лаборатория фармакогеномики

Лаборатория фармакогеномики

Заведующий лабораторией



Филипенко Максим Леонидович
кандидат биологических наук

телефон: (383) 363-51-70




Сотрудники

ФИО Должность Звание Телефон E-mail Researcher ID
1. Филипенко Максим Леонидович Зав. лабораторией к.б.н. 363-51-70
2. Кель Александр Эдуардович с.н.с. к.б.н. 363-51-71
3. Боярских Ульяна Александровна м.н.с. к.б.н. 363-51-71
4. Воронина Елена Николаевна н.с.к.б.н. 363-51-71 G-9834-2013
5. Дымова Майя Александровна м.н.с.к.б.н. 363-51-71 E-8240-2011
6. Сметанина Мария Александровна м.н.с.к.б.н. 363-51-71 I-9741-2014
7. Мишукова Ольга Викторовна м.н.с. 363-51-71
8. Храпов Евгений Александрович м.н.с. 363-51-71
9. Соколова Екатерина Алексеевнам.н.с. к.б.н. 363-51-71 sokolovaea2608@gmail.com
10.Задорожный Андрей Валентинович инженер 363-51-71
11.Оськина Наталья Александровна вед. инженер 363-51-71 G-9830-2013
12.Троменшлегер Ирина Николаевна вед. инженер 363-51-71
13.Шадрина Александра Сергеевна ст.лаборантк.б.н. 363-51-71 G-9753-2013
14.Ермоленко Наталья Александровна ст. лаборант 363-51-71
15.Пашкова Зоя Афанасиевна ст. лаборант 363-51-71
16.Ширшова Арина Николаевна ст. лаборант 363-51-71
17.Афонюшкин Василий Николаевич вед. инженер к.с-х.н. 363-51-71
18.Малова Галина Ивановналаборант
19.Шамовская Дарья Вадимовна ст.лаборант
20.Оскорбин Игорь Петрович ст. лаборант 363-51-71
21.Кечин Андрей Андреевич лаборант 363-51-71

Основные направления исследований


  • Разработка методов выявления структурного полиморфизма геномов:

- молекулярно-генетическая диагностика наследственных и мультифакториальных заболеваний человека, фармакогенетические исследования - выявление соматических мутаций в опухолях и внеклеточных жидкостях при онкологических заболеваниях человека - молекулярно-генетическое типирование бактерий (Mycobacterium tuberculosis, Salmonella, Lactobacillus и другие).

  • Дизайн, клонирование и экспрессия рекомбинантных белков:

- рекомбинантные цитокины и антигены для дендритно-клеточной терапии - новые ферменты для модификации и амплификации ДНК

  • Системная биология и анализ геномных и транскриптомных данных:

- исследование молекулярных механизмов возникновения заболеваний человека и действия лекарственных препаратов - системная биология и биоинформатика микроорганизмов


Важнейшие научные результаты:

  • Совместно с ИКИ СО РАМН созданы рекомбинантные плазмиды для экспрессии искусственного белка, содержащего 11 эпитопов опухоль-ассоциированных антигенов для колоректального рака. Трансфекция рекомбинантных плазмид в дендритные клетки человека позволила достичь стимуляции специфических Т-хелперов и цитотоксических Т-лимфоцитов. [Заявка на изобретение № 2012119658, 2012 г.].
  • Выявлены 6 наиболее частых мутаций генов BRCA1, обуславливающих развитие рака молочной железы у женщин, проживающих в западно-сибирском регионе РФ. Разработана и апробирована система скрининга мутаций BRCA1 (5382 insC, 300 T>G, 3819del5, 3875del4, 185 del AG, 4153 delA, 2800delAA и BRCA2 (6174delT, 9318del4 и 1528del4) с помощью «real-time» ПЦР и последующего анализа кривых плавления с высоким разрешением (HRM). Обнаружено, что носительство аллеля Т (rs1050450) гена GPX1 является протективным в отношении спорадического рака молочной железы. [Ермоленко и др., Генетика, 2010 г.].
  • Проведено исследование механизмов резистентности клеток немелкоклеточного рака легких (НМРЛ) к действию таргетных противоопухолевых препаратов Nutlin-3, tenovin-6 и RITA, активирующих транскрипционный фактор р53. Определены сигнальные пути, активирующиеся в клетках резистентных к действию этих препаратов и ключевые регуляторные молекулы этих сигнальных путей (преимущественно компоненты Act и NFkB сигнальных путей). Найденные ключевые молекулы могут рассматриваться как потенциальные молекулы-мишени для комплексной противоопухолевой терапии. [Боярских У.А. и др., Молекулярная биология, 2011 г.].
  • Создана и охарактеризована представительная коллекция изолятов M.tuberculosis, циркулирующих на различных территориях бывшего СНГ [Dymova et al., BMS, 2011 г]. Показано, что некоторые генетические семейства имеют ассоциацию с множественной лекарственной устойчивостью [Dymova et al., 2011г., JMM; Дымова М.А. и соавт., 2012г., MEDLINE.RU]. Проведено полногеномное секвенирование 10 изолятов M.tuberculosis. Разработан быстрый и эффективный способ скрининга известных и неизвестных мутаций с использованием HRM-PCR анализа в генах rpoB, katG и pncA, отвечающих за лекарственную устойчивость к рифампицину, изониазиду и пиразинамиду, соответственно [Заявка на изобретение № 2012108730/10, 2012 г].
  • Проведено исследование влияния различных генов и негенетических параметров на вариабельность дозы варфарина среди жителей Западно-Сибирского региона. Показано, что только полиморфные локусы генов VKORC1(-1639 G>A) и CYP2C9 (*3) оказывают статистически значимое влияние на подобранную дозу варфарина в исследованной выборке (22,3% межиндивидуальной вариабельности) [Belozerceva L.A., et al,. EPMA J., 2012 г.].
  • Создана программа ProcAnnot, позволяющая производить аннотацию SNP, полученных при анализе геномов разных прокариотических организмов. Помимо картирования этих снипов на гены и определения их синонимичности или несинонимичости, новая программа способна осуществлять Gene set enrichment analysis (GSEA), что позволяет определять, какие метаболические пути были преимущественно затронуты данным списком SNP.
  • Проведено клонирование и экспрессия в клетках E.coli ряда термостабильных ферментов: ДНК лигаза из Pyrococcus abyssi [Закабунин и др., Молекуляр. Биология. 2011 г.]; FEN1 нуклеаза Pyrococcus abyssi, РНКаза HII и эндонуклеаза V из Thermus thermophiles, нативные и гибридные ДНК полимеразы из Geobacillus ssp 777 и Thermococcus celer. Полученные ферменты используются для разработки новых методов анализа ДНК и РНК.

Текущие гранты


Комплексная программа СО РАН (III.2П.1) МКБ

  • проект №1.7.24 «Изучение роли системы ремоделирования внеклеточного матрикса и ее взаимодействия с гладкомышечными клетками в патогенезе варикозной болезни вен» (2015-2017 гг.)

Базовые проекты ПФНИ ГАН

  • VI.55.1.1 Биология бактериально-вирусных сообществ. (2017-2020 гг.)
  • VI.62.1.5 Синтетическая биология: разработка средств манипуляции генетическим материалом и создание перспективных препаратов для терапии и диагностики. (2017-2020 гг.)

Гранты Российского фонда фундаментальных исследований

  • № 16-34-60106 «Исследование механизмов патогенности новой бактерии рода Lactobacillus, вызывающей эндокардит у кур» (2016-2018 гг.)

Стипендии Президента РФ молодым ученым и аспирантам

  • СП-945.2016.4 «Изучение роли системы ремоделирования внеклеточного матрикса и ее взаимодействия с гладкомышечными клетками в патогенезе варикозной болезни вен.» (2016-2017 гг.)


Отчеты по проектам МинОбрНауки России


Публикации 2015-2017 года


  1. Top SNPs from the phenome-wide association study catalog and the risk of varicose veins of lower extremities: A replication study. Shadrina A.S., Smetanina M.A., Sokolova E.A., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Seliverstov E.I., Zakharova E., Ilyukhin E.A., Voronina E.N., Makarov D., Kirienko A., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Meta Gene 2017 V. 12 P. 47 - 49
  2. Allele and genotype frequencies of polymorphisms in cytokine genes in ethnic Russian individuals from Moscow, Russia. Shadrina A.S., Voronina E.N., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Human Immunology 2016 V. 78 N2 P. 190-191.
  3. Epidemiology of Brucellosis and Genetic Diversity of Brucella abortus in Kazakhstan. Shevtsova E., Shevtsov A., Mukanov K., Filipenko M.L., Kamalova D., Sytnik I., Syzdykov M., Kuznetsov A., Akhmetova A., Zharova M., Karibaev T., Tarlykov P., Ramanculov E. PloS ONE 2016 V. 11 N 12 e0167496.
  4. Молекулярная эпидемиология туберкулезной инфекции в Омской области. Пасечник О.А., Дымова М.А., Филипенко М.Л., Стасенко В.Л., Татаринцева М.П., Павлик А.А.Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2016 № 4(89) С. 26-36.
  5. Фенотипические и генетические особенности больных сахарным диабетом 2 типа с различным ответом на терапию метформином в Новосибирской области. Бондарь И.А., Шабельникова О.Ю., Соколова Е.А., Пьянкова О.В., Филипенко М.Л.Сахарный диабет 2016 Т. 19 № 2 С. 125-131.
  6. Allele rs2010963 C of the VEGFA gene is associated with the decreased risk of primary varicose veins in ethnic Russians. Shadrina A.S., Smetanina M.A., Sokolova E.A., Shamovskaya D.V., Sevost'ianova K.S., Shevela A.I., Soldatsky E.Y., Seliverstov E.I., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin E.A., Voronina E.N., Pikalov I.V., Zolotukhin I.A., Kirienko A.I., Filipenko M.L. Phlebology. 2016 принята к печати.
  7. Effect of Modified Heptamethyltrisiloxane on the Efficiency of Agrobacterium-mediated Transformation and Expression of Recombinant Structure in Plant Cell and Tissue Culture. Skaptsov M., Kutsev M., Filipenko M.L., Khrapov E.A., Shinoyama H.Key Engineering Materials 2016 V. 683 P. 506-510
  8. Polymorphisms in the MTHFR and MTR genes and the risk of varicose veins in ethnical Russians. Shadrina A.S., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Soldatsky E.Y., Seliverstov E.., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin E.A., Smetanina M.A., Voronina E.N., Pikalov I.V., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L. Biomarkers 2016 V. 21 N 7 P. 619-624.
  9. Comparison of fluorescent intercalating dyes for quantitative loop-mediated isothermal amplification (qLAMP). Oscorbin I.P., Belousova E.A., Zakabunin A.I., Boyarskikh U.A., Filipenko M.L.BioTechniques 2016 V. 61 N 1 P. 20-25.
  10. GTRD: a database of transcription factor binding sites identified by ChIP-seq experiments. Yevshin I., Sharipov R.N., Valeev T., Kel A.E., Kolpakov F.Nucleic Acids Res.2016 P. 1-7.
  11. No Evidence of a Common DNA Variant Profile Specific to World Class Endurance Athletes. Rankinen., Fuku N., Wolfarth B., Wang G., Sarzynski M.A., Alexeev D.G., Ahmetov I.I., Boulay M.R., Cieszczyk P., Eynon N., Filipenko M.L., Garton F.C. Generozov E.V., Govorun V.M., Houweling P.J., Kawahara T., Kostryukova E.S., Kulemin N.A., Larin A.K., Maciejewska-Karłowska A., Miyachi M., Muniesa C.A., Murakami H., Ospanova E.A., Padmanabhan S., Pavlenko A.V., Pyankova O.N., Santiago C., Sawczuk M., Scott R.A., Uyba V.V., Yvert T., Perusse L., Ghosh S., Rauramaa R., North K.N., Lucia A., Pitsiladis Y., Bouchard C. PloS ONE 2016 V. 11 N 1 e0147330.
  12. Выявление полиморфных вариантов генов, ассоциированных с риском варикозной болезни нижних конечностей у русских жителей Российской Федерации. Шадрина А.С., Сметанина М.А., Севостьянова К.С., Соколова Е.А., Шевела А.И., Солдатский Е.Ю., Селиверстов Е.И., Демехова М.Ю., Шонов О.А., Илюхин Е.А., Воронина Е.Н., Пикалов И.В., Золотухин И.А., Кириенко А.И., Филипенко М.Л. Флебология 2016 Т. 10 № 2 С. 68-76.
  13. Молекулярно-генетическая характеристика лекарственно-устойчивых штаммов M.TUBERCULOSIS В Омской области. Пасечник О.А., Стасенко В.Л., Дымова М.А., Татаринцева М.П., Колесникова Л.П. Инфекционные болезни 2016 Т. 14 S1 С. 224.
  14. Полиморфные варианты rs13155212 (T/C) и rs7704267 (G/C) гена AGGF1 и риск развития варикозного расширения вен нижних конечностей в популяции этнических русских. Шадрина А.С., Сметанина М.А., Севостьянова К.С., Соколова Е.А., Шевела А.И., Селиверстов Е.И., Демехова М.Ю., Шонов О.А., Илюхин Е.А., Воронина Е.Н., Золотухин И.А., Кириенко А.И., Филипенко М.Л.Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2016 Т. 161 № 5 С. 642-646.
  15. Антагонистическая активность лактобактерий из кишечника сельскохозяйственной птицы в отношении клинических изолятов salmonella enterica. Афонюшкин В.Н., Троменшлегер И.Н., Филипенко М.Л., Храпов Е.А., Дударева Е.В. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2016 Т. 161 № 6 С. 757-760.
  16. Cтруктурный анализ биосинтезированной целлюлозы (наноцеллюлозы) по результатам конфокальной микроскопии. Ларионов П.М., Филипенко М.Л., Ступак В.В., Харченко А.В., Афонюшкин В.Н., Терещенко В.П., Баринов А.А. Сибирский научный медицинский журнал. 2016. Т. 36. № 4 С. 5-9.
  17. Генетические основы хронических заболеваний вен нижних конечностей: обзор современных представлений. Сметанина М.А., Шадрина А.С., Золотухин И.А., Филипенко М.Л. Флебология. 2016 Т. 10 № 4 С. 199-213.
  18. Chromosome aberrations in peripheral blood lymphocytes of lung cancer patients exposed to radon and air pollution. Minina V.I., Sinitsky M.Y., Druzhinin V.G., Fucic A., Bakanova M.L., Ryzhkova A.V., Savchenko Y.A., Timofeeva A.A., Titov R.A., Voronina E.N., Titov V.A. Eur. J. Cancer. Prev. 2016 V. 25 N 4 P. 70-77.
  19. Этиология и патогенез гепатитов кур. Козлова Ю.Н., Афонюшкин В.Н., Черепушкина В.С., Хоменко Ю.С., Березин С.С. Птицеводство. 2016 № 10С. 25-32
  20. Prediction of protein-DNA interactions of transcription factors linking proteomics and transcriptomics data. Kondrakhin Yu., Valeev T., Yevshin I., Kolpakov F.A., Kel A.E. EuPA Open Proteomics. 2016 V. 13P. 14-23
  21. Use of the VH6-1 gene segment to code for anti-interleukin-18 autoantibodies in multiple sclerosis. Tumentseva M., Morozova V.V., Zakabunin A.I., Korobko D., Malkova N., Filipenko M.L., Tikunova N.V.Immunogenetics 2016 V. 68 N 4 P. 237-246.
  22. НАНОайболиты. Бактериофаги как альтернатива антибиотикам в ветеринарии. Филипенко М.Л., Афонюшкин В.Н., Козлова Ю.Н. Наука из первых рук. 2016 Т. 70 № 4 С. 82-87.
  23. Multi-omics “upstream analysis” of regulatory genomic regions helps identifying targets against methotrexate resistance of colon cancer. Kel A.E., Stegmaier P., Valeev T., Koschmann J., Poroikov V., Kel-Margoulis O., Wingender E. EuPA Open Proteomics. 2016 V. 11 P. 1-13.
  24. HFE p.C282Y gene variant is associated with varicose veins in Russian population. Sokolova E.A., Shadrina A.S., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Soldatsky E.Y., Seliverstov E.I., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin B.A., Smetanina M.A., Voronina E.N., Zolotukhin I.A., Filipenko M.L.Clinical and Experimental Medicine. 2016 V. 16 N 3 P. 463-470
  25. Полиморфизм гена APOE как фактор риска дислипидемии, атеротромбоза и потенциальный фармакогенетический маркер терапии статинами у пациентов высокого риска сердечно-сосудистых осложнений. Кох Н.В., Воронина Е.Н., Лифшиц Г.И. Атеросклероз и дислипидемии. 2016 № 3 (24) С. 107-115.
  26. Distribution of EGFR Mutations in 10,607 Russian Patients with Lung Cancer. Imyanitov E.N., Demidova I.A., Gordiev M.G., Filipenko M.L., Kekeyeva T.V., Moliaka Y.K., Gervas P.A., Kozhemyako V.B., Vodolazhskiy D.I., Sergeyeva L.A., Fattakhova D.U., Iyevleva A.G., Mitiushkina N.V., Kuligina E.S., Barinov A.A., Mommaeva M.S., Aleksakhina S.N., Tsimafeyeu I.V., Tjulandin S.A.Molecular Diagnosis & Therapy 2016 V. 20 N 4 P. 401-406
  27. Identification of mechanism of semisynthetic derivative of glycyrrhetinic acid Soloxolone methyl on cancer cell. Logashenko E.B., Markov A.V., Kel A.E., Кель-Маргулис О., Zenkova M.A.New Horizons in Translational Medicine. 2016 V. 3 N 2 P. 147.
  28. Association of polymorphisms near the FOXC2 gene with the risk of varicose veins in ethnic Russians. Shadrina A.S., Smetanina M.A., Sokolova E.A., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin E.A., Voronina E.N., Zolotukhin I.A, Kirienko A.I., Filipenko M.L. Phlebology 2016 V. 31 N 9 P. 640-648
  29. Полиморфизм гена цитохрома Р450 CYP1A1 (ILE462VAL) в популяциях тундровых ненцев Ямало-Ненецкого автономного округа, нганасан Таймыра и русских Сибири. Тийс Р.П., Осипова Л.П., Чуркина Т.В., Табиханова Л.Э., Личман Д.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Вавиловский журнал генетики и селекции.2016 Т. 20 № 1 С. 16-22.
  30. Нейроподобный текст-майнинг для выявления и характеризации самых популярных микроРНК. Кечин А.А., Кель А.Э., Кушлинский Н.Е., Филипенко М.Л. Нейрокомпьютеры: разработка, применение. 2016 № 9 С. 1-12.
  31. Полиморфные варианты гена системы биотрансформации ксенобиотиков GSTP1 у ненцев и нганасан тундры по сравнению с русскими. Тийс Р.П., Осипова Л.П., Личман Д.В., Табиханова Л.Э., Чуркина Т.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л., Кривощеков С.Г. Физиология человека. 2016 Т. 42 № 2 P. 112-120.
  32. Генотипирование и определение масти древних лошадей Бурятии. Куслий М.А., Дружкова А.С., Попова К.О., Воробьева Н.В., Макунин А.И., Юрлова А.А., Тишкин А.А., Миняев С.С., Трифонов В.А., Графодатский А.С., Дымова М.А., Филипенко М.Л. Цитология 2016 Т. 58 № 4 С. 304-308
  33. Designing the method for optical in vitro monitoring of the cell-mediated scaffold technology for bone regeneration based on laser-induced fluorescence spectroscopy. Larionov P. M., Maslov N.A., Papaeva E.O., Tereshchenko V.P., Khlestkin V.K., Bogachev, S.S., Proskurina A.S., Titov A.T., Filipenko M.L., Pavlov V.V., Kudrov G.A., Orishich A.M.AIP Conference Proceedings 2016 V. 176 pii. 020041.
  34. Resilience to orthostasis and haemorrhage: A pilot study of common genetic and conditioning mechanisms. Dmitry M. Davydov, Zhdanov R. I., Dvoenosov V.G., Kravtsova O.A., Voronina E.N., Filipenko M.L.Scientific Reports 2015 V. 5 P. 10703 1-17.
  35. DNA-Binding Domain of DNA Ligase from the Thermophilic Archaeon Pyrococcus abyssi: Improving Long-Range PCR and Neutralization of Heparin’s Inhibitory Effect. Oscorbin I.P., Boyarskikh U.A., Zakabunin A.I., Khrapov E.A., Filipenko M.L. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2015 V. 176 N7 P. 1859-1869.
  36. Massive Parallel Sequencing for Diagnostic Genetic Testing of BRCA Genes - a Single Center Experience.Ermolenko N.A., Boyarskikh U.A., Kechin A.A., Mazitova A.M., Khrapov E.A., Petrova V.D., Lazarev A.F., Kushlinskii N.E., Filipenko M.L.Asian Pacific Journal of Cancer Prevention 2015 V. 16 N 17 P. 7935-7941
  37. The protective effect of G1958A SNP on the MTHFD1 gene in susceptibility to non-Hodgkin malignant lymphomas. Berezina O.V., Shadrina A.S., Voropaeva E.N., Pospelova T.I., Filipenko M.L. European Journal of Cancer Suplements 2015 V. 13 N 1 P. 5
  38. Genetic diversity of Brucella abortus and Brucella melitensis in Kazakhstan using MLVA-16. Shevtsov A., Ramanculov E., Shevtsova E., Kairzhanova A., Tarlykov P., Filipenko M.L., Dymova M.A., Abisheva G., Jailbekova A., Kamalova D., Chsherbakov A., Tulegenov S., Akhmetova A., Sytnik I., Karibaev T., Mukanov K.Infect. Genet. Evol. 2015 V. 34 P. 173–180
  39. Association of SNPs of HFE gene with varicose veins in Russian population. Sokolova E.A., Shadrina A.S., Sevostyanova K.S., Shevela A.I., Soldatsky E.Y., Seliverstov E.I., Demekhova M.Y., Shonov O.A., Ilyukhin E.A., Smetanina M.A., Voronina E.N., Filipenko M.L. Int. Angiol. 2015 V. 34 Suppl.1 to No.4 P. 27 .
  40. DNA methylation and gene expression profiling reveals MFAP5 as a regulatory driver of extracellular matrix remodeling in varicose vein disease. Smetanina M.A. Int. Angiol.2015 V. 34 Suppl.1 to No.4 P. 108
  41. Large Fragment of DNA Polymerase I from Geobacillus sp. 777: Cloning and Comparison with DNA Polymerases I in Practical Applications. Oscorbin I.P., Boyarskikh U.A., Filipenko M.L.Mol. Biotechnol. 2015 V. 57 P. 10 P. 947-959.
  42. Genome-wide significant association with seven novel multiple sclerosis risk loci. Lill CM, Luessi F, Alcina A, Sokolova E.A., Ugidos N, de la Hera B, Guillot-Noël L, Malhotra S, Reinthaler E, Schjeide BM, Mescheriakova JY, Mashychev A, Wohlers I, Akkad DA, Aktas O, Alloza I, Antigüedad A, Arroyo R, Astobiza I, Blaschke P, Boyko AN, Buttmann M, Chan A, Dörner T, Epplen JT, Favorova OO, Fedetz M, Fernández O, García-Martínez A, Gerdes LA, Graetz C, Hartung HP, Hoffjan S, Izquierdo G, Korobko DS, Kroner A, Kubisch C, Kümpfel T, Leyva L, Lohse P, Malkova NA, Montalban X, Popova EV, Rieckmann P, Rozhdestvenskii AS, Schmied C, Smagina IV, Tsareva EY, Winkelmann A, Zettl UK, Binder H, Cournu-Rebeix I, Hintzen R, Zimprich A, Comabella M, Fontaine B, Urcelay E, Vandenbroeck K, Filipenko M.L., Matesanz F, Zipp F, Bertram L.Journal of Medical Genetics. 2015 V. 52 N 12 P. 848-855
  43. Новая модификация ПЦР-метода определения антигенной структуры Salmonella enterica серотипов Enteritidis, Infantis, Virchow, Typhimurium. Афонюшкин В.Н., Дударева Е.В., Троменшлегер И.Н., Филипенко М.Л. БИО. Журнал для специалистов птицеводческих и животноводческих хозяйств 2015 № 3 (174) С. 16-19
  44. Перемешивание кормовых масс в кишечнике лабораторных мышей под воздействием препаратов, модулирующих моторику кишечника. Афонюшкин В.Н., Филипенко М.Л., В.Ю.Коптев, М.А.Титова, С.А. Боляхина, В.С. Черепушкина. БИО. Журнал для специалистов птицеводческих и животноводческих хозяйств. 2015 Т. 242 № 1 С. 81-88.
  45. Replication of KCNJ11 (p.E23K) and ABCC8 (p.S1369A) Association in Russian Diabetes Mellitus 2 Type Cohort and Meta-Analysis.Sokolova E.A., Bondar I.A., Shabelnikova O.Yu., Pyankova O.V., Filipenko M.L.PloS ONE 2015 V. 10 N 5 e0124662.
  46. Dendritic Cells Transfected with a DNA Construct Encoding Tumour-associated Antigen Epitopes Induce a Cytotoxic Immune Response Against Autologous Tumour Cells in a Culture of Mononuclear Cells from Colorectal Cancer Patients. Kulikova E. V., Kurilin V. V., Shevchenko J. A., Obleukhova I. A., Khrapov E.A., Boyarskikh U.A., Filipenko M.L., Shorokhov R. V., Yakushenko V. K., Sokolov A. V., Sennikov S.V.Scandinavian journal of immunology. 2015 V. 82 N 2 P. 110-117.
  47. TERT polymorphisms rs2853669, rs2736100, rs7726159 and rs10069690 and the risk of non-Hodgkin’s lymphoma in ethnical Russians. Shadrina A.S., Berezina O.V., Ovchinnikov V.S., Voropaeva E.N., Pospelova T.I., Filipenko M.L.Telomere and Telomerase. 2015 N 2 P. e736 .
  48. Mutations in the pncA and rpsA genes among 77 Mycobacterium tuberculosis isolates in Kazakhstan. Akhmetova A, Kozhamkulov U, Bismilda V, Chingissova L, Abildaev T, Dymova M.A., Filipenko M.L., Раманкулов Е.М.The International Journal of Tuberculosis and Lung Disease. 2015 V. 19 N 2 P. 179-184.
  49. Cytochrome P450 1A2 co-determines neuroleptic load and may diminish tardive dyskinesia by increased inducibility. Ivanova S.A., Toshchakova V.A., Filipenko M.L., Fedorenko O.Y., Boyarko E.G., Boiko A.S., Semke A.V., Bokhan N.A., Aftanas L.I., Loonen A.J.The World Journal of Biological Psychiatry. 2015 V. 16 N 3 P. 200-205 .
  50. TERT polymorphisms rs2853669 and rs7726159 influence on prostate cancer risk in Russian population. Shadrina A.S., Boyarskikh U.A., Os'kina N.A., Sinkina T.V., Lazarev A.F., Petrova V.D., Filipenko M.L. Tumor Biology. 2015 V. 36 N 2 P. 841-847.
  51. Серологическая диагностика вариантных штаммов болезни Гамборо у цыплят-бройлеров. Арискина Ю.С., Афонюшкин В.Н., Дударева Е.В. БИО. Журнал для специалистов птицеводческих и животноводческих хозяйств. 2015 №5 (176) С. 4-7.
  52. Концентрация цинка и магния в сыворотке крови цыплят-бройлеров как биохимический маркер для поиска причин развития у них перозиса. Афонюшкин В.Н., Черепушкина В.С., Дударева Е.В., Донченко О.А. БИО. Журнал для специалистов птицеводческих и животноводческих хозяйств. 2015 №1/2 (172-173) С. 16-19.
  53. Генетическое разнообразие изолятов Mycobacterium avium, циркулирующих на территории западной Cибири. Ионина С.В., Дымова М.А., Филипенко М.Л., Донченко Н.А.Актуальные вопросы ветеринарной биологии. 2015 № 4 (28) С. 31-37.
  54. Разработка метода выявления соматических мутаций гена PIK3CA методом мультиплексной аллель-специфичной ПЦР в режиме реального времени и его валидация в опухолях больных раком молочной железы. Филипенко М.Л., Шамовская Д.В., Оськина Н.А., Оскорбин И.П., Храпов Е.А., Овчинникова Л.К., Герштейн Е.С., Кушлинский Н.Е. Альманах клинической медицины. 2015 № 41 С. 12-18.
  55. МикроРНК – новые перспективные биомаркеры опухолей и мишени химиотерапии. Часть 3. Терапевтическое применение микрорнк. Методы количественного определения. Ширшова А.Н., Сметанина М.А., Аушев В.Н., Филипенко М.Л., Кушлинский Н.Е. Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии. 2015 №4 С. 31-39
  56. МикроРНК – новые перспективные биомаркеры опухолей и мишени химиотерапии. Часть 1. История открытия, биогенез и использование. Роль микроРНК в качестве биомаркеров. Ширшова А.Н., Сметанина М.А., Аушев В.Н., Филипенко М.Л., Кушлинский Н.Е. Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии. 2015 №2 С. 33-43.
  57. МикроРНК – новые перспективные биомаркеры опухолей и мишени химиотерапии. Часть 2. исследование микроРНК в клинике онколо-гических заболеваний. Ширшова А.Н., Сметанина М.А., Аушев В.Н., Филипенко М.Л., Кушлинский Н.Е. Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии 2015 №3 С. 35-50
  58. Полиморфизм генов CYP1A2, CYP2D6 у больных шизофренией с лекарственно-индуцированными нейролептическими побочными эффектами. Иванова С.А., Филипенко М.Л., Вялова Н.М., Воронина Е.Н., Пожидаев И.В., Османова Д.З., Иванов М.В., Федоренко О.Ю., Семке А.В., Бохан Н.А.Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2015 Т. 160 № 11 С. 639-643
  59. Выявление и характеризация рифампицинустойчивых изолятов Mycobacterium tuberculosis. Чередниченко А.Г., Дымова М.А., Солодилова О.А., Петренко Т.И., Прозоров А.И., Филипенко М.Л. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2015Т. 160 № 11 С. 608-613
  60. Генетические предикторы ответа на иммуномодулирующую терапию рассеянного склероза. Коробко Д.С., Малкова Н.А., Соколова Е.А., Филипенко М.Л.Вестник НГУ. Серия: Биология,клиническая медицина 2015 Т. 13 № 1 С. 5-10
  61. Выбор патогенетической терапии рассеянного склероза с позиций фармакогеномики. Коробко Д.С., Малкова Н.А., Соколова Е.А., Филипенко М.Л. Журнал неврологии и психиатрии им. Корсакова. 2015 V. 115 N 8-2 P. 60-61.
  62. Мониторинг уровня цинка в крови цыплят в качестве маркера мальабсорбции и синдрома расслоения по массе. Черепушкина В.С., Афонюшкин В.Н. Информация и образование: границы коммуникаций 2015 № 7 (15) С. 143-145.
  63. Генетический полиморфизм факторов свертывания крови FII и FV в популяции коренных этносов (тундровых и лесных ненцев, нганасан), русских Северной Сибири и их метисов в связи с риском развития тромбозов. Тийс Р.П., Осипова Л.П., Табиханова Л.Э., Чуркина Т.В., Личман Д.В., Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. Медицинская генетика. 2015 № 7 С. 27-31
  64. Биомаркеры для своевременной диагностики колоректального рака. Соколова Е.А., Боярских У.А., Ширшова А.Н., Кель А.Э., Филипенко М.Л. Клиническая лабораторная диагностика. 2015 № 12 С. 15-23
  65. Распределение генов фолатного цикла в популяции подростков г.Барнаула Алтайского края. Строзенко Л.А., Гордеев В.В., Лобанов Ю.Ф., Момот А.П., Воронина Е.Н. Мать и дитя в Кузбассе. 2015 № 1 С. 29-34.
  66. Исследование ассоциации полиморфизма генов ферментов детоксикации ксенобиотиков и факторов среды с риском плоскоклеточного рака легкого у мужчин. Гордеева Л.А., Мун С.А., Воронина Е.Н., Магатина А.Д., Титов В.А., Рагожина С.Е., Вафин И.А., Филипенко М.Л., Глушков А.Н. Медицина в Кузбассе 2015 № 3 С. 14-21.
  67. Разработка набора реагентов для количественного определения молекул ДНК TREC и KREC в цельной крови и сухих пятнах крови методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времени. Гордукова М.А., Оскорбин И.П., Мишукова О.В., Зимин С.Б., Зиновьева Н.В., Давыдова Н.В., Смирнова А.С., Никитина И.А., Корсунский И.А., Филипенко М.Л., Продеус А.П. Медицинская иммунология. 2015 Т. 17 № 5 С. 467-478.
  68. МикроРНК при онкологических заболеваниях. Ширшова А.Н., Аушев В.Н., Филипенко М.Л., Кушлинский Н.Е. Молекулярная медицина 2015 № 2 С. 4-12

Патенты


  1. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ УСТОЙЧИВЫХ К ПИРАЗИНАМИНУ ИЗОЛЯТОВ Mycobacterium tuberculosis. Филипенко М.Л., Дымова М.А., Храпов Е.А., Боярских У.А. 2015 г. № 2552214.
  2. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИТЕЛ К БАКТЕРИАЛЬНЫМ АНТИГЕНАМ. Афонюшкин В.Н., Филипенко М.Л., Киревичева Анна Сергеевна, Мишукова О.В., Черепушкина В.С., Ширшова А.Н. 2015 г. № 2563885.
  3. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЯ ТРАНСКРИПЦИИ ГЕНА, КОДИРУЮЩЕГО ХЕМОКИН CCL2 (МСР-1) ЧЕЛОВЕКА И НАБОР ДЛЯ ЕГО ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ. Филипенко М.Л., Боярских У.А., Храпов Е.А., Силков А.Н., Сенников С.В. 2014 г. № 2522801.
  4. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCI-UB-POLYEPI, СОДЕРЖАЩАЯ ЭПИТОПЫ ОПУХОЛЬ-АССОЦИИРОВАННЫХ АНТИГЕНОВ ДЛЯ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА, И СПОСОБ ЕЕ ПРИМЕНЕНИЯ ДЛЯ СТИМУЛЯЦИИ СПЕЦИФИЧЕСКОГО ПРОТИВООПУХОЛЕВОГО ИММУННОГО ОТВЕТА ПРОТИВ КЛЕТОК КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА. Сенников С.В., Филипенко М.Л., Курилин В.В., Куликова Е.В., Храпов Е.А., Шевченко Ю.А., Шорохов Р.В., Якушенко В.К., Соколов А.В. 2014 г. № 2507265.
  5. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ МЕТОДИКА ОЦЕНКИ РИСКА ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К ТРОМБОЗУ. «Ноу-хау» (Секрет-производства). Лифшиц Г.И., Кох Н.В., Слепухина А.А., Белеванцева А.В., Филипенко М.Л., Воронина Е.Н. 2014 г.
  6. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ КЛЕТОК НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНОГО РАКА ЛЕГКИХ К ДЕЙСТВИЮ ПРЕПАРАТОВ, РЕАКТИВИРУЮЩИХ БЕЛОК р53. Филипенко М.Л., Боярских У.А., Сметанина М.А., Кель А.Э. 2014 г. № 2509808.
  7. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ УСТОЙЧИВЫХ К РИФАМПИЦИНУ ИЗОЛЯТОВ Mycobacterium tuberculosis. Филипенко М.Л., Дымова М.А., Боярских У.А., Храпов Е.А., Петренко Т.И., Альховик О.И. 2013 г. № 2485177.
  8. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АНТИГЕНОВ БАКТЕРИЙ. Афонюшкин В.Н., Филипенко М.Л., Юшков Ю.Г. 2012 г. № 2451083.
  9. ЭТИДИЙ ЭТИЛСУЛЬФАТ - ФЛУОРЕСЦЕНТНЫЙ КРАСИТЕЛЬ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ. Осадчий С.А., Филипенко М.Л., Боярских У.А. 2011 г. № 2415842.
  10. СПОСОБ СЕКРЕЦИИ ЗЕЛЕНОГО ФЛУОРЕСЦЕНТНОГО БЕЛКА (GFP) ИЗ РАСТИТЕЛЬНЫХ КЛЕТОК. Филипенко М.Л., Храпов Е.А. 2011 г. № 2415936.
  11. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ОРНИТОБАКТЕРИОЗА У СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОЙ ПТИЦЫ. Филипенко М.Л., Хрипко Ю.И., Афонюшкин В.Н., Дударева Е.В. 2010 г. № 2407801.
  12. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pBinPLUS-ARS-EPSPS, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ ЭКСПРЕССИЮ ГЕНА АГРОБАКТЕРИАЛЬНОЙ 5-ЕНОЛПИРУВИЛ-ШИКИМАТ-3-ФОСФАТ-СИНТЕТАЗЫ В ТРАНСГЕННЫХ МИКРОВОДОРОСЛЯХ РОДА ХЛОРЕЛЛА. Филипенко М.Л., Храпов Е.А., Тронева А.В. 2010 г. № 2407794.
  13. СОСТАВ ДЛЯ ОБРАБОТКИ ПТИЦЕВОДЧЕСКИХ ПОМЕЩЕНИЙ. Афонюшкин В.Н., Филипенко М.Л., Дударева Е.В., Морозов К.В. 2010 г. № 2407545.
  14. СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ РОДА SALMONELLA. Филипенко М.Л., Хрипко Ю.И., Афонюшкин В.Н., Боярских У.А., Дударева Е.В. 2009 г. № 2360004.
  15. СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ КУР К ВИРУСНЫМ ИНФЕКЦИЯМ. Филипенко М.Л., Хрипко Ю.И., Морозов К.В., Афонюшкин В.Н. 2009 г. № 2352640.
  16. СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТИ К ТРОМБОФИЛИИ. Воронина Е.Н., Филипенко М.Л. 2009 г. № 2352641.
  17. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pBi101-IL18, КОДИРУЮЩАЯ СИНТЕЗ ИНТЕРЛЕЙКИНА-18 ЧЕЛОВЕКА В ТРАНСГЕННЫХ РАСТЕНИЯХ. Турчинович А.А., Дейнеко Е.В., Филипенко М.Л., Шумный В.К., Храпов Е.А., Сенников С.В. 2007 г. № 2302460
  18. СПОСОБ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТИПИРОВАНИЯ ШТАММОВ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗНОГО КОМПЛЕКСА. Филипенко М.Л., Норкина О.В., Краснов В.А., Киншт В.Н. 2004 г. № 2237090

Оборудование


  • Амплификатор Real-time CFX384 (Bio-Rad);
  • амплификатор Real-time CFX96 (Bio-Rad);
  • пиросеквенатор (QIAGEN);
  • центрифуга Avanti J-26 XP I (Beckman Coulter);
  • хроматограф DuoFlow (Bio-Rad); автоматизированная система Biomek2000 (Beckman Coulter);
  • микробилогический бокс, сертифицированный по 3-4 группе биобезопасности.




© Copyright 2017. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика