Лаборатория биомедицинской химии [Институт химической биологии и фундаментальной медицины]
ИХБФМ СО РАН » ru » Структура института » Лаборатории » Лаборатория биомедицинской химии
Лаборатория биомедицинской химии

Лаборатория биомедицинской химии

Директор Института, заведующий лабораторией




Пышный Дмитрий Владимирович

Директор Института
чл.-корр.РАН, профессор, доктор химических наук, доцент,
Лауреат VII Конкурса молодых ученых Европейской Академии наук, Лауреат Премии журнала «Биоорганическая химия», лауреат Премии МАИК за лучшую публикацию.

телефон: (383) 363-51-51,


Сотрудники

ФИО Должность Звание Телефон Researcher ID
Амирханов Нариман Валерманович с.н.с. к.х.н. 363-51-90 G-3503-2013
Барановская Елизавета Евгеньевна инженер 363-51-22
Бобрикова Екатерина Николаевна инженер 363-51-02
Булгакова Анастасия Евгеньевнаст.лаборант 363-51-72
Бушуева Татьяна Юрьевна инженер 363-51-36
Веньяминова Лариса Николаевна вед. инженер 363-51-72
Горбунова Екатерина Андреевна ст.лаборант 363-51-34
Григорьева Евгения Владимировна инженер 363-51-02
Дмитриенко Елена Владимировнам.н.с. к.х.н. 363-51-02 I-4567-2017
Жарков Тимофей Дмитриевичст.лаборант 363-51-72
Зайцев Дмитрий Евгеньевичвед. инженер 363-51-72
Замосковцева Анастасия Алексеевнаинженер 363-51-34
Илющенко Валерия Викторовна ст.лаборант 363-51-34
Костина Елена Викторовна н.с. к.б.н. 363-51-72
Кулмухамедова Елена Михайловна ст. лаборант 363-51-72
Ломзов Александр Анатольевич с.н.с. к.ф.-м.н. 363-51-35 G-4750-2013
Максакова Галия Атаулловна ведущий инженерк.х.н. 363-51-72
Малова Евгения Андреевна инженер 363-51-36
Попова (Фоменко) Виктория Константиновна инженер 363-51-72
Порываева Алена Васильевна ст.лаборант 363-51-72
Пышный Дмитрий Владимирович Директор Института,зав. лабораторией чл.-корр.РАН,
профессор, д.х.н.
363-51-51 F-4729-2013
Пышная Инна Алексеевна с.н.с. к.х.н. 363-51-35 F-9519-2013
Рябинин Владимир Алексеевич с.н.с.к.х.н. 363-51-73 AAF-6454-2021
Синяков Александр Николаевич в.н.с. к.х.н. 363-51-73 H-1129-2013
Степанова Татьяна Владимировна вед. инженер 363-51-72
Таратайко Андрей Игоревичн.с. к.х.н. 363-51-72
Хомякова Галина Викторовна инженер 363-51-72
Чижик Евгения Игоревна инженер 363-51-72
Чуканов Никита Владимирович н.с. к.х.н. 363-51-72
Чубаров Алексей Сергеевичн.с. к.х.н. 363-51-83 A-6530-2014
Яцученко Полина Александровна лаборант 363-51-72

Основные направления исследований


  • Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными, термодинамический анализ комплексообразования нуклеиновых кислот.
  • Термодинамический анализ комплексообразования нуклеиновых кислот.
  • Разработка биоаналитических систем на основе микро- и наноструктурированных материалов, в том числе молекулярно-импринтированных полимеров и аптамеров.
  • ДНК-наноархитектоника – исследование самоорганизующихся супрамолекулярных ансамблей на основе нуклеиновых кислот.

Важнейшие научные результаты


  • Разработаны принципы рационального конструирования олигонуклеотидов, их производных и аналогов – необходимого инструментария для молекулярной диагностики, молекулярной биологии, биофизики, а также НК-направленных агентов как перспективных терапевтических препаратов Kupryushkin M.S. Organic Letters. 2014; Pyshnaya I.A. et al., BioMed Research Intern. 2014; Пышный Д.В. Успехи химии. 2012.
  • Изучены физико-химические особенности образования тандемных олигонуклеотидных комплексов с ДНК, конкатамерных олигонуклеотидных комплексов и ДНК-ДНК комплексов олигонуклеотидов, несущих ненуклеотидные вставки на основе фосфодиэфиров олигометилендиолов и олигоэтиленгликолей. Полученные термодинамические характеристики позволяют создавать олигонуклеотидные зонды с направленно пониженной гибридизационной способностью и производить расчет стабильности как совершенных, так и несовершенных тандемных комплексов в различных буферных условиях Pyshnyi D.V. et al., J. Biomol. Struct. Dyn. 2003; Pyshnyi D.V. et al., J. Biomol. Struct. Dyn. 2006; Ломзов А.А. и др., Докл. АН. 2006.
  • С использованием олигонуклеотидов, несущих ненуклеотидные вставки, разработан высокоселективный подход к анализу точечных мутаций в ДНК и направленной функционализации олигонуклеотидов Дмитриенко Е.В. и др., Биоорган. химия. 2010.; Виноградова О.А. и др., Молекуляр. биология. 2007; Kupryushkin M.S. Organic Letters. 2014.
  • Исследованы особенности ферментативного лигирования олигонуклеотидов на ДНК матрице в зависимости от нуклеотидной композиции в точке одноцепочечного разрыва ДНК. Выявленные характеристики позволяют производить выбор оптимальной структуры олигонуклеотидных зондов для выявления точечных мутаций в ДНК методом лигирования олигонуклеотидов (OLA) Skobeltsyna L.M. et al., Mol. Biotechnol. 2010.
  • Предложен новый подход к получению молекулярно импринтированных полимеров (МИПов), содержащих в своей структуре отпечатки биомолекул и способных к их специфическому распознаванию Dmitriyenko E.V. et al., J. Mol. Recognit. 2013.
  • Доказано, что пространственную организацию супрамолекулярных конкатамерных комплексов ДНК можно направлено изменять, используя в качестве мономерных блоков модифицированные дуплексы ДНК, несущие вставки ненуклеотидной природы Виноградова О.А. и др., Успехи химии. 2012; Lomzov A.A. J. Nanosci. Nanotechno. 2015.
  • Разработан метод введения спиновых меток различной природы в структуру комплексов нуклеиновых кислот. Впервые продемонстрирована возможность измерения спин-спинового расстояния в таких комплексах при физиологических температурах (37oC) методом ЭПР Shevelev G.Y. Journal of the American Chemical Society. 2014.

Текущие гранты


Базовые проекты
Программа фундаментальных научных исследований государственных академий наук

  • Проект ФИМТ-154 Разработка электронного нанопроволочного биосенсора для анализа РНК-маркеров немелкоклеточного рака легкого.(0309-2014-0044)
  • Проект 1.1.5.Разработка микроустройств для проведения параллельного массивного анализа ДНК (0309-2015-0003) рук. Синяков А.Н.
  • ПФНИ ГАН VI.62.1.4, 0309-2016-0004 Интеллектуальные материалы для биомедицины. (2018 - 2020 гг.)
  • Проект КП ФНИ СО РАН II.1 (ГЗ № 0309-2018-0017) Разработка новых способов экспресс-диагностики заболеваний человека на основе детекции органоспецифических маркеров с помощью современных физических и физико-химических подходов. (2018 - 2020 гг.)

Гранты Российского научного фонда

  • № 19-15-00217 «Многоуровневые транспортеры для эффективной доставки в клетки терапевтических нуклеиновых кислот с различным механизмом действия» (2019-2021 гг.)
  • № 19-14-00204 «Модифицированные ДНК как ингибиторы систем репарации ДНК: определение клеточных мишеней и оптимальных структур для сенсибилизации опухолевых клеток» (2019-2021 гг.)
  • № 18-14-00357 Исследование структурно-функциональных свойств фосфорилгуанидиновых олигонуклеотидов как перспективных инструментов для создания высокочувствительных систем диагностики нуклеиновых кислот. (2018 - 2020 гг.)

Гранты Российского фонда фундаментальных исследований

  • № 17-00-00367 комфи Исследование нуклеотидной специфичности ингибирования трансляции мРНК антибиотиками и аналогами малых РНК. (2018-2020 гг.)
  • № 20-04-00719 А «Псевдоузлы TW-типа - новый вид пространственной организации нуклеиновых кислот: физико-химические свойства и биологическая роль» (2020 - 2022 гг.)
  • № 19-34-90132 Аспиранты «Выявление структурированных мРНК на основе удлинения обратной транскриптазой электронейтральных фосфорилгуанидиновых производных олигонуклеотидов» (2019 - 2021 гг.)

Публикации 2019-2021 года


  1. Rational Design of Albumin Theranostic Conjugates for Gold Nanoparticles Anticancer Drugs: Where the Seed Meets the Soil?. Popova T.V., Pyshnaya I.A., Zakharova O., Akulov A.E., Shevelev O.B., Poletaeva Y., Zavjalov E L, Silnikov V.N., Ryabchikova E.I., Godovikova T.S. Biomedicines. 2021. V. 9. N 1. P. 74.
  2. Terminal mono- and bis-conjugates of oligonucleotides with closo-dodecaborate: synthesis and physico-chemical properties. Novopashina D.S., Vorobyeva M.A., Lomzov A.A., Silnikov V.N., Venyaminova A.G. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. N 1. P. 182.
  3. Reversible Dimerization of Human Serum Albumin. Chubarov A.S., Spitsyna A., Krumkacheva O.A., Mitin O., Suvorov D., Tormyshev V.M., Fedin M.V., Bowman M.K., Bagryanskaya E.G. Molecules. 2021. V. 26. N 1.P. 108.
  4. Data on multimerization efficiency for short linear DNA templates and phosphoryl guanidine primers during isothermal amplification with Bst exo- DNA polymerase. Garafutdinov R.R., Sakhabutdinova A.R., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V. Data in Brief. 2020. V. 29. P. 105188.
  5. Human Serum Albumin Labelled with Sterically-Hindered Nitroxides as Potential MRI Contrast Agents. Dobrynin S., Kutseikin S., Morozov D., Krumkacheva O.A., Spitsyna A., Gatilov Yu., Silnikov V.N., Angelovski G., Bowman M.K., Kirilyuk I., Chubarov A.S. Molecules. 2020. V. 25. E1709.
  6. Prevention of DNA multimerization using phosphoryl guanidine primers during isothermal amplification with Bst exo- DNA polymerase. Garafutdinov R.R., Sakhabutdinova A.R., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V. Biochimie. 2020. V. 168. P. 259-267.
  7. Модификация поверхности КНИ-сенсоров для детекции РНК-биомаркеров. Наумова О. В., Фомин Б. И., Дмитриенко Е.В., Пышная И.А., Пышный Д.В. Физика и техника полупроводников. 2020. Т. 54. выпуск 4. С. 394-399.
  8. Methanethiosulfonate Derivative of OX063 Trityl: A Promising and Efficient Reagent for Side-Directed Spin Labeling of Proteins. Tormyshev V.M., Chubarov A.S., Krumkacheva O., Trukhin D.V., Rogozhnikova O.Yu., Spitsina A.S., Kuzhelev A.A., Koval V.V., Fedin M.V., Godovikova T.S., Bowman M.K., Bagryanskaya E.G. Chem. Eur. J. 2020. V. 26. N 12. P. 2705-2712.
  9. Human tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 possesses transphosphooligonucleotidation activity with primary alcohols. Dyrkheeva N.S., Anarbayev R.O., Lebedeva N.A., Kupryushkin M.S., Kuznetsova A.A., Kuznetsov N.A., Rechkunova N.I., Lavrik O.I. Front. Cell Dev Biol. 2020. V. 8. P. 604732.
  10. Changes in the Ultrastructure of Candida albicans Treated with Cationic Peptides. Grigoryeva A.E., Bardasheva A., Tupitsyna A.V., Amirkhanov N.V., Tikunova N.V., Pyshnyi D.V., Kleshev M.A., Ryabchikova E.I. Microorganisms. 2020. V. 8. N 4. P. 82.
  11. Surface Modification of SOI Sensors for the Detection of RNA Biomarkers. Naumova O.V., Fomin B.I., Dmitriyenko E.V., Pyshnaya I.A., Pyshnyi D.V. Semiconductors. 2020. V. 54. N 4.P. 4 71-475.(переводная версия)
  12. Postsynthetic On-Column 2' Functionalization of RNA by Convenient Versatile Method. Krasheninina O.A., Fishman V.S., Lomzov A.A., Ustinov V.A., Venyaminova A.G. Int. J. Mol. Sci. 2020. V. 21. N 14. P. 5127.
  13. Transport Oligonucleotides-A Novel System for Intracellular Delivery of Antisense Therapeutics. Markov O.V., Filatov A.V., Kupryushkin M.S., Chernikov I.V., Patutina O.A., Strunov A.A., Chernolovskaya E.L., Vlassov V.V., Pyshnyi D.V., Zenkova M.A. Molecules. 2020. V. 25. N 16. E3663.
  14. Application of EPR to porphyrin-protein agents for photodynamic therapy. Sannikova N.E., Timofeev I.O., Chubarov A.S., Lebedeva N.S., Semeikin A.S., Kirilyuk I.A., Tsentalovich Y.P., Fedin M.V., Bagryanskaya E.G., Babaylova E.S. J. Photochem. Photobio. B. 2020. P. 112008.
  15. A QCM-based rupture event scanning technique as a simple and reliable approach to study the kinetics of DNA duplex dissociation. Kurus N.N., Dultsev F.N., Golyshev V.M., Nekrasov D.V., Pyshnyi D.V., Lomzov A.A. Analytical methods. 2020. V. 12. N 30. P. 3771-3777.
  16. G-QUADRUPLEX 2'-F-modified RNA aptamers Targeting hemoglobin: Structure studies and colorimetric assays. Davydova A.S., Timoshenko V.V., Lomzov A.A., Pyshnyi D.V., Venyaminova A.G., Vorobyeva M.A. Anal Biochem. 2020. V. 611. P. 113886.
  17. Amphiphilic “Like-a-Brush” Oligonucleotide Conjugates with Three Dodecyl Chains: Self-Assembly Features of Novel Scaffold Compounds for Nucleic Acids Delivery. Pavlova A.S., Dovydenko I.S., Kupryushkin M.S., Grigoryeva A.E., Pyshnaya I.A., Pyshnyi D.V. Nanomaterials. 2020. V. 10. N 10. P. 1948.
  18. Ultrastructural features of HepG2 and HEK293 spheroids and their interaction with gold nanoparticles. Chelobanov B.P., Poletaeva Y., Epanchintseva A.V., Tupitsyna A.V., Pyshnaya I.A., Ryabchikova E.I. Nanomaterials. 2020. V. 10. N 10. P. 2040.
  19. Structure and Hybridization Properties of Glycine Morpholine Oligomers in Complexes with DNA and RNA: Experimental and Molecular Dynamics Studies Golyshev V.M., Abramova T.V., Pyshnyi D.V., Lomzov A.A. J. Phys. Chem. B. 2019. V. 123 N 50. P. 10571-10581.
  20. Surface modification of SOI based sensors for label-free, high specificity detection of RNA/DNA markers. Dmitriyenko E.V., Naumova O.V., Fomin B.I., Poryvaeva A.V., Kupryushkin M.S., Pyshnaya I.A., Pyshnyi D.V. Проблемы медицинской микологии. 2019. Т. 21 № 2. С. 63.
  21. Исследование структурных и иммунологических свойств химерных белков, содержащих участки MPER ВИЧ-1. Рудометов А.П., Рудометова Н.Б., Щербаков Д.Н., Ломзов А.А., Каплина О.Н., Щербакова Н.С., Ильичев А.А., Бакулина А.Ю., Карпенко Л.И. Acta Naturae. 2019 Т. 11 № 3(42). С. 56-65.
  22. Study of the Staudinger Reaction and Reveal of Key Factors Affecting the Efficacy of Automatic Synthesis of Phosphoryl Guanidinic Oligonucleotide Analogs. Bazhenov M.A., Shernyukov A.V., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V. Биоорганическая химия. 2019 V. 45 N 6 P. 699–708.
  23. New Approach for the Hybridization Analysis of Pathogens. Kostina E.V., Sinyakov A.N., Ryabinin V.A. Биоорганическая химия 2019 V. 45 N 6 P. 841–843
  24. Synthetic Antimicrobial Peptides. II. Antimicrobial and Hemolytic Activity of Cationic Peptides Containing Cysteine Residues with Free Sulfhydryl Groups. Amirkhanov N.V., Tikunova N.V., Pyshnyi D.V. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 16. P. 832–840.
  25. Синтетические антимикробные пептиды. II. Антимикробная и гемолитическая активность катионных пептидов, содержащих остатки цистеина со свободными сульфгидрильными группами. Амирханов Н.В., Тикунова Н.В., Пышный Д.В. Биоорганическая химия. 2019. Т. 45. № 6. С. 832-840.
  26. Antiviral activity of a New Class of Chemically Modified Antisense Oligonucleotides Against Influenza A Virus. Markov A.V., Kupryushkin M.S., Goncharova E.P., Amirkhanov R.N., Vasilyeva S.V., Pyshnyi D.V., Zenkova M.A., Logashenko E.B. Биоорганическая химия. 2019. V. 45 N. 6. P. 773 – 781.
  27. Новые бис-имидазол-содержащие пептидоподобные соединения для металл-независимого расщепления РНК: Синтез и твердофазный метод скрининга. Павлова А.С., Огурцова П.А., Королева Л.С., Серпокрылова И.Ю., Ломзов А.А., Пышная И.А., Сильников В.Н., Пышный Д.В. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 6. P. 812–823.
  28. Nucleic Acids Delivery Into the Cells Using Pro-Apoptotic Protein Lactaptin. Chinak O.A., Golubitskaya E.A., Pyshnaya I.A., Stepanov G.A., Zhuravlev E.S., Richter V.A., Koval O.A. Front Pharmacol. 2019. V. 10. Article 1043.
  29. Algorithm for Searching and Testing the Activity of Antisense Oligonucleotides Exemplified by the mRNA of the rpoD Gene Encoding Staphylococcus aureus RNA Polymerase Sigma Factor. Mironova N.L., Kupryushkin M.S., Khlusevich Y.A., Matveev A.L., Pyshnyi D.V., Zenkova M.A. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 6. P. 668–675.
  30. New hydrazinothiazole derivatives of usnic acid as potent TDP1 inhibitors. Filimonov A.S., Chepanova A.A., Luzina O.A., Zakharenko A.L., Zakharova O., Ilina E.S., Dyrkheeva N.S., Kupryushkin M.S., Kolotaev A.V., Khachatryan D.S., Patel J., Leung I.K.H., Chand R., Ayine-Tora D.M., Reynisson J., Volcho К.P., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I. Molecules. 2019. V. 24. N 20. pii: E3711.
  31. Structural and Aggregation Features of a Human κ-Casein Fragment with Antitumor and Cell-Penetrating Properties. Chinak O.A., Shernyukov A.V., Ovcherenko S.S., Sviridov E.A., Golyshev V.M., Fomin A.S., Pyshnaya I.A., Kuligina E.V., Richter V.A., Bagryanskaya E.G. Molecules. 2019. V. 24. P. 2919.
  32. The Development of Tyrosyl-DNA Phosphodyesterase 1 (TDP1) Inhibitors Based on the Amines Combining Aromatic/Heteroaromatic and Monoterpenoid Moieties. Mozhaitsev E.S., Suslov E.V., Demidova Y., Korchagina D.V., Volcho K, Zakharenko A.L., Vasil'eva I.A., Kupryushkin M.S., Chepanova A., Moscoh Ayine-Tora D., Reynisson J., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I. Letters in Drug Design and Discovery. 2019. V. 16. P. 597-605.
  33. Artificial Anti-HIV-1 Immunogen Comprising Epitopes of Broadly Neutralizing Antibodies 2F5, 10E8, and a Peptide Mimic of VRC01 Discontinuous Epitope. Rudometov A.P., Chikaev A.N., Rudometova N.B., Antonets D.V., Lomzov A.A., Kaplina O.N., Ilyichev A.A., Karpenko L.I. Vaccines (Basel). 2019. V. 7. N 3. P. 83.
  34. Data for isolation and properties analysis of diastereomers of a mono-substituted phosphoryl guanidine trideoxyribonucleotide. Lomzov A.A., Kupryushkin M.S., Shernyukov A.V., Nekrasov M.D., Dovydenko I.S., Stetsenko D.A., Pyshnyi D.V. Data in Brief. 2019. V. 25. P. 104148.
  35. Diastereomers of a mono-substituted phosphoryl guanidine trideoxyribonucleotide: Isolation and properties. Lomzov A.A., Kupryushkin M.S., Shernyukov A.V., Nekrasov M.D., Dovydenko I.S., Stetsenko D.A., Pyshnyi D.V. Biochem. Bioph. Res. Co. 2019. V. 513. N 4. P. 807-811.
  36. Novel Peptide Conjugates of Modified Oligonucleotides for Inhibition of Bacterial RNase P. Novopashina D.S., Vorobjeva M.A., Nazarov A., Davydova A.S., Danilin N., Koroleva L.S., Matveev A.L., Bardasheva A., Tikunova N.V., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V., Altman S., Venyaminova A.G. Front Pharmacol. 2019 V. 10. P. 813.
  37. DNA complexes with human purinic/apyrimidinic endonuclease 1: structural insights revealed by pulsed dipolar EPR with orthogonal spin labeling. Krumkacheva O.A., Shevelev G.Y., Lomzov A.A., Dyrkheeva N.S., Kuzhelev A.A., Koval V.V., Tormyshev V.M., Polienko Y.F., Fedin M.V., Pyshnyi D.V., Lavrik O.I., Bagryanskaya E.G. Nucleic Acids Res. 2019. V. 47. N 15. P. 7767-7780.
  38. Triplet Fullerenes as Prospective Spin Labels for Nanoscale Distance Measurements by Pulsed Dipolar EPR. Krumkacheva O.A., Timofeev I.O., Politanskaya L.V., Polienko Yu. F., Tretyakov E.V., Rogozhnikova O.Yu., Trukhin D.V., Tormyshev V.M., Chubarov A.S., Bagryanskaya E.G., Fedin M.V. Angew. Chem. Int. Ed. 2019. V. 58. P. 13271–13275.
  39. DNA Binding to Gold Nanoparticles through the Prism of Molecular Selection: Sequence – Affinity Relation. Vorobyev P.E., Epanchintseva A.V., Lomzov A.A., Tupikin A.E., Kabilov M.R., Pyshnaya I.A., Pyshnyi D.V. Langmuir 2019. V. 35. N 24. P. 7916-7928.
  40. Molecular dynamics simulation of polarizable gold nanoparticles interacting with sodium citrate. Perfilieva O.A., Pyshnyi D.V., Lomzov A.A. J. Chem. Theory Comput. 2019. V. 15. N 2. P. 1278-1292.
  41. Colloidal FeIII, MnIII, CoIII and CuII hydroxides stabilized by starch as catalysts of water oxidation reaction with one electron oxidant Ru(bpy)33. Сhikunov A. S., Taran O.P., Pyshnaya I.A., Parmon V. N. Chemphyschem. 2019. V. 20 P. 410-421.
  42. Inhibitory Effect of New Semisynthetic Usnic Acid Derivatives on Human Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1. Dyrkheeva N.S., Luzina O., Filimonov A., Zakharova O.D., Ilina E.S., Zakharenko A.L., Kupryushkin M.S., Nilov D., Gushchina I., Švedas V.K., Salakhutdinov N.F., Lavrik O.I. Planta Med. 2019. V. 85. N 2. P. 103-111.
  43. Boosting of the cytotoxic effect of RNAs by using the pro-apoptotic protein lactaptin for delivery of nucleic acids into cancer cells. Golubitskaya E., Chinak O.A., Pyshnaya I.A., Stepanov G.A., Zhuravlev E.S., Richter V.A., Koval O.A. Cell Death Discovery. 2019. P. 28-29.
  44. Novel Bisimidazole-Containing Peptidomimetic Molecules for Мetal-Independent RNA Cleavage: Synthesis and Solid-Phase Screening Method. Павлова А.С., Огурцова П.А., Королева Л.С., Серпокрылова И.Ю., Ломзов А.А., Пышная И.А., Сильников В.Н., Пышный Д.В. Биоорганическая химия. 2019.V. 45. N 6. P. 813–824.
  45. Methods for Molecular Evolution of Polymerases. Zhukov S., Fokina A.A., Stetsenko D.A., Vasilyeva S.V. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 6. P. 726–738.
  46. Bridged Oligonucleotides with Smoothed Hybridization Properties as a Tool for Analysis of Nucleotide Sequences. Pyshnaya I.A., Lomzov A.A., Pyshnyi D.V. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 6. P. 677–683.
  47. A New Approach for the Hybridization Analysis of Pathogens Kostina E.V., Sinyakov A.N., Ryabinin V.A. Биоорганическая химия. 2019. V. 45. N 6. P. 842–844.

Патенты


  1. «Ноу-хау». Устройство для параллельного автоматического измерения КНИ-сенсоров. Пышный Д.В., Пышная И.А., Ломзов А.А., Дмитриенко Е.В. 2017 г.
  2. «СПОСОБ КОНСЕРВАЦИИ ТВЕРДОТЕЛЬНОЙ ПОВЕРХНОСТИ И КОНСЕРВИРУЮЩЕЕ ТВЕРДОТЕЛЬНУЮ ПОВЕРХНОСТЬ ПОКРЫТИЕ». Наумова О. В., Фомин Б. И., Кайгородова Ю. В., Дмитриенко Е.В., Пышный Д.В. 2016 г. № 2601745.
  3. «БИОЧИП И СПОСОБ ТИПИРОВАНИЯ ПАТОГЕНОВ I ГРУППЫ, ОТНОСЯЩИХСЯ К СЕМЕЙСТВАМ АРЕНА- И ФИЛОВИРУСОВ». Синяков А.Н., Рябинин В.А. 2015 г.№ 2562117.
  4. «БИОЧИП И СПОСОБ ТИПИРОВАНИЯ ГЕНОВ ГЕМАГГЛЮТИНИНА И НЕЙРАМИНИДАЗЫ ВИРУСА ГРИППА А». Костина Е.В., Синяков А.Н., Рябинин В.А. 2015 г.№ 2560591.
  5. «НОВЫЕ ТИПЫ МОДИФИЦИРОВАННЫХ НУКЛЕОТИДОВ С ЗАМЕЩЕННОЙ ФОСФАТНОЙ ГРУППОЙ И МЕТОД ИХ ПОЛУЧЕНИЯ». «Ноу-хау» (Секрет производства).Стеценко Д.А., Пышный Д.В., Купрюшкин М.С. 2013 г.
  6. «СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ АМИДОФОСФИТНОГО МОНОМЕРА АХИРАЛЬНОЙ НЕНУКЛЕОТИДНОЙ ВСТАВКИ ДЛЯ МОДИФИКАЦИИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ». Пышный Д.В., Купрюшкин М.С. 2012 г.№ 2460721.
  7. «СПОСОБ ВЫБОРА ДНК-ЗОНДОВ ДЛЯ МИКРОЧИПОВОЙ ДИАГНОСТИКИ, БИОЧИП И СПОСОБ ТИПИРОВАНИЯ ГЕНА НЕЙРАМИНИДАЗЫ И ГЕМАГГЛЮТИНИНА ВИРУСА ГРИППА А». Костина Е.В., Синяков А.Н., Рябинин В.А., Максакова Г.А. 2012 г. № 2470076.
  8. «СПОСОБ СЕЛЕКТИВНОГО ВЫДЕЛЕНИЯ ПОПУЛЯЦИИ ЖИЗНЕСПОСОБНЫХ КЛЕТОК ИЗ БИОЛОГИЧЕСКИХ ЖИДКОСТЕЙ» Лактионов П.П., Вайнер О.Б., Запорожченко И.А., Пышная И.А., Пышный Д.В., Дмитриенко Е.В., Романов С.И., Власов В.В. 2011 г. № 2423698.
  9. «СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ИМПРИНТИРОВАННОГО ПОЛИМЕРА». Дмитриенко Е.В., Пышный Д.В., Рогоза А.В., Пышный Д.В. 2010 г. № 2385889.
  10. «СПОСОБ ДИАГНОСТИКИ ВИРУСНОГО ГЕПАТИТА С И ОПРЕДЕЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТИПА ВИРУСА» Шопаева Г.А., Бейсембаева Ш.А., Пышная И.А., Дмитриенко Е.В., Зарытова В.Ф., Пышный Д.В. 2010 г. № 22681.
  11. «СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ДНК-ЧИПА».Пышная И.А., Дмитриенко Е.В., Пышный Д.В. 2008 г. № 2340677.
  12. «ОЛИГОНУКЛЕОТИДПЕПТИДНЫЙ КОНЪЮГАТ, ОБЛАДАЮЩИЙ СПОСОБНОСТЬЮ РАСЩЕПЛЯТЬ ФОСФОДИЭФИРНЫЕ СВЯЗИ РНК В ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ 5'GpN3'» Миронова Н.Л., Пышный Д.В., Штадлер Д.В., Зенкова М.А., Власов В.В.2007 г. № 2305108.
  13. «СПОСОБ ВЫЯВЛЕНИЯ АНАЛИЗИРУЕМОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ДНК». Пышный Д.В., Иванова Е.М., Пышная И.А., Зарытова В.Ф. 2005 г. № 2259402.
  14. «СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ЗАМЕН В ИЗВЕСТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ». Пышный Д.В., Иванова Е.М., Пышная И.А., Дымшиц Г.М., Зарытова В.Ф. 2005 г. № 2247781.

Оборудование


  • ДНК-синтезатор ASM-800 (БИОССЕТ, Россия);
  • высокоэффективные жидкостные хроматографы Аgilent 1200 (Аgilent Technology, США) и Милихром А4 (ЭкоНова, Россия);
  • спектрофотометр Cary 300 Biomelt (Varian, Австралия), оснащенный терморегулируемой 6-ти кюветной приставкой;
  • БИК-Фурье спектрометр MPA (Bruker Optics, Германия);
  • микроскоп Leica DM 5000 (Leica Microsystems, Германия);
  • система капиллярного электрофореза P/ACE MDQ (Becman Coulter, США);
  • спектрофотометр Nanoview (GE, США); биоаналитическая система Bio-Plex 200 (BioRad, США);
  • система для характеризации наночастиц Malvern Zetasizer Nano (Malvern Instruments Ltd, Великобритания), атомно-силовой микроскоп Multimode 8 (Bruker);
  • автоматические синтезаторы ДНК;
  • ДНК-амплификаторы;
  • ВЭЖХ-хроматографы;
  • споттеры для изготовления ДНК-микрочипов;
  • сканеры микрочипов;
  • оборудование для тонкого химического синтеза.

Услуги





© Copyright 2021. ИХБФМ СО РАН

Яндекс.Метрика