Лаборатория молекулярной микробиологии

Тикунова Нина Викторовна
доктор биологических наук, г.н.с.

телефон: (383) 363-51-57
Email

• Геномика патогенов, переносимых клещами.
  
• Разработка иммунотерапевтических препаратов нового поколения.
  
• Исследование методами комбинаторной биологии гуморального статуса организма человека в норме и при патологии.
  
• Исследование биоразнообразия микробных сообществ экстремальных экологических ниш.
  
• Изучение молекулярной эпидемиологии гастровирусов в Западной Сибири.

• Впервые в Новосибирской области и на территории Алтая в иксодовых клещах обнаружена РНК вируса Кемерово, вызывающего не диагностируемую в настоящее время лихорадочную форму нейроинфекции. Впервые обнаружена РНК этого вируса в клещах Ixodes pavlovskyi. Исследовано молекулярно-генетическое разнообразие инфекционных агентов, передаваемых клещами в сибирском регионе [Ruzek et al., Lancet. 2010. 376, 2104; Demina et al., J. Med. Virol. 2010. 82(6), 965; Romashchenko et al., J. Insect Physiology. 2012. 58(7), 903; Rar et al., Vector-Borne and Zoonotic Diseases. 2011, 11(8), 1013; Rar V., et al., Infect Genet Evol. 2011, 11(8), 1842].
• Сконструированы гуманизированные антитела против вируса клещевого энцефалита, обеспечивающие протекцию модельных животных от введения сотен летальных доз этого вируса. [Леванов и др., Биоорг. химия. 2009. 35, 524; Levanov et. al., Vaccine. 2010. 28, 4415]. Сконструированы полноразмерные антитела человека против ортопоксвирусов, способные нейтрализовать патогенные для человека ортопоксвирусы. [Tikunova N.V. et al., Virus research. 2012. 163(1), 141]. Получены одноцепочечные антитела человека против фактора некроза опухолей, интерлейкина 18, гамма-интерферона человека и исследованы их иммунохимические свойства. [Vikhrova M.A. et al., Hum antibodies. 2010, 19, 71; Вихрова М.А., Биоорг. химия. 2011. 37, 334; Вихрова М.А, Мол. биол. 2011. 45, 96].
• Созданы аутоиммунная, иммунная и наивная комбинаторные библиотеки одноцепочечных антител человека. Получены одноцепочечные антитела человека против основного белка миелина. Показано, что репертуары антител против гамма-интерферона, циркулирующих в организме здоровых людей и больных рассеянным склерозом, существенно различаются. [Gabibov A.G. et al., FASEB J. 2011. 25, 4211].
• Исследован этиологический вклад ротавирусов А и С, норо-, астро-, аденовирусов, патогенных и условно-патогенных бактерий в структуру острых кишечных инфекций у детей раннего возраста г. Новосибирска. Изучены генетические особенности изолятов рота-, норо- и астровирусов, циркулирующих в Западной Сибири; выявлена динамика изменения генетических вариантов этих вирусов за последние годы; доказано существование различий в генотипах ротавирусов, циркулирующих в один и тот же эпидемический сезон в Новосибирске и Омске. Проведено секвенирование полных нуклеотидных последовательностей геномов редких генотипов астровирусов, обнаруженных в Новосибирске. Создан лабораторный вариант мультиплексной ПЦР тест-системы для детекции астро-, бока- и ротавирусов группы С. [Боднев С.А. и др., Эпидемиология и инфекционные болезни. 2010. 1, 40; Нетесов С.В. и др., Вопросы вирусологии. 2010. 6, 19; Babkin I. et. al., Infect Genet Evol. 2012. 12(2), 435].

На базе лаборатории сформирована коллекция экстремофильных микроорганизмов и типовых культур (ЭМТК).

Базовые проекты
Программа фундаментальных научных исследований государственных академий наук

• ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.55.1.1 «Биология бактериально-вирусных сообществ» (2017-2020 гг.)
• ПФИ РАН по приоритетному направлению I.42, ФИМТ, ГЗ «Биологические эффекты бактериофагов в организме млекопитающих» (2018-2020 гг.)
• КП ФНИ СО РАН II.1 Блок: «Молекулярно-генетическое разнообразие микробных сообществ в экстремальных экосистемах. Проект: Исследование биологических процессов, ассоциированных с экстремофильными микроорганизмами: биоразнообразие, биогеотехнологический потенциал». (2018-2020 гг.)
• КП ФНИ СО РАН II.1 Блок: Выявление нарушений микробиома при аллергических (атопический дерматит и бронхиальная астма) и онкологических (неходжкинская лимфома и множественная миелома) заболеваниях. Поиск и характеризация микроорганизмов - потенциальных регуляторов микробиома человека. Проект: «Микробиом человека и сельскохозяйственных животных. Изучение возможностей коррекции» (2018-2020 гг.)

Российский научный фонд

• № 19-75-00065 мол «Роль бактериофагов в развитии Т-хелперного ответа при гематогенной бактериальной инфекции» (2019-2021 гг.)
• № 19-74-00107 мол «Структурный дизайн антител широкой специфичности против вируса клещевого энцефалита» (2019-2021 гг.)
• № 21-14-00360 «Изменения кишечных виромов при хронических заболеваниях кишечника как ключ к нормализации микробиоты»
• № 21-74-00141 «Вклад малоизученных В-клеточных эпитопов N- и S- белка SARS-CoV-2 в иммунный ответ при COVID-19»
• № 22-74-10103 «Молекулярные механизмы протективного иммунитета и антитело-зависимого усиления инфекции при клещевом энцефалите.»

Гранты Российского фонда фундаментальных исследований

• № 18-29-08015 мк «Разработка способов создания геномов искусственных бактериофагов для контроля патогенных бактерий».(2018-2021 гг.)
• № 18-44-540021 р_а «Взаимосвязь феногенетических характеристик вируса клещевого энцефалита и вида клеща-переносчика из различных биотопов природных очагов клещевого энцефалита Новосибирской области» (2018-2020 гг.)

1. Иксодовые инвазии лошадей, сезонная динамика и зараженность пастбищных клещей пироплазмидами в горном Алтае. Марченко В.А., Рар В.А., Бирюков И.В. Российский паразитологический журнал. 2023. Т. 17. 3. С. 352-364. DOI: 10.31016/1998-8435-2023-17-3-352-364
2. Genomes of a Novel Group of Phages That Use Alternative Genetic Code Found in Human Gut Viromes. Babkin I.V. , Tikunov A.Y. , Morozova V.V. , Matveev A.L. , Morozov V.V. , Tikunova N.V. International Journal of Molecular Sciences. 2023. V.24. N20. 15302. DOI: 10.3390/ijms242015302
3. Special Issue “Bacteriophage Genomics”: Editorial. Babkin I.V., Tikunova N.V. Microorganisms. 2023. V. 11. N 3. P. 693. DOI: 10.3390/microorganisms11030693
4. Isolation, Characterization and Genomic Analysis of a Novel Jumbo Phage, AerS_266, That Infects Aeromonas salmonicida. Morozova V.V., Babkin I.V., Kozlova Y.N., Tikunov A., Ushakova T.A., Bardasheva A., Fedoretc V.A., Zhirakovskaia E.V., Tikunova N.V. Microorganisms. 2023. V. 11. N 11. P. 2649. DOI: 10.3390/microorganisms11112649
5. Генетическая вариабельность риккетсий в клещах Dermacentor spp. на территории Западной Сибири и Северного Казахстана. Якубовский В.И., Иголкина Я.П., Тикунов А.Ю., Панов В.В., Якименко В.В., Жабыкпаева А.Г., Епихина Т.И., Рар В.А. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2023. Т. 41. № 3. С. 25‑34. DOI: 10.17116/molgen20234103125
6. Changes in the Ultrastructure of Staphylococcus aureus Cells Make It Possible to Identify and Analyze the Injuring Effects of Ciprofloxacin, Polycationic Amphiphile and Their Hybrid. Grigoryeva A.E., Bardasheva A., Ryabova E.S., Tupitsyna A.V., Zadvornykh D.A., Koroleva L.S., Silnikov V.N., Tikunova N.V., Ryabchikova E.I. Microorganisms. 2023. V. 11. P. 2192. DOI: 10.3390/microorganisms11092192
7. Современные стратегии и перспективы лечения язвенного колита. Шрайнер Е.В., Хавкин А.И., Новикова М.С., Тикунов А.Ю., Чечушков А.В., Харахорин Р.А., Тикунова Н.В. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2023. Т. 1. № 1. С. 149-157. DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-209-1-149-157
8. Antibodies Capable of Enhancing SARS-CoV-2 Infection Can Circulate in Patients with Severe COVID-19. Matveev A.L., Pyankov O., Khlusevich Y.A., Tyazhelkova O.V., Emelyanova L., Shipovalov A.V., Chechushkov A.V., Zaitseva N., Kudrov G.A., Iusubalieva S.M., Yussubaliyeva S., Zhukova O., Baklaushev V., Sedykh S.E., Lifshits G.I., Tikunov A., Tikunova N.V. Int. J. Mol. Sci. 2023. V. 24. P. 10799. DOI: 10.3390/ijms241310799
9. Novel Genetic Lineages of Rickettsia helvetica Associated with Ixodes apronophorus and Ixodes trianguliceps Ticks. Igolkina Y.P., Yakimenko V.V., Tikunov A., Epikhina T.I., Tancev A., Tikunova N.V., Rar V.A. Microorganisms. 2023. V. 11. N 5. P. 1215. DOI: 10.3390/microorganisms11051215
10. Identification, Characterization, and Genome Analysis of Two Novel Temperate Pseudomonas protegens phages PseuP_222 and PseuP_224. Morozova V.V., Kozlova Y.N., Tikunov A., Babkin I.V., Ushakova T.A., Bardasheva A., Jdeed G., Zhirakovskaia E.V., Mogileva A., Netesov S., Tikunova N.V. Microorganisms. 2023. V. 11. N 6. P. 1456. DOI: 10.3390/microorganisms11061456
11. New Neutralizing Epitope Exposed on the Domain II of Tick-Borne Encephalitis Virus Envelope Glycoprotein E. Matveev A.L., Khlusevich Y.A., Kozlova I., Matveyev L.E., Emelyanova L., Tikunov A., Baykov I.K., Tikunova N.V. Viruses. 2023. V. 15. N 6. P. 1256> DOI: 10.3390/v15061256
12. Composition and Concentration of the Biogenic Components of the Aerosols Collected over Vasyugan Marshes and Karakan Pine Forest at Altitudes from 500 to 7000 m. Andreeva I.S., Safatov A.S., Morozova V.V., Solovyanova N.A., Puchkova L.I., Buryak G.A., Olkin S.E., Reznikova I.K., Emelyanova E.K., Okhlopkova O.V., Simonenkov D.V., Belan B.D. Atmosphere. 2023. V. 14. N 2. P. 301. DOI: 10.3390/atmos14020301
13. Short-Term Outcomes of Phage-Antibiotic Combination Treatment in Adult Patients with Periprosthetic Hip Joint Infection. Fedorov E., Samokhin A., Kozlova Y.N., Kretien S., Sheraliev T., Morozova V.V., Tikunova N.V., Kiselev A., Pavlov V. Viruses. 2023.V. 15. N 2. P. 499. DOI: 10.3390/v15020499
14. Abolishment of morphology-based taxa and change to binomial species names: 2022 taxonomy update of the ICTV bacterial viruses subcommittee. Turner D., Shkoporov A.N., Lood C., Millard A.D., Dutilh B.E., Alfenas‑Zerbini P., Zyl van L.J Aziz R.K., Oksanen H.M., Poranen M.M., Kropinski A.M., Barylski J., Brister J.R., Chanisvili N., Edwards R.A., Enault F., Gillis A., Knezevic P., Krupovic M., Kurtböke İ., Kushkina A., Lavigne R., Lehman S., Lobocka M., Moraru C., Switt AM., Morozova V.V., Nakavuma J., Muñoz A.R., Rumnieks J., Sarkar B.L., Sullivan M.B., Uchiyama J., Wittmann J., Yigang T., Adriaenssens E.M. Archives of Virology. 2023. V. 168. P. 74. DOI: 10.1007/s00705-022-05694-2
15. Detection and genetic characterization of a putative novel Borrelia genospecies in Ixodes apronophorus / Ixodes persulcatus / Ixodes trianguliceps sympatric areas in Western Siberia. Sabitova Y.V., Rar V.A., Tikunov A., Yakimenko V.V., Korallo-Vinarskaya N., Livanova N.N., Tikunova N.V. Ticks Tick-borne Dis. 2023. V. 14. N 1. P. 102075. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2022.102075
16. Multilocus genetic analysis indicates taxonomic status of «Candidatus Rickettsia mendelii» as a separate basal group. Igolkina Y.P., Nikitin A., Verzhutskaya Y., Gordeyko N., Tikunov A., Epikhina T.I., Tikunova N.V., Rar V.A. Ticks Tick-borne Dis. 2023. V. 14. N 2. P. 102104. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2022.102104
17. Occurrence and clinical manifestations of tick-borne rickettsioses in Western Siberia: First Russian cases of Rickettsia aeschlimannii and Rickettsia slovaca infections. Igolkina Y.P., Rar V.A., Krasnova E., Filimonova E., Tikunov A., Epikhina T.I., Tikunova N.V. Ticks Tick-borne Dis. 2022. V. 13. N 3. P. 101927. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2022.101927
18. Tick-borne encephalitis nonstructural protein NS1 expressed in E. coli retains immunological properties of the native protein. Matveev A.L., Khlusevich Y.A., Golota O.V., Kravchuk B.I., Tkachev S.E., Emelyanova L., Tikunova N.V. Protein Expres. Purif. 2022. V. 191. P. 106031. DOI: 10.1016/j.pep.2021.106031
19. Delimitation of the tick-borne flaviviruses. Resolving the tick-borne encephalitis virus and louping-ill virus paraphyletic taxa. Bondaryuk N.A., Andaev E.I., Dzhioev Yu.P., Zlobin V.I., Tkachev S.E., Kozlova I.V., Bukin Y.S. Mol Phylogenet Evol. 2022. V. 169. P. 107411. DOI: 10.1016/j.ympev.2022.107411
20. «Candidatus Rickettsia uralica» and «Candidatus Rickettsia thierseensis» are genetic variants of one species. Igolkina Y.P., Rar V.A., Yakimenko V., Tikunov A., Tikunova N.V. Ticks Tick-borne Dis. 2022. V. 13. N 3. P. 101933. DOI: 10.1016/j.ttbdis.2022.101933
21. An Update of Orthopoxvirus Molecular Evolution. Babkin I.V., Babkina I.N., Tikunova N.V. Viruses. 2022. V. 14. N 2. P. 388. DOI: 10.3390/v14020388
22. New p35 (H3L) Epitope Involved in Vaccinia Virus Neutralization and Its Deimmunization. Khlusevich Y.A., Matveev A.L., Emelyanova L., Goncharova E.P., Golosova N., Pereverzev I.M., Tikunova N.V. Viruses. 2022. V. 14. P. 1224. DOI: 10.3390/v14061224
23. Вклад антител против различных доменов S-белка SARS-CoV-2 в патогенез COVID-19.. Матвеев А.Л., Хлусевич Я.А., Чечушков А.В., Емельянова Л.А., Голота О.В., Лифшиц Г.И., Тикунова Н.В. Проблемы медицинской микологии. 2022. Т. 24. № 2. С.101. (тезисы конференции)
24. Multicompartmental Mathematical Model of SARS-CoV-2 Distribution in Human Organs and Their Treatment. Afonyushkin V.N., Akberdin I., Kozlova Y.N., Schukin I., Mironova T., Bobikova A.S., Cherepushkina V., Donchenko N., Poletaeva Y., Kolpakov F. Mathematics. 2022. V. 10. N 11. P. 1925. DOI: 10.3390/math10111925
25. Синтетические антимикробные пептиды. IV. Влияние катионных групп лизина, аргинина и гистидина на антимикробную активность пептидов с “круговым” типом амфипатичности. Амирханов Н.В., Бардашева А.В., Тикунова Н.В., Пышный Д.В. Биоорганическая химия. 2022. Т. 48. № 5. С. 537–550. DOI: 10.31857/S0132342322050049
26. Synthetic Antimicrobial Peptides: IV. Effect of Cationic Groups of Lysine, Arginine, and Histidine on Antimicrobial Activity of Peptides With a ‘Circular’ Type of Amphipathicity. Amirkhanov N.V., Bardasheva A., Tikunova N.V., Pyshnyi D.V. Биоорганическая химия. 2022. V. 48. N 5. P. 937–948. DOI: 10.1134/S1068162022050041 (перевод)
27. Parasitoid venom alters the lipid composition and development of microorganisms on the wax moth cuticle. Kryukov V.Yu., Chernyak E.I., Kryukova N., Tyurin M., Krivopalov A., Yaroslavtseva O., Senderskiy I., Polenogova O., Zhirakovskaia E.V., Glupov V.V., Morozov S.V. Entomol Exp Appl. 2022. V. 170. N 10. P. 852-868. DOI: 10.1111/eea.13219
28. Antibacterial activity of cationic amphiphil conjugates with ciprofloxacin. International Journal of Health Sciences. Zadvornykh D.A., Zhang Z., Liu C., Serpokrylova I.Y., Bardasheva A., Tikunova N.V., Silnikov V.N., Koroleva L.S. International Journal of Health Sciences. 2022. V. 6. S7. P. 3009–3023. DOI: 10.53730/ijhs.v6nS7.12110
29. Профилактическая эффективность препаратов при пироплазмидозах лошадей в Горном Алтае. Марченко В.А., Рар В.А., Бирюков И.В. Российский паразитологический журнал. 2022. Т. 16. № 3. С. 359-366. DOI: 10.31016/1998-8435-2022-16-3-359-366
30. Natural IgG against S-Protein and RBD of SARS-CoV-2 Do Not Bind and Hydrolyze DNA and Are Not Autoimmune. Timofeeva A.M., Sedykh S.E., Ermakov E.A., Matveev A.L., Odegova E.I., Sedykh T.A., Shcherbakov D.N., Merkuleva I.A., Volosnikova E.A., Nesmeyanova V. S., Tikunova N.V., Nevinsky G.A. Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. P. 13681 DOI: 10.3390/ijms232213681
31. Пироплазмоз лошадей Иркутской области: этиология, инвазированность, распространение. Сунцова О.В., Лисак О.В., Дорощенко Е.К., Савинова Ю.С., Козлова И.В., Рар В.А., Тикунов А.Ю., Мельцов И.В. Ветеринария. 2022. № 6. С. 31-40. DOI: 10.30896/0042-4846.2022.25.6.31-40
32. Novel Aeromonas popoffii Phage AerP_220 Proposed to Be a Member of a New Tolavirus Genus in the Autographiviridae Family. Morozova V.V., Kozlova Y.N., Jdeed G., Tikunov A., Ushakova T., Bardasheva A., Zhirakovskaia E.V., Poletaeva Y., Ryabchikova E.I., Tikunova N.V. Viruses. 2022. V. 14. N 12. P. 2733. DOI: 10.3390/v14122733
33. Identification of neutralizing epitopes of the vaccinia virus H3L protein. Khlusevich Y.A., Emelyanova L., Matveev A.L., Goncharova E.P., Shevelev G.Yu., Tikunova N.V. Febs Open Bio. 2022. V. 12. S. 1. P. 160-161. DOI: 10.1002/2211-5463.13440 (тезисы конференции)
34. Non-RBD binding antibody neutralize SARS-CoV-2 A. Matveev, O. Pyankov, O. Golota, A. Chechushkov, Y. Khlusevich, N. Tikunova. Matveev A.L., Pyankov O., Golota O.V., Chechushkov A.V., Khlusevich Y.A., Tikunova N.V. Febs Open Bio. 2022. V. 12. S. 1. P. 162. DOI: 10.1002/2211-5463.13440 (тезисы конференции)
35. Синтетические антимикробные пептиды. III. Влияние катионных групп лизина, аргинина и гистидина на антимикробную активность пептидов с линейным типом амфипатичности. Амирханов Н.В., Бардашева А.В., Тикунова Н.В., Пышный Д.В. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 23. C. 315-326. DOI: 10.31857/S0132342321030027
36. A Neurotoxic Insecticide Promotes Fungal Infection in Aedes aegypti Larvae by Altering the Bacterial Community. Noskov Y.A., Kabilov M.R., Polenogova O.V., Yurchenko Y.A., Belevich O.E., Yaroslavtseva O.N., Alikina T.Y., Byvaltsev A.M., Rotskaya U.N., Morozova V.V., Glupov V.V., Kryukov V.Yu. Microbial Ecology. 2021. V. 81. N 2. P. 493-505. DOI: 10.1007/s00248-020-01567-w
37. Направляющие РНКазу Р конъюгаты олигонуклеотидов с олиго(N-метилпирролом) как перспективные антибактериальные препараты. Данилин Н.А., Матвеев А.Л., Бардашева А.В., Тикунова Н.В., Новопашина Д.С., Веньяминова А.Г. Биоорганическая химия. 2021. Т. 47. № 2. С. 259-269. DOI: 10.31857/S0132342321020081
38. Активация инфекции мочевых путей и морфологические реакции почек крыс после инъекции мультипотентных стромальных клеток в отдаленные ткани. Майбородин И.В., Козлова Ю.Н., Маслов Р.В., Марчуков С.В., Михеева Т.В., Майбородина В.И., Рягузов М.Е. Вестник Кыргызско-Российского Славянского Университета. 2021. Т. 21. № 1. С. 162-168.
39. Conjugates of RNase P-Guiding Oligonucleotides with Oligo(N-Methylpyrrole) as Prospective Antibacterial Agents. Danilin N.A., Matveev A.L., Tikunova N.V., Venyaminova A.G., Novopashina D.S. Биоорганическая химия. 2021. V. 47. N 2. P. 469–477. DOI: 10.1134/S1068162021020084 (перевод)
40. Genetic diversity of Anaplasma bacteria: Twenty years later. Rar V.A., Tkachev S.E., Tikunova N.V. Infect. Genet. Evol. 2021. V. 91. P. 104833. DOI: 10.1016/j.meegid.2021.104833
41. Генетическая характеристика клинических изолятов клебсиелл, циркулирующих в Новосибирске. Бардашева А.В., Фоменко Н.В., Калымбетова Т.В., Бабкин И.В., Кретьен С.О., Жираковская Е.В., Тикунова Н.В., Морозова В.В. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021. V. 25. N 2. P. 234-245. DOI: 10.18699/VJ21.49-o
42. Роль Ixodes pavlovskyi (Acari, Ixodidae) в боррелиозном эпизоотическом процессе на острове Русском. Никитин А.Я., Сабитова Ю.В., Рар В.А., Морозов И.М., Гордейко Н.С., Алленов А.В., Каверина Г.Б., Бабкин И.В., Тикунова Н.В., Андаев Е.И. Проблемы особо опасных инфекций. 2021. Т. 1. С. 116– 121. DOI: 10.21055/0370-1069-2021-1-116-121
43. Epizootic situation on anaplasmosis of small ruminants in the Irkutsk Region. Suntsova O.V., Rar V.A., Lisak O.V., Meltsov I.V., Doroshchenko E.K., Savinova Y.S., Tikunov A., Kozlova I.V. Acta Biomedica Scientifica. 2021. V. 6. N 1. P. 60-68. DOI: 10.29413/ABS.2021-6.1.9
44. Epitope composition of recombinant fragment of orthopoxvirus p35 protein. Khlusevich Y.A., Matveev A.L., Emelyanova L., Golota O.V., Tikunova N.V. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 175. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 (тезисы конференции)
45. Structural basis of antiviral activity of a protective antibody against tick-borne encephalitis virus and structure-guided rational design of this antibody. Baykov I.K., Chojnowski G., Matveev A.L., Pachl P., Emelyanova L., Moor N.A., Rezacova P., Lamzin V., Tikunova N.V. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 214. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 (тезисы конференции)
46. A new enterobacter cloacae bacteriophage ec151 encodes the deazaguanine dna modification pathway and represents a new genus within the siphoviridae family. Morozova V.V., Jdeed G., Kozlova Y.N., Babkin I.V., Tikunov A., Tikunova N.V. Viruses. 2021. V. 13. N 7. P. 1372. DOI: 10.3390/v13071372
47. Computational and rational design of single-chain antibody against tick-borne encephalitis virus for modifying its specificity. Baykov I.K., Desyukevich P.Y., Mikhaylova E.E., Kurchenko O.M., Tikunova N.V. Viruses. 2021. V. 13. N 8. P. 1494. DOI: 10.3390/v13081494
48. Influence of caudovirales phages on humoral immunity inmice. Chechushkov A.V., Kozlova Y.N., Baykov I.K., Morozova V.V., Kravchuk B.I., Ushakova T., Bardasheva A., Zelentsova E., Al Allaf L., Tikunov A., Vlassov V.V., Tikunova N.V. Viruses. 2021. V. 13. N 7. P. 1241. DOI: 10.3390/v13071241
49. Характеристика аффинности АНТИ-Β-(1→3)-D-глюканового моноклонального антитела 3G11 методом поляризационно-флуоресцентного иммуноанализа. Мухаметова Л.И., Крылов В.Б., Соловьев А.С., Яшунский Д.В., Матвеев А.Л., Тикунова Н.В., Еремин С.А., Нифантьев Н.Э. Известия АН. Серия химическая. 2021. № 5. С. 975-981.
50. Случаи заболевания ку-лихорадкой, выявленные у жителей новосибирской области, госпитализированных с подозрением на инфекции, передаваемые клещами. Бондаренко Е.И., Филимонова Е.С., Краснова Е.И., Криницина Э.В., Ткачев С.Е. Клиническая лабораторная диагностика. 2021. Т. 66. № 4. С. 229-236. DOI: 10.51620/0869-2084-2021-66-4-229-236
51. Proteus bacteriophage augments specific and non-specific immunity against host bacterial pathogen. Chechushkov A.V., Al Allaf L., Kozlova Y.N., Kravchuk B.I., Morozova V.V., Tikunova N.V. Febs Open Bio. 2021. P. 297. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 (тезисы конференции)
52. The prospective antibacterial conjugates of modified oligonucleotides. Danilin N.A., Novopashina D.S., Matveev A.L., Bardasheva A., Tikunova N.V., Kupryushkin M.S., Pyshnyi D.V., Venyaminova A.G. Febs Open Bio. 2021. V. 11. S. 1. P. 307. DOI: 10.1002/2211-5463.13205 (тезисы конференции)
53. Potential for phages in the treatment of bacterial sexually transmitted infections. Cater K., Miedzybrodzki R., Morozova V.V., Letkiewicz S., Łusiak-Szelachowska M., Rękas J., Weber-Dabrowska B., Górski A. Antibiotics. 2021. V. 10. N 9. P. 1030. DOI: 10.3390/antibiotics10091030
54. Острый гастроэнтерит при новой коронавирусной инфекции у жителей Новосибирска. Краснова Е.И., Проворова В.В., Хохлова Н.И., Майбородина Е.В., Шеронова О.Б., Тикунова Н.В., Кузнецова В.Г., Куимова И.В., Извекова И.Я., Панасенко Л.М., Помогаева А.П., Лукашова Л.В., Евстропов А.Н. Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 2021. № 6 (190). С. 12-17. DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-190-6-12-17
55. Профилактика пироплазмидозов лошадей Горного Алтая. Марченко В.А., Рар В.А., Айбыкова Ч.Т. Теория и практика борьбы с паразитарными болезнями. 2021. № 22. С. 323-329. DOI: 10.31016/978-5-6046256-1-3.2021.22.323-329
56. The infectious bronchitis coronavirus pneumonia model presenting a novel insight for the sars-cov-2 dissemination route. Nefedova E., Koptev V., Bobikova A.S., Cherepushkina V., Mironova T., Afonyushkin V.N., Shkil N., Donchenko N., Kozlova Y.N., Sigareva N., Davidova N., Bogdanchikova N., Pestryakov A., Toledano-Magaña Y. Vet. Sci. 2021. V. 8. N 10. P. 239. DOI: 0.3390/vetsci8100239
57. Клещевые риккетсиозы - близкие родственники сыпного тифа. Рар В.А., Иголкина Я.П., Тикунова Н.В., Власов В.В. Наука из первых рук. 2021. № 1-2 (91). С. 54-65.
58. Uptake of Cell-Penetrating Peptide RL2 by Human Lung Cancer Cells: Monitoring by Electron Paramagnetic Resonance and Confocal Laser Scanning Microscopy. Ovcherenko S.S., Chinak O.A., Chechushkov A.V., Dobrynin S., Kirilyuk I.A., Babaylova E.S., Richter V.A., Bagryanskaya E.G. Molecules. 2021. V. 26. N 18. P. 5442. DOI: 10.3390/molecules26185442
59. Bacterial Viruses Subcommittee and Archaeal Viruses Subcommittee of the ICTV: update of taxonomy changes in 2021. Krupovic M., Turner D., Morozova V.V., Dyall-Smith M., Oksanen H.M., Edwards R., Dutilh B.E., Lehman S.M., Reyes A., Baquero D.P., Sullivan M.B., Uchiyama J., Nakavuma J., Barylski J., Young M.J., Du S., Alfenas-Zerbini P., Kushkina A., Kropinski A.M., Kurtböke İ., Brister J.R., Lood C., Sarkar B.L., Yigang T., Liu Y., Huang L., Wittmann J., Chanishvili N., Zyl L.J Van., Rumnieks J., Mochizuki T., Jalasvuori M., Aziz R.K., Łobocka M., Stedman K.M., Shkoporov A.N., Gillis A., Peng X., Enault F., Knezevic P., Lavigne R., Rhee S-K., Cvirkaite-Krupovic V., Moraru C., Moreno Switt A.I., Poranen M.M., Millard A., Prangishvili D., Adriaenssens E.M. Archives of Virology. 2021. V. 166. N 11. P. 3239-3244. DOI: 10.1007/s00705-021-05205-9
60. Short-term results of treatment of staphylococcal periprosthetic hip joint infection with combined antibiotics and bacteriophages treatment. Fedorov E.A., Kretien S.O., Samokhin A.G., Tikunova N.V., Korytkin A.A., Pavlov V.V. Acta Biomedica Scientifica. 2021. V. 6. N 4. P. 50-63. DOI: 10.29413/ABS.2021-6.4.5
61. Клещевые риккетсиозы в Западной Сибири. Первые российские случаи риккетсиозов, вызванных Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia raoultii и Rickettsia slovaca. Власов В.В., Иголкина Я.П., Рар В.А., Краснова Е.И., Филимонова Е.С., Тикунов А.Ю., Епихина Т.И., Тикунова Н.В. Национальные приоритеты России. 2021. № 3 (42). С. 122-126.
62. Antibiotic Resistance and Pathogenomics of Staphylococci Circulating in Novosibirsk, Russia. Bardasheva A., Tikunov A., Kozlova Y.N., Zhirakovskaia E.V., Fedoretc V.A., Fomenko N.V., Kalymbetova T., Chretien S., Pavlov V., Tikunova N.V., Morozova V.V. Microorganisms. 2021. V. 9. N 12. P. 2487. DOI: 10.3390/microorganisms9122487
63. Разработка ПЦР в режиме реального времени для детекции P. aeruginosa в биопленках. Черепушкина В.С., Миронова Т.Е., Афонюшкин В.Н., Луканина С.А., Бобикова А.С., Козлова Ю.Н. Ветеринарный врач. 2021. № 5. С. 64-72. DOI: 10.33632/1998-698x.2021-5-64-72
64. Locus-Specific Methylation of GSTP1, RNF219, and KIAA1539 Genes with Single Molecule Resolution in Cell-Free DNA from Healthy Donors and Prostate Tumor Patients: Application in Diagnostics. Bryzgunova O.E., Bondar A.A., Ruzankin P., Laktionov P., Tarasenko A., Kurilschikov A.M., Epifanov R., Zaripov M., Kabilov M.R., Laktionov P.P. Cancers. 2021. V. 13. N 24. P. 6234. DOI: 10.3390/cancers13246234
65. Клинико-лабораторная характеристика клещевого риккетсиоза, связанного с микст-инфицированием Rickettsia sibirica и «Candidatus Rickettsia tarasevichiae». Рудаков Н.В., Самойленко И.Е., Штрек С.В., Рудакова С.А., Кумпан Л.В., Иголкина Я.П., Рар В.А., Жираковская Е.В., Ткачев С.Е., Тикунова Н.В., Кострыкина Т.В., Блохина И.В., Ленц П.А. Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11. № 6. С. 1173-1178. DOI: 10.15789/2220-7619-CAL-1597
66. Таксономический состав и биоразнообразие кишечного микробиома пациентов с синдромом раздраженного кишечника, язвенным колитом и бронхиальной астмой. Тикунов А.Ю., Швалов А.Н., Морозов В.В., Бабкин И.В., Селедцова Г.В., Волошина И.О., Иванова И.П., Бардашева А.В., Морозова В.В., Власов В.В., Тикунова Н.В. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2021. Т. 25. № 8. С. 864-873. DOI: 10.18699/VJ21.100

1. ХИМЕРНОЕ АНТИТЕЛО ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА. «Ноу-хау» (Секрет-производства). Тикунова Н.В., Трошкова Г.П., Матвеев А.Л., Байков И.К., Хлусевич Я.А. 2014 г.
   
2. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pFK2, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ РЕКОМБИНАНТНОГО ПЕПТИДА, ЯВЛЯЮЩЕГОСЯ АНАЛОГОМ ФРАГМЕНТА КАППА-КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ПЕПТИДА И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ПЕПТИД, АНАЛОГ ФРАГМЕНТА КАППА-КАЗЕИНА ЧЕЛОВЕКА, ОБЛАДАЮЩИЙ АПОПТОТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ Тикунова Н.В., Семенов Д.В., Бабкина И.Н., Кулигина Е.В., Коваль О.А., Фомин А.С., Матвеева В.А., Матвеев А.Л., Матвеев Л.Э., Рихтер В.А. 2010 № 2401307.
   
3. ШТАММ ГИБРИДНЫХ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ КЛЕТОК ЖИВОТНЫХ Mus. Musculus, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ МОНОКЛОНАЛЬНЫЕ АНТИТЕЛА, СПЕЦИФИЧНЫЕ К ПЕПТИДУ, ОБЛАДАЮЩЕМУ АПОПТОТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ ПО ОТНОШЕНИЮ К РАКОВЫМ КЛЕТКАМ ЧЕЛОВЕКА Матвеев Л.Э., Матвеев А.Л., Семенов Д.В., Фомин А.С., Кулигина Е.В., Матвеева В.А., Тикунова Н.В., Рихтер В.А. 2010 г. № 2402605.
   
4. ШТАММ БАКТЕРИОФАГА Staphylococcus aureus SA20, ОБЕСПЕЧИВАЮЩИЙ РАЗРУШЕНИЕ БИОПЛЕНОК, ОБРАЗУЕМЫХ БАКТЕРИЯМИ РОДА Staphylococcus Козлова Ю.Н., Морозова В.В., Тикунова Н.В., Рябчикова Е.И., Курильщиков А.М., Власов В.В. 2015 г. № 2565824.
   
5. ШТАММ БАКТЕРИОФАГА Citrobacter freundii CF17, СПОСОБНЫЙ ЛИЗИРОВАТЬ ПАТОГЕННЫЕ ШТАММЫ CITROBACTER FREUNDII. Морозова В.В., Козлова Ю.Н., Тикунова Н.В., Пугачев В.Г., Курильщиков А.М., Власов В.В. 2015 г. № 2565559.
   
6. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCLm4/hygro-14D5, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД СО СВОЙСТВАМИ ЛЕГКОЙ ЦЕПИ ХИМЕРНОГО АНТИТЕЛА ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, И РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCHm2-14D5, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД СО СВОЙСТВАМИ ТЯЖЕЛОЙ ЦЕПИ ХИМЕРНОГО АНТИТЕЛА ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ХИМЕРНОЕ АНТИТЕЛО, ОБЕСПЕЧИВАЮЩЕЕ ЭКСТРЕННУЮ ПРОФИЛАКТИКУ КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА У МЫШЕЙ Тикунова Н.В., Байков И.К., Матвеев А.Л., Бабкина И.Н., Матвеев Л.Э., Рихтер В.А.2015 г. № 2550252.
   
7. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCL2h-1I1G, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ ПОЛИПЕПТИДА СО СВОЙСТВАМИ ЛЕГКОЙ ЦЕПИ АНТИТЕЛА ЧЕЛОВЕКА ПРОТИВ ИНТЕРЛЕЙКИНА-18, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pCH2g-1I1G, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ ПОЛИПЕПТИДА СО СВОЙСТВАМИ ТЯЖЕЛОЙ ЦЕПИ АНТИТЕЛА ЧЕЛОВЕКА ПРОТИВ ИНТЕРЛЕЙКИНА-18, И РЕКОМБИНАНТНОЕ АНТИТЕЛО ЧЕЛОВЕКА fh1I1G, ОБЛАДАЮЩЕЕ СПОСОБНОСТЬЮ СВЯЗЫВАТЬ ИНТЕРЛЕЙКИН-18 Вихрова М., Тикунова Н.В., Бабкина И.Н., Матвеев А.Л., Байков И.К., Кухаренко Людмила Александровна 2015 г. № 2562857.
   
8. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pFLAG-sc14D5a-Rm7, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ ГИБРИДНОГО БЕЛКА sc14D5a-Rm7, ШТАММ БАКТЕРИЙ Escherichia coli – ПРОДУЦЕНТ ГИБРИДНОГО БЕЛКА sc14D5a-Rm7 И ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК sc14D5a-Rm7, СВЯЗЫВАЮЩИЙ БЕЛОК Е ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА И ОБЛАДАЮЩИЙ БИОЛЮМИНЕСЦЕНТНОЙ АКТИВНОСТЬЮ Франк Л.А., Тикунова Н.В., Буракова Л.П., Байков И.К., Кудрявцев А.Н., Морозова В.В. 2015 г.№ 2565545.
   
9. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pSC13D6, СОДЕРЖАЩАЯ ГЕН ОДНОЦЕПОЧЕЧНОГО АНТИТЕЛА ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, И ШТАММ БАКТЕРИЙ Escherichia coli BL21(DE3)/pSC13D6 - ПРОДУЦЕНТ ОДНОЦЕПОЧЕЧНЫХ АНТИТЕЛ ПРОТИВ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ОБЛАДАЮЩИХ ВИРУСНЕЙТРАЛИЗУЮЩИМИ СВОЙСТВАМИ. Леванов Л.Н., Тикунова Н.В., Матвеев Л.Э., Гончарова Е.П., Юн Т.Э., Рыжиков А.Б., Матвеева В.А., Рихтер В.А. 2010 г. № 2378378.
   
10. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pG1-Rm7, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ ГИБРИДНОГО БЕЛКА G1-Rm7, И ГИБРИДНЫЙ БЕЛОК, СВЯЗЫВАЮЩИЙ ФАКТОР НЕКРОЗА ОПУХОЛЕЙ И ОБЛАДАЮЩИЙ БИОЛЮМИНЕСЦЕНТНОЙ АКТИВНОСТЬЮ. Франк Л.А., Тикунова Н.В., Буракова Л.П., Кудрявцев А.Н., Морозова В.В. 2014 г. № 2513686.
    
11. СРЕДСТВО ДЛЯ НЕЙТРАЛИЗАЦИИ ВИРУСА НАТУРАЛЬНОЙ ОСПЫ. Хлусевич Я.А., Тикунова Н.В., Морозова В.В., Булычев Л.Е., Бормотов Н.И., Власов В.В., Сергеев А.Н. 2014 г. № 2515905.
    
12. РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pQE-p35d, ОБЕСПЕЧИВАЮЩАЯ СИНТЕЗ РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА p35d ВИРУСА ОСПЫ КОРОВ, ШТАММ БАКТЕРИЙ Escherichia coli - ПРОДУЦЕНТ РЕКОМБИНАНТНОГО БЕЛКА p35d ВИРУСА ОСПЫ КОРОВ И РЕКОМБИНАНТНЫЙ БЕЛОК p35d ВИРУСА ОСПЫ КОРОВ, ИСПОЛЬЗУЕМЫЙ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ТЕСТ-СИСТЕМ И КОНСТРУИРОВАНИЯ СУБЪЕДИНИЧНЫХ ВАКЦИН ПРОТИВ ОРТОПОКСВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ. Хлусевич Я.А., Тикунова Н.В., Морозова В.В., Григорьева А.С., Байков И.К., Пьянков О.В. 2014 г. № 2511037.
    

• автоматизированные оптические биосенсоры ProteON XPR36 Protein Interaction Array System;
  
• система гель-документирования Gel Doc™ XR+ system с фильтром EtBR/SYBR Green BP (BioRad, США);
  
• хроматографическая система BioLogic LP (BioRad, США);
  
• электропораторная система Gene Pulser Xcell microbial system для электропорации бактерий и грибов (BioRad, США);
  
• электропораторная система Gene Pulser Xcell eukaryotic system для электропорации клеток позвоночных и растительных протопластов (BioRad, США);
  
• сканирующий спектрофотометр SmartSpec Plus (BioRad, США);
• планшетный спектрофотометр iMark™ microplate absorbance reader (BioRad, США).